RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592578.5

PSME3-215, Transcript of proteasome activator subunit 3, humanhuman

TSL 4

Gene PSME3, Length 549 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME3-215ENST00000592578 ABCC10Q5T3U5 1492 aa25.33■■□□□ 1.65
PSME3-215ENST00000592578 TOP2BQ02880 1626 aa25.28■■□□□ 1.64
PSME3-215ENST00000592578 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.27■■□□□ 1.64
PSME3-215ENST00000592578 MAPKBP1O60336 1514 aa25.27■■□□□ 1.64
PSME3-215ENST00000592578 KDM6BO15054 1643 aa25.23■■□□□ 1.63
PSME3-215ENST00000592578 DIP2BQ9P265 1576 aa25.2■■□□□ 1.62
PSME3-215ENST00000592578 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa25.17■■□□□ 1.62
PSME3-215ENST00000592578 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.15■■□□□ 1.62
PSME3-215ENST00000592578 ADCY10Q96PN6 1610 aa25.12■■□□□ 1.61
PSME3-215ENST00000592578 TSPOAP1O95153 1857 aa25.11■■□□□ 1.61
PSME3-215ENST00000592578 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
PSME3-215ENST00000592578 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.02■■□□□ 1.6
PSME3-215ENST00000592578 PTPRGP23470 1445 aa24.95■■□□□ 1.58
PSME3-215ENST00000592578 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa24.89■■□□□ 1.58
PSME3-215ENST00000592578 CUL7Q14999 1698 aa24.89■■□□□ 1.58
PSME3-215ENST00000592578 PLB1Q6P1J6 1458 aa24.89■■□□□ 1.57
PSME3-215ENST00000592578 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
PSME3-215ENST00000592578 ABCC2Q92887 1545 aa24.86■■□□□ 1.57
PSME3-215ENST00000592578 ADGRL1O94910 1474 aa24.86■■□□□ 1.57
PSME3-215ENST00000592578 KIF27Q86VH2 1401 aa24.85■■□□□ 1.57
PSME3-215ENST00000592578 GLI2P10070 1586 aa24.84■■□□□ 1.57
PSME3-215ENST00000592578 TNIKQ9UKE5 1360 aa24.84■■□□□ 1.57
PSME3-215ENST00000592578 IGF1RP08069 1367 aa24.83■■□□□ 1.57
PSME3-215ENST00000592578 ASXL2Q76L83 1435 aa24.83■■□□□ 1.57
PSME3-215ENST00000592578 TEX14Q8IWB6 1497 aa24.77■■□□□ 1.56
PSME3-215ENST00000592578 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
PSME3-215ENST00000592578 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa24.74■■□□□ 1.55
PSME3-215ENST00000592578 HECW2Q9P2P5 1572 aa24.71■■□□□ 1.55
PSME3-215ENST00000592578 UACAQ9BZF9 1416 aa24.71■■□□□ 1.55
PSME3-215ENST00000592578 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa24.71■■□□□ 1.55
PSME3-215ENST00000592578 IQGAP2Q13576 1575 aa24.68■■□□□ 1.54
PSME3-215ENST00000592578 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
PSME3-215ENST00000592578 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa24.65■■□□□ 1.54
PSME3-215ENST00000592578 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
PSME3-215ENST00000592578 KDM5BQ9UGL1 1544 aa24.61■■□□□ 1.53
PSME3-215ENST00000592578 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
PSME3-215ENST00000592578 DISP1Q96F81 1524 aa24.54■■□□□ 1.52
PSME3-215ENST00000592578 WDR7Q9Y4E6 1490 aa24.5■■□□□ 1.51
PSME3-215ENST00000592578 FBXO41Q8TF61 875 aa24.49■■□□□ 1.51
PSME3-215ENST00000592578 UGGT2Q9NYU1 1516 aa24.48■■□□□ 1.51
PSME3-215ENST00000592578 CD109Q6YHK3 1445 aa24.45■■□□□ 1.51
PSME3-215ENST00000592578 KIAA0556O60303 1618 aa24.43■■□□□ 1.5
PSME3-215ENST00000592578 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa24.43■■□□□ 1.5
PSME3-215ENST00000592578 CFAP43Q8NDM7 1665 aa24.43■■□□□ 1.5
PSME3-215ENST00000592578 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa24.42■■□□□ 1.5
PSME3-215ENST00000592578 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
PSME3-215ENST00000592578 KCNH8Q96L42 1107 aa24.39■■□□□ 1.49
PSME3-215ENST00000592578 GOLGA3Q08378 1498 aa24.34■■□□□ 1.49
PSME3-215ENST00000592578 KIF21BO75037 1637 aa24.32■■□□□ 1.48
