RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000594537.2

LTBP4-211, Transcript of latent transforming growth factor beta binding protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene LTBP4, Length 657 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4-211ENST00000594537 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa37.84■■■■□ 3.65
LTBP4-211ENST00000594537 IQGAP2Q13576 1575 aa37.81■■■■□ 3.64
LTBP4-211ENST00000594537 SHROOM2Q13796 1616 aa37.78■■■■□ 3.64
LTBP4-211ENST00000594537 JPH4Q96JJ6 628 aa37.73■■■■□ 3.63
LTBP4-211ENST00000594537 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.73■■■■□ 3.63
LTBP4-211ENST00000594537 UBTFP17480 764 aaKnown RBP37.7■■■■□ 3.63
LTBP4-211ENST00000594537 UGGT2Q9NYU1 1516 aa37.66■■■■□ 3.62
LTBP4-211ENST00000594537 TNIKQ9UKE5 1360 aa37.59■■■■□ 3.61
LTBP4-211ENST00000594537 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP37.59■■■■□ 3.61
LTBP4-211ENST00000594537 ARHGEF11O15085 1522 aa37.56■■■■□ 3.6
LTBP4-211ENST00000594537 EHMT2Q96KQ7 1210 aa37.56■■■■□ 3.6
LTBP4-211ENST00000594537 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa37.55■■■■□ 3.6
LTBP4-211ENST00000594537 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.47■■■■□ 3.59
LTBP4-211ENST00000594537 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.47■■■■□ 3.59
LTBP4-211ENST00000594537 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.47■■■■□ 3.59
LTBP4-211ENST00000594537 DISP1Q96F81 1524 aa37.46■■■■□ 3.59
LTBP4-211ENST00000594537 EFCAB5A4FU69 1503 aa37.43■■■■□ 3.58
LTBP4-211ENST00000594537 KIAA0556O60303 1618 aa37.43■■■■□ 3.58
LTBP4-211ENST00000594537 SAMD9Q5K651 1589 aa37.42■■■■□ 3.58
LTBP4-211ENST00000594537 ERCC6L2Q5T890 1561 aa37.42■■■■□ 3.58
LTBP4-211ENST00000594537 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa37.41■■■■□ 3.58
LTBP4-211ENST00000594537 ARAP1Q96P48 1450 aa37.3■■■■□ 3.56
LTBP4-211ENST00000594537 PTPRGP23470 1445 aa37.25■■■■□ 3.55
LTBP4-211ENST00000594537 CLIP1P30622 1438 aa37.25■■■■□ 3.55
LTBP4-211ENST00000594537 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa37.25■■■■□ 3.55
LTBP4-211ENST00000594537 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP37.23■■■■□ 3.55
LTBP4-211ENST00000594537 CEP162Q5TB80 1403 aa37.21■■■■□ 3.55
LTBP4-211ENST00000594537 FHOD3Q2V2M9 1422 aa37.13■■■■□ 3.53
LTBP4-211ENST00000594537 P3H3Q8IVL6 736 aa37.13■■■■□ 3.53
LTBP4-211ENST00000594537 CYB5RLQ6IPT4 315 aa37.12■■■■□ 3.53
LTBP4-211ENST00000594537 FMN1Q68DA7 1419 aa37.07■■■■□ 3.52
LTBP4-211ENST00000594537 UACAQ9BZF9 1416 aa37.03■■■■□ 3.52
LTBP4-211ENST00000594537 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa37.02■■■■□ 3.52
LTBP4-211ENST00000594537 ABCA8O94911 1581 aa36.99■■■■□ 3.51
LTBP4-211ENST00000594537 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP36.98■■■■□ 3.51
LTBP4-211ENST00000594537 ABCC2Q92887 1545 aa36.97■■■■□ 3.51
LTBP4-211ENST00000594537 PLB1Q6P1J6 1458 aa36.94■■■■□ 3.5
LTBP4-211ENST00000594537 ADCY10Q96PN6 1610 aa36.91■■■■□ 3.5
LTBP4-211ENST00000594537 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa36.9■■■■□ 3.5
LTBP4-211ENST00000594537 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa36.81■■■■□ 3.48
LTBP4-211ENST00000594537 KDM5BQ9UGL1 1544 aa36.8■■■■□ 3.48
LTBP4-211ENST00000594537 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP36.79■■■■□ 3.48
LTBP4-211ENST00000594537 HECW1Q76N89 1606 aa36.78■■■■□ 3.48
LTBP4-211ENST00000594537 VPS8Q8N3P4 1428 aa36.77■■■■□ 3.48
LTBP4-211ENST00000594537 FYCO1Q9BQS8 1478 aa36.77■■■■□ 3.48
LTBP4-211ENST00000594537 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP36.76■■■■□ 3.48
LTBP4-211ENST00000594537 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP36.73■■■■□ 3.47
LTBP4-211ENST00000594537 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP36.67■■■■□ 3.46
