RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590124.5

EFTUD2-217, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 899 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-217ENST00000590124 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa33.83■■■■□ 3.01
EFTUD2-217ENST00000590124 JPH4Q96JJ6 628 aa33.82■■■■□ 3
EFTUD2-217ENST00000590124 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP33.79■■■■□ 3
EFTUD2-217ENST00000590124 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa33.74■■■□□ 2.99
EFTUD2-217ENST00000590124 IQGAP2Q13576 1575 aa33.61■■■□□ 2.97
EFTUD2-217ENST00000590124 PRXQ9BXM0 1461 aa33.6■■■□□ 2.97
EFTUD2-217ENST00000590124 CHIC1Q5VXU3 224 aa33.5■■■□□ 2.95
EFTUD2-217ENST00000590124 EEA1Q15075 1411 aa33.49■■■□□ 2.95
EFTUD2-217ENST00000590124 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa33.47■■■□□ 2.95
EFTUD2-217ENST00000590124 CSRNP3Q8WYN3 585 aa33.46■■■□□ 2.95
EFTUD2-217ENST00000590124 UGGT2Q9NYU1 1516 aa33.44■■■□□ 2.94
EFTUD2-217ENST00000590124 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa33.43■■■□□ 2.94
EFTUD2-217ENST00000590124 DISP1Q96F81 1524 aa33.41■■■□□ 2.94
EFTUD2-217ENST00000590124 TRHP20396 242 aaPredicted RBP33.39■■■□□ 2.94
EFTUD2-217ENST00000590124 TNIKQ9UKE5 1360 aa33.35■■■□□ 2.93
EFTUD2-217ENST00000590124 ADCY10Q96PN6 1610 aa33.35■■■□□ 2.93
EFTUD2-217ENST00000590124 PTPRGP23470 1445 aa33.34■■■□□ 2.93
EFTUD2-217ENST00000590124 KIAA0556O60303 1618 aa33.31■■■□□ 2.92
EFTUD2-217ENST00000590124 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP33.26■■■□□ 2.91
EFTUD2-217ENST00000590124 KIF21BO75037 1637 aa33.2■■■□□ 2.9
EFTUD2-217ENST00000590124 GOLGA3Q08378 1498 aa33.19■■■□□ 2.9
EFTUD2-217ENST00000590124 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP33.19■■■□□ 2.9
EFTUD2-217ENST00000590124 MAPKBP1O60336 1514 aa33.18■■■□□ 2.9
EFTUD2-217ENST00000590124 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa33.15■■■□□ 2.9
EFTUD2-217ENST00000590124 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP33.15■■■□□ 2.9
EFTUD2-217ENST00000590124 UACAQ9BZF9 1416 aa33.13■■■□□ 2.89
EFTUD2-217ENST00000590124 ABCC2Q92887 1545 aa33.1■■■□□ 2.89
EFTUD2-217ENST00000590124 KIF13AQ9H1H9 1805 aa33.09■■■□□ 2.89
EFTUD2-217ENST00000590124 SAMD9Q5K651 1589 aa33.04■■■□□ 2.88
EFTUD2-217ENST00000590124 ABCC10Q5T3U5 1492 aa33.03■■■□□ 2.88
EFTUD2-217ENST00000590124 KDM5BQ9UGL1 1544 aa32.99■■■□□ 2.87
EFTUD2-217ENST00000590124 DIP2BQ9P265 1576 aa32.99■■■□□ 2.87
EFTUD2-217ENST00000590124 PLB1Q6P1J6 1458 aa32.98■■■□□ 2.87
EFTUD2-217ENST00000590124 ABCA8O94911 1581 aa32.97■■■□□ 2.87
EFTUD2-217ENST00000590124 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP32.92■■■□□ 2.86
EFTUD2-217ENST00000590124 P3H3Q8IVL6 736 aa32.91■■■□□ 2.86
EFTUD2-217ENST00000590124 FAM69CQ0P6D2 419 aa32.9■■■□□ 2.86
EFTUD2-217ENST00000590124 ASXL2Q76L83 1435 aa32.9■■■□□ 2.86
EFTUD2-217ENST00000590124 EFCAB5A4FU69 1503 aa32.82■■■□□ 2.85
EFTUD2-217ENST00000590124 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP32.81■■■□□ 2.84
EFTUD2-217ENST00000590124 EHMT2Q96KQ7 1210 aa32.81■■■□□ 2.84
EFTUD2-217ENST00000590124 UBTFP17480 764 aaKnown RBP32.8■■■□□ 2.84
EFTUD2-217ENST00000590124 FHOD3Q2V2M9 1422 aa32.77■■■□□ 2.84
EFTUD2-217ENST00000590124 GLI2P10070 1586 aa32.77■■■□□ 2.84
EFTUD2-217ENST00000590124 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa32.73■■■□□ 2.83
EFTUD2-217ENST00000590124 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP32.72■■■□□ 2.83
EFTUD2-217ENST00000590124 WDR7Q9Y4E6 1490 aa32.71■■■□□ 2.83
EFTUD2-217ENST00000590124 ATP10BO94823 1461 aa32.67■■■□□ 2.82
EFTUD2-217ENST00000590124 TSPOAP1O95153 1857 aa32.67■■■□□ 2.82
EFTUD2-217ENST00000590124 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa32.63■■■□□ 2.81
EFTUD2-217ENST00000590124 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP32.62■■■□□ 2.81
