RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576390.5

P4HB-223, Transcript of prolyl 4-hydroxylase subunit beta, human

TSL 4 BASIC

Gene P4HB, Length 439 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
P4HB-223	ENST00000576390	IGF1R	P08069	1367 aa		33.23	■■■□□ 2.91
P4HB-223	ENST00000576390	KIF27	Q86VH2	1401 aa		33.23	■■■□□ 2.91
P4HB-223	ENST00000576390	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		33.13	■■■□□ 2.89
P4HB-223	ENST00000576390	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		33.13	■■■□□ 2.89
P4HB-223	ENST00000576390	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		32.99	■■■□□ 2.87
P4HB-223	ENST00000576390	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		32.99	■■■□□ 2.87
P4HB-223	ENST00000576390	MAPKBP1	O60336	1514 aa		32.95	■■■□□ 2.87
P4HB-223	ENST00000576390	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		32.88	■■■□□ 2.85
P4HB-223	ENST00000576390	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	32.85	■■■□□ 2.85
P4HB-223	ENST00000576390	IQGAP2	Q13576	1575 aa		32.83	■■■□□ 2.85
P4HB-223	ENST00000576390	DIP2B	Q9P265	1576 aa		32.83	■■■□□ 2.85
P4HB-223	ENST00000576390	PTPRG	P23470	1445 aa		32.77	■■■□□ 2.84
P4HB-223	ENST00000576390	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		32.76	■■■□□ 2.83
P4HB-223	ENST00000576390	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		32.76	■■■□□ 2.83
P4HB-223	ENST00000576390	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		32.73	■■■□□ 2.83
P4HB-223	ENST00000576390	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		32.72	■■■□□ 2.83
P4HB-223	ENST00000576390	DISP1	Q96F81	1524 aa		32.68	■■■□□ 2.82
P4HB-223	ENST00000576390	ABCC2	Q92887	1545 aa		32.65	■■■□□ 2.82
P4HB-223	ENST00000576390	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	32.64	■■■□□ 2.82
P4HB-223	ENST00000576390	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		32.64	■■■□□ 2.82
P4HB-223	ENST00000576390	TSPOAP1	O95153	1857 aa		32.62	■■■□□ 2.81
P4HB-223	ENST00000576390	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		32.61	■■■□□ 2.81
P4HB-223	ENST00000576390	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	32.57	■■■□□ 2.8
P4HB-223	ENST00000576390	UACA	Q9BZF9	1416 aa		32.56	■■■□□ 2.8
P4HB-223	ENST00000576390	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		32.56	■■■□□ 2.8
P4HB-223	ENST00000576390	KIAA0556	O60303	1618 aa		32.55	■■■□□ 2.8
P4HB-223	ENST00000576390	KDM6B	O15054	1643 aa		32.51	■■■□□ 2.8
P4HB-223	ENST00000576390	ASXL2	Q76L83	1435 aa		32.51	■■■□□ 2.79
P4HB-223	ENST00000576390	GLI2	P10070	1586 aa		32.49	■■■□□ 2.79
P4HB-223	ENST00000576390	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		32.49	■■■□□ 2.79
P4HB-223	ENST00000576390	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		32.47	■■■□□ 2.79
P4HB-223	ENST00000576390	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	32.46	■■■□□ 2.79
P4HB-223	ENST00000576390	PRX	Q9BXM0	1461 aa		32.42	■■■□□ 2.78
P4HB-223	ENST00000576390	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	32.42	■■■□□ 2.78
P4HB-223	ENST00000576390	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	32.34	■■■□□ 2.77
P4HB-223	ENST00000576390	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		32.33	■■■□□ 2.77
P4HB-223	ENST00000576390	GOLGA3	Q08378	1498 aa		32.33	■■■□□ 2.77
P4HB-223	ENST00000576390	ABCA8	O94911	1581 aa		32.27	■■■□□ 2.76
P4HB-223	ENST00000576390	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		32.2	■■■□□ 2.75
P4HB-223	ENST00000576390	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		32.16	■■■□□ 2.74
P4HB-223	ENST00000576390	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	32.15	■■■□□ 2.74
P4HB-223	ENST00000576390	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		32.14	■■■□□ 2.74
P4HB-223	ENST00000576390	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		32.1	■■■□□ 2.73
P4HB-223	ENST00000576390	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		32.09	■■■□□ 2.73
P4HB-223	ENST00000576390	SAMD9	Q5K651	1589 aa		32.07	■■■□□ 2.72
P4HB-223	ENST00000576390	EEA1	Q15075	1411 aa		32.02	■■■□□ 2.72
P4HB-223	ENST00000576390	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		32.01	■■■□□ 2.72
P4HB-223	ENST00000576390	CD109	Q6YHK3	1445 aa		31.98	■■■□□ 2.71
P4HB-223	ENST00000576390	P3H3	Q8IVL6	736 aa		31.95	■■■□□ 2.71
P4HB-223	ENST00000576390	ATP10B	O94823	1461 aa		31.95	■■■□□ 2.7
P4HB-223	ENST00000576390	KCNH8	Q96L42	1107 aa		31.94	■■■□□ 2.7
