RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591666.5

SAFB-209, Transcript of scaffold attachment factor B, human

TSL 3

Gene SAFB, Length 632 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Exosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SAFB-209	ENST00000591666	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		33.42	■■■□□ 2.94
SAFB-209	ENST00000591666	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		33.4	■■■□□ 2.94
SAFB-209	ENST00000591666	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		33.37	■■■□□ 2.93
SAFB-209	ENST00000591666	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	33.36	■■■□□ 2.93
SAFB-209	ENST00000591666	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		33.34	■■■□□ 2.93
SAFB-209	ENST00000591666	PRX	Q9BXM0	1461 aa		33.26	■■■□□ 2.92
SAFB-209	ENST00000591666	EEA1	Q15075	1411 aa		33.26	■■■□□ 2.91
SAFB-209	ENST00000591666	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		33.23	■■■□□ 2.91
SAFB-209	ENST00000591666	IQGAP2	Q13576	1575 aa		33.19	■■■□□ 2.9
SAFB-209	ENST00000591666	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	33.1	■■■□□ 2.89
SAFB-209	ENST00000591666	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		33.09	■■■□□ 2.89
SAFB-209	ENST00000591666	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		33.02	■■■□□ 2.88
SAFB-209	ENST00000591666	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		32.98	■■■□□ 2.87
SAFB-209	ENST00000591666	PTPRG	P23470	1445 aa		32.97	■■■□□ 2.87
SAFB-209	ENST00000591666	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		32.97	■■■□□ 2.87
SAFB-209	ENST00000591666	DISP1	Q96F81	1524 aa		32.97	■■■□□ 2.87
SAFB-209	ENST00000591666	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	32.93	■■■□□ 2.86
SAFB-209	ENST00000591666	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	32.9	■■■□□ 2.86
SAFB-209	ENST00000591666	KIAA0556	O60303	1618 aa		32.87	■■■□□ 2.85
SAFB-209	ENST00000591666	GOLGA3	Q08378	1498 aa		32.86	■■■□□ 2.85
SAFB-209	ENST00000591666	KIF21B	O75037	1637 aa		32.85	■■■□□ 2.85
SAFB-209	ENST00000591666	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	32.82	■■■□□ 2.84
SAFB-209	ENST00000591666	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		32.8	■■■□□ 2.84
SAFB-209	ENST00000591666	UACA	Q9BZF9	1416 aa		32.74	■■■□□ 2.83
SAFB-209	ENST00000591666	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		32.7	■■■□□ 2.83
SAFB-209	ENST00000591666	ABCC2	Q92887	1545 aa		32.67	■■■□□ 2.82
SAFB-209	ENST00000591666	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		32.66	■■■□□ 2.82
SAFB-209	ENST00000591666	MAPKBP1	O60336	1514 aa		32.66	■■■□□ 2.82
SAFB-209	ENST00000591666	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	32.65	■■■□□ 2.82
SAFB-209	ENST00000591666	P3H3	Q8IVL6	736 aa		32.63	■■■□□ 2.81
SAFB-209	ENST00000591666	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	32.61	■■■□□ 2.81
SAFB-209	ENST00000591666	SAMD9	Q5K651	1589 aa		32.61	■■■□□ 2.81
SAFB-209	ENST00000591666	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		32.58	■■■□□ 2.81
SAFB-209	ENST00000591666	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		32.54	■■■□□ 2.8
SAFB-209	ENST00000591666	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		32.54	■■■□□ 2.8
SAFB-209	ENST00000591666	ABCA8	O94911	1581 aa		32.52	■■■□□ 2.8
SAFB-209	ENST00000591666	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		32.49	■■■□□ 2.79
SAFB-209	ENST00000591666	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		32.49	■■■□□ 2.79
SAFB-209	ENST00000591666	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		32.47	■■■□□ 2.79
SAFB-209	ENST00000591666	ASXL2	Q76L83	1435 aa		32.47	■■■□□ 2.79
SAFB-209	ENST00000591666	DIP2B	Q9P265	1576 aa		32.43	■■■□□ 2.78
SAFB-209	ENST00000591666	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	32.41	■■■□□ 2.78
SAFB-209	ENST00000591666	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		32.4	■■■□□ 2.78
SAFB-209	ENST00000591666	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		32.31	■■■□□ 2.76
SAFB-209	ENST00000591666	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		32.31	■■■□□ 2.76
SAFB-209	ENST00000591666	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		32.3	■■■□□ 2.76
SAFB-209	ENST00000591666	ARID3C	A6NKF2	412 aa		32.3	■■■□□ 2.76
SAFB-209	ENST00000591666	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	32.27	■■■□□ 2.76
SAFB-209	ENST00000591666	ATP10B	O94823	1461 aa		32.27	■■■□□ 2.76
SAFB-209	ENST00000591666	GLI2	P10070	1586 aa		32.26	■■■□□ 2.75
