RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561718.5

RNPS1-205, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RNPS1, Length 1,806 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPS1-205ENST00000561718 APLP2Q06481 763 aa27.9■■■□□ 2.06
RNPS1-205ENST00000561718 EFCAB5A4FU69 1503 aa27.9■■■□□ 2.06
RNPS1-205ENST00000561718 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
RNPS1-205ENST00000561718 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
RNPS1-205ENST00000561718 HRCP23327 699 aa27.77■■■□□ 2.04
RNPS1-205ENST00000561718 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.73■■■□□ 2.03
RNPS1-205ENST00000561718 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP27.73■■■□□ 2.03
RNPS1-205ENST00000561718 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.73■■■□□ 2.03
RNPS1-205ENST00000561718 SAMD9Q5K651 1589 aa27.72■■■□□ 2.03
RNPS1-205ENST00000561718 MAP3K1Q13233 1512 aa27.7■■■□□ 2.02
RNPS1-205ENST00000561718 IQGAP2Q13576 1575 aa27.67■■■□□ 2.02
RNPS1-205ENST00000561718 FHOD3Q2V2M9 1422 aa27.66■■■□□ 2.02
RNPS1-205ENST00000561718 FMN1Q68DA7 1419 aa27.63■■■□□ 2.01
RNPS1-205ENST00000561718 GRIN2AQ12879 1464 aa27.63■■■□□ 2.01
RNPS1-205ENST00000561718 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP27.63■■■□□ 2.01
RNPS1-205ENST00000561718 FYCO1Q9BQS8 1478 aa27.62■■■□□ 2.01
RNPS1-205ENST00000561718 TIAM1Q13009 1591 aa27.61■■■□□ 2.01
RNPS1-205ENST00000561718 SYNJ2O15056 1496 aa27.6■■■□□ 2.01
RNPS1-205ENST00000561718 P3H3Q8IVL6 736 aa27.58■■■□□ 2.01
RNPS1-205ENST00000561718 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa27.57■■■□□ 2
RNPS1-205ENST00000561718 CFAP43Q8NDM7 1665 aa27.57■■■□□ 2
RNPS1-205ENST00000561718 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa27.56■■■□□ 2
RNPS1-205ENST00000561718 UGGT2Q9NYU1 1516 aa27.53■■■□□ 2
RNPS1-205ENST00000561718 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
RNPS1-205ENST00000561718 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.47■■□□□ 1.99
RNPS1-205ENST00000561718 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa27.45■■□□□ 1.99
RNPS1-205ENST00000561718 CEP170Q5SW79 1584 aa27.42■■□□□ 1.98
RNPS1-205ENST00000561718 NUP160Q12769 1436 aa27.42■■□□□ 1.98
RNPS1-205ENST00000561718 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.98
RNPS1-205ENST00000561718 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.97
RNPS1-205ENST00000561718 KIAA0556O60303 1618 aa27.38■■□□□ 1.97
RNPS1-205ENST00000561718 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
RNPS1-205ENST00000561718 DISP1Q96F81 1524 aa27.34■■□□□ 1.97
RNPS1-205ENST00000561718 HECW1Q76N89 1606 aa27.33■■□□□ 1.97
RNPS1-205ENST00000561718 FBLN2P98095 1184 aa27.33■■□□□ 1.97
RNPS1-205ENST00000561718 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa27.31■■□□□ 1.96
RNPS1-205ENST00000561718 CCDC18Q5T9S5 1454 aa27.3■■□□□ 1.96
RNPS1-205ENST00000561718 CCNB3Q8WWL7 1395 aa27.27■■□□□ 1.96
RNPS1-205ENST00000561718 CHD1O14646 1710 aa27.22■■□□□ 1.95
RNPS1-205ENST00000561718 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
RNPS1-205ENST00000561718 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa27.22■■□□□ 1.95
RNPS1-205ENST00000561718 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa27.2■■□□□ 1.95
RNPS1-205ENST00000561718 MTUS2Q5JR59 1369 aa27.2■■□□□ 1.94
RNPS1-205ENST00000561718 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
RNPS1-205ENST00000561718 PHLDB1Q86UU1 1377 aa27.18■■□□□ 1.94
RNPS1-205ENST00000561718 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
RNPS1-205ENST00000561718 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
RNPS1-205ENST00000561718 JPH4Q96JJ6 628 aa27.16■■□□□ 1.94
