RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574236.5

PHF23-208, Transcript of PHD finger protein 23, humanhuman

TSL 3

Gene PHF23, Length 583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF23-208ENST00000574236 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP40.19■■■■■ 4.02
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PHF23-208ENST00000574236 KIF13AQ9H1H9 1805 aa39.69■■■■□ 3.94
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PHF23-208ENST00000574236 PTPRGP23470 1445 aa39.59■■■■□ 3.93
PHF23-208ENST00000574236 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa39.59■■■■□ 3.93
PHF23-208ENST00000574236 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP39.58■■■■□ 3.93
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PHF23-208ENST00000574236 PRXQ9BXM0 1461 aa39.54■■■■□ 3.92
PHF23-208ENST00000574236 MAPKBP1O60336 1514 aa39.54■■■■□ 3.92
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PHF23-208ENST00000574236 ABCC2Q92887 1545 aa39.35■■■■□ 3.89
PHF23-208ENST00000574236 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa39.33■■■■□ 3.89
PHF23-208ENST00000574236 UACAQ9BZF9 1416 aa39.32■■■■□ 3.89
PHF23-208ENST00000574236 CSRNP3Q8WYN3 585 aa39.28■■■■□ 3.88
PHF23-208ENST00000574236 TSPOAP1O95153 1857 aa39.21■■■■□ 3.87
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PHF23-208ENST00000574236 KDM5BQ9UGL1 1544 aa39.16■■■■□ 3.86
PHF23-208ENST00000574236 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP39.16■■■■□ 3.86
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PHF23-208ENST00000574236 PLB1Q6P1J6 1458 aa39.13■■■■□ 3.85
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PHF23-208ENST00000574236 CHIC1Q5VXU3 224 aa39.03■■■■□ 3.84
PHF23-208ENST00000574236 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP39.01■■■■□ 3.84
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PHF23-208ENST00000574236 P3H3Q8IVL6 736 aa38.99■■■■□ 3.83
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PHF23-208ENST00000574236 KIF21BO75037 1637 aa38.93■■■■□ 3.82
PHF23-208ENST00000574236 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa38.89■■■■□ 3.82
PHF23-208ENST00000574236 WDR7Q9Y4E6 1490 aa38.86■■■■□ 3.81
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PHF23-208ENST00000574236 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa38.74■■■■□ 3.79
PHF23-208ENST00000574236 ATP10BO94823 1461 aa38.73■■■■□ 3.79
PHF23-208ENST00000574236 FHOD3Q2V2M9 1422 aa38.72■■■■□ 3.79
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PHF23-208ENST00000574236 KCNH8Q96L42 1107 aa38.67■■■■□ 3.78
PHF23-208ENST00000574236 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP38.66■■■■□ 3.78
PHF23-208ENST00000574236 CFAP43Q8NDM7 1665 aa38.64■■■■□ 3.78
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PHF23-208ENST00000574236 TEX14Q8IWB6 1497 aa38.6■■■■□ 3.77
PHF23-208ENST00000574236 EFCAB5A4FU69 1503 aa38.6■■■■□ 3.77
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PHF23-208ENST00000574236 CD109Q6YHK3 1445 aa38.56■■■■□ 3.76
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PHF23-208ENST00000574236 ABCA9Q8IUA7 1624 aa38.45■■■■□ 3.75
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PHF23-208ENST00000574236 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP38.41■■■■□ 3.74
PHF23-208ENST00000574236 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa38.4■■■■□ 3.74
PHF23-208ENST00000574236 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa38.35■■■■□ 3.73
PHF23-208ENST00000574236 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP38.29■■■■□ 3.72
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PHF23-208ENST00000574236 ARAP3Q8WWN8 1544 aa38.21■■■■□ 3.71
PHF23-208ENST00000574236 FMN1Q68DA7 1419 aa38.21■■■■□ 3.71
PHF23-208ENST00000574236 HECW1Q76N89 1606 aa38.18■■■■□ 3.7
PHF23-208ENST00000574236 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP38.16■■■■□ 3.7
PHF23-208ENST00000574236 ADGRL1O94910 1474 aa38.15■■■■□ 3.7
PHF23-208ENST00000574236 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa38.15■■■■□ 3.7
PHF23-208ENST00000574236 TTC37Q6PGP7 1564 aa38.14■■■■□ 3.7
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PHF23-208ENST00000574236 CLIP1P30622 1438 aa37.89■■■■□ 3.66
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PHF23-208ENST00000574236 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa37.75■■■■□ 3.63
PHF23-208ENST00000574236 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa37.71■■■■□ 3.63
PHF23-208ENST00000574236 SCAPERQ9BY12 1400 aa37.7■■■■□ 3.63
PHF23-208ENST00000574236 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa37.7■■■■□ 3.63
PHF23-208ENST00000574236 ADAMTSL3P82987 1691 aa37.69■■■■□ 3.62
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