RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588315.5

SLC25A39-210, Transcript of solute carrier family 25 member 39, humanhuman

TSL 2

Gene SLC25A39, Length 1,409 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A39-210ENST00000588315 SHROOM2Q13796 1616 aa34.2■■■■□ 3.06
SLC25A39-210ENST00000588315 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa34.17■■■■□ 3.06
SLC25A39-210ENST00000588315 JPH4Q96JJ6 628 aa34.08■■■■□ 3.05
SLC25A39-210ENST00000588315 PRXQ9BXM0 1461 aa34.05■■■■□ 3.04
SLC25A39-210ENST00000588315 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa34.04■■■■□ 3.04
SLC25A39-210ENST00000588315 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP34.03■■■■□ 3.04
SLC25A39-210ENST00000588315 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa34.03■■■■□ 3.04
SLC25A39-210ENST00000588315 CSRNP3Q8WYN3 585 aa33.99■■■■□ 3.03
SLC25A39-210ENST00000588315 KIF21BO75037 1637 aa33.83■■■■□ 3.01
SLC25A39-210ENST00000588315 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP33.8■■■■□ 3
SLC25A39-210ENST00000588315 IQGAP2Q13576 1575 aa33.77■■■■□ 3
SLC25A39-210ENST00000588315 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa33.71■■■□□ 2.99
SLC25A39-210ENST00000588315 TRHP20396 242 aaPredicted RBP33.7■■■□□ 2.99
SLC25A39-210ENST00000588315 DISP1Q96F81 1524 aa33.64■■■□□ 2.98
SLC25A39-210ENST00000588315 GOLGA3Q08378 1498 aa33.62■■■□□ 2.97
SLC25A39-210ENST00000588315 UGGT2Q9NYU1 1516 aa33.62■■■□□ 2.97
SLC25A39-210ENST00000588315 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa33.61■■■□□ 2.97
SLC25A39-210ENST00000588315 PTPRGP23470 1445 aa33.58■■■□□ 2.97
SLC25A39-210ENST00000588315 TNIKQ9UKE5 1360 aa33.57■■■□□ 2.96
SLC25A39-210ENST00000588315 ADCY10Q96PN6 1610 aa33.56■■■□□ 2.96
SLC25A39-210ENST00000588315 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP33.51■■■□□ 2.95
SLC25A39-210ENST00000588315 KIAA0556O60303 1618 aa33.49■■■□□ 2.95
SLC25A39-210ENST00000588315 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP33.37■■■□□ 2.93
SLC25A39-210ENST00000588315 MAPKBP1O60336 1514 aa33.36■■■□□ 2.93
SLC25A39-210ENST00000588315 UACAQ9BZF9 1416 aa33.35■■■□□ 2.93
SLC25A39-210ENST00000588315 SAMD9Q5K651 1589 aa33.34■■■□□ 2.93
SLC25A39-210ENST00000588315 UBTFP17480 764 aaKnown RBP33.34■■■□□ 2.93
SLC25A39-210ENST00000588315 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa33.33■■■□□ 2.93
SLC25A39-210ENST00000588315 ABCC2Q92887 1545 aa33.31■■■□□ 2.92
SLC25A39-210ENST00000588315 KIF13AQ9H1H9 1805 aa33.28■■■□□ 2.92
SLC25A39-210ENST00000588315 EFCAB5A4FU69 1503 aa33.27■■■□□ 2.92
SLC25A39-210ENST00000588315 ABCC10Q5T3U5 1492 aa33.26■■■□□ 2.92
SLC25A39-210ENST00000588315 EHMT2Q96KQ7 1210 aa33.24■■■□□ 2.91
SLC25A39-210ENST00000588315 PLB1Q6P1J6 1458 aa33.23■■■□□ 2.91
SLC25A39-210ENST00000588315 DIP2BQ9P265 1576 aa33.2■■■□□ 2.91
SLC25A39-210ENST00000588315 FAM69CQ0P6D2 419 aa33.19■■■□□ 2.9
SLC25A39-210ENST00000588315 P3H3Q8IVL6 736 aa33.19■■■□□ 2.9
SLC25A39-210ENST00000588315 KDM5BQ9UGL1 1544 aa33.19■■■□□ 2.9
SLC25A39-210ENST00000588315 ABCA8O94911 1581 aa33.16■■■□□ 2.9
SLC25A39-210ENST00000588315 ASXL2Q76L83 1435 aa33.15■■■□□ 2.9
SLC25A39-210ENST00000588315 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP33.1■■■□□ 2.89
SLC25A39-210ENST00000588315 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP33.1■■■□□ 2.89
SLC25A39-210ENST00000588315 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa33.09■■■□□ 2.89
SLC25A39-210ENST00000588315 FHOD3Q2V2M9 1422 aa33.06■■■□□ 2.88
SLC25A39-210ENST00000588315 CLIP1P30622 1438 aa32.98■■■□□ 2.87
SLC25A39-210ENST00000588315 GLI2P10070 1586 aa32.96■■■□□ 2.87
SLC25A39-210ENST00000588315 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa32.95■■■□□ 2.87
SLC25A39-210ENST00000588315 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP32.95■■■□□ 2.87
SLC25A39-210ENST00000588315 CEP162Q5TB80 1403 aa32.93■■■□□ 2.86
SLC25A39-210ENST00000588315 FMN1Q68DA7 1419 aa32.92■■■□□ 2.86
