RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639398.1

ME2-211, Transcript of malic enzyme 2, humanhuman

TSL 5

Gene ME2, Length 2,127 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME2-211ENST00000639398 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.42■■■■□ 3.42
ME2-211ENST00000639398 MAP3K1Q13233 1512 aa36.41■■■■□ 3.42
ME2-211ENST00000639398 WDR62O43379 1518 aa36.39■■■■□ 3.42
ME2-211ENST00000639398 P3H3Q8IVL6 736 aa36.37■■■■□ 3.41
ME2-211ENST00000639398 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.34■■■■□ 3.41
ME2-211ENST00000639398 FHOD3Q2V2M9 1422 aa36.33■■■■□ 3.41
ME2-211ENST00000639398 TIAM1Q13009 1591 aa36.33■■■■□ 3.41
ME2-211ENST00000639398 IFT140Q96RY7 1462 aa36.3■■■■□ 3.4
ME2-211ENST00000639398 PBRM1Q86U86 1689 aa36.29■■■■□ 3.4
ME2-211ENST00000639398 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP36.29■■■■□ 3.4
ME2-211ENST00000639398 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP36.25■■■■□ 3.39
ME2-211ENST00000639398 GRIN2BQ13224 1484 aa36.23■■■■□ 3.39
ME2-211ENST00000639398 ERCC6Q03468 1493 aa36.22■■■■□ 3.39
ME2-211ENST00000639398 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa36.2■■■■□ 3.39
ME2-211ENST00000639398 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa36.19■■■■□ 3.38
ME2-211ENST00000639398 FYCO1Q9BQS8 1478 aa36.19■■■■□ 3.38
ME2-211ENST00000639398 SAMD9Q5K651 1589 aa36.18■■■■□ 3.38
ME2-211ENST00000639398 ADAMTS12P58397 1594 aa36.18■■■■□ 3.38
ME2-211ENST00000639398 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.17■■■■□ 3.38
ME2-211ENST00000639398 FMN1Q68DA7 1419 aa36.16■■■■□ 3.38
ME2-211ENST00000639398 CFAP43Q8NDM7 1665 aa36.14■■■■□ 3.38
ME2-211ENST00000639398 CCNB3Q8WWL7 1395 aa36.13■■■■□ 3.37
ME2-211ENST00000639398 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.09■■■■□ 3.37
ME2-211ENST00000639398 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP36.08■■■■□ 3.37
ME2-211ENST00000639398 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.05■■■■□ 3.36
ME2-211ENST00000639398 PHLDB1Q86UU1 1377 aa35.97■■■■□ 3.35
ME2-211ENST00000639398 IQGAP2Q13576 1575 aa35.97■■■■□ 3.35
ME2-211ENST00000639398 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.96■■■■□ 3.35
ME2-211ENST00000639398 UGGT2Q9NYU1 1516 aa35.82■■■■□ 3.32
ME2-211ENST00000639398 GRIN2AQ12879 1464 aa35.81■■■■□ 3.32
ME2-211ENST00000639398 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa35.81■■■■□ 3.32
ME2-211ENST00000639398 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.8■■■■□ 3.32
ME2-211ENST00000639398 ITGAEP38570 1179 aa35.78■■■■□ 3.32
ME2-211ENST00000639398 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa35.78■■■■□ 3.32
ME2-211ENST00000639398 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP35.77■■■■□ 3.32
ME2-211ENST00000639398 CLSPNQ9HAW4 1339 aa35.76■■■■□ 3.31
ME2-211ENST00000639398 MTUS2Q5JR59 1369 aa35.75■■■■□ 3.31
ME2-211ENST00000639398 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP35.7■■■■□ 3.3
ME2-211ENST00000639398 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP35.69■■■■□ 3.3
ME2-211ENST00000639398 SYNJ2O15056 1496 aa35.69■■■■□ 3.3
ME2-211ENST00000639398 CCDC18Q5T9S5 1454 aa35.66■■■■□ 3.3
ME2-211ENST00000639398 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.66■■■■□ 3.3
ME2-211ENST00000639398 DISP1Q96F81 1524 aa35.64■■■■□ 3.3
ME2-211ENST00000639398 HECW1Q76N89 1606 aa35.63■■■■□ 3.29
ME2-211ENST00000639398 FGD6Q6ZV73 1430 aa35.61■■■■□ 3.29
ME2-211ENST00000639398 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa35.61■■■■□ 3.29
ME2-211ENST00000639398 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa35.6■■■■□ 3.29
ME2-211ENST00000639398 KIAA0556O60303 1618 aa35.59■■■■□ 3.29
ME2-211ENST00000639398 NCOA2Q15596 1464 aa35.58■■■■□ 3.29
