RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551155.1

CS-224, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 558 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-224ENST00000551155 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa15.6■□□□□ 0.09
CS-224ENST00000551155 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa15.6■□□□□ 0.09
CS-224ENST00000551155 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa15.6■□□□□ 0.09
CS-224ENST00000551155 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa15.59■□□□□ 0.09
CS-224ENST00000551155 ARHGEF11O15085 1522 aa15.59■□□□□ 0.09
CS-224ENST00000551155 CSRNP3Q8WYN3 585 aa15.57■□□□□ 0.08
CS-224ENST00000551155 SHROOM2Q13796 1616 aa15.54■□□□□ 0.08
CS-224ENST00000551155 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa15.54■□□□□ 0.08
CS-224ENST00000551155 PRXQ9BXM0 1461 aa15.53■□□□□ 0.08
CS-224ENST00000551155 JPH4Q96JJ6 628 aa15.52■□□□□ 0.08
CS-224ENST00000551155 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
CS-224ENST00000551155 IQGAP2Q13576 1575 aa15.48■□□□□ 0.07
CS-224ENST00000551155 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa15.48■□□□□ 0.07
CS-224ENST00000551155 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
CS-224ENST00000551155 CYB5RLQ6IPT4 315 aa15.46■□□□□ 0.07
CS-224ENST00000551155 ARAP1Q96P48 1450 aa15.45■□□□□ 0.06
CS-224ENST00000551155 KIF21BO75037 1637 aa15.43■□□□□ 0.06
CS-224ENST00000551155 ERCC6L2Q5T890 1561 aa15.42■□□□□ 0.06
CS-224ENST00000551155 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa15.41■□□□□ 0.06
CS-224ENST00000551155 UGGT2Q9NYU1 1516 aa15.38■□□□□ 0.05
CS-224ENST00000551155 GOLGA3Q08378 1498 aa15.34■□□□□ 0.05
CS-224ENST00000551155 DISP1Q96F81 1524 aa15.33■□□□□ 0.04
CS-224ENST00000551155 TNIKQ9UKE5 1360 aa15.32■□□□□ 0.04
CS-224ENST00000551155 UBTFP17480 764 aaKnown RBP15.31■□□□□ 0.04
CS-224ENST00000551155 KIAA0556O60303 1618 aa15.31■□□□□ 0.04
CS-224ENST00000551155 PTPRGP23470 1445 aa15.3■□□□□ 0.04
CS-224ENST00000551155 EHMT2Q96KQ7 1210 aa15.26■□□□□ 0.03
CS-224ENST00000551155 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
CS-224ENST00000551155 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP15.24■□□□□ 0.03
CS-224ENST00000551155 SAMD9Q5K651 1589 aa15.24■□□□□ 0.03
CS-224ENST00000551155 EFCAB5A4FU69 1503 aa15.22■□□□□ 0.03
CS-224ENST00000551155 ADCY10Q96PN6 1610 aa15.21■□□□□ 0.03
CS-224ENST00000551155 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
CS-224ENST00000551155 UACAQ9BZF9 1416 aa15.2■□□□□ 0.02
CS-224ENST00000551155 P3H3Q8IVL6 736 aa15.19■□□□□ 0.02
CS-224ENST00000551155 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa15.19■□□□□ 0.02
CS-224ENST00000551155 ABCC2Q92887 1545 aa15.17■□□□□ 0.02
CS-224ENST00000551155 TRHP20396 242 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
CS-224ENST00000551155 ABCA8O94911 1581 aa15.13■□□□□ 0.01
CS-224ENST00000551155 PLB1Q6P1J6 1458 aa15.13■□□□□ 0.01
CS-224ENST00000551155 MAPKBP1O60336 1514 aa15.12■□□□□ 0.01
CS-224ENST00000551155 FHOD3Q2V2M9 1422 aa15.11■□□□□ 0.01
CS-224ENST00000551155 KDM5BQ9UGL1 1544 aa15.11■□□□□ 0.01
CS-224ENST00000551155 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa15.1■□□□□ 0.01
CS-224ENST00000551155 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa15.1■□□□□ 0.01
CS-224ENST00000551155 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
CS-224ENST00000551155 FMN1Q68DA7 1419 aa15.08■□□□□ 0
CS-224ENST00000551155 CLIP1P30622 1438 aa15.05■□□□□ -0
