RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586268.5

NEDD4L-215, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, humanhuman

TSL 3

Gene NEDD4L, Length 830 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4L-215ENST00000586268 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.52■■□□□ 1.23e-6■■■□□ 15.8
NEDD4L-215ENST00000586268 GRIN2BQ13224 1484 aa22.52■■□□□ 1.2
NEDD4L-215ENST00000586268 UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
NEDD4L-215ENST00000586268 ADAMTS12P58397 1594 aa22.44■■□□□ 1.18
NEDD4L-215ENST00000586268 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.41■■□□□ 1.18
NEDD4L-215ENST00000586268 CEP162Q5TB80 1403 aa22.38■■□□□ 1.17
NEDD4L-215ENST00000586268 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
NEDD4L-215ENST00000586268 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.36■■□□□ 1.17
NEDD4L-215ENST00000586268 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.29■■□□□ 1.16
NEDD4L-215ENST00000586268 SYNJ2O15056 1496 aa22.27■■□□□ 1.16
NEDD4L-215ENST00000586268 CLIP1P30622 1438 aa22.26■■□□□ 1.15
NEDD4L-215ENST00000586268 GRIN2AQ12879 1464 aa22.23■■□□□ 1.15
NEDD4L-215ENST00000586268 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa22.22■■□□□ 1.15
NEDD4L-215ENST00000586268 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
NEDD4L-215ENST00000586268 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.12■■□□□ 1.13
NEDD4L-215ENST00000586268 IQGAP2Q13576 1575 aa22.12■■□□□ 1.13
NEDD4L-215ENST00000586268 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.11■■□□□ 1.13
NEDD4L-215ENST00000586268 NUP160Q12769 1436 aa22.1■■□□□ 1.13
NEDD4L-215ENST00000586268 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.1■■□□□ 1.13
NEDD4L-215ENST00000586268 ARAP1Q96P48 1450 aa22.09■■□□□ 1.13
NEDD4L-215ENST00000586268 CEP170Q5SW79 1584 aa22.09■■□□□ 1.13
NEDD4L-215ENST00000586268 CHD1O14646 1710 aa22.08■■□□□ 1.12
NEDD4L-215ENST00000586268 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.06■■□□□ 1.12
NEDD4L-215ENST00000586268 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
NEDD4L-215ENST00000586268 SAMD9Q5K651 1589 aa22.05■■□□□ 1.12
NEDD4L-215ENST00000586268 FBLN2P98095 1184 aa22.04■■□□□ 1.12
NEDD4L-215ENST00000586268 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.03■■□□□ 1.12
NEDD4L-215ENST00000586268 FHOD3Q2V2M9 1422 aa21.93■■□□□ 1.1
NEDD4L-215ENST00000586268 KIAA0556O60303 1618 aa21.9■■□□□ 1.1
NEDD4L-215ENST00000586268 DISP1Q96F81 1524 aa21.89■■□□□ 1.09
NEDD4L-215ENST00000586268 FMN1Q68DA7 1419 aa21.88■■□□□ 1.09
NEDD4L-215ENST00000586268 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.86■■□□□ 1.09
NEDD4L-215ENST00000586268 P3H3Q8IVL6 736 aa21.86■■□□□ 1.09
NEDD4L-215ENST00000586268 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa21.86■■□□□ 1.09
NEDD4L-215ENST00000586268 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
NEDD4L-215ENST00000586268 SHROOM2Q13796 1616 aa21.84■■□□□ 1.09
NEDD4L-215ENST00000586268 JPH4Q96JJ6 628 aa21.83■■□□□ 1.09
NEDD4L-215ENST00000586268 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
NEDD4L-215ENST00000586268 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa21.82■■□□□ 1.08
NEDD4L-215ENST00000586268 DCAF8L1A6NGE4 600 aa21.82■■□□□ 1.08
NEDD4L-215ENST00000586268 FYCO1Q9BQS8 1478 aa21.82■■□□□ 1.08
NEDD4L-215ENST00000586268 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa21.8■■□□□ 1.08
NEDD4L-215ENST00000586268 MAP3K1Q13233 1512 aa21.77■■□□□ 1.08
NEDD4L-215ENST00000586268 APLP2Q06481 763 aa21.76■■□□□ 1.07
NEDD4L-215ENST00000586268 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
NEDD4L-215ENST00000586268 CFAP43Q8NDM7 1665 aa21.72■■□□□ 1.07
NEDD4L-215ENST00000586268 TIAM1Q13009 1591 aa21.71■■□□□ 1.07
NEDD4L-215ENST00000586268 HECW1Q76N89 1606 aa21.69■■□□□ 1.06
NEDD4L-215ENST00000586268 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
