RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558379.5

TLE3-213, Transcript of transducin like enhancer of split 3, human

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TLE3, Length 2,304 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TLE3-213	ENST00000558379	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		19.07	■□□□□ 0.64
TLE3-213	ENST00000558379	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		19.05	■□□□□ 0.64
TLE3-213	ENST00000558379	WDR62	O43379	1518 aa		19.03	■□□□□ 0.64
TLE3-213	ENST00000558379	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	19.02	■□□□□ 0.64
TLE3-213	ENST00000558379	PBRM1	Q86U86	1689 aa		19.02	■□□□□ 0.64
TLE3-213	ENST00000558379	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	18.99	■□□□□ 0.63
TLE3-213	ENST00000558379	TIAM1	Q13009	1591 aa		18.98	■□□□□ 0.63
TLE3-213	ENST00000558379	ERCC6	Q03468	1493 aa		18.98	■□□□□ 0.63
TLE3-213	ENST00000558379	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		18.96	■□□□□ 0.63
TLE3-213	ENST00000558379	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		18.95	■□□□□ 0.62
TLE3-213	ENST00000558379	IFT140	Q96RY7	1462 aa		18.94	■□□□□ 0.62
TLE3-213	ENST00000558379	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	18.94	■□□□□ 0.62
TLE3-213	ENST00000558379	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	18.93	■□□□□ 0.62
TLE3-213	ENST00000558379	ADAMTS12	P58397	1594 aa		18.93	■□□□□ 0.62
TLE3-213	ENST00000558379	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	18.93	■□□□□ 0.62
TLE3-213	ENST00000558379	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	18.92	■□□□□ 0.62
TLE3-213	ENST00000558379	GRIN2B	Q13224	1484 aa		18.92	■□□□□ 0.62
TLE3-213	ENST00000558379	MAP3K1	Q13233	1512 aa		18.92	■□□□□ 0.62
TLE3-213	ENST00000558379	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		18.91	■□□□□ 0.62
TLE3-213	ENST00000558379	SAMD9	Q5K651	1589 aa		18.91	■□□□□ 0.62
TLE3-213	ENST00000558379	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		18.88	■□□□□ 0.61
TLE3-213	ENST00000558379	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		18.87	■□□□□ 0.61
TLE3-213	ENST00000558379	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		18.87	■□□□□ 0.61
TLE3-213	ENST00000558379	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	18.86	■□□□□ 0.61
TLE3-213	ENST00000558379	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		18.86	■□□□□ 0.61
TLE3-213	ENST00000558379	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		18.85	■□□□□ 0.61
TLE3-213	ENST00000558379	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		18.84	■□□□□ 0.61
TLE3-213	ENST00000558379	FMN1	Q68DA7	1419 aa		18.83	■□□□□ 0.61
TLE3-213	ENST00000558379	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		18.82	■□□□□ 0.6
TLE3-213	ENST00000558379	IQGAP2	Q13576	1575 aa		18.81	■□□□□ 0.6
TLE3-213	ENST00000558379	ITGAE	P38570	1179 aa		18.79	■□□□□ 0.6
TLE3-213	ENST00000558379	GRIN2A	Q12879	1464 aa		18.74	■□□□□ 0.59
TLE3-213	ENST00000558379	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		18.69	■□□□□ 0.58
TLE3-213	ENST00000558379	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		18.69	■□□□□ 0.58
TLE3-213	ENST00000558379	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	18.69	■□□□□ 0.58
TLE3-213	ENST00000558379	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	18.68	■□□□□ 0.58
TLE3-213	ENST00000558379	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	18.68	■□□□□ 0.58
TLE3-213	ENST00000558379	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		18.67	■□□□□ 0.58
TLE3-213	ENST00000558379	DISP1	Q96F81	1524 aa		18.67	■□□□□ 0.58
TLE3-213	ENST00000558379	FBLN2	P98095	1184 aa		18.66	■□□□□ 0.58
TLE3-213	ENST00000558379	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		18.66	■□□□□ 0.58
TLE3-213	ENST00000558379	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	18.66	■□□□□ 0.58
TLE3-213	ENST00000558379	CEP170	Q5SW79	1584 aa		18.65	■□□□□ 0.58
TLE3-213	ENST00000558379	SYNJ2	O15056	1496 aa		18.65	■□□□□ 0.58
TLE3-213	ENST00000558379	ARID3C	A6NKF2	412 aa		18.64	■□□□□ 0.57
TLE3-213	ENST00000558379	KIAA0556	O60303	1618 aa		18.62	■□□□□ 0.57
TLE3-213	ENST00000558379	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		18.61	■□□□□ 0.57
TLE3-213	ENST00000558379	NCOA2	Q15596	1464 aa		18.61	■□□□□ 0.57
TLE3-213	ENST00000558379	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	18.61	■□□□□ 0.57
