RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550274.1

LETMD1-222, Transcript of LETM1 domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LETMD1, Length 809 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1-222ENST00000550274 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
LETMD1-222ENST00000550274 JPH4Q96JJ6 628 aa22.33■■□□□ 1.17
LETMD1-222ENST00000550274 CUL7Q14999 1698 aa22.28■■□□□ 1.16
LETMD1-222ENST00000550274 ADCY10Q96PN6 1610 aa22.25■■□□□ 1.15
LETMD1-222ENST00000550274 IGF1RP08069 1367 aa22.22■■□□□ 1.15
LETMD1-222ENST00000550274 KIF27Q86VH2 1401 aa22.22■■□□□ 1.15
LETMD1-222ENST00000550274 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.21■■□□□ 1.15
LETMD1-222ENST00000550274 MAPKBP1O60336 1514 aa22.2■■□□□ 1.14
LETMD1-222ENST00000550274 DIP2BQ9P265 1576 aa22.17■■□□□ 1.14
LETMD1-222ENST00000550274 ABCC10Q5T3U5 1492 aa22.16■■□□□ 1.14
LETMD1-222ENST00000550274 TSPOAP1O95153 1857 aa22.11■■□□□ 1.13
LETMD1-222ENST00000550274 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP22.1■■□□□ 1.13
LETMD1-222ENST00000550274 FAM69CQ0P6D2 419 aa22.1■■□□□ 1.13
LETMD1-222ENST00000550274 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.07■■□□□ 1.12
LETMD1-222ENST00000550274 IQGAP2Q13576 1575 aa22.04■■□□□ 1.12
LETMD1-222ENST00000550274 KDM6BO15054 1643 aa22.01■■□□□ 1.11
LETMD1-222ENST00000550274 PTPRGP23470 1445 aa22■■□□□ 1.11
LETMD1-222ENST00000550274 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
LETMD1-222ENST00000550274 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
LETMD1-222ENST00000550274 TNIKQ9UKE5 1360 aa21.96■■□□□ 1.11
LETMD1-222ENST00000550274 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa21.96■■□□□ 1.11
LETMD1-222ENST00000550274 ABCC2Q92887 1545 aa21.95■■□□□ 1.1
LETMD1-222ENST00000550274 DISP1Q96F81 1524 aa21.93■■□□□ 1.1
LETMD1-222ENST00000550274 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
LETMD1-222ENST00000550274 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa21.89■■□□□ 1.09
LETMD1-222ENST00000550274 ASXL2Q76L83 1435 aa21.88■■□□□ 1.09
LETMD1-222ENST00000550274 UGGT2Q9NYU1 1516 aa21.87■■□□□ 1.09
LETMD1-222ENST00000550274 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa21.87■■□□□ 1.09
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LETMD1-222ENST00000550274 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa21.85■■□□□ 1.09
LETMD1-222ENST00000550274 KIAA0556O60303 1618 aa21.85■■□□□ 1.09
LETMD1-222ENST00000550274 UACAQ9BZF9 1416 aa21.85■■□□□ 1.09
LETMD1-222ENST00000550274 PLB1Q6P1J6 1458 aa21.84■■□□□ 1.09
LETMD1-222ENST00000550274 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
LETMD1-222ENST00000550274 KDM5BQ9UGL1 1544 aa21.8■■□□□ 1.08
LETMD1-222ENST00000550274 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa21.8■■□□□ 1.08
LETMD1-222ENST00000550274 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa21.77■■□□□ 1.08
LETMD1-222ENST00000550274 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
LETMD1-222ENST00000550274 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
LETMD1-222ENST00000550274 ABCA8O94911 1581 aa21.65■■□□□ 1.06
LETMD1-222ENST00000550274 TEX14Q8IWB6 1497 aa21.64■■□□□ 1.06
LETMD1-222ENST00000550274 WDR7Q9Y4E6 1490 aa21.64■■□□□ 1.06
LETMD1-222ENST00000550274 GOLGA3Q08378 1498 aa21.63■■□□□ 1.05
LETMD1-222ENST00000550274 PRXQ9BXM0 1461 aa21.63■■□□□ 1.05
LETMD1-222ENST00000550274 CFAP43Q8NDM7 1665 aa21.61■■□□□ 1.05
LETMD1-222ENST00000550274 ADGRL1O94910 1474 aa21.61■■□□□ 1.05
LETMD1-222ENST00000550274 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa21.52■■□□□ 1.04
LETMD1-222ENST00000550274 CD109Q6YHK3 1445 aa21.5■■□□□ 1.03
LETMD1-222ENST00000550274 KCNH8Q96L42 1107 aa21.48■■□□□ 1.03
LETMD1-222ENST00000550274 SAMD9Q5K651 1589 aa21.47■■□□□ 1.03
LETMD1-222ENST00000550274 P3H3Q8IVL6 736 aa21.43■■□□□ 1.02
LETMD1-222ENST00000550274 ATP10BO94823 1461 aa21.43■■□□□ 1.02
LETMD1-222ENST00000550274 KIF21BO75037 1637 aa21.42■■□□□ 1.02
LETMD1-222ENST00000550274 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa21.41■■□□□ 1.02
LETMD1-222ENST00000550274 ARID3CA6NKF2 412 aa21.41■■□□□ 1.02
LETMD1-222ENST00000550274 ABCA9Q8IUA7 1624 aa21.4■■□□□ 1.02
LETMD1-222ENST00000550274 HECW2Q9P2P5 1572 aa21.39■■□□□ 1.01
LETMD1-222ENST00000550274 ARAP3Q8WWN8 1544 aa21.36■■□□□ 1.01
LETMD1-222ENST00000550274 CSRNP3Q8WYN3 585 aa21.36■■□□□ 1.01
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LETMD1-222ENST00000550274 FHOD3Q2V2M9 1422 aa21.26■□□□□ 0.99
LETMD1-222ENST00000550274 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa21.26■□□□□ 0.99
LETMD1-222ENST00000550274 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP21.23■□□□□ 0.99
LETMD1-222ENST00000550274 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP21.23■□□□□ 0.99
LETMD1-222ENST00000550274 NEO1Q92859 1461 aa21.23■□□□□ 0.99
LETMD1-222ENST00000550274 ADAMTSL3P82987 1691 aa21.23■□□□□ 0.99
LETMD1-222ENST00000550274 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.23■□□□□ 0.99
LETMD1-222ENST00000550274 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP21.21■□□□□ 0.99
LETMD1-222ENST00000550274 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP21.21■□□□□ 0.99
LETMD1-222ENST00000550274 RAPGEF3O95398 923 aa21.19■□□□□ 0.98
LETMD1-222ENST00000550274 BCORL1Q5H9F3 1711 aa21.18■□□□□ 0.98
LETMD1-222ENST00000550274 RICTORQ6R327 1708 aa21.18■□□□□ 0.98
LETMD1-222ENST00000550274 EFCAB5A4FU69 1503 aa21.18■□□□□ 0.98
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LETMD1-222ENST00000550274 MADDQ8WXG6 1647 aa21.14■□□□□ 0.97
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LETMD1-222ENST00000550274 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa21.04■□□□□ 0.96
LETMD1-222ENST00000550274 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP21.03■□□□□ 0.96
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LETMD1-222ENST00000550274 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa21■□□□□ 0.95
LETMD1-222ENST00000550274 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa20.99■□□□□ 0.95
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LETMD1-222ENST00000550274 EHMT2Q96KQ7 1210 aa20.98■□□□□ 0.95
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LETMD1-222ENST00000550274 KIF14Q15058 1648 aa20.96■□□□□ 0.95
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