RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589446.5

SEH1L-206, Transcript of SEH1 like nucleoporin, humanhuman

TSL 5

Gene SEH1L, Length 655 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEH1L-206ENST00000589446 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa29.51■■■□□ 2.32
SEH1L-206ENST00000589446 CUL7Q14999 1698 aa29.51■■■□□ 2.31
SEH1L-206ENST00000589446 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa29.51■■■□□ 2.31
SEH1L-206ENST00000589446 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.49■■■□□ 2.31
SEH1L-206ENST00000589446 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP29.43■■■□□ 2.3
SEH1L-206ENST00000589446 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa29.29■■■□□ 2.28
SEH1L-206ENST00000589446 PTPRGP23470 1445 aa29.25■■■□□ 2.27
SEH1L-206ENST00000589446 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa29.23■■■□□ 2.27
SEH1L-206ENST00000589446 TNIKQ9UKE5 1360 aa29.21■■■□□ 2.27
SEH1L-206ENST00000589446 FAM69CQ0P6D2 419 aa29.19■■■□□ 2.26
SEH1L-206ENST00000589446 IQGAP2Q13576 1575 aa29.18■■■□□ 2.26
SEH1L-206ENST00000589446 MAPKBP1O60336 1514 aa29.16■■■□□ 2.26
SEH1L-206ENST00000589446 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP29.15■■■□□ 2.26
SEH1L-206ENST00000589446 ADCY10Q96PN6 1610 aa29.14■■■□□ 2.26
SEH1L-206ENST00000589446 ABCC10Q5T3U5 1492 aa29.14■■■□□ 2.26
SEH1L-206ENST00000589446 DISP1Q96F81 1524 aa29.02■■■□□ 2.24
SEH1L-206ENST00000589446 UGGT2Q9NYU1 1516 aa29.02■■■□□ 2.24
SEH1L-206ENST00000589446 KIF13AQ9H1H9 1805 aa29.01■■■□□ 2.23
SEH1L-206ENST00000589446 ABCC2Q92887 1545 aa29■■■□□ 2.23
SEH1L-206ENST00000589446 UACAQ9BZF9 1416 aa29■■■□□ 2.23
SEH1L-206ENST00000589446 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
SEH1L-206ENST00000589446 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa28.98■■■□□ 2.23
SEH1L-206ENST00000589446 DIP2BQ9P265 1576 aa28.96■■■□□ 2.23
SEH1L-206ENST00000589446 PRXQ9BXM0 1461 aa28.94■■■□□ 2.22
SEH1L-206ENST00000589446 PLB1Q6P1J6 1458 aa28.92■■■□□ 2.22
SEH1L-206ENST00000589446 GOLGA3Q08378 1498 aa28.91■■■□□ 2.22
SEH1L-206ENST00000589446 ASXL2Q76L83 1435 aa28.89■■■□□ 2.22
SEH1L-206ENST00000589446 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.22
SEH1L-206ENST00000589446 KIAA0556O60303 1618 aa28.87■■■□□ 2.21
SEH1L-206ENST00000589446 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.87■■■□□ 2.21
SEH1L-206ENST00000589446 KDM5BQ9UGL1 1544 aa28.83■■■□□ 2.21
SEH1L-206ENST00000589446 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa28.78■■■□□ 2.2
SEH1L-206ENST00000589446 EEA1Q15075 1411 aa28.77■■■□□ 2.2
SEH1L-206ENST00000589446 GLI2P10070 1586 aa28.75■■■□□ 2.19
SEH1L-206ENST00000589446 KDM6BO15054 1643 aa28.71■■■□□ 2.19
SEH1L-206ENST00000589446 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP28.69■■■□□ 2.18
SEH1L-206ENST00000589446 TSPOAP1O95153 1857 aa28.66■■■□□ 2.18
SEH1L-206ENST00000589446 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
SEH1L-206ENST00000589446 WDR7Q9Y4E6 1490 aa28.64■■■□□ 2.17
SEH1L-206ENST00000589446 P3H3Q8IVL6 736 aa28.62■■■□□ 2.17
SEH1L-206ENST00000589446 TEX14Q8IWB6 1497 aa28.61■■■□□ 2.17
SEH1L-206ENST00000589446 ABCA8O94911 1581 aa28.61■■■□□ 2.17
SEH1L-206ENST00000589446 KCNH8Q96L42 1107 aa28.57■■■□□ 2.16
SEH1L-206ENST00000589446 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa28.52■■■□□ 2.16
SEH1L-206ENST00000589446 CD109Q6YHK3 1445 aa28.49■■■□□ 2.15
SEH1L-206ENST00000589446 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
SEH1L-206ENST00000589446 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP28.47■■■□□ 2.15
SEH1L-206ENST00000589446 ARID3CA6NKF2 412 aa28.46■■■□□ 2.15
SEH1L-206ENST00000589446 SAMD9Q5K651 1589 aa28.45■■■□□ 2.15
SEH1L-206ENST00000589446 ATP10BO94823 1461 aa28.44■■■□□ 2.14
