RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615637.2

FOXD1-202, Transcript of forkhead box D1, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene FOXD1, Length 2,272 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1-202ENST00000615637 CFAP43Q8NDM7 1665 aa43.85■■■■■ 4.61
FOXD1-202ENST00000615637 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.84■■■■■ 4.61
FOXD1-202ENST00000615637 KCNH8Q96L42 1107 aa43.83■■■■■ 4.61
FOXD1-202ENST00000615637 WDR97A6NE52 1622 aa43.81■■■■■ 4.6
FOXD1-202ENST00000615637 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.78■■■■■ 4.6
FOXD1-202ENST00000615637 FHAD1B1AJZ9 1412 aa43.75■■■■■ 4.59
FOXD1-202ENST00000615637 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP43.74■■■■■ 4.59
FOXD1-202ENST00000615637 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa43.69■■■■■ 4.58
FOXD1-202ENST00000615637 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.67■■■■■ 4.58
FOXD1-202ENST00000615637 SIN3AQ96ST3 1273 aa43.65■■■■■ 4.58
FOXD1-202ENST00000615637 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP43.64■■■■■ 4.58
FOXD1-202ENST00000615637 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP43.57■■■■■ 4.57
FOXD1-202ENST00000615637 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa43.56■■■■■ 4.56
FOXD1-202ENST00000615637 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP43.52■■■■■ 4.56
FOXD1-202ENST00000615637 FYCO1Q9BQS8 1478 aa43.49■■■■■ 4.55
FOXD1-202ENST00000615637 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP43.45■■■■■ 4.55
FOXD1-202ENST00000615637 P3H3Q8IVL6 736 aa43.45■■■■■ 4.55
FOXD1-202ENST00000615637 FHOD3Q2V2M9 1422 aa43.44■■■■■ 4.54
FOXD1-202ENST00000615637 EFCAB5A4FU69 1503 aa43.43■■■■■ 4.54
FOXD1-202ENST00000615637 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa43.4■■■■■ 4.54
FOXD1-202ENST00000615637 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.39■■■■■ 4.54
FOXD1-202ENST00000615637 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP43.34■■■■■ 4.53
FOXD1-202ENST00000615637 FKBP8Q14318 412 aa43.29■■■■■ 4.52
FOXD1-202ENST00000615637 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.29■■■■■ 4.52
FOXD1-202ENST00000615637 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.28■■■■■ 4.52
FOXD1-202ENST00000615637 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa43.28■■■■■ 4.52
FOXD1-202ENST00000615637 CCER2I3L3R5 266 aa43.28■■■■■ 4.52
FOXD1-202ENST00000615637 BCANQ96GW7 911 aa43.27■■■■■ 4.52
FOXD1-202ENST00000615637 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.26■■■■■ 4.52
FOXD1-202ENST00000615637 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP43.24■■■■■ 4.51
FOXD1-202ENST00000615637 FGD6Q6ZV73 1430 aa43.23■■■■■ 4.51
FOXD1-202ENST00000615637 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.23■■■■■ 4.51
FOXD1-202ENST00000615637 CUL7Q14999 1698 aa43.23■■■■■ 4.51
FOXD1-202ENST00000615637 CCDC18Q5T9S5 1454 aa43.16■■■■■ 4.5
FOXD1-202ENST00000615637 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.16■■■■■ 4.5
FOXD1-202ENST00000615637 ANP32CO43423 234 aa43.16■■■■■ 4.5
FOXD1-202ENST00000615637 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa43.14■■■■■ 4.5
FOXD1-202ENST00000615637 ANP32EQ9BTT0 268 aa43.13■■■■■ 4.49
FOXD1-202ENST00000615637 FMN1Q68DA7 1419 aa43.12■■■■■ 4.49
FOXD1-202ENST00000615637 TOPBP1Q92547 1522 aa43.11■■■■■ 4.49
FOXD1-202ENST00000615637 TONSLQ96HA7 1378 aa43.1■■■■■ 4.49
FOXD1-202ENST00000615637 HFM1A2PYH4 1435 aa43.1■■■■■ 4.49
FOXD1-202ENST00000615637 PTPN23Q9H3S7 1636 aa43.08■■■■■ 4.49
FOXD1-202ENST00000615637 UACAQ9BZF9 1416 aa43.08■■■■■ 4.49
FOXD1-202ENST00000615637 PTPRKQ15262 1439 aa43.06■■■■■ 4.48
FOXD1-202ENST00000615637 TRIM52Q96A61 297 aa43.05■■■■■ 4.48
FOXD1-202ENST00000615637 NEFLP07196 543 aa43.03■■■■■ 4.48
FOXD1-202ENST00000615637 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa43.01■■■■■ 4.48
FOXD1-202ENST00000615637 MTUS2Q5JR59 1369 aa42.98■■■■■ 4.47