CS-224ENST00000551155 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa15.04■□□□□ -0
CS-224ENST00000551155 KIF13AQ9H1H9 1805 aa15.03■□□□□ -0
CS-224ENST00000551155 ABCC10Q5T3U5 1492 aa15.03■□□□□ -0
CS-224ENST00000551155 ASXL2Q76L83 1435 aa15.03■□□□□ -0
CS-224ENST00000551155 DIP2BQ9P265 1576 aa15.01□□□□□ -0.01
CS-224ENST00000551155 ATP10BO94823 1461 aa15.01□□□□□ -0.01
CS-224ENST00000551155 FAM69CQ0P6D2 419 aa15□□□□□ -0.01
CS-224ENST00000551155 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
CS-224ENST00000551155 CEP162Q5TB80 1403 aa15□□□□□ -0.01
CS-224ENST00000551155 HECW1Q76N89 1606 aa14.99□□□□□ -0.01
CS-224ENST00000551155 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
CS-224ENST00000551155 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
CS-224ENST00000551155 WDR7Q9Y4E6 1490 aa14.98□□□□□ -0.01
CS-224ENST00000551155 ARID3CA6NKF2 412 aa14.97□□□□□ -0.01
CS-224ENST00000551155 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
CS-224ENST00000551155 GLI2P10070 1586 aa14.96□□□□□ -0.01
CS-224ENST00000551155 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
CS-224ENST00000551155 PLEKHD1A6NEE1 506 aa14.94□□□□□ -0.02
CS-224ENST00000551155 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa14.93□□□□□ -0.02
CS-224ENST00000551155 KCNH8Q96L42 1107 aa14.92□□□□□ -0.02
CS-224ENST00000551155 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
CS-224ENST00000551155 FYCO1Q9BQS8 1478 aa14.92□□□□□ -0.02
CS-224ENST00000551155 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
CS-224ENST00000551155 TSPOAP1O95153 1857 aa14.91□□□□□ -0.02
CS-224ENST00000551155 CCDC18Q5T9S5 1454 aa14.9□□□□□ -0.02
CS-224ENST00000551155 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa14.9□□□□□ -0.02
CS-224ENST00000551155 CFAP43Q8NDM7 1665 aa14.9□□□□□ -0.02
CS-224ENST00000551155 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa14.89□□□□□ -0.03
CS-224ENST00000551155 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
CS-224ENST00000551155 ABCA9Q8IUA7 1624 aa14.85□□□□□ -0.03
CS-224ENST00000551155 TEX14Q8IWB6 1497 aa14.85□□□□□ -0.03
CS-224ENST00000551155 CD109Q6YHK3 1445 aa14.84□□□□□ -0.03
CS-224ENST00000551155 VPS8Q8N3P4 1428 aa14.83□□□□□ -0.03
CS-224ENST00000551155 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
CS-224ENST00000551155 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
CS-224ENST00000551155 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa14.82□□□□□ -0.04
CS-224ENST00000551155 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
CS-224ENST00000551155 KIF14Q15058 1648 aa14.8□□□□□ -0.04
CS-224ENST00000551155 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP14.79□□□□□ -0.04
CS-224ENST00000551155 KDM6BO15054 1643 aa14.77□□□□□ -0.05
CS-224ENST00000551155 MYO5CQ9NQX4 1742 aa14.75□□□□□ -0.05
CS-224ENST00000551155 PHLDB1Q86UU1 1377 aa14.75□□□□□ -0.05
CS-224ENST00000551155 PLPPR3Q6T4P5 718 aa14.75□□□□□ -0.05
CS-224ENST00000551155 TTC37Q6PGP7 1564 aa14.75□□□□□ -0.05
CS-224ENST00000551155 CFAP74Q9C0B2 1584 aa14.75□□□□□ -0.05
CS-224ENST00000551155 MTUS2Q5JR59 1369 aa14.74□□□□□ -0.05
CS-224ENST00000551155 APLP2Q06481 763 aa14.73□□□□□ -0.05
CS-224ENST00000551155 TIAM1Q13009 1591 aa14.73□□□□□ -0.05
CS-224ENST00000551155 MAP3K1Q13233 1512 aa14.72□□□□□ -0.05
CS-224ENST00000551155 NEO1Q92859 1461 aa14.72□□□□□ -0.05
CS-224ENST00000551155 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa14.71□□□□□ -0.05
CS-224ENST00000551155 PLCH2O75038 1416 aa14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 139.5 ms