RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558895.5

SEMA4B-206, Transcript of semaphorin 4B, humanhuman

TSL 4

Gene SEMA4B, Length 533 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4B-206ENST00000558895 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa41.39■■■■■ 4.22
SEMA4B-206ENST00000558895 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa41.33■■■■■ 4.21
SEMA4B-206ENST00000558895 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP41.3■■■■■ 4.2
SEMA4B-206ENST00000558895 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.29■■■■■ 4.2
SEMA4B-206ENST00000558895 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.21■■■■■ 4.19
SEMA4B-206ENST00000558895 EEA1Q15075 1411 aa41.15■■■■■ 4.18
SEMA4B-206ENST00000558895 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.14■■■■■ 4.18
SEMA4B-206ENST00000558895 PRXQ9BXM0 1461 aa41.13■■■■■ 4.17
SEMA4B-206ENST00000558895 IQGAP2Q13576 1575 aa41.08■■■■■ 4.17
SEMA4B-206ENST00000558895 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa40.99■■■■■ 4.15
SEMA4B-206ENST00000558895 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP40.9■■■■■ 4.14
SEMA4B-206ENST00000558895 UGGT2Q9NYU1 1516 aa40.88■■■■■ 4.13
SEMA4B-206ENST00000558895 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa40.85■■■■■ 4.13
SEMA4B-206ENST00000558895 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.84■■■■■ 4.13
SEMA4B-206ENST00000558895 TNIKQ9UKE5 1360 aa40.84■■■■■ 4.13
SEMA4B-206ENST00000558895 PTPRGP23470 1445 aa40.83■■■■■ 4.13
SEMA4B-206ENST00000558895 DISP1Q96F81 1524 aa40.79■■■■■ 4.12
SEMA4B-206ENST00000558895 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP40.72■■■■■ 4.11
SEMA4B-206ENST00000558895 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP40.69■■■■■ 4.11
SEMA4B-206ENST00000558895 GOLGA3Q08378 1498 aa40.69■■■■■ 4.1
SEMA4B-206ENST00000558895 KIAA0556O60303 1618 aa40.66■■■■■ 4.1
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SEMA4B-206ENST00000558895 ADCY10Q96PN6 1610 aa40.62■■■■■ 4.09
SEMA4B-206ENST00000558895 UACAQ9BZF9 1416 aa40.53■■■■■ 4.08
SEMA4B-206ENST00000558895 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa40.51■■■■■ 4.07
SEMA4B-206ENST00000558895 MAPKBP1O60336 1514 aa40.45■■■■■ 4.07
SEMA4B-206ENST00000558895 ABCC2Q92887 1545 aa40.44■■■■■ 4.06
SEMA4B-206ENST00000558895 UBTFP17480 764 aaKnown RBP40.41■■■■■ 4.06
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SEMA4B-206ENST00000558895 KDM5BQ9UGL1 1544 aa40.29■■■■■ 4.04
SEMA4B-206ENST00000558895 FAM69CQ0P6D2 419 aa40.27■■■■■ 4.04
SEMA4B-206ENST00000558895 ABCA8O94911 1581 aa40.25■■■■■ 4.03
SEMA4B-206ENST00000558895 KIF13AQ9H1H9 1805 aa40.21■■■■■ 4.03
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SEMA4B-206ENST00000558895 EFCAB5A4FU69 1503 aa40.19■■■■■ 4.02
SEMA4B-206ENST00000558895 DIP2BQ9P265 1576 aa40.16■■■■■ 4.02
SEMA4B-206ENST00000558895 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP40.14■■■■■ 4.02
SEMA4B-206ENST00000558895 FHOD3Q2V2M9 1422 aa40.11■■■■■ 4.01
SEMA4B-206ENST00000558895 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa40■■■■□ 3.99
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SEMA4B-206ENST00000558895 ATP10BO94823 1461 aa39.95■■■■□ 3.99
SEMA4B-206ENST00000558895 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP39.95■■■■□ 3.99