ME2-211ENST00000639398 SETD5Q9C0A6 1442 aa35.57■■■■□ 3.28
ME2-211ENST00000639398 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP35.57■■■■□ 3.28
ME2-211ENST00000639398 CEP170Q5SW79 1584 aa35.56■■■■□ 3.28
ME2-211ENST00000639398 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa35.55■■■■□ 3.28
ME2-211ENST00000639398 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP35.54■■■■□ 3.28
ME2-211ENST00000639398 FBLN2P98095 1184 aa35.51■■■■□ 3.27
ME2-211ENST00000639398 NUP160Q12769 1436 aa35.51■■■■□ 3.27
ME2-211ENST00000639398 MYOM3Q5VTT5 1437 aa35.51■■■■□ 3.27
ME2-211ENST00000639398 ARHGEF11O15085 1522 aa35.5■■■■□ 3.27
ME2-211ENST00000639398 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP35.44■■■■□ 3.26
ME2-211ENST00000639398 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP35.44■■■■□ 3.26
ME2-211ENST00000639398 JPH4Q96JJ6 628 aa35.37■■■■□ 3.25
ME2-211ENST00000639398 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP35.35■■■■□ 3.25
ME2-211ENST00000639398 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP35.35■■■■□ 3.25
ME2-211ENST00000639398 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa35.34■■■■□ 3.25
ME2-211ENST00000639398 ARID3CA6NKF2 412 aa35.32■■■■□ 3.25
ME2-211ENST00000639398 PTPRKQ15262 1439 aa35.31■■■■□ 3.24
ME2-211ENST00000639398 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa35.31■■■■□ 3.24
ME2-211ENST00000639398 MAPKBP1O60336 1514 aa35.3■■■■□ 3.24
ME2-211ENST00000639398 PTPN23Q9H3S7 1636 aa35.3■■■■□ 3.24
ME2-211ENST00000639398 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP35.26■■■■□ 3.24
ME2-211ENST00000639398 HFM1A2PYH4 1435 aa35.23■■■■□ 3.23
ME2-211ENST00000639398 MIA2Q96PC5 1412 aa35.23■■■■□ 3.23
ME2-211ENST00000639398 PLB1Q6P1J6 1458 aa35.2■■■■□ 3.22
ME2-211ENST00000639398 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP35.19■■■■□ 3.22
ME2-211ENST00000639398 NAIPQ13075 1403 aa35.13■■■■□ 3.21
ME2-211ENST00000639398 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP35.07■■■■□ 3.2
ME2-211ENST00000639398 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP35.04■■■■□ 3.2
ME2-211ENST00000639398 ABCA8O94911 1581 aa35.03■■■■□ 3.2
ME2-211ENST00000639398 UACAQ9BZF9 1416 aa35.01■■■■□ 3.2
ME2-211ENST00000639398 CHD1O14646 1710 aa35.01■■■■□ 3.19
ME2-211ENST00000639398 AKNAQ7Z591 1439 aa34.99■■■■□ 3.19
ME2-211ENST00000639398 SIN3AQ96ST3 1273 aa34.98■■■■□ 3.19
ME2-211ENST00000639398 CHIC2Q9UKJ5 165 aa34.96■■■■□ 3.19
ME2-211ENST00000639398 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa34.94■■■■□ 3.18
ME2-211ENST00000639398 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa34.93■■■■□ 3.18
ME2-211ENST00000639398 ADCY10Q96PN6 1610 aa34.91■■■■□ 3.18
ME2-211ENST00000639398 PTPRGP23470 1445 aa34.91■■■■□ 3.18
ME2-211ENST00000639398 ATP10BO94823 1461 aa34.9■■■■□ 3.18
ME2-211ENST00000639398 NEUROD1Q13562 356 aa34.9■■■■□ 3.18
ME2-211ENST00000639398 GCC2Q8IWJ2 1684 aa34.9■■■■□ 3.18
ME2-211ENST00000639398 DAPK1P53355 1430 aa34.88■■■■□ 3.17
ME2-211ENST00000639398 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP34.88■■■■□ 3.17
ME2-211ENST00000639398 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP34.86■■■■□ 3.17
ME2-211ENST00000639398 KIF14Q15058 1648 aa34.86■■■■□ 3.17
ME2-211ENST00000639398 PLEKHD1A6NEE1 506 aa34.85■■■■□ 3.17
ME2-211ENST00000639398 ABCC5O15440 1437 aa34.85■■■■□ 3.17
ME2-211ENST00000639398 SHROOM2Q13796 1616 aa34.85■■■■□ 3.17
ME2-211ENST00000639398 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP34.84■■■■□ 3.17
ME2-211ENST00000639398 ROCK1Q13464 1354 aa34.83■■■■□ 3.17
ME2-211ENST00000639398 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP34.82■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms