RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553948.1

TTC7B-202, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 7B, humanhuman

TSL 5

Gene TTC7B, Length 630 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC7B-202ENST00000553948 JPH4Q96JJ6 628 aa55.79■■■■■ 6.52
TTC7B-202ENST00000553948 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP55.78■■■■■ 6.52
TTC7B-202ENST00000553948 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa55.6■■■■■ 6.49
TTC7B-202ENST00000553948 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa55.59■■■■■ 6.49
TTC7B-202ENST00000553948 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa55.16■■■■■ 6.42
TTC7B-202ENST00000553948 IQGAP2Q13576 1575 aa55.14■■■■■ 6.42
TTC7B-202ENST00000553948 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP55.06■■■■■ 6.4
TTC7B-202ENST00000553948 ADCY10Q96PN6 1610 aa55.06■■■■■ 6.4
TTC7B-202ENST00000553948 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa55.05■■■■■ 6.4
TTC7B-202ENST00000553948 PTPRGP23470 1445 aa54.98■■■■■ 6.39
TTC7B-202ENST00000553948 TNIKQ9UKE5 1360 aa54.93■■■■■ 6.38
TTC7B-202ENST00000553948 KIF13AQ9H1H9 1805 aa54.91■■■■■ 6.38
TTC7B-202ENST00000553948 MAPKBP1O60336 1514 aa54.89■■■■■ 6.38
TTC7B-202ENST00000553948 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP54.87■■■■■ 6.37
TTC7B-202ENST00000553948 DISP1Q96F81 1524 aa54.81■■■■■ 6.37
TTC7B-202ENST00000553948 UGGT2Q9NYU1 1516 aa54.8■■■■■ 6.36
TTC7B-202ENST00000553948 ABCC10Q5T3U5 1492 aa54.77■■■■■ 6.36
TTC7B-202ENST00000553948 FAM69CQ0P6D2 419 aa54.71■■■■■ 6.35
TTC7B-202ENST00000553948 PRXQ9BXM0 1461 aa54.71■■■■■ 6.35
TTC7B-202ENST00000553948 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa54.7■■■■■ 6.35
TTC7B-202ENST00000553948 DIP2BQ9P265 1576 aa54.64■■■■■ 6.34
TTC7B-202ENST00000553948 KIAA0556O60303 1618 aa54.62■■■■■ 6.34
TTC7B-202ENST00000553948 ABCC2Q92887 1545 aa54.61■■■■■ 6.33
TTC7B-202ENST00000553948 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa54.58■■■■■ 6.33
TTC7B-202ENST00000553948 UACAQ9BZF9 1416 aa54.57■■■■■ 6.33
TTC7B-202ENST00000553948 GOLGA3Q08378 1498 aa54.44■■■■■ 6.31
TTC7B-202ENST00000553948 CSRNP3Q8WYN3 585 aa54.44■■■■■ 6.31
TTC7B-202ENST00000553948 ASXL2Q76L83 1435 aa54.36■■■■■ 6.29
TTC7B-202ENST00000553948 PLB1Q6P1J6 1458 aa54.35■■■■■ 6.29
TTC7B-202ENST00000553948 EEA1Q15075 1411 aa54.33■■■■■ 6.29
TTC7B-202ENST00000553948 KDM5BQ9UGL1 1544 aa54.32■■■■■ 6.29
TTC7B-202ENST00000553948 TSPOAP1O95153 1857 aa54.26■■■■■ 6.28
TTC7B-202ENST00000553948 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP54.22■■■■■ 6.27
TTC7B-202ENST00000553948 GLI2P10070 1586 aa54.16■■■■■ 6.26
TTC7B-202ENST00000553948 ABCA8O94911 1581 aa54.08■■■■■ 6.25
TTC7B-202ENST00000553948 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP54.06■■■■■ 6.24
TTC7B-202ENST00000553948 KDM6BO15054 1643 aa54.05■■■■■ 6.24
TTC7B-202ENST00000553948 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP54.03■■■■■ 6.24
TTC7B-202ENST00000553948 P3H3Q8IVL6 736 aa53.98■■■■■ 6.23
TTC7B-202ENST00000553948 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP53.96■■■■■ 6.23
TTC7B-202ENST00000553948 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP53.93■■■■■ 6.22
TTC7B-202ENST00000553948 SAMD9Q5K651 1589 aa53.93■■■■■ 6.22
TTC7B-202ENST00000553948 WDR7Q9Y4E6 1490 aa53.93■■■■■ 6.22
TTC7B-202ENST00000553948 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa53.89■■■■■ 6.22
TTC7B-202ENST00000553948 CHIC1Q5VXU3 224 aa53.88■■■■■ 6.22
TTC7B-202ENST00000553948 KIF21BO75037 1637 aa53.84■■■■■ 6.21
TTC7B-202ENST00000553948 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP53.74■■■■■ 6.19
TTC7B-202ENST00000553948 TEX14Q8IWB6 1497 aa53.72■■■■■ 6.19
TTC7B-202ENST00000553948 KCNH8Q96L42 1107 aa53.67■■■■■ 6.18
TTC7B-202ENST00000553948 ARID3CA6NKF2 412 aa53.66■■■■■ 6.18
TTC7B-202ENST00000553948 ATP10BO94823 1461 aa53.65■■■■■ 6.18
TTC7B-202ENST00000553948 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa53.63■■■■■ 6.18
TTC7B-202ENST00000553948 CFAP43Q8NDM7 1665 aa53.58■■■■■ 6.17
TTC7B-202ENST00000553948 FHOD3Q2V2M9 1422 aa53.58■■■■■ 6.17
TTC7B-202ENST00000553948 CD109Q6YHK3 1445 aa53.55■■■■■ 6.16
TTC7B-202ENST00000553948 EFCAB5A4FU69 1503 aa53.52■■■■■ 6.16
TTC7B-202ENST00000553948 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP53.51■■■■■ 6.16
TTC7B-202ENST00000553948 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa53.48■■■■■ 6.15
TTC7B-202ENST00000553948 EHMT2Q96KQ7 1210 aa53.46■■■■■ 6.15
TTC7B-202ENST00000553948 UBTFP17480 764 aaKnown RBP53.44■■■■■ 6.15
TTC7B-202ENST00000553948 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP53.41■■■■■ 6.14
TTC7B-202ENST00000553948 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP53.39■■■■■ 6.14
TTC7B-202ENST00000553948 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP53.39■■■■■ 6.14
TTC7B-202ENST00000553948 ABCA9Q8IUA7 1624 aa53.27■■■■■ 6.12
TTC7B-202ENST00000553948 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa53.24■■■■■ 6.11
TTC7B-202ENST00000553948 PLEKHD1A6NEE1 506 aa53.11■■■■■ 6.09
TTC7B-202ENST00000553948 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa53.09■■■■■ 6.09
TTC7B-202ENST00000553948 ARAP3Q8WWN8 1544 aa53.06■■■■■ 6.08
TTC7B-202ENST00000553948 FMN1Q68DA7 1419 aa53.04■■■■■ 6.08
TTC7B-202ENST00000553948 PHLDB1Q86UU1 1377 aa53.02■■■■■ 6.08
TTC7B-202ENST00000553948 ADGRL1O94910 1474 aa52.98■■■■■ 6.07
TTC7B-202ENST00000553948 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP52.96■■■■■ 6.07
TTC7B-202ENST00000553948 NEO1Q92859 1461 aa52.94■■■■■ 6.07
TTC7B-202ENST00000553948 HECW1Q76N89 1606 aa52.91■■■■■ 6.06
TTC7B-202ENST00000553948 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP52.9■■■■■ 6.06
TTC7B-202ENST00000553948 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP52.83■■■■■ 6.05
TTC7B-202ENST00000553948 TTC37Q6PGP7 1564 aa52.76■■■■■ 6.04
TTC7B-202ENST00000553948 RAPGEF3O95398 923 aa52.75■■■■■ 6.03
TTC7B-202ENST00000553948 CFAP74Q9C0B2 1584 aa52.69■■■■■ 6.03
TTC7B-202ENST00000553948 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP52.69■■■■■ 6.03
TTC7B-202ENST00000553948 FANCAO15360 1455 aa52.68■■■■■ 6.02
TTC7B-202ENST00000553948 AKNAQ7Z591 1439 aa52.64■■■■■ 6.02
TTC7B-202ENST00000553948 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa52.64■■■■■ 6.02
TTC7B-202ENST00000553948 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP52.57■■■■■ 6.01
TTC7B-202ENST00000553948 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa52.55■■■■■ 6
TTC7B-202ENST00000553948 PLCH2O75038 1416 aa52.51■■■■■ 6
TTC7B-202ENST00000553948 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa52.51■■■■■ 6
TTC7B-202ENST00000553948 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP52.51■■■■■ 6
TTC7B-202ENST00000553948 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP52.5■■■■■ 6
TTC7B-202ENST00000553948 RICTORQ6R327 1708 aa52.5■■■■■ 5.99
TTC7B-202ENST00000553948 CLIP1P30622 1438 aa52.48■■■■■ 5.99
TTC7B-202ENST00000553948 KIF14Q15058 1648 aa52.48■■■■■ 5.99
TTC7B-202ENST00000553948 MYO5CQ9NQX4 1742 aa52.44■■■■■ 5.99
TTC7B-202ENST00000553948 CCDC18Q5T9S5 1454 aa52.42■■■■■ 5.98
TTC7B-202ENST00000553948 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa52.35■■■■■ 5.97
TTC7B-202ENST00000553948 FYCO1Q9BQS8 1478 aa52.34■■■■■ 5.97
TTC7B-202ENST00000553948 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa52.33■■■■■ 5.97
TTC7B-202ENST00000553948 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa52.31■■■■■ 5.96
TTC7B-202ENST00000553948 SCAPERQ9BY12 1400 aa52.31■■■■■ 5.96
TTC7B-202ENST00000553948 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP52.26■■■■■ 5.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.8 ms