RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550724.2

HECTD4-212, Transcript of HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 3

Gene HECTD4, Length 587 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4-212ENST00000550724 CUL7Q14999 1698 aa24.66■■□□□ 1.54
HECTD4-212ENST00000550724 SHROOM2Q13796 1616 aa24.65■■□□□ 1.54
HECTD4-212ENST00000550724 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.63■■□□□ 1.53
HECTD4-212ENST00000550724 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa24.59■■□□□ 1.53
HECTD4-212ENST00000550724 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
HECTD4-212ENST00000550724 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa24.48■■□□□ 1.51
HECTD4-212ENST00000550724 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP24.42■■□□□ 1.5
HECTD4-212ENST00000550724 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa24.39■■□□□ 1.5
HECTD4-212ENST00000550724 IQGAP2Q13576 1575 aa24.38■■□□□ 1.49
HECTD4-212ENST00000550724 PTPRGP23470 1445 aa24.37■■□□□ 1.49
HECTD4-212ENST00000550724 TNIKQ9UKE5 1360 aa24.33■■□□□ 1.49
HECTD4-212ENST00000550724 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
HECTD4-212ENST00000550724 CSRNP3Q8WYN3 585 aa24.28■■□□□ 1.48
HECTD4-212ENST00000550724 PRXQ9BXM0 1461 aa24.27■■□□□ 1.48
HECTD4-212ENST00000550724 ADCY10Q96PN6 1610 aa24.27■■□□□ 1.48
HECTD4-212ENST00000550724 DISP1Q96F81 1524 aa24.25■■□□□ 1.47
HECTD4-212ENST00000550724 FAM69CQ0P6D2 419 aa24.23■■□□□ 1.47
HECTD4-212ENST00000550724 UGGT2Q9NYU1 1516 aa24.23■■□□□ 1.47
HECTD4-212ENST00000550724 UACAQ9BZF9 1416 aa24.16■■□□□ 1.46
HECTD4-212ENST00000550724 MAPKBP1O60336 1514 aa24.15■■□□□ 1.46
HECTD4-212ENST00000550724 KIAA0556O60303 1618 aa24.15■■□□□ 1.46
HECTD4-212ENST00000550724 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.15■■□□□ 1.46
HECTD4-212ENST00000550724 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa24.15■■□□□ 1.46
HECTD4-212ENST00000550724 ABCC10Q5T3U5 1492 aa24.14■■□□□ 1.46
HECTD4-212ENST00000550724 EEA1Q15075 1411 aa24.14■■□□□ 1.45
HECTD4-212ENST00000550724 ABCC2Q92887 1545 aa24.12■■□□□ 1.45
HECTD4-212ENST00000550724 GOLGA3Q08378 1498 aa24.12■■□□□ 1.45
HECTD4-212ENST00000550724 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
HECTD4-212ENST00000550724 P3H3Q8IVL6 736 aa24.11■■□□□ 1.45
HECTD4-212ENST00000550724 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa24.08■■□□□ 1.45
HECTD4-212ENST00000550724 EHMT2Q96KQ7 1210 aa24.08■■□□□ 1.45
HECTD4-212ENST00000550724 KIF13AQ9H1H9 1805 aa24.07■■□□□ 1.44
HECTD4-212ENST00000550724 DIP2BQ9P265 1576 aa24.05■■□□□ 1.44
HECTD4-212ENST00000550724 ASXL2Q76L83 1435 aa24.05■■□□□ 1.44
HECTD4-212ENST00000550724 PLB1Q6P1J6 1458 aa24.02■■□□□ 1.44
HECTD4-212ENST00000550724 KDM5BQ9UGL1 1544 aa23.98■■□□□ 1.43
HECTD4-212ENST00000550724 ARID3CA6NKF2 412 aa23.97■■□□□ 1.43
HECTD4-212ENST00000550724 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
HECTD4-212ENST00000550724 UBTFP17480 764 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
HECTD4-212ENST00000550724 ABCA8O94911 1581 aa23.91■■□□□ 1.42
HECTD4-212ENST00000550724 KCNH8Q96L42 1107 aa23.89■■□□□ 1.41
HECTD4-212ENST00000550724 TSPOAP1O95153 1857 aa23.88■■□□□ 1.41
HECTD4-212ENST00000550724 KIF21BO75037 1637 aa23.88■■□□□ 1.41
HECTD4-212ENST00000550724 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
HECTD4-212ENST00000550724 WDR7Q9Y4E6 1490 aa23.85■■□□□ 1.41
HECTD4-212ENST00000550724 SAMD9Q5K651 1589 aa23.85■■□□□ 1.41
HECTD4-212ENST00000550724 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.84■■□□□ 1.41
HECTD4-212ENST00000550724 GLI2P10070 1586 aa23.84■■□□□ 1.41
HECTD4-212ENST00000550724 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.41
HECTD4-212ENST00000550724 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
