RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551936.5

CS-229, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 744 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-229ENST00000551936 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.12■■□□□ 1.61
CS-229ENST00000551936 CUL7Q14999 1698 aa25.11■■□□□ 1.61
CS-229ENST00000551936 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.04■■□□□ 1.6
CS-229ENST00000551936 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa25.04■■□□□ 1.6
CS-229ENST00000551936 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP24.83■■□□□ 1.57
CS-229ENST00000551936 ADCY10Q96PN6 1610 aa24.83■■□□□ 1.56
CS-229ENST00000551936 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa24.82■■□□□ 1.56
CS-229ENST00000551936 KIF13AQ9H1H9 1805 aa24.82■■□□□ 1.56
CS-229ENST00000551936 IQGAP2Q13576 1575 aa24.8■■□□□ 1.56
CS-229ENST00000551936 PTPRGP23470 1445 aa24.78■■□□□ 1.56
CS-229ENST00000551936 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa24.78■■□□□ 1.56
CS-229ENST00000551936 MAPKBP1O60336 1514 aa24.76■■□□□ 1.55
CS-229ENST00000551936 TNIKQ9UKE5 1360 aa24.76■■□□□ 1.55
CS-229ENST00000551936 ABCC10Q5T3U5 1492 aa24.73■■□□□ 1.55
CS-229ENST00000551936 FAM69CQ0P6D2 419 aa24.72■■□□□ 1.55
CS-229ENST00000551936 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
CS-229ENST00000551936 DISP1Q96F81 1524 aa24.71■■□□□ 1.55
CS-229ENST00000551936 UGGT2Q9NYU1 1516 aa24.67■■□□□ 1.54
CS-229ENST00000551936 DIP2BQ9P265 1576 aa24.66■■□□□ 1.54
CS-229ENST00000551936 PRXQ9BXM0 1461 aa24.62■■□□□ 1.53
CS-229ENST00000551936 ABCC2Q92887 1545 aa24.61■■□□□ 1.53
CS-229ENST00000551936 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa24.6■■□□□ 1.53
CS-229ENST00000551936 UACAQ9BZF9 1416 aa24.6■■□□□ 1.53
CS-229ENST00000551936 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa24.59■■□□□ 1.53
CS-229ENST00000551936 KIAA0556O60303 1618 aa24.58■■□□□ 1.53
CS-229ENST00000551936 ASXL2Q76L83 1435 aa24.52■■□□□ 1.52
CS-229ENST00000551936 PLB1Q6P1J6 1458 aa24.5■■□□□ 1.51
CS-229ENST00000551936 KDM5BQ9UGL1 1544 aa24.49■■□□□ 1.51
CS-229ENST00000551936 TSPOAP1O95153 1857 aa24.49■■□□□ 1.51
CS-229ENST00000551936 CSRNP3Q8WYN3 585 aa24.48■■□□□ 1.51
CS-229ENST00000551936 GOLGA3Q08378 1498 aa24.47■■□□□ 1.51
CS-229ENST00000551936 GLI2P10070 1586 aa24.44■■□□□ 1.5
CS-229ENST00000551936 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
CS-229ENST00000551936 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
CS-229ENST00000551936 KDM6BO15054 1643 aa24.39■■□□□ 1.5
CS-229ENST00000551936 EEA1Q15075 1411 aa24.37■■□□□ 1.49
CS-229ENST00000551936 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
CS-229ENST00000551936 ABCA8O94911 1581 aa24.37■■□□□ 1.49
CS-229ENST00000551936 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
CS-229ENST00000551936 P3H3Q8IVL6 736 aa24.31■■□□□ 1.48
CS-229ENST00000551936 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa24.3■■□□□ 1.48
CS-229ENST00000551936 WDR7Q9Y4E6 1490 aa24.29■■□□□ 1.48
CS-229ENST00000551936 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
CS-229ENST00000551936 SAMD9Q5K651 1589 aa24.26■■□□□ 1.47
CS-229ENST00000551936 KCNH8Q96L42 1107 aa24.21■■□□□ 1.47
CS-229ENST00000551936 TEX14Q8IWB6 1497 aa24.2■■□□□ 1.47
CS-229ENST00000551936 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.2■■□□□ 1.46
CS-229ENST00000551936 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
CS-229ENST00000551936 ATP10BO94823 1461 aa24.19■■□□□ 1.46
CS-229ENST00000551936 KIF21BO75037 1637 aa24.17■■□□□ 1.46
