RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548567.5

CS-212, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CS, Length 3,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-212ENST00000548567 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.42
CS-212ENST00000548567 CHD1O14646 1710 aa12.4□□□□□ -0.42
CS-212ENST00000548567 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP12.37□□□□□ -0.43
CS-212ENST00000548567 CSRNP3Q8WYN3 585 aa12.37□□□□□ -0.43
CS-212ENST00000548567 SYNJ2O15056 1496 aa12.37□□□□□ -0.43
CS-212ENST00000548567 KIF27Q86VH2 1401 aa12.37□□□□□ -0.43
CS-212ENST00000548567 GRIN2AQ12879 1464 aa12.33□□□□□ -0.44
CS-212ENST00000548567 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa12.31□□□□□ -0.44
CS-212ENST00000548567 MLECQ14165 292 aa12.31□□□□□ -0.44
CS-212ENST00000548567 FHAD1B1AJZ9 1412 aa12.3□□□□□ -0.44
CS-212ENST00000548567 PTPRGP23470 1445 aa12.29□□□□□ -0.44
CS-212ENST00000548567 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
CS-212ENST00000548567 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
CS-212ENST00000548567 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
CS-212ENST00000548567 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP12.24□□□□□ -0.45
CS-212ENST00000548567 TOP2BQ02880 1626 aa12.24□□□□□ -0.45
CS-212ENST00000548567 CEP170Q5SW79 1584 aa12.22□□□□□ -0.45
CS-212ENST00000548567 RAPGEF3O95398 923 aa12.21□□□□□ -0.45
CS-212ENST00000548567 PRDM2Q13029 1718 aa12.19□□□□□ -0.46
CS-212ENST00000548567 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa12.17□□□□□ -0.46
CS-212ENST00000548567 PBRM1Q86U86 1689 aa12.15□□□□□ -0.46
CS-212ENST00000548567 PLB1Q6P1J6 1458 aa12.15□□□□□ -0.46
CS-212ENST00000548567 FHOD3Q2V2M9 1422 aa12.14□□□□□ -0.47
CS-212ENST00000548567 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-212ENST00000548567 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-212ENST00000548567 NUP160Q12769 1436 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-212ENST00000548567 TSPOAP1O95153 1857 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-212ENST00000548567 ADAMTS12P58397 1594 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-212ENST00000548567 TNIKQ9UKE5 1360 aa12.09□□□□□ -0.47
CS-212ENST00000548567 PLEKHD1A6NEE1 506 aa12.08□□□□□ -0.48
CS-212ENST00000548567 CLASP1Q7Z460 1538 aa12.08□□□□□ -0.48
CS-212ENST00000548567 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa12.08□□□□□ -0.48
CS-212ENST00000548567 ERICH3Q5RHP9 1530 aa12.06□□□□□ -0.48
CS-212ENST00000548567 ITGAEP38570 1179 aa12.05□□□□□ -0.48
CS-212ENST00000548567 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa12.05□□□□□ -0.48
CS-212ENST00000548567 ASXL2Q76L83 1435 aa12.05□□□□□ -0.48
CS-212ENST00000548567 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa12.02□□□□□ -0.48
CS-212ENST00000548567 HSPA2P54652 639 aa12.02□□□□□ -0.48
CS-212ENST00000548567 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP12.02□□□□□ -0.49
CS-212ENST00000548567 UACAQ9BZF9 1416 aa12.01□□□□□ -0.49
CS-212ENST00000548567 AFAP1Q8N556 730 aa12.01□□□□□ -0.49
CS-212ENST00000548567 WDR97A6NE52 1622 aa12□□□□□ -0.49
CS-212ENST00000548567 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa11.99□□□□□ -0.49
CS-212ENST00000548567 DISP1Q96F81 1524 aa11.95□□□□□ -0.5
CS-212ENST00000548567 IQGAP2Q13576 1575 aa11.95□□□□□ -0.5
CS-212ENST00000548567 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
CS-212ENST00000548567 CD109Q6YHK3 1445 aa11.94□□□□□ -0.5
CS-212ENST00000548567 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP11.94□□□□□ -0.5
CS-212ENST00000548567 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
