RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566783.1

RNPS1-221, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, humanhuman

Gene RNPS1, Length 1,826 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPS1-221ENST00000566783 ADAMTS12P58397 1594 aa22.45■■□□□ 1.18
RNPS1-221ENST00000566783 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
RNPS1-221ENST00000566783 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.4■■□□□ 1.18
RNPS1-221ENST00000566783 APLP2Q06481 763 aa22.39■■□□□ 1.17
RNPS1-221ENST00000566783 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.35■■□□□ 1.17
RNPS1-221ENST00000566783 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.33■■□□□ 1.16
RNPS1-221ENST00000566783 P3H3Q8IVL6 736 aa22.27■■□□□ 1.16
RNPS1-221ENST00000566783 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.27■■□□□ 1.15
RNPS1-221ENST00000566783 SAMD9Q5K651 1589 aa22.24■■□□□ 1.15
RNPS1-221ENST00000566783 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
RNPS1-221ENST00000566783 HRCP23327 699 aa22.24■■□□□ 1.15
RNPS1-221ENST00000566783 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
RNPS1-221ENST00000566783 IQGAP2Q13576 1575 aa22.22■■□□□ 1.15
RNPS1-221ENST00000566783 GRIN2AQ12879 1464 aa22.2■■□□□ 1.14
RNPS1-221ENST00000566783 SYNJ2O15056 1496 aa22.16■■□□□ 1.14
RNPS1-221ENST00000566783 TIAM1Q13009 1591 aa22.16■■□□□ 1.14
RNPS1-221ENST00000566783 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
RNPS1-221ENST00000566783 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.14■■□□□ 1.13
RNPS1-221ENST00000566783 FMN1Q68DA7 1419 aa22.13■■□□□ 1.13
RNPS1-221ENST00000566783 MAP3K1Q13233 1512 aa22.13■■□□□ 1.13
RNPS1-221ENST00000566783 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.13■■□□□ 1.13
RNPS1-221ENST00000566783 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.11■■□□□ 1.13
RNPS1-221ENST00000566783 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
RNPS1-221ENST00000566783 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.1■■□□□ 1.13
RNPS1-221ENST00000566783 CEP170Q5SW79 1584 aa22.08■■□□□ 1.13
RNPS1-221ENST00000566783 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.08■■□□□ 1.13
RNPS1-221ENST00000566783 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
RNPS1-221ENST00000566783 FBLN2P98095 1184 aa22.06■■□□□ 1.12
RNPS1-221ENST00000566783 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.03■■□□□ 1.12
RNPS1-221ENST00000566783 KIAA0556O60303 1618 aa22■■□□□ 1.11
RNPS1-221ENST00000566783 NUP160Q12769 1436 aa22■■□□□ 1.11
RNPS1-221ENST00000566783 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa21.98■■□□□ 1.11
RNPS1-221ENST00000566783 DISP1Q96F81 1524 aa21.97■■□□□ 1.11
RNPS1-221ENST00000566783 CHD1O14646 1710 aa21.94■■□□□ 1.1
RNPS1-221ENST00000566783 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
RNPS1-221ENST00000566783 HECW1Q76N89 1606 aa21.93■■□□□ 1.1
RNPS1-221ENST00000566783 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
RNPS1-221ENST00000566783 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
RNPS1-221ENST00000566783 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.87■■□□□ 1.09
RNPS1-221ENST00000566783 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
RNPS1-221ENST00000566783 CCNB3Q8WWL7 1395 aa21.86■■□□□ 1.09
RNPS1-221ENST00000566783 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.84■■□□□ 1.09
RNPS1-221ENST00000566783 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.84■■□□□ 1.09
RNPS1-221ENST00000566783 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
RNPS1-221ENST00000566783 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa21.83■■□□□ 1.08
RNPS1-221ENST00000566783 JPH4Q96JJ6 628 aa21.83■■□□□ 1.08
RNPS1-221ENST00000566783 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