EFTUD2-217ENST00000590124 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa32.62■■■□□ 2.81
EFTUD2-217ENST00000590124 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP32.62■■■□□ 2.81
EFTUD2-217ENST00000590124 ARID3CA6NKF2 412 aa32.58■■■□□ 2.81
EFTUD2-217ENST00000590124 FMN1Q68DA7 1419 aa32.49■■■□□ 2.79
EFTUD2-217ENST00000590124 CFAP43Q8NDM7 1665 aa32.48■■■□□ 2.79
EFTUD2-217ENST00000590124 KCNH8Q96L42 1107 aa32.48■■■□□ 2.79
EFTUD2-217ENST00000590124 KDM6BO15054 1643 aa32.48■■■□□ 2.79
EFTUD2-217ENST00000590124 TEX14Q8IWB6 1497 aa32.42■■■□□ 2.78
EFTUD2-217ENST00000590124 CD109Q6YHK3 1445 aa32.41■■■□□ 2.78
EFTUD2-217ENST00000590124 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP32.4■■■□□ 2.78
EFTUD2-217ENST00000590124 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP32.4■■■□□ 2.78
EFTUD2-217ENST00000590124 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa32.4■■■□□ 2.78
EFTUD2-217ENST00000590124 HECW1Q76N89 1606 aa32.38■■■□□ 2.77
EFTUD2-217ENST00000590124 ABCA9Q8IUA7 1624 aa32.38■■■□□ 2.77
EFTUD2-217ENST00000590124 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP32.36■■■□□ 2.77
EFTUD2-217ENST00000590124 CLIP1P30622 1438 aa32.33■■■□□ 2.77
EFTUD2-217ENST00000590124 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP32.31■■■□□ 2.76
EFTUD2-217ENST00000590124 PLEKHD1A6NEE1 506 aa32.3■■■□□ 2.76
EFTUD2-217ENST00000590124 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa32.26■■■□□ 2.76
EFTUD2-217ENST00000590124 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP32.24■■■□□ 2.75
EFTUD2-217ENST00000590124 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP32.24■■■□□ 2.75
EFTUD2-217ENST00000590124 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa32.24■■■□□ 2.75
EFTUD2-217ENST00000590124 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP32.19■■■□□ 2.74
EFTUD2-217ENST00000590124 CEP162Q5TB80 1403 aa32.15■■■□□ 2.74
EFTUD2-217ENST00000590124 FYCO1Q9BQS8 1478 aa32.15■■■□□ 2.74
EFTUD2-217ENST00000590124 TTC37Q6PGP7 1564 aa32.15■■■□□ 2.74
EFTUD2-217ENST00000590124 ARAP3Q8WWN8 1544 aa32.13■■■□□ 2.73
EFTUD2-217ENST00000590124 CCDC18Q5T9S5 1454 aa32.11■■■□□ 2.73
EFTUD2-217ENST00000590124 NEO1Q92859 1461 aa32.11■■■□□ 2.73
EFTUD2-217ENST00000590124 PHLDB1Q86UU1 1377 aa32.11■■■□□ 2.73
EFTUD2-217ENST00000590124 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP32.11■■■□□ 2.73
EFTUD2-217ENST00000590124 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa32.1■■■□□ 2.73
EFTUD2-217ENST00000590124 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP32.09■■■□□ 2.73
EFTUD2-217ENST00000590124 KIF14Q15058 1648 aa32.05■■■□□ 2.72
EFTUD2-217ENST00000590124 CFAP74Q9C0B2 1584 aa31.99■■■□□ 2.71
EFTUD2-217ENST00000590124 FANCAO15360 1455 aa31.99■■■□□ 2.71
EFTUD2-217ENST00000590124 PLCH2O75038 1416 aa31.98■■■□□ 2.71
EFTUD2-217ENST00000590124 MYO5CQ9NQX4 1742 aa31.96■■■□□ 2.71
EFTUD2-217ENST00000590124 AKNAQ7Z591 1439 aa31.94■■■□□ 2.7
EFTUD2-217ENST00000590124 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa31.94■■■□□ 2.7
EFTUD2-217ENST00000590124 RAPGEF3O95398 923 aa31.89■■■□□ 2.7
EFTUD2-217ENST00000590124 RICTORQ6R327 1708 aa31.87■■■□□ 2.69
EFTUD2-217ENST00000590124 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP31.85■■■□□ 2.69
EFTUD2-217ENST00000590124 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa31.84■■■□□ 2.69
EFTUD2-217ENST00000590124 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP31.82■■■□□ 2.68
EFTUD2-217ENST00000590124 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa31.82■■■□□ 2.68
EFTUD2-217ENST00000590124 ADGRL1O94910 1474 aa31.81■■■□□ 2.68
EFTUD2-217ENST00000590124 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa31.81■■■□□ 2.68
EFTUD2-217ENST00000590124 PREX2Q70Z35 1606 aa31.81■■■□□ 2.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.6 ms