SEMA4B-206ENST00000558895 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa39.94■■■■□ 3.98
SEMA4B-206ENST00000558895 ARID3CA6NKF2 412 aa39.91■■■■□ 3.98
SEMA4B-206ENST00000558895 FMN1Q68DA7 1419 aa39.88■■■■□ 3.97
SEMA4B-206ENST00000558895 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP39.87■■■■□ 3.97
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SEMA4B-206ENST00000558895 CLIP1P30622 1438 aa39.7■■■■□ 3.95
SEMA4B-206ENST00000558895 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP39.68■■■■□ 3.94
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SEMA4B-206ENST00000558895 CD109Q6YHK3 1445 aa39.65■■■■□ 3.94
SEMA4B-206ENST00000558895 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP39.64■■■■□ 3.94
SEMA4B-206ENST00000558895 CFAP43Q8NDM7 1665 aa39.63■■■■□ 3.93
SEMA4B-206ENST00000558895 HECW1Q76N89 1606 aa39.62■■■■□ 3.93
SEMA4B-206ENST00000558895 KDM6BO15054 1643 aa39.58■■■■□ 3.93
SEMA4B-206ENST00000558895 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa39.57■■■■□ 3.93
SEMA4B-206ENST00000558895 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP39.54■■■■□ 3.92
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SEMA4B-206ENST00000558895 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa39.52■■■■□ 3.92
SEMA4B-206ENST00000558895 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa39.51■■■■□ 3.92
SEMA4B-206ENST00000558895 ABCA9Q8IUA7 1624 aa39.51■■■■□ 3.91
SEMA4B-206ENST00000558895 CEP162Q5TB80 1403 aa39.46■■■■□ 3.91
SEMA4B-206ENST00000558895 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP39.4■■■■□ 3.9
SEMA4B-206ENST00000558895 FYCO1Q9BQS8 1478 aa39.39■■■■□ 3.9
SEMA4B-206ENST00000558895 CCDC18Q5T9S5 1454 aa39.38■■■■□ 3.9
SEMA4B-206ENST00000558895 PHLDB1Q86UU1 1377 aa39.36■■■■□ 3.89
SEMA4B-206ENST00000558895 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP39.35■■■■□ 3.89
SEMA4B-206ENST00000558895 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP39.32■■■■□ 3.89
SEMA4B-206ENST00000558895 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa39.3■■■■□ 3.88
SEMA4B-206ENST00000558895 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP39.3■■■■□ 3.88
SEMA4B-206ENST00000558895 NEO1Q92859 1461 aa39.27■■■■□ 3.88
SEMA4B-206ENST00000558895 ARAP3Q8WWN8 1544 aa39.24■■■■□ 3.87
SEMA4B-206ENST00000558895 TTC37Q6PGP7 1564 aa39.21■■■■□ 3.87
SEMA4B-206ENST00000558895 KIF14Q15058 1648 aa39.18■■■■□ 3.86
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SEMA4B-206ENST00000558895 CFAP74Q9C0B2 1584 aa39.11■■■■□ 3.85
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SEMA4B-206ENST00000558895 MYO5CQ9NQX4 1742 aa39.03■■■■□ 3.84
SEMA4B-206ENST00000558895 RAPGEF3O95398 923 aa39.03■■■■□ 3.84
SEMA4B-206ENST00000558895 VPS8Q8N3P4 1428 aa39.02■■■■□ 3.84
SEMA4B-206ENST00000558895 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP38.99■■■■□ 3.83
SEMA4B-206ENST00000558895 MTUS2Q5JR59 1369 aa38.98■■■■□ 3.83
SEMA4B-206ENST00000558895 ARHGAP5Q13017 1502 aa38.92■■■■□ 3.82
SEMA4B-206ENST00000558895 ADGRL1O94910 1474 aa38.92■■■■□ 3.82
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SEMA4B-206ENST00000558895 SCAPERQ9BY12 1400 aa38.89■■■■□ 3.82
SEMA4B-206ENST00000558895 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa38.86■■■■□ 3.81
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