CS-229ENST00000551936 ARID3CA6NKF2 412 aa24.16■■□□□ 1.46
CS-229ENST00000551936 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
CS-229ENST00000551936 CD109Q6YHK3 1445 aa24.15■■□□□ 1.46
CS-229ENST00000551936 CFAP43Q8NDM7 1665 aa24.15■■□□□ 1.46
CS-229ENST00000551936 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa24.13■■□□□ 1.45
CS-229ENST00000551936 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa24.13■■□□□ 1.45
CS-229ENST00000551936 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa24.12■■□□□ 1.45
CS-229ENST00000551936 FHOD3Q2V2M9 1422 aa24.1■■□□□ 1.45
CS-229ENST00000551936 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
CS-229ENST00000551936 EFCAB5A4FU69 1503 aa24.03■■□□□ 1.44
CS-229ENST00000551936 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
CS-229ENST00000551936 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
CS-229ENST00000551936 EHMT2Q96KQ7 1210 aa24.01■■□□□ 1.43
CS-229ENST00000551936 UBTFP17480 764 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
CS-229ENST00000551936 ABCA9Q8IUA7 1624 aa23.99■■□□□ 1.43
CS-229ENST00000551936 ARAP3Q8WWN8 1544 aa23.93■■□□□ 1.42
CS-229ENST00000551936 ADGRL1O94910 1474 aa23.93■■□□□ 1.42
CS-229ENST00000551936 PLEKHD1A6NEE1 506 aa23.92■■□□□ 1.42
CS-229ENST00000551936 PHLDB1Q86UU1 1377 aa23.9■■□□□ 1.42
CS-229ENST00000551936 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa23.87■■□□□ 1.41
CS-229ENST00000551936 NEO1Q92859 1461 aa23.85■■□□□ 1.41
CS-229ENST00000551936 FMN1Q68DA7 1419 aa23.83■■□□□ 1.4
CS-229ENST00000551936 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP23.82■■□□□ 1.4
CS-229ENST00000551936 RAPGEF3O95398 923 aa23.81■■□□□ 1.4
CS-229ENST00000551936 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP23.8■■□□□ 1.4
CS-229ENST00000551936 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
CS-229ENST00000551936 HECW1Q76N89 1606 aa23.76■■□□□ 1.39
CS-229ENST00000551936 TTC37Q6PGP7 1564 aa23.74■■□□□ 1.39
CS-229ENST00000551936 AKNAQ7Z591 1439 aa23.74■■□□□ 1.39
CS-229ENST00000551936 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa23.74■■□□□ 1.39
CS-229ENST00000551936 FANCAO15360 1455 aa23.71■■□□□ 1.39
CS-229ENST00000551936 CFAP74Q9C0B2 1584 aa23.69■■□□□ 1.38
CS-229ENST00000551936 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
CS-229ENST00000551936 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
CS-229ENST00000551936 RICTORQ6R327 1708 aa23.67■■□□□ 1.38
CS-229ENST00000551936 PLCH2O75038 1416 aa23.67■■□□□ 1.38
CS-229ENST00000551936 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa23.66■■□□□ 1.38
CS-229ENST00000551936 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
CS-229ENST00000551936 KIF14Q15058 1648 aa23.6■■□□□ 1.37
CS-229ENST00000551936 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa23.59■■□□□ 1.37
CS-229ENST00000551936 ADAMTSL3P82987 1691 aa23.59■■□□□ 1.37
CS-229ENST00000551936 MYO5CQ9NQX4 1742 aa23.58■■□□□ 1.37
CS-229ENST00000551936 SCAPERQ9BY12 1400 aa23.58■■□□□ 1.36
CS-229ENST00000551936 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa23.57■■□□□ 1.36
CS-229ENST00000551936 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa23.57■■□□□ 1.36
CS-229ENST00000551936 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
CS-229ENST00000551936 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa23.56■■□□□ 1.36
CS-229ENST00000551936 BCORL1Q5H9F3 1711 aa23.56■■□□□ 1.36
CS-229ENST00000551936 CLIP1P30622 1438 aa23.55■■□□□ 1.36
CS-229ENST00000551936 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
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