SAFB-209	ENST00000591666	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	32.24	■■■□□ 2.75
SAFB-209	ENST00000591666	FMN1	Q68DA7	1419 aa		32.23	■■■□□ 2.75
SAFB-209	ENST00000591666	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	32.18	■■■□□ 2.74
SAFB-209	ENST00000591666	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	32.18	■■■□□ 2.74
SAFB-209	ENST00000591666	KCNH8	Q96L42	1107 aa		32.15	■■■□□ 2.74
SAFB-209	ENST00000591666	CLIP1	P30622	1438 aa		32.12	■■■□□ 2.73
SAFB-209	ENST00000591666	TSPOAP1	O95153	1857 aa		32.07	■■■□□ 2.72
SAFB-209	ENST00000591666	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		32.07	■■■□□ 2.72
SAFB-209	ENST00000591666	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	32.06	■■■□□ 2.72
SAFB-209	ENST00000591666	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		32.03	■■■□□ 2.72
SAFB-209	ENST00000591666	HECW1	Q76N89	1606 aa		32.03	■■■□□ 2.72
SAFB-209	ENST00000591666	CD109	Q6YHK3	1445 aa		32.01	■■■□□ 2.72
SAFB-209	ENST00000591666	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		32.01	■■■□□ 2.71
SAFB-209	ENST00000591666	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	31.99	■■■□□ 2.71
SAFB-209	ENST00000591666	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	31.99	■■■□□ 2.71
SAFB-209	ENST00000591666	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		31.96	■■■□□ 2.71
SAFB-209	ENST00000591666	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		31.95	■■■□□ 2.71
SAFB-209	ENST00000591666	CEP162	Q5TB80	1403 aa		31.95	■■■□□ 2.71
SAFB-209	ENST00000591666	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		31.95	■■■□□ 2.71
SAFB-209	ENST00000591666	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		31.95	■■■□□ 2.7
SAFB-209	ENST00000591666	KDM6B	O15054	1643 aa		31.94	■■■□□ 2.7
SAFB-209	ENST00000591666	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	31.9	■■■□□ 2.7
SAFB-209	ENST00000591666	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		31.89	■■■□□ 2.7
SAFB-209	ENST00000591666	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	31.89	■■■□□ 2.7
SAFB-209	ENST00000591666	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		31.86	■■■□□ 2.69
SAFB-209	ENST00000591666	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		31.84	■■■□□ 2.69
SAFB-209	ENST00000591666	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	31.78	■■■□□ 2.68
SAFB-209	ENST00000591666	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	31.76	■■■□□ 2.68
SAFB-209	ENST00000591666	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	31.76	■■■□□ 2.68	5e-6	■■■■□ 21.3
SAFB-209	ENST00000591666	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	31.74	■■■□□ 2.67
SAFB-209	ENST00000591666	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		31.73	■■■□□ 2.67
SAFB-209	ENST00000591666	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		31.73	■■■□□ 2.67
SAFB-209	ENST00000591666	NEO1	Q92859	1461 aa		31.71	■■■□□ 2.67
SAFB-209	ENST00000591666	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		31.7	■■■□□ 2.67
SAFB-209	ENST00000591666	KIF14	Q15058	1648 aa		31.67	■■■□□ 2.66
SAFB-209	ENST00000591666	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		31.66	■■■□□ 2.66
SAFB-209	ENST00000591666	FANCA	O15360	1455 aa		31.62	■■■□□ 2.65
SAFB-209	ENST00000591666	PLCH2	O75038	1416 aa		31.62	■■■□□ 2.65
SAFB-209	ENST00000591666	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		31.58	■■■□□ 2.65
SAFB-209	ENST00000591666	AKNA	Q7Z591	1439 aa		31.57	■■■□□ 2.64
SAFB-209	ENST00000591666	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		31.56	■■■□□ 2.64
SAFB-209	ENST00000591666	RAPGEF3	O95398	923 aa		31.52	■■■□□ 2.64
SAFB-209	ENST00000591666	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		31.52	■■■□□ 2.64
SAFB-209	ENST00000591666	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		31.52	■■■□□ 2.64
SAFB-209	ENST00000591666	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	31.49	■■■□□ 2.63
SAFB-209	ENST00000591666	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		31.49	■■■□□ 2.63
SAFB-209	ENST00000591666	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		31.46	■■■□□ 2.63
SAFB-209	ENST00000591666	ADGRL1	O94910	1474 aa		31.46	■■■□□ 2.63
SAFB-209	ENST00000591666	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		31.42	■■■□□ 2.62
SAFB-209	ENST00000591666	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		31.41	■■■□□ 2.62

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