RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547912.1

CS-210, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 674 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-210ENST00000547912 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
CS-210ENST00000547912 FGD5Q6ZNL6 1462 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-210ENST00000547912 SOGA1O94964 1423 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-210ENST00000547912 SYNJ1O43426 1573 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-210ENST00000547912 WDR97A6NE52 1622 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-210ENST00000547912 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.93
CS-210ENST00000547912 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-210ENST00000547912 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
CS-210ENST00000547912 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-210ENST00000547912 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
CS-210ENST00000547912 ATXN8OSP0DMR3 200 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-210ENST00000547912 TRIM41Q8WV44 630 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-210ENST00000547912 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
CS-210ENST00000547912 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
CS-210ENST00000547912 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP9.14□□□□□ -0.956e-6■■■■□ 25.1
CS-210ENST00000547912 GRIN2BQ13224 1484 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-210ENST00000547912 GAPVD1Q14C86 1478 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-210ENST00000547912 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa9.13□□□□□ -0.95
CS-210ENST00000547912 AKT1S1Q96B36 256 aa9.13□□□□□ -0.95
CS-210ENST00000547912 PBRM1Q86U86 1689 aa9.13□□□□□ -0.95
CS-210ENST00000547912 KIF27Q86VH2 1401 aa9.12□□□□□ -0.95
CS-210ENST00000547912 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
CS-210ENST00000547912 CHRDL2Q6WN34 429 aa9.11□□□□□ -0.95
CS-210ENST00000547912 ERICH3Q5RHP9 1530 aa9.1□□□□□ -0.95
CS-210ENST00000547912 ZBTB22O15209 634 aa9.09□□□□□ -0.95
CS-210ENST00000547912 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-210ENST00000547912 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
CS-210ENST00000547912 FBLN2P98095 1184 aa9.06□□□□□ -0.96
CS-210ENST00000547912 SYNJ2O15056 1496 aa9.06□□□□□ -0.96
CS-210ENST00000547912 CUL7Q14999 1698 aa9.06□□□□□ -0.96
CS-210ENST00000547912 OSCARQ8IYS5 282 aa9.05□□□□□ -0.96
CS-210ENST00000547912 CHD1O14646 1710 aa9.05□□□□□ -0.96
CS-210ENST00000547912 FHAD1B1AJZ9 1412 aa9.05□□□□□ -0.96
CS-210ENST00000547912 EEA1Q15075 1411 aa9.05□□□□□ -0.96
CS-210ENST00000547912 ADAMTS12P58397 1594 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-210ENST00000547912 IGF1RP08069 1367 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-210ENST00000547912 GRIN2AQ12879 1464 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-210ENST00000547912 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa8.99□□□□□ -0.97
CS-210ENST00000547912 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
CS-210ENST00000547912 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa8.97□□□□□ -0.97
CS-210ENST00000547912 CSRNP3Q8WYN3 585 aa8.97□□□□□ -0.97
CS-210ENST00000547912 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa8.96□□□□□ -0.97
CS-210ENST00000547912 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa8.96□□□□□ -0.98
CS-210ENST00000547912 NUP160Q12769 1436 aa8.95□□□□□ -0.98
CS-210ENST00000547912 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
CS-210ENST00000547912 CEP170Q5SW79 1584 aa8.94□□□□□ -0.98
CS-210ENST00000547912 SPDYE2BA6NHP3 402 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-210ENST00000547912 SPDYE6P0CI01 402 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-210ENST00000547912 SPDYE2Q495Y8 402 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-210ENST00000547912 CLASP1Q7Z460 1538 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-210ENST00000547912 PRXQ9BXM0 1461 aa8.92□□□□□ -0.98
CS-210ENST00000547912 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa8.91□□□□□ -0.98
CS-210ENST00000547912 KIF21BO75037 1637 aa8.91□□□□□ -0.98
CS-210ENST00000547912 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa8.9□□□□□ -0.98
CS-210ENST00000547912 IQGAP2Q13576 1575 aa8.88□□□□□ -0.99
CS-210ENST00000547912 PIP4P2Q8N4L2 257 aa8.87□□□□□ -0.99
CS-210ENST00000547912 JPH4Q96JJ6 628 aa8.87□□□□□ -0.99
CS-210ENST00000547912 GOLGA3Q08378 1498 aa8.87□□□□□ -0.99
CS-210ENST00000547912 SHROOM2Q13796 1616 aa8.87□□□□□ -0.99
CS-210ENST00000547912 ARHGEF11O15085 1522 aa8.86□□□□□ -0.99
CS-210ENST00000547912 PITPNM1O00562 1244 aa8.86□□□□□ -0.99
CS-210ENST00000547912 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa8.86□□□□□ -0.99
CS-210ENST00000547912 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa8.86□□□□□ -0.99
CS-210ENST00000547912 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa8.86□□□□□ -0.99
CS-210ENST00000547912 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa8.86□□□□□ -0.99
CS-210ENST00000547912 UBTFP17480 764 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
CS-210ENST00000547912 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP8.85□□□□□ -0.99
CS-210ENST00000547912 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
CS-210ENST00000547912 UGGT2Q9NYU1 1516 aa8.82□□□□□ -1
CS-210ENST00000547912 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
CS-210ENST00000547912 EHMT2Q96KQ7 1210 aa8.8□□□□□ -1
CS-210ENST00000547912 ARAP1Q96P48 1450 aa8.78□□□□□ -1
CS-210ENST00000547912 TNIKQ9UKE5 1360 aa8.78□□□□□ -1
CS-210ENST00000547912 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
CS-210ENST00000547912 CYB5RLQ6IPT4 315 aa8.78□□□□□ -1
CS-210ENST00000547912 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
CS-210ENST00000547912 KIAA0556O60303 1618 aa8.78□□□□□ -1
CS-210ENST00000547912 ERCC6L2Q5T890 1561 aa8.78□□□□□ -1
CS-210ENST00000547912 EFCAB5A4FU69 1503 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-210ENST00000547912 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
CS-210ENST00000547912 DISP1Q96F81 1524 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-210ENST00000547912 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
CS-210ENST00000547912 SSUH2Q9Y2M2 353 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-210ENST00000547912 PTPRGP23470 1445 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-210ENST00000547912 SAMD9Q5K651 1589 aa8.75□□□□□ -1.01
CS-210ENST00000547912 HAX1O00165 279 aa8.74□□□□□ -1.01
CS-210ENST00000547912 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
CS-210ENST00000547912 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP8.73□□□□□ -1.01
CS-210ENST00000547912 P3H3Q8IVL6 736 aa8.71□□□□□ -1.02
CS-210ENST00000547912 UACAQ9BZF9 1416 aa8.71□□□□□ -1.02
CS-210ENST00000547912 CLIP1P30622 1438 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-210ENST00000547912 FMN1Q68DA7 1419 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-210ENST00000547912 CLEC11AQ9Y240 323 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-210ENST00000547912 FHOD3Q2V2M9 1422 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-210ENST00000547912 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-210ENST00000547912 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-210ENST00000547912 ABCC2Q92887 1545 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-210ENST00000547912 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-210ENST00000547912 ADCY10Q96PN6 1610 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-210ENST00000547912 CEP162Q5TB80 1403 aa8.67□□□□□ -1.02
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