RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565787.1

CHTF18-216, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

TSL 5

Gene CHTF18, Length 607 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-216ENST00000565787 JPH4Q96JJ6 628 aa40.37■■■■■ 4.05
CHTF18-216ENST00000565787 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa40.37■■■■■ 4.05
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CHTF18-216ENST00000565787 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa40.21■■■■■ 4.03
CHTF18-216ENST00000565787 IQGAP2Q13576 1575 aa40.11■■■■■ 4.01
CHTF18-216ENST00000565787 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.03■■■■■ 4
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CHTF18-216ENST00000565787 ADCY10Q96PN6 1610 aa39.86■■■■□ 3.97
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CHTF18-216ENST00000565787 PTPRGP23470 1445 aa39.81■■■■□ 3.96
CHTF18-216ENST00000565787 CHIC1Q5VXU3 224 aa39.76■■■■□ 3.96
CHTF18-216ENST00000565787 KIAA0556O60303 1618 aa39.74■■■■□ 3.95
CHTF18-216ENST00000565787 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP39.66■■■■□ 3.94
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CHTF18-216ENST00000565787 ABCC2Q92887 1545 aa39.55■■■■□ 3.92
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CHTF18-216ENST00000565787 KDM5BQ9UGL1 1544 aa39.38■■■■□ 3.89
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CHTF18-216ENST00000565787 TSPOAP1O95153 1857 aa39.16■■■■□ 3.86
CHTF18-216ENST00000565787 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP39.12■■■■□ 3.85
CHTF18-216ENST00000565787 EFCAB5A4FU69 1503 aa39.11■■■■□ 3.85
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CHTF18-216ENST00000565787 ABCA9Q8IUA7 1624 aa38.67■■■■□ 3.78
CHTF18-216ENST00000565787 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP38.61■■■■□ 3.77
CHTF18-216ENST00000565787 HECW1Q76N89 1606 aa38.61■■■■□ 3.77
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CHTF18-216ENST00000565787 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa38.47■■■■□ 3.75
CHTF18-216ENST00000565787 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP38.46■■■■□ 3.75
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CHTF18-216ENST00000565787 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP38.41■■■■□ 3.74
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CHTF18-216ENST00000565787 PHLDB1Q86UU1 1377 aa38.34■■■■□ 3.73
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CHTF18-216ENST00000565787 KIF14Q15058 1648 aa38.23■■■■□ 3.71
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CHTF18-216ENST00000565787 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa38.12■■■■□ 3.69
CHTF18-216ENST00000565787 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa38.11■■■■□ 3.69
CHTF18-216ENST00000565787 RAPGEF3O95398 923 aa38.11■■■■□ 3.69
CHTF18-216ENST00000565787 RICTORQ6R327 1708 aa38.09■■■■□ 3.69
CHTF18-216ENST00000565787 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP38.06■■■■□ 3.68
CHTF18-216ENST00000565787 ADGRL1O94910 1474 aa38.04■■■■□ 3.68
CHTF18-216ENST00000565787 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa37.97■■■■□ 3.67
CHTF18-216ENST00000565787 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa37.96■■■■□ 3.67
CHTF18-216ENST00000565787 PREX2Q70Z35 1606 aa37.95■■■■□ 3.67
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