CS-212ENST00000548567 GGT6Q6P531 493 aa11.92□□□□□ -0.5
CS-212ENST00000548567 CHIC2Q9UKJ5 165 aa11.91□□□□□ -0.5
CS-212ENST00000548567 ADCY10Q96PN6 1610 aa11.91□□□□□ -0.5
CS-212ENST00000548567 APLP2Q06481 763 aa11.9□□□□□ -0.5
CS-212ENST00000548567 PRXQ9BXM0 1461 aa11.89□□□□□ -0.51
CS-212ENST00000548567 ABCC10Q5T3U5 1492 aa11.89□□□□□ -0.51
CS-212ENST00000548567 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
CS-212ENST00000548567 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
CS-212ENST00000548567 ABCC2Q92887 1545 aa11.87□□□□□ -0.51
CS-212ENST00000548567 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP11.86□□□□□ -0.516e-9■□□□□ 10
CS-212ENST00000548567 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
CS-212ENST00000548567 ATP10BO94823 1461 aa11.86□□□□□ -0.51
CS-212ENST00000548567 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
CS-212ENST00000548567 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
CS-212ENST00000548567 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
CS-212ENST00000548567 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
CS-212ENST00000548567 CUL7Q14999 1698 aa11.81□□□□□ -0.52
CS-212ENST00000548567 CLIP1P30622 1438 aa11.81□□□□□ -0.52
CS-212ENST00000548567 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa11.79□□□□□ -0.52
CS-212ENST00000548567 KDM6BO15054 1643 aa11.79□□□□□ -0.52
CS-212ENST00000548567 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
CS-212ENST00000548567 MTUS2Q5JR59 1369 aa11.78□□□□□ -0.52
CS-212ENST00000548567 WDR7Q9Y4E6 1490 aa11.78□□□□□ -0.52
CS-212ENST00000548567 KIAA0556O60303 1618 aa11.78□□□□□ -0.52
CS-212ENST00000548567 GOLGA3Q08378 1498 aa11.77□□□□□ -0.52
CS-212ENST00000548567 SCAPERQ9BY12 1400 aa11.76□□□□□ -0.53
CS-212ENST00000548567 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
CS-212ENST00000548567 SHROOM2Q13796 1616 aa11.75□□□□□ -0.53
CS-212ENST00000548567 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa11.75□□□□□ -0.53
CS-212ENST00000548567 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
CS-212ENST00000548567 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
CS-212ENST00000548567 DIP2BQ9P265 1576 aa11.74□□□□□ -0.53
CS-212ENST00000548567 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa11.73□□□□□ -0.53
CS-212ENST00000548567 YEATS2Q9ULM3 1422 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-212ENST00000548567 KIF3BO15066 747 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-212ENST00000548567 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
CS-212ENST00000548567 UGGT2Q9NYU1 1516 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-212ENST00000548567 BCANQ96GW7 911 aa11.71□□□□□ -0.53
CS-212ENST00000548567 KIF13AQ9H1H9 1805 aa11.71□□□□□ -0.54
CS-212ENST00000548567 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.54
CS-212ENST00000548567 KDM5BQ9UGL1 1544 aa11.7□□□□□ -0.54
CS-212ENST00000548567 CEP162Q5TB80 1403 aa11.69□□□□□ -0.54
CS-212ENST00000548567 CHGAP10645 457 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
CS-212ENST00000548567 ADGRL1O94910 1474 aa11.69□□□□□ -0.54
CS-212ENST00000548567 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
CS-212ENST00000548567 PLEKHG5O94827 1062 aa11.68□□□□□ -0.54
CS-212ENST00000548567 FANCAO15360 1455 aa11.67□□□□□ -0.54
CS-212ENST00000548567 EEA1Q15075 1411 aa11.67□□□□□ -0.54
CS-212ENST00000548567 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
CS-212ENST00000548567 AKNAQ7Z591 1439 aa11.66□□□□□ -0.54
CS-212ENST00000548567 CCNB3Q8WWL7 1395 aa11.65□□□□□ -0.54
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