RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590194.5

SLC25A39-212, Transcript of solute carrier family 25 member 39, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene SLC25A39, Length 1,542 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A39-212ENST00000590194 KIF21BO75037 1637 aa33.91■■■■□ 3.02
SLC25A39-212ENST00000590194 JPH4Q96JJ6 628 aa33.88■■■■□ 3.01
SLC25A39-212ENST00000590194 ARHGEF11O15085 1522 aa33.85■■■■□ 3.01
SLC25A39-212ENST00000590194 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa33.85■■■■□ 3.01
SLC25A39-212ENST00000590194 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa33.85■■■■□ 3.01
SLC25A39-212ENST00000590194 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa33.85■■■■□ 3.01
SLC25A39-212ENST00000590194 IQGAP2Q13576 1575 aa33.81■■■■□ 3
SLC25A39-212ENST00000590194 SHROOM2Q13796 1616 aa33.81■■■■□ 3
SLC25A39-212ENST00000590194 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa33.8■■■■□ 3
SLC25A39-212ENST00000590194 GOLGA3Q08378 1498 aa33.78■■■■□ 3
SLC25A39-212ENST00000590194 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP33.77■■■■□ 3
SLC25A39-212ENST00000590194 UBTFP17480 764 aaKnown RBP33.76■■■■□ 3
SLC25A39-212ENST00000590194 ERCC6L2Q5T890 1561 aa33.75■■■□□ 2.99
SLC25A39-212ENST00000590194 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP33.64■■■□□ 2.98
SLC25A39-212ENST00000590194 ARAP1Q96P48 1450 aa33.62■■■□□ 2.97
SLC25A39-212ENST00000590194 CYB5RLQ6IPT4 315 aa33.62■■■□□ 2.97
SLC25A39-212ENST00000590194 UGGT2Q9NYU1 1516 aa33.62■■■□□ 2.97
SLC25A39-212ENST00000590194 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa33.58■■■□□ 2.97
SLC25A39-212ENST00000590194 DISP1Q96F81 1524 aa33.56■■■□□ 2.96
SLC25A39-212ENST00000590194 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP33.54■■■□□ 2.96
SLC25A39-212ENST00000590194 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa33.52■■■□□ 2.96
SLC25A39-212ENST00000590194 KIAA0556O60303 1618 aa33.49■■■□□ 2.95
SLC25A39-212ENST00000590194 P3H3Q8IVL6 736 aa33.48■■■□□ 2.95
SLC25A39-212ENST00000590194 TNIKQ9UKE5 1360 aa33.45■■■□□ 2.95
SLC25A39-212ENST00000590194 PTPRGP23470 1445 aa33.42■■■□□ 2.94
SLC25A39-212ENST00000590194 SAMD9Q5K651 1589 aa33.38■■■□□ 2.93
SLC25A39-212ENST00000590194 EFCAB5A4FU69 1503 aa33.3■■■□□ 2.92
SLC25A39-212ENST00000590194 FHOD3Q2V2M9 1422 aa33.29■■■□□ 2.92
SLC25A39-212ENST00000590194 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa33.25■■■□□ 2.91
SLC25A39-212ENST00000590194 CLIP1P30622 1438 aa33.21■■■□□ 2.91
SLC25A39-212ENST00000590194 UACAQ9BZF9 1416 aa33.18■■■□□ 2.9
SLC25A39-212ENST00000590194 PLB1Q6P1J6 1458 aa33.17■■■□□ 2.9
SLC25A39-212ENST00000590194 ADCY10Q96PN6 1610 aa33.17■■■□□ 2.9
SLC25A39-212ENST00000590194 CEP162Q5TB80 1403 aa33.16■■■□□ 2.9
SLC25A39-212ENST00000590194 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP33.09■■■□□ 2.89
SLC25A39-212ENST00000590194 ABCC2Q92887 1545 aa33.09■■■□□ 2.89
SLC25A39-212ENST00000590194 ABCA8O94911 1581 aa33.08■■■□□ 2.89
SLC25A39-212ENST00000590194 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa33.07■■■□□ 2.88
SLC25A39-212ENST00000590194 TRHP20396 242 aaPredicted RBP33.05■■■□□ 2.88
SLC25A39-212ENST00000590194 FMN1Q68DA7 1419 aa33.02■■■□□ 2.88
SLC25A39-212ENST00000590194 ARID3CA6NKF2 412 aa33.02■■■□□ 2.88
SLC25A39-212ENST00000590194 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa33.01■■■□□ 2.87
SLC25A39-212ENST00000590194 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP32.97■■■□□ 2.87
SLC25A39-212ENST00000590194 KDM5BQ9UGL1 1544 aa32.94■■■□□ 2.86
SLC25A39-212ENST00000590194 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP32.9■■■□□ 2.86
SLC25A39-212ENST00000590194 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP32.9■■■□□ 2.86
SLC25A39-212ENST00000590194 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP32.87■■■□□ 2.85
SLC25A39-212ENST00000590194 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP32.87■■■□□ 2.85
SLC25A39-212ENST00000590194 ATP10BO94823 1461 aa32.85■■■□□ 2.85