HECTD4-212ENST00000550724 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP23.8■■□□□ 1.4
HECTD4-212ENST00000550724 KDM6BO15054 1643 aa23.8■■□□□ 1.4
HECTD4-212ENST00000550724 ATP10BO94823 1461 aa23.76■■□□□ 1.39
HECTD4-212ENST00000550724 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa23.73■■□□□ 1.39
HECTD4-212ENST00000550724 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa23.71■■□□□ 1.39
HECTD4-212ENST00000550724 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.71■■□□□ 1.39
HECTD4-212ENST00000550724 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.39
HECTD4-212ENST00000550724 TEX14Q8IWB6 1497 aa23.7■■□□□ 1.38
HECTD4-212ENST00000550724 CD109Q6YHK3 1445 aa23.7■■□□□ 1.38
HECTD4-212ENST00000550724 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
HECTD4-212ENST00000550724 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
HECTD4-212ENST00000550724 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
HECTD4-212ENST00000550724 PLEKHD1A6NEE1 506 aa23.61■■□□□ 1.37
HECTD4-212ENST00000550724 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa23.6■■□□□ 1.37
HECTD4-212ENST00000550724 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa23.59■■□□□ 1.37
HECTD4-212ENST00000550724 CFAP43Q8NDM7 1665 aa23.58■■□□□ 1.37
HECTD4-212ENST00000550724 FMN1Q68DA7 1419 aa23.55■■□□□ 1.36
HECTD4-212ENST00000550724 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
HECTD4-212ENST00000550724 ABCA9Q8IUA7 1624 aa23.48■■□□□ 1.35
HECTD4-212ENST00000550724 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa23.47■■□□□ 1.35
HECTD4-212ENST00000550724 HECW1Q76N89 1606 aa23.44■■□□□ 1.34
HECTD4-212ENST00000550724 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
HECTD4-212ENST00000550724 RAPGEF3O95398 923 aa23.41■■□□□ 1.34
HECTD4-212ENST00000550724 CLIP1P30622 1438 aa23.4■■□□□ 1.34
HECTD4-212ENST00000550724 PHLDB1Q86UU1 1377 aa23.4■■□□□ 1.34
HECTD4-212ENST00000550724 ARAP3Q8WWN8 1544 aa23.38■■□□□ 1.33
HECTD4-212ENST00000550724 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP23.38■■□□□ 1.33
HECTD4-212ENST00000550724 NEO1Q92859 1461 aa23.37■■□□□ 1.33
HECTD4-212ENST00000550724 ADGRL1O94910 1474 aa23.35■■□□□ 1.33
HECTD4-212ENST00000550724 TTC37Q6PGP7 1564 aa23.34■■□□□ 1.33
HECTD4-212ENST00000550724 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa23.33■■□□□ 1.32
HECTD4-212ENST00000550724 FANCAO15360 1455 aa23.32■■□□□ 1.32
HECTD4-212ENST00000550724 AKNAQ7Z591 1439 aa23.32■■□□□ 1.32
HECTD4-212ENST00000550724 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
HECTD4-212ENST00000550724 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
HECTD4-212ENST00000550724 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
HECTD4-212ENST00000550724 PLCH2O75038 1416 aa23.26■■□□□ 1.31
HECTD4-212ENST00000550724 CCDC18Q5T9S5 1454 aa23.25■■□□□ 1.31
HECTD4-212ENST00000550724 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa23.25■■□□□ 1.31
HECTD4-212ENST00000550724 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa23.25■■□□□ 1.31
HECTD4-212ENST00000550724 KIF14Q15058 1648 aa23.23■■□□□ 1.31
HECTD4-212ENST00000550724 FYCO1Q9BQS8 1478 aa23.23■■□□□ 1.31
HECTD4-212ENST00000550724 CFAP74Q9C0B2 1584 aa23.23■■□□□ 1.31
HECTD4-212ENST00000550724 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
HECTD4-212ENST00000550724 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa23.22■■□□□ 1.31
HECTD4-212ENST00000550724 CEP162Q5TB80 1403 aa23.21■■□□□ 1.31
HECTD4-212ENST00000550724 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa23.2■■□□□ 1.3
HECTD4-212ENST00000550724 SCAPERQ9BY12 1400 aa23.2■■□□□ 1.3
HECTD4-212ENST00000550724 ARHGAP5Q13017 1502 aa23.17■■□□□ 1.3
HECTD4-212ENST00000550724 MYO5CQ9NQX4 1742 aa23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.8 ms