SEH1L-206ENST00000589446 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
SEH1L-206ENST00000589446 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
SEH1L-206ENST00000589446 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa28.43■■■□□ 2.14
SEH1L-206ENST00000589446 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.42■■■□□ 2.14
SEH1L-206ENST00000589446 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa28.41■■■□□ 2.14
SEH1L-206ENST00000589446 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP28.4■■■□□ 2.14
SEH1L-206ENST00000589446 KIF21BO75037 1637 aa28.37■■■□□ 2.13
SEH1L-206ENST00000589446 CFAP43Q8NDM7 1665 aa28.35■■■□□ 2.13
SEH1L-206ENST00000589446 UBTFP17480 764 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
SEH1L-206ENST00000589446 FHOD3Q2V2M9 1422 aa28.34■■■□□ 2.13
SEH1L-206ENST00000589446 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa28.33■■■□□ 2.13
SEH1L-206ENST00000589446 EFCAB5A4FU69 1503 aa28.31■■■□□ 2.12
SEH1L-206ENST00000589446 PHLDB1Q86UU1 1377 aa28.3■■■□□ 2.12
SEH1L-206ENST00000589446 PLEKHD1A6NEE1 506 aa28.29■■■□□ 2.12
SEH1L-206ENST00000589446 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
SEH1L-206ENST00000589446 EHMT2Q96KQ7 1210 aa28.23■■■□□ 2.11
SEH1L-206ENST00000589446 ARAP3Q8WWN8 1544 aa28.2■■■□□ 2.1
SEH1L-206ENST00000589446 ADGRL1O94910 1474 aa28.19■■■□□ 2.1
SEH1L-206ENST00000589446 ABCA9Q8IUA7 1624 aa28.18■■■□□ 2.1
SEH1L-206ENST00000589446 NEO1Q92859 1461 aa28.15■■■□□ 2.1
SEH1L-206ENST00000589446 FMN1Q68DA7 1419 aa28.14■■■□□ 2.1
SEH1L-206ENST00000589446 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
SEH1L-206ENST00000589446 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
SEH1L-206ENST00000589446 RAPGEF3O95398 923 aa28.06■■■□□ 2.08
SEH1L-206ENST00000589446 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa28.03■■■□□ 2.08
SEH1L-206ENST00000589446 FANCAO15360 1455 aa27.96■■■□□ 2.07
SEH1L-206ENST00000589446 AKNAQ7Z591 1439 aa27.96■■■□□ 2.07
SEH1L-206ENST00000589446 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP27.96■■■□□ 2.07
SEH1L-206ENST00000589446 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP27.96■■■□□ 2.072e-7■■■■□ 26.2
SEH1L-206ENST00000589446 HECW1Q76N89 1606 aa27.95■■■□□ 2.06
SEH1L-206ENST00000589446 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP27.95■■■□□ 2.06
SEH1L-206ENST00000589446 CFAP74Q9C0B2 1584 aa27.9■■■□□ 2.06
SEH1L-206ENST00000589446 PLCH2O75038 1416 aa27.89■■■□□ 2.06
SEH1L-206ENST00000589446 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP27.89■■■□□ 2.05
SEH1L-206ENST00000589446 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa27.87■■■□□ 2.05
SEH1L-206ENST00000589446 CLIP1P30622 1438 aa27.86■■■□□ 2.05
SEH1L-206ENST00000589446 TTC37Q6PGP7 1564 aa27.86■■■□□ 2.05
SEH1L-206ENST00000589446 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP27.83■■■□□ 2.05
SEH1L-206ENST00000589446 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa27.82■■■□□ 2.04
SEH1L-206ENST00000589446 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa27.8■■■□□ 2.04
SEH1L-206ENST00000589446 SCAPERQ9BY12 1400 aa27.79■■■□□ 2.04
SEH1L-206ENST00000589446 MAGI2Q86UL8 1455 aa27.78■■■□□ 2.04
SEH1L-206ENST00000589446 CCDC18Q5T9S5 1454 aa27.76■■■□□ 2.04
SEH1L-206ENST00000589446 KIF14Q15058 1648 aa27.75■■■□□ 2.03
SEH1L-206ENST00000589446 POGZQ7Z3K3 1410 aa27.74■■■□□ 2.03
SEH1L-206ENST00000589446 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa27.73■■■□□ 2.03
SEH1L-206ENST00000589446 RICTORQ6R327 1708 aa27.72■■■□□ 2.03
SEH1L-206ENST00000589446 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa27.72■■■□□ 2.03
SEH1L-206ENST00000589446 PTPRMP28827 1452 aa27.7■■■□□ 2.03
SEH1L-206ENST00000589446 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa27.7■■■□□ 2.02
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