LTBP4-211ENST00000594537 MAPKBP1O60336 1514 aa36.66■■■■□ 3.46
LTBP4-211ENST00000594537 ATP10BO94823 1461 aa36.66■■■■□ 3.46
LTBP4-211ENST00000594537 CCDC18Q5T9S5 1454 aa36.64■■■■□ 3.46
LTBP4-211ENST00000594537 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP36.63■■■■□ 3.45
LTBP4-211ENST00000594537 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP36.59■■■■□ 3.45
LTBP4-211ENST00000594537 ASXL2Q76L83 1435 aa36.51■■■■□ 3.44
LTBP4-211ENST00000594537 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP36.51■■■■□ 3.44
LTBP4-211ENST00000594537 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP36.5■■■■□ 3.43
LTBP4-211ENST00000594537 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP36.5■■■■□ 3.43
LTBP4-211ENST00000594537 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP36.5■■■■□ 3.43
LTBP4-211ENST00000594537 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa36.49■■■■□ 3.43
LTBP4-211ENST00000594537 WDR7Q9Y4E6 1490 aa36.48■■■■□ 3.43
LTBP4-211ENST00000594537 ARID3CA6NKF2 412 aa36.47■■■■□ 3.43
LTBP4-211ENST00000594537 MAP3K1Q13233 1512 aa36.46■■■■□ 3.43
LTBP4-211ENST00000594537 PLEKHD1A6NEE1 506 aa36.44■■■■□ 3.42
LTBP4-211ENST00000594537 CFAP43Q8NDM7 1665 aa36.38■■■■□ 3.41
LTBP4-211ENST00000594537 ABCC10Q5T3U5 1492 aa36.37■■■■□ 3.41
LTBP4-211ENST00000594537 TIAM1Q13009 1591 aa36.36■■■■□ 3.41
LTBP4-211ENST00000594537 APLP2Q06481 763 aa36.35■■■■□ 3.41
LTBP4-211ENST00000594537 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP36.34■■■■□ 3.41
LTBP4-211ENST00000594537 GLI2P10070 1586 aa36.3■■■■□ 3.4
LTBP4-211ENST00000594537 DIP2BQ9P265 1576 aa36.3■■■■□ 3.4
LTBP4-211ENST00000594537 MTUS2Q5JR59 1369 aa36.26■■■■□ 3.39
LTBP4-211ENST00000594537 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa36.25■■■■□ 3.39
LTBP4-211ENST00000594537 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa36.24■■■■□ 3.39
LTBP4-211ENST00000594537 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa36.21■■■■□ 3.39
LTBP4-211ENST00000594537 KIF14Q15058 1648 aa36.2■■■■□ 3.39
LTBP4-211ENST00000594537 KCNH8Q96L42 1107 aa36.2■■■■□ 3.39
LTBP4-211ENST00000594537 FAM69CQ0P6D2 419 aa36.19■■■■□ 3.38
LTBP4-211ENST00000594537 KIF13AQ9H1H9 1805 aa36.18■■■■□ 3.38
LTBP4-211ENST00000594537 ABCA9Q8IUA7 1624 aa36.16■■■■□ 3.38
LTBP4-211ENST00000594537 TRHP20396 242 aaPredicted RBP36.15■■■■□ 3.38
LTBP4-211ENST00000594537 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP36.11■■■■□ 3.376e-7■■■■□ 19.9
LTBP4-211ENST00000594537 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa36.1■■■■□ 3.37
LTBP4-211ENST00000594537 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP36.06■■■■□ 3.36
LTBP4-211ENST00000594537 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP36.06■■■■□ 3.36
LTBP4-211ENST00000594537 CD109Q6YHK3 1445 aa36.05■■■■□ 3.36
LTBP4-211ENST00000594537 TTC37Q6PGP7 1564 aa36.02■■■■□ 3.36
LTBP4-211ENST00000594537 ARAP3Q8WWN8 1544 aa35.99■■■■□ 3.35
LTBP4-211ENST00000594537 NCOA2Q15596 1464 aa35.99■■■■□ 3.35
LTBP4-211ENST00000594537 TEX14Q8IWB6 1497 aa35.95■■■■□ 3.35
LTBP4-211ENST00000594537 PLCH2O75038 1416 aa35.95■■■■□ 3.35
LTBP4-211ENST00000594537 MYO5CQ9NQX4 1742 aa35.94■■■■□ 3.34
LTBP4-211ENST00000594537 CCNB3Q8WWL7 1395 aa35.92■■■■□ 3.34
LTBP4-211ENST00000594537 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP35.89■■■■□ 3.34
LTBP4-211ENST00000594537 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP35.88■■■■□ 3.33
LTBP4-211ENST00000594537 PREX2Q70Z35 1606 aa35.88■■■■□ 3.33
LTBP4-211ENST00000594537 PHLDB1Q86UU1 1377 aa35.88■■■■□ 3.33
LTBP4-211ENST00000594537 ITSN2Q9NZM3 1697 aa35.87■■■■□ 3.33
LTBP4-211ENST00000594537 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa35.86■■■■□ 3.33
LTBP4-211ENST00000594537 CFAP74Q9C0B2 1584 aa35.85■■■■□ 3.33
LTBP4-211ENST00000594537 NEO1Q92859 1461 aa35.85■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.4 ms