RNPS1-221ENST00000566783 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa21.82■■□□□ 1.08
RNPS1-221ENST00000566783 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa21.81■■□□□ 1.08
RNPS1-221ENST00000566783 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
RNPS1-221ENST00000566783 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
RNPS1-221ENST00000566783 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa21.77■■□□□ 1.08
RNPS1-221ENST00000566783 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
RNPS1-221ENST00000566783 ARID3CA6NKF2 412 aa21.73■■□□□ 1.07
RNPS1-221ENST00000566783 NCOA2Q15596 1464 aa21.73■■□□□ 1.07
RNPS1-221ENST00000566783 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
RNPS1-221ENST00000566783 PLB1Q6P1J6 1458 aa21.7■■□□□ 1.07
RNPS1-221ENST00000566783 SHROOM2Q13796 1616 aa21.7■■□□□ 1.06
RNPS1-221ENST00000566783 ITGAEP38570 1179 aa21.69■■□□□ 1.06
RNPS1-221ENST00000566783 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
RNPS1-221ENST00000566783 FGD6Q6ZV73 1430 aa21.68■■□□□ 1.06
RNPS1-221ENST00000566783 ARHGEF11O15085 1522 aa21.66■■□□□ 1.06
RNPS1-221ENST00000566783 MYOM3Q5VTT5 1437 aa21.65■■□□□ 1.06
RNPS1-221ENST00000566783 ABCA8O94911 1581 aa21.64■■□□□ 1.06
RNPS1-221ENST00000566783 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.62■■□□□ 1.05
RNPS1-221ENST00000566783 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP21.61■■□□□ 1.05
RNPS1-221ENST00000566783 PTPRGP23470 1445 aa21.58■■□□□ 1.05
RNPS1-221ENST00000566783 PTPN23Q9H3S7 1636 aa21.58■■□□□ 1.04
RNPS1-221ENST00000566783 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
RNPS1-221ENST00000566783 ERCC6L2Q5T890 1561 aa21.56■■□□□ 1.04
RNPS1-221ENST00000566783 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
RNPS1-221ENST00000566783 ADCY10Q96PN6 1610 aa21.5■■□□□ 1.03
RNPS1-221ENST00000566783 ATP10BO94823 1461 aa21.5■■□□□ 1.03
RNPS1-221ENST00000566783 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
RNPS1-221ENST00000566783 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa21.49■■□□□ 1.03
RNPS1-221ENST00000566783 MIA2Q96PC5 1412 aa21.48■■□□□ 1.03
RNPS1-221ENST00000566783 SETD5Q9C0A6 1442 aa21.48■■□□□ 1.03
RNPS1-221ENST00000566783 KIF14Q15058 1648 aa21.48■■□□□ 1.03
RNPS1-221ENST00000566783 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
RNPS1-221ENST00000566783 UACAQ9BZF9 1416 aa21.47■■□□□ 1.03
RNPS1-221ENST00000566783 ITSN2Q9NZM3 1697 aa21.44■■□□□ 1.02
RNPS1-221ENST00000566783 PTPRKQ15262 1439 aa21.43■■□□□ 1.02
RNPS1-221ENST00000566783 ABCC2Q92887 1545 aa21.42■■□□□ 1.02
RNPS1-221ENST00000566783 PLEKHD1A6NEE1 506 aa21.41■■□□□ 1.02
RNPS1-221ENST00000566783 CLSPNQ9HAW4 1339 aa21.37■■□□□ 1.01
RNPS1-221ENST00000566783 HFM1A2PYH4 1435 aa21.36■■□□□ 1.01
RNPS1-221ENST00000566783 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
RNPS1-221ENST00000566783 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa21.33■■□□□ 1.01
RNPS1-221ENST00000566783 ABCC10Q5T3U5 1492 aa21.33■■□□□ 1.01
RNPS1-221ENST00000566783 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa21.32■■□□□ 1
RNPS1-221ENST00000566783 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
RNPS1-221ENST00000566783 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
RNPS1-221ENST00000566783 GCC2Q8IWJ2 1684 aa21.31■■□□□ 1
RNPS1-221ENST00000566783 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa21.31■■□□□ 1
RNPS1-221ENST00000566783 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
RNPS1-221ENST00000566783 NAIPQ13075 1403 aa21.3■■□□□ 1
RNPS1-221ENST00000566783 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
RNPS1-221ENST00000566783 DAPK1P53355 1430 aa21.3■■□□□ 1
RNPS1-221ENST00000566783 OSCARQ8IYS5 282 aa21.29■■□□□ 1
RNPS1-221ENST00000566783 CHIC2Q9UKJ5 165 aa21.29■■□□□ 1
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