FOXD1-202ENST00000615637 SAMD9Q5K651 1589 aa42.95■■■■■ 4.47
FOXD1-202ENST00000615637 NAIPQ13075 1403 aa42.92■■■■■ 4.46
FOXD1-202ENST00000615637 KDM5BQ9UGL1 1544 aa42.92■■■■■ 4.46
FOXD1-202ENST00000615637 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.9■■■■■ 4.46
FOXD1-202ENST00000615637 NCOA2Q15596 1464 aa42.89■■■■■ 4.46
FOXD1-202ENST00000615637 MYOM3Q5VTT5 1437 aa42.88■■■■■ 4.46
FOXD1-202ENST00000615637 GRIN2BQ13224 1484 aa42.85■■■■■ 4.45
FOXD1-202ENST00000615637 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.83■■■■■ 4.45
FOXD1-202ENST00000615637 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP42.83■■■■■ 4.45
FOXD1-202ENST00000615637 NESP48681 1621 aa42.79■■■■■ 4.44
FOXD1-202ENST00000615637 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa42.78■■■■■ 4.44
FOXD1-202ENST00000615637 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP42.76■■■■■ 4.44
FOXD1-202ENST00000615637 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.75■■■■■ 4.43
FOXD1-202ENST00000615637 UGGT2Q9NYU1 1516 aa42.7■■■■■ 4.43
FOXD1-202ENST00000615637 ARHGEF11O15085 1522 aa42.69■■■■■ 4.42
FOXD1-202ENST00000615637 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.67■■■■■ 4.42
FOXD1-202ENST00000615637 GCC2Q8IWJ2 1684 aa42.64■■■■■ 4.42
FOXD1-202ENST00000615637 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.64■■■■■ 4.42
FOXD1-202ENST00000615637 HECW1Q76N89 1606 aa42.62■■■■■ 4.41
FOXD1-202ENST00000615637 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa42.61■■■■■ 4.41
FOXD1-202ENST00000615637 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP42.59■■■■■ 4.41
FOXD1-202ENST00000615637 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.58■■■■■ 4.41
FOXD1-202ENST00000615637 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP42.57■■■■■ 4.41
FOXD1-202ENST00000615637 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.57■■■■■ 4.41
FOXD1-202ENST00000615637 WASHC2AQ641Q2 1341 aa42.55■■■■■ 4.4
FOXD1-202ENST00000615637 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP42.54■■■■■ 4.4
FOXD1-202ENST00000615637 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP42.5■■■■■ 4.39
FOXD1-202ENST00000615637 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.49■■■■■ 4.39
FOXD1-202ENST00000615637 AKNAQ7Z591 1439 aa42.48■■■■■ 4.39
FOXD1-202ENST00000615637 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa42.48■■■■■ 4.39
FOXD1-202ENST00000615637 KDM6BO15054 1643 aa42.46■■■■■ 4.39
FOXD1-202ENST00000615637 CHIC2Q9UKJ5 165 aa42.39■■■■■ 4.38
FOXD1-202ENST00000615637 CNTLNQ9NXG0 1405 aa42.37■■■■■ 4.37
FOXD1-202ENST00000615637 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP42.35■■■■■ 4.37
FOXD1-202ENST00000615637 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP42.29■■■■■ 4.36
FOXD1-202ENST00000615637 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP42.28■■■■■ 4.36
FOXD1-202ENST00000615637 MIA2Q96PC5 1412 aa42.27■■■■■ 4.36
FOXD1-202ENST00000615637 MPHOSPH9Q99550 1183 aa42.26■■■■■ 4.36
FOXD1-202ENST00000615637 NCOA1Q15788 1441 aa42.25■■■■■ 4.35
FOXD1-202ENST00000615637 MSH5O43196 834 aa42.24■■■■■ 4.35
FOXD1-202ENST00000615637 L3MBTL2Q969R5 705 aa42.22■■■■■ 4.35
FOXD1-202ENST00000615637 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.22■■■■■ 4.35
FOXD1-202ENST00000615637 CCDC184Q52MB2 194 aa42.22■■■■■ 4.35
FOXD1-202ENST00000615637 ERICH6BQ5W0A0 696 aa42.2■■■■■ 4.35
FOXD1-202ENST00000615637 CCDC7Q96M83 1385 aa42.2■■■■■ 4.35
FOXD1-202ENST00000615637 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP42.19■■■■■ 4.34
FOXD1-202ENST00000615637 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP42.19■■■■■ 4.34
FOXD1-202ENST00000615637 FANCIQ9NVI1 1328 aa42.18■■■■■ 4.34
FOXD1-202ENST00000615637 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP42.17■■■■■ 4.34
FOXD1-202ENST00000615637 IQGAP2Q13576 1575 aa42.17■■■■■ 4.34
FOXD1-202ENST00000615637 WDR62O43379 1518 aa42.15■■■■■ 4.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.3 ms