TLE3-213	ENST00000558379	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	18.6	■□□□□ 0.57
TLE3-213	ENST00000558379	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		18.6	■□□□□ 0.57
TLE3-213	ENST00000558379	HECW1	Q76N89	1606 aa		18.59	■□□□□ 0.57
TLE3-213	ENST00000558379	MYT1	Q01538	1121 aa		18.57	■□□□□ 0.56
TLE3-213	ENST00000558379	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		18.56	■□□□□ 0.56
TLE3-213	ENST00000558379	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		18.56	■□□□□ 0.56
TLE3-213	ENST00000558379	NUP160	Q12769	1436 aa		18.55	■□□□□ 0.56
TLE3-213	ENST00000558379	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	18.55	■□□□□ 0.56
TLE3-213	ENST00000558379	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		18.54	■□□□□ 0.56
TLE3-213	ENST00000558379	ARHGEF11	O15085	1522 aa		18.53	■□□□□ 0.56
TLE3-213	ENST00000558379	PTPRK	Q15262	1439 aa		18.53	■□□□□ 0.56
TLE3-213	ENST00000558379	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		18.53	■□□□□ 0.56
TLE3-213	ENST00000558379	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	18.52	■□□□□ 0.56	6e-9	■■■■■ 33.9
TLE3-213	ENST00000558379	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		18.52	■□□□□ 0.55
TLE3-213	ENST00000558379	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	18.51	■□□□□ 0.55
TLE3-213	ENST00000558379	JPH4	Q96JJ6	628 aa		18.51	■□□□□ 0.55
TLE3-213	ENST00000558379	MAPKBP1	O60336	1514 aa		18.48	■□□□□ 0.55
TLE3-213	ENST00000558379	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		18.48	■□□□□ 0.55
TLE3-213	ENST00000558379	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		18.47	■□□□□ 0.55
TLE3-213	ENST00000558379	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		18.45	■□□□□ 0.54
TLE3-213	ENST00000558379	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	18.45	■□□□□ 0.54
TLE3-213	ENST00000558379	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	18.43	■□□□□ 0.54
TLE3-213	ENST00000558379	CHD1	O14646	1710 aa		18.4	■□□□□ 0.54
TLE3-213	ENST00000558379	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		18.39	■□□□□ 0.54
TLE3-213	ENST00000558379	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	18.38	■□□□□ 0.53
TLE3-213	ENST00000558379	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	18.37	■□□□□ 0.53
TLE3-213	ENST00000558379	HFM1	A2PYH4	1435 aa		18.37	■□□□□ 0.53
TLE3-213	ENST00000558379	NAIP	Q13075	1403 aa		18.36	■□□□□ 0.53
TLE3-213	ENST00000558379	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		18.35	■□□□□ 0.53
TLE3-213	ENST00000558379	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		18.35	■□□□□ 0.53
TLE3-213	ENST00000558379	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	18.33	■□□□□ 0.53
TLE3-213	ENST00000558379	MIA2	Q96PC5	1412 aa		18.33	■□□□□ 0.52
TLE3-213	ENST00000558379	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		18.32	■□□□□ 0.52
TLE3-213	ENST00000558379	ABCA8	O94911	1581 aa		18.32	■□□□□ 0.52
TLE3-213	ENST00000558379	KIF14	Q15058	1648 aa		18.3	■□□□□ 0.52
TLE3-213	ENST00000558379	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	18.3	■□□□□ 0.52
TLE3-213	ENST00000558379	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	18.3	■□□□□ 0.52
TLE3-213	ENST00000558379	NEUROD1	Q13562	356 aa		18.28	■□□□□ 0.52
TLE3-213	ENST00000558379	ATP10B	O94823	1461 aa		18.27	■□□□□ 0.52
TLE3-213	ENST00000558379	KDM6B	O15054	1643 aa		18.27	■□□□□ 0.52
TLE3-213	ENST00000558379	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		18.25	■□□□□ 0.51
TLE3-213	ENST00000558379	UACA	Q9BZF9	1416 aa		18.25	■□□□□ 0.51
TLE3-213	ENST00000558379	PTPRG	P23470	1445 aa		18.24	■□□□□ 0.51
TLE3-213	ENST00000558379	SHROOM2	Q13796	1616 aa		18.23	■□□□□ 0.51
TLE3-213	ENST00000558379	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	18.23	■□□□□ 0.51
TLE3-213	ENST00000558379	ABCC5	O15440	1437 aa		18.22	■□□□□ 0.51
TLE3-213	ENST00000558379	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		18.22	■□□□□ 0.51
TLE3-213	ENST00000558379	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		18.22	■□□□□ 0.51
TLE3-213	ENST00000558379	DAPK1	P53355	1430 aa		18.22	■□□□□ 0.51
TLE3-213	ENST00000558379	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	18.2	■□□□□ 0.5
TLE3-213	ENST00000558379	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	18.2	■□□□□ 0.5

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