RNPS1-205ENST00000561718 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa27.15■■□□□ 1.94
RNPS1-205ENST00000561718 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.94
RNPS1-205ENST00000561718 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP27.07■■□□□ 1.923e-6■■■■□ 26.4
RNPS1-205ENST00000561718 NCOA2Q15596 1464 aa27.06■■□□□ 1.92
RNPS1-205ENST00000561718 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
RNPS1-205ENST00000561718 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa27.06■■□□□ 1.92
RNPS1-205ENST00000561718 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
RNPS1-205ENST00000561718 ARHGEF11O15085 1522 aa27.04■■□□□ 1.92
RNPS1-205ENST00000561718 SHROOM2Q13796 1616 aa27.03■■□□□ 1.92
RNPS1-205ENST00000561718 FGD6Q6ZV73 1430 aa27.02■■□□□ 1.92
RNPS1-205ENST00000561718 MYOM3Q5VTT5 1437 aa27■■□□□ 1.91
RNPS1-205ENST00000561718 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
RNPS1-205ENST00000561718 PLB1Q6P1J6 1458 aa26.96■■□□□ 1.91
RNPS1-205ENST00000561718 ABCA8O94911 1581 aa26.95■■□□□ 1.91
RNPS1-205ENST00000561718 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
RNPS1-205ENST00000561718 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
RNPS1-205ENST00000561718 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.91■■□□□ 1.9
RNPS1-205ENST00000561718 ITGAEP38570 1179 aa26.88■■□□□ 1.89
RNPS1-205ENST00000561718 PTPRGP23470 1445 aa26.86■■□□□ 1.89
RNPS1-205ENST00000561718 PTPN23Q9H3S7 1636 aa26.86■■□□□ 1.89
RNPS1-205ENST00000561718 ARID3CA6NKF2 412 aa26.85■■□□□ 1.89
RNPS1-205ENST00000561718 MIA2Q96PC5 1412 aa26.84■■□□□ 1.89
RNPS1-205ENST00000561718 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
RNPS1-205ENST00000561718 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
RNPS1-205ENST00000561718 ADCY10Q96PN6 1610 aa26.81■■□□□ 1.88
RNPS1-205ENST00000561718 CLSPNQ9HAW4 1339 aa26.81■■□□□ 1.88
RNPS1-205ENST00000561718 SETD5Q9C0A6 1442 aa26.8■■□□□ 1.88
RNPS1-205ENST00000561718 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
RNPS1-205ENST00000561718 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa26.77■■□□□ 1.88
RNPS1-205ENST00000561718 ATP10BO94823 1461 aa26.75■■□□□ 1.87
RNPS1-205ENST00000561718 UACAQ9BZF9 1416 aa26.74■■□□□ 1.87
RNPS1-205ENST00000561718 ITSN2Q9NZM3 1697 aa26.73■■□□□ 1.87
RNPS1-205ENST00000561718 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.72■■□□□ 1.87
RNPS1-205ENST00000561718 KIF14Q15058 1648 aa26.68■■□□□ 1.86
RNPS1-205ENST00000561718 PLEKHD1A6NEE1 506 aa26.67■■□□□ 1.86
RNPS1-205ENST00000561718 ABCC2Q92887 1545 aa26.67■■□□□ 1.86
RNPS1-205ENST00000561718 HFM1A2PYH4 1435 aa26.66■■□□□ 1.86
RNPS1-205ENST00000561718 PTPRKQ15262 1439 aa26.65■■□□□ 1.86
RNPS1-205ENST00000561718 AKNAQ7Z591 1439 aa26.61■■□□□ 1.85
RNPS1-205ENST00000561718 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
RNPS1-205ENST00000561718 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa26.59■■□□□ 1.85
RNPS1-205ENST00000561718 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
RNPS1-205ENST00000561718 ABCC10Q5T3U5 1492 aa26.57■■□□□ 1.84
RNPS1-205ENST00000561718 GCC2Q8IWJ2 1684 aa26.57■■□□□ 1.84
RNPS1-205ENST00000561718 NAIPQ13075 1403 aa26.55■■□□□ 1.84
RNPS1-205ENST00000561718 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa26.55■■□□□ 1.84
RNPS1-205ENST00000561718 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa26.53■■□□□ 1.84
RNPS1-205ENST00000561718 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
RNPS1-205ENST00000561718 DAPK1P53355 1430 aa26.52■■□□□ 1.84
RNPS1-205ENST00000561718 MAPKBP1O60336 1514 aa26.5■■□□□ 1.83
RNPS1-205ENST00000561718 ROCK1Q13464 1354 aa26.48■■□□□ 1.83
RNPS1-205ENST00000561718 KDM5BQ9UGL1 1544 aa26.48■■□□□ 1.83
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