SLC25A39-210ENST00000588315 WDR7Q9Y4E6 1490 aa32.92■■■□□ 2.86
SLC25A39-210ENST00000588315 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa32.9■■■□□ 2.86
SLC25A39-210ENST00000588315 ATP10BO94823 1461 aa32.9■■■□□ 2.86
SLC25A39-210ENST00000588315 ARID3CA6NKF2 412 aa32.9■■■□□ 2.86
SLC25A39-210ENST00000588315 TSPOAP1O95153 1857 aa32.88■■■□□ 2.85
SLC25A39-210ENST00000588315 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP32.83■■■□□ 2.85
SLC25A39-210ENST00000588315 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP32.83■■■□□ 2.85
SLC25A39-210ENST00000588315 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa32.8■■■□□ 2.84
SLC25A39-210ENST00000588315 KCNH8Q96L42 1107 aa32.77■■■□□ 2.84
SLC25A39-210ENST00000588315 HECW1Q76N89 1606 aa32.74■■■□□ 2.83
SLC25A39-210ENST00000588315 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa32.69■■■□□ 2.82
SLC25A39-210ENST00000588315 KDM6BO15054 1643 aa32.69■■■□□ 2.82
SLC25A39-210ENST00000588315 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP32.68■■■□□ 2.82
SLC25A39-210ENST00000588315 FYCO1Q9BQS8 1478 aa32.66■■■□□ 2.82
SLC25A39-210ENST00000588315 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP32.64■■■□□ 2.82
SLC25A39-210ENST00000588315 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP32.64■■■□□ 2.82
SLC25A39-210ENST00000588315 CD109Q6YHK3 1445 aa32.64■■■□□ 2.82
SLC25A39-210ENST00000588315 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP32.62■■■□□ 2.81
SLC25A39-210ENST00000588315 CFAP43Q8NDM7 1665 aa32.62■■■□□ 2.81
SLC25A39-210ENST00000588315 TEX14Q8IWB6 1497 aa32.6■■■□□ 2.81
SLC25A39-210ENST00000588315 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa32.59■■■□□ 2.81
SLC25A39-210ENST00000588315 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP32.58■■■□□ 2.81
SLC25A39-210ENST00000588315 CCDC18Q5T9S5 1454 aa32.55■■■□□ 2.8
SLC25A39-210ENST00000588315 VPS8Q8N3P4 1428 aa32.54■■■□□ 2.8
SLC25A39-210ENST00000588315 ABCA9Q8IUA7 1624 aa32.54■■■□□ 2.8
SLC25A39-210ENST00000588315 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa32.51■■■□□ 2.79
SLC25A39-210ENST00000588315 PLEKHD1A6NEE1 506 aa32.51■■■□□ 2.79
SLC25A39-210ENST00000588315 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP32.48■■■□□ 2.79
SLC25A39-210ENST00000588315 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP32.39■■■□□ 2.784e-7■■■□□ 16.9
SLC25A39-210ENST00000588315 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP32.39■■■□□ 2.78
SLC25A39-210ENST00000588315 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP32.35■■■□□ 2.77
SLC25A39-210ENST00000588315 TTC37Q6PGP7 1564 aa32.34■■■□□ 2.77
SLC25A39-210ENST00000588315 ARAP3Q8WWN8 1544 aa32.32■■■□□ 2.76
SLC25A39-210ENST00000588315 NEO1Q92859 1461 aa32.29■■■□□ 2.76
SLC25A39-210ENST00000588315 MAP3K1Q13233 1512 aa32.29■■■□□ 2.76
SLC25A39-210ENST00000588315 PHLDB1Q86UU1 1377 aa32.27■■■□□ 2.76
SLC25A39-210ENST00000588315 TIAM1Q13009 1591 aa32.26■■■□□ 2.75
SLC25A39-210ENST00000588315 KIF14Q15058 1648 aa32.26■■■□□ 2.75
SLC25A39-210ENST00000588315 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa32.2■■■□□ 2.75
SLC25A39-210ENST00000588315 FANCAO15360 1455 aa32.19■■■□□ 2.74
SLC25A39-210ENST00000588315 RAPGEF3O95398 923 aa32.18■■■□□ 2.74
SLC25A39-210ENST00000588315 PLCH2O75038 1416 aa32.18■■■□□ 2.74
SLC25A39-210ENST00000588315 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa32.17■■■□□ 2.74
SLC25A39-210ENST00000588315 AKNAQ7Z591 1439 aa32.17■■■□□ 2.74
SLC25A39-210ENST00000588315 MTUS2Q5JR59 1369 aa32.16■■■□□ 2.74
SLC25A39-210ENST00000588315 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa32.14■■■□□ 2.74
SLC25A39-210ENST00000588315 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP32.12■■■□□ 2.73
SLC25A39-210ENST00000588315 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa32.1■■■□□ 2.73
SLC25A39-210ENST00000588315 CFAP74Q9C0B2 1584 aa32.09■■■□□ 2.73
SLC25A39-210ENST00000588315 MYO5CQ9NQX4 1742 aa32.07■■■□□ 2.72
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