PSME3-215ENST00000592578 ARAP3Q8WWN8 1544 aa24.25■■□□□ 1.47
PSME3-215ENST00000592578 PHLDB1Q86UU1 1377 aa24.25■■□□□ 1.47
PSME3-215ENST00000592578 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa24.24■■□□□ 1.47
PSME3-215ENST00000592578 ABCA8O94911 1581 aa24.23■■□□□ 1.47
PSME3-215ENST00000592578 PTPRMP28827 1452 aa24.21■■□□□ 1.47
PSME3-215ENST00000592578 ADAMTSL3P82987 1691 aa24.17■■□□□ 1.46
PSME3-215ENST00000592578 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
PSME3-215ENST00000592578 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
PSME3-215ENST00000592578 NEO1Q92859 1461 aa24.08■■□□□ 1.45
PSME3-215ENST00000592578 BCORL1Q5H9F3 1711 aa24.07■■□□□ 1.44
PSME3-215ENST00000592578 ABCA9Q8IUA7 1624 aa24.07■■□□□ 1.44
PSME3-215ENST00000592578 RAPGEF3O95398 923 aa24.07■■□□□ 1.44
PSME3-215ENST00000592578 ARID3CA6NKF2 412 aa24.06■■□□□ 1.44
PSME3-215ENST00000592578 ATP10BO94823 1461 aa24.04■■□□□ 1.44
PSME3-215ENST00000592578 MADDQ8WXG6 1647 aa24.02■■□□□ 1.44
PSME3-215ENST00000592578 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
PSME3-215ENST00000592578 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
PSME3-215ENST00000592578 LMTK3Q96Q04 1460 aa24.01■■□□□ 1.43
PSME3-215ENST00000592578 PRXQ9BXM0 1461 aa23.99■■□□□ 1.43
PSME3-215ENST00000592578 POGZQ7Z3K3 1410 aa23.97■■□□□ 1.43
PSME3-215ENST00000592578 P3H3Q8IVL6 736 aa23.97■■□□□ 1.43
PSME3-215ENST00000592578 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
PSME3-215ENST00000592578 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.92■■□□□ 1.42
PSME3-215ENST00000592578 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa23.91■■□□□ 1.42
PSME3-215ENST00000592578 CERKQ8TCT0 537 aa23.91■■□□□ 1.42
PSME3-215ENST00000592578 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
PSME3-215ENST00000592578 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa23.91■■□□□ 1.42
PSME3-215ENST00000592578 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa23.9■■□□□ 1.42
PSME3-215ENST00000592578 FANCAO15360 1455 aa23.89■■□□□ 1.42
PSME3-215ENST00000592578 HSPA2P54652 639 aa23.89■■□□□ 1.41
PSME3-215ENST00000592578 PLPPR3Q6T4P5 718 aa23.89■■□□□ 1.41
PSME3-215ENST00000592578 AKNAQ7Z591 1439 aa23.88■■□□□ 1.41
PSME3-215ENST00000592578 CFAP74Q9C0B2 1584 aa23.87■■□□□ 1.41
PSME3-215ENST00000592578 EEA1Q15075 1411 aa23.86■■□□□ 1.41
PSME3-215ENST00000592578 PLEKHD1A6NEE1 506 aa23.86■■□□□ 1.41
PSME3-215ENST00000592578 RICTORQ6R327 1708 aa23.82■■□□□ 1.4
PSME3-215ENST00000592578 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.82■■□□□ 1.4
PSME3-215ENST00000592578 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.81■■□□□ 1.4
PSME3-215ENST00000592578 SAMD9Q5K651 1589 aa23.8■■□□□ 1.4
PSME3-215ENST00000592578 MAGI2Q86UL8 1455 aa23.78■■□□□ 1.4
PSME3-215ENST00000592578 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa23.78■■□□□ 1.4
PSME3-215ENST00000592578 DISP3Q9P2K9 1392 aa23.78■■□□□ 1.4
PSME3-215ENST00000592578 DMRT2Q9Y5R5 561 aa23.77■■□□□ 1.4
PSME3-215ENST00000592578 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa23.75■■□□□ 1.39
PSME3-215ENST00000592578 MLECQ14165 292 aa23.75■■□□□ 1.39
PSME3-215ENST00000592578 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa23.75■■□□□ 1.39
PSME3-215ENST00000592578 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
PSME3-215ENST00000592578 SOCS7O14512 581 aa23.73■■□□□ 1.39
PSME3-215ENST00000592578 TTC37Q6PGP7 1564 aa23.7■■□□□ 1.38
PSME3-215ENST00000592578 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.68■■□□□ 1.38
PSME3-215ENST00000592578 YEATS2Q9ULM3 1422 aa23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.8 ms