P4HB-223	ENST00000576390	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		31.92	■■■□□ 2.7
P4HB-223	ENST00000576390	ADGRL1	O94910	1474 aa		31.9	■■■□□ 2.7
P4HB-223	ENST00000576390	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	31.89	■■■□□ 2.7
P4HB-223	ENST00000576390	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		31.85	■■■□□ 2.69
P4HB-223	ENST00000576390	KIF21B	O75037	1637 aa		31.82	■■■□□ 2.69
P4HB-223	ENST00000576390	ARID3C	A6NKF2	412 aa		31.82	■■■□□ 2.68
P4HB-223	ENST00000576390	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		31.77	■■■□□ 2.68
P4HB-223	ENST00000576390	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	31.77	■■■□□ 2.68
P4HB-223	ENST00000576390	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		31.75	■■■□□ 2.67
P4HB-223	ENST00000576390	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		31.71	■■■□□ 2.67
P4HB-223	ENST00000576390	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		31.68	■■■□□ 2.66
P4HB-223	ENST00000576390	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	31.66	■■■□□ 2.66
P4HB-223	ENST00000576390	NEO1	Q92859	1461 aa		31.63	■■■□□ 2.65
P4HB-223	ENST00000576390	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	31.61	■■■□□ 2.65
P4HB-223	ENST00000576390	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	31.61	■■■□□ 2.65
P4HB-223	ENST00000576390	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		31.54	■■■□□ 2.64
P4HB-223	ENST00000576390	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		31.52	■■■□□ 2.64
P4HB-223	ENST00000576390	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		31.52	■■■□□ 2.64
P4HB-223	ENST00000576390	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	31.49	■■■□□ 2.63	1e-22	■■□□□ 13.7
P4HB-223	ENST00000576390	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		31.48	■■■□□ 2.63
P4HB-223	ENST00000576390	RAPGEF3	O95398	923 aa		31.48	■■■□□ 2.63
P4HB-223	ENST00000576390	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		31.45	■■■□□ 2.63
P4HB-223	ENST00000576390	RICTOR	Q6R327	1708 aa		31.45	■■■□□ 2.63
P4HB-223	ENST00000576390	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	31.44	■■■□□ 2.62
P4HB-223	ENST00000576390	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		31.44	■■■□□ 2.62
P4HB-223	ENST00000576390	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		31.44	■■■□□ 2.62
P4HB-223	ENST00000576390	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		31.41	■■■□□ 2.62
P4HB-223	ENST00000576390	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	31.41	■■■□□ 2.62
P4HB-223	ENST00000576390	AKNA	Q7Z591	1439 aa		31.39	■■■□□ 2.62
P4HB-223	ENST00000576390	FANCA	O15360	1455 aa		31.39	■■■□□ 2.62
P4HB-223	ENST00000576390	FMN1	Q68DA7	1419 aa		31.38	■■■□□ 2.61
P4HB-223	ENST00000576390	HECW1	Q76N89	1606 aa		31.38	■■■□□ 2.61
P4HB-223	ENST00000576390	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	31.37	■■■□□ 2.61
P4HB-223	ENST00000576390	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		31.36	■■■□□ 2.61
P4HB-223	ENST00000576390	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		31.35	■■■□□ 2.61
P4HB-223	ENST00000576390	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		31.34	■■■□□ 2.61
P4HB-223	ENST00000576390	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		31.3	■■■□□ 2.6
P4HB-223	ENST00000576390	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		31.29	■■■□□ 2.6
P4HB-223	ENST00000576390	PTPRM	P28827	1452 aa		31.28	■■■□□ 2.6
P4HB-223	ENST00000576390	PLCH2	O75038	1416 aa		31.26	■■■□□ 2.6
P4HB-223	ENST00000576390	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		31.26	■■■□□ 2.59
P4HB-223	ENST00000576390	MADD	Q8WXG6	1647 aa		31.25	■■■□□ 2.59
P4HB-223	ENST00000576390	KIF14	Q15058	1648 aa		31.21	■■■□□ 2.59
P4HB-223	ENST00000576390	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		31.2	■■■□□ 2.58
P4HB-223	ENST00000576390	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		31.19	■■■□□ 2.58
P4HB-223	ENST00000576390	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		31.19	■■■□□ 2.58
P4HB-223	ENST00000576390	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	31.18	■■■□□ 2.58
P4HB-223	ENST00000576390	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	31.17	■■■□□ 2.58
P4HB-223	ENST00000576390	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	31.16	■■■□□ 2.58

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