SLC25A39-212ENST00000590194 MAPKBP1O60336 1514 aa32.83■■■□□ 2.85
SLC25A39-212ENST00000590194 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP32.83■■■□□ 2.85
SLC25A39-212ENST00000590194 HECW1Q76N89 1606 aa32.81■■■□□ 2.84
SLC25A39-212ENST00000590194 ASXL2Q76L83 1435 aa32.8■■■□□ 2.84
SLC25A39-212ENST00000590194 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa32.8■■■□□ 2.84
SLC25A39-212ENST00000590194 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP32.75■■■□□ 2.83
SLC25A39-212ENST00000590194 FYCO1Q9BQS8 1478 aa32.75■■■□□ 2.83
SLC25A39-212ENST00000590194 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP32.73■■■□□ 2.83
SLC25A39-212ENST00000590194 VPS8Q8N3P4 1428 aa32.71■■■□□ 2.83
SLC25A39-212ENST00000590194 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa32.68■■■□□ 2.82
SLC25A39-212ENST00000590194 WDR7Q9Y4E6 1490 aa32.68■■■□□ 2.82
SLC25A39-212ENST00000590194 KCNH8Q96L42 1107 aa32.67■■■□□ 2.82
SLC25A39-212ENST00000590194 ABCC10Q5T3U5 1492 aa32.67■■■□□ 2.82
SLC25A39-212ENST00000590194 FAM69CQ0P6D2 419 aa32.67■■■□□ 2.82
SLC25A39-212ENST00000590194 PLEKHD1A6NEE1 506 aa32.65■■■□□ 2.82
SLC25A39-212ENST00000590194 CCDC18Q5T9S5 1454 aa32.62■■■□□ 2.81
SLC25A39-212ENST00000590194 DIP2BQ9P265 1576 aa32.62■■■□□ 2.81
SLC25A39-212ENST00000590194 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP32.59■■■□□ 2.81
SLC25A39-212ENST00000590194 KIF13AQ9H1H9 1805 aa32.58■■■□□ 2.81
SLC25A39-212ENST00000590194 GLI2P10070 1586 aa32.49■■■□□ 2.79
SLC25A39-212ENST00000590194 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP32.45■■■□□ 2.79
SLC25A39-212ENST00000590194 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa32.45■■■□□ 2.78
SLC25A39-212ENST00000590194 APLP2Q06481 763 aa32.41■■■□□ 2.78
SLC25A39-212ENST00000590194 TIAM1Q13009 1591 aa32.4■■■□□ 2.78
SLC25A39-212ENST00000590194 MTUS2Q5JR59 1369 aa32.4■■■□□ 2.78
SLC25A39-212ENST00000590194 TSPOAP1O95153 1857 aa32.39■■■□□ 2.78
SLC25A39-212ENST00000590194 CFAP43Q8NDM7 1665 aa32.39■■■□□ 2.78
SLC25A39-212ENST00000590194 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa32.37■■■□□ 2.77
SLC25A39-212ENST00000590194 CD109Q6YHK3 1445 aa32.37■■■□□ 2.77
SLC25A39-212ENST00000590194 KIF14Q15058 1648 aa32.36■■■□□ 2.77
SLC25A39-212ENST00000590194 ABCA9Q8IUA7 1624 aa32.35■■■□□ 2.77
SLC25A39-212ENST00000590194 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP32.35■■■□□ 2.774e-7■■■□□ 16.9
SLC25A39-212ENST00000590194 TTC37Q6PGP7 1564 aa32.31■■■□□ 2.76
SLC25A39-212ENST00000590194 MAP3K1Q13233 1512 aa32.31■■■□□ 2.76
SLC25A39-212ENST00000590194 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP32.3■■■□□ 2.76
SLC25A39-212ENST00000590194 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa32.29■■■□□ 2.76
SLC25A39-212ENST00000590194 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa32.27■■■□□ 2.76
SLC25A39-212ENST00000590194 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP32.27■■■□□ 2.76
SLC25A39-212ENST00000590194 TEX14Q8IWB6 1497 aa32.2■■■□□ 2.75
SLC25A39-212ENST00000590194 PLCH2O75038 1416 aa32.16■■■□□ 2.74
SLC25A39-212ENST00000590194 MYO5CQ9NQX4 1742 aa32.15■■■□□ 2.74
SLC25A39-212ENST00000590194 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP32.15■■■□□ 2.74
SLC25A39-212ENST00000590194 NCOA2Q15596 1464 aa32.13■■■□□ 2.73
SLC25A39-212ENST00000590194 CCNB3Q8WWL7 1395 aa32.13■■■□□ 2.73
SLC25A39-212ENST00000590194 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP32.1■■■□□ 2.73
SLC25A39-212ENST00000590194 FANCAO15360 1455 aa32.1■■■□□ 2.73
SLC25A39-212ENST00000590194 ARHGAP5Q13017 1502 aa32.09■■■□□ 2.73
SLC25A39-212ENST00000590194 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa32.08■■■□□ 2.73
SLC25A39-212ENST00000590194 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP32.08■■■□□ 2.73
SLC25A39-212ENST00000590194 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa32.07■■■□□ 2.72
SLC25A39-212ENST00000590194 PREX2Q70Z35 1606 aa32.06■■■□□ 2.72
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