NEDD4L-215ENST00000586268 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa21.66■■□□□ 1.06
NEDD4L-215ENST00000586268 OSCARQ8IYS5 282 aa21.65■■□□□ 1.06
NEDD4L-215ENST00000586268 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.64■■□□□ 1.05
NEDD4L-215ENST00000586268 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
NEDD4L-215ENST00000586268 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa21.63■■□□□ 1.05
NEDD4L-215ENST00000586268 ERCC6L2Q5T890 1561 aa21.61■■□□□ 1.05
NEDD4L-215ENST00000586268 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
NEDD4L-215ENST00000586268 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
NEDD4L-215ENST00000586268 ABCA8O94911 1581 aa21.6■■□□□ 1.05
NEDD4L-215ENST00000586268 PTPRGP23470 1445 aa21.59■■□□□ 1.05
NEDD4L-215ENST00000586268 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
NEDD4L-215ENST00000586268 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa21.58■■□□□ 1.05
NEDD4L-215ENST00000586268 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.04
NEDD4L-215ENST00000586268 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
NEDD4L-215ENST00000586268 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
NEDD4L-215ENST00000586268 PLB1Q6P1J6 1458 aa21.57■■□□□ 1.04
NEDD4L-215ENST00000586268 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
NEDD4L-215ENST00000586268 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
NEDD4L-215ENST00000586268 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa21.5■■□□□ 1.03
NEDD4L-215ENST00000586268 UACAQ9BZF9 1416 aa21.49■■□□□ 1.03
NEDD4L-215ENST00000586268 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.46■■□□□ 1.03
NEDD4L-215ENST00000586268 ABCC2Q92887 1545 aa21.45■■□□□ 1.02
NEDD4L-215ENST00000586268 PCGF6Q9BYE7 350 aa21.45■■□□□ 1.02
NEDD4L-215ENST00000586268 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa21.45■■□□□ 1.02
NEDD4L-215ENST00000586268 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa21.45■■□□□ 1.02
NEDD4L-215ENST00000586268 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
NEDD4L-215ENST00000586268 ATP10BO94823 1461 aa21.4■■□□□ 1.02
NEDD4L-215ENST00000586268 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
NEDD4L-215ENST00000586268 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
NEDD4L-215ENST00000586268 RNF39Q9H2S5 420 aa21.38■■□□□ 1.01
NEDD4L-215ENST00000586268 ARHGEF11O15085 1522 aa21.38■■□□□ 1.01
NEDD4L-215ENST00000586268 ARID3CA6NKF2 412 aa21.37■■□□□ 1.01
NEDD4L-215ENST00000586268 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
NEDD4L-215ENST00000586268 NCOA2Q15596 1464 aa21.36■■□□□ 1.01
NEDD4L-215ENST00000586268 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
NEDD4L-215ENST00000586268 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.35■■□□□ 1.01
NEDD4L-215ENST00000586268 ADCY10Q96PN6 1610 aa21.33■■□□□ 1.01
NEDD4L-215ENST00000586268 KDM5BQ9UGL1 1544 aa21.33■■□□□ 1
NEDD4L-215ENST00000586268 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
NEDD4L-215ENST00000586268 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
NEDD4L-215ENST00000586268 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
NEDD4L-215ENST00000586268 CCNB3Q8WWL7 1395 aa21.29■■□□□ 1
NEDD4L-215ENST00000586268 PLEKHD1A6NEE1 506 aa21.27■■□□□ 1
NEDD4L-215ENST00000586268 MYOM3Q5VTT5 1437 aa21.27■■□□□ 1
NEDD4L-215ENST00000586268 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa21.26■□□□□ 0.99
NEDD4L-215ENST00000586268 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa21.26■□□□□ 0.99
NEDD4L-215ENST00000586268 KIF14Q15058 1648 aa21.26■□□□□ 0.99
NEDD4L-215ENST00000586268 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa21.26■□□□□ 0.99
NEDD4L-215ENST00000586268 FGD6Q6ZV73 1430 aa21.24■□□□□ 0.99
NEDD4L-215ENST00000586268 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP21.23■□□□□ 0.992e-19■■■■■ 288.6
NEDD4L-215ENST00000586268 MIA2Q96PC5 1412 aa21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.2 ms