RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545464.5

MACROD1-208, Transcript of MACRO domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene MACROD1, Length 899 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MACROD1-208ENST00000545464 KIF13AQ9H1H9 1805 aa43.36■■■■■ 4.53
MACROD1-208ENST00000545464 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa43.35■■■■■ 4.53
MACROD1-208ENST00000545464 FAM69CQ0P6D2 419 aa43.31■■■■■ 4.52
MACROD1-208ENST00000545464 ABCC10Q5T3U5 1492 aa43.18■■■■■ 4.5
MACROD1-208ENST00000545464 IGF1RP08069 1367 aa43.16■■■■■ 4.5
MACROD1-208ENST00000545464 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa43.13■■■■■ 4.5
MACROD1-208ENST00000545464 KIF27Q86VH2 1401 aa43.13■■■■■ 4.49
MACROD1-208ENST00000545464 ADCY10Q96PN6 1610 aa43.11■■■■■ 4.49
MACROD1-208ENST00000545464 MAPKBP1O60336 1514 aa43.1■■■■■ 4.49
MACROD1-208ENST00000545464 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP43.03■■■■■ 4.48
MACROD1-208ENST00000545464 DIP2BQ9P265 1576 aa43.02■■■■■ 4.48
MACROD1-208ENST00000545464 CUL7Q14999 1698 aa43.02■■■■■ 4.48
MACROD1-208ENST00000545464 PTPRGP23470 1445 aa42.9■■■■■ 4.46
MACROD1-208ENST00000545464 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42.9■■■■■ 4.46
MACROD1-208ENST00000545464 TSPOAP1O95153 1857 aa42.83■■■■■ 4.45
MACROD1-208ENST00000545464 KDM6BO15054 1643 aa42.82■■■■■ 4.44
MACROD1-208ENST00000545464 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa42.79■■■■■ 4.44
MACROD1-208ENST00000545464 TNIKQ9UKE5 1360 aa42.76■■■■■ 4.44
MACROD1-208ENST00000545464 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa42.66■■■■■ 4.42
MACROD1-208ENST00000545464 ABCC2Q92887 1545 aa42.66■■■■■ 4.42
MACROD1-208ENST00000545464 IQGAP2Q13576 1575 aa42.65■■■■■ 4.42
MACROD1-208ENST00000545464 ASXL2Q76L83 1435 aa42.61■■■■■ 4.41
MACROD1-208ENST00000545464 PLB1Q6P1J6 1458 aa42.55■■■■■ 4.4
MACROD1-208ENST00000545464 UACAQ9BZF9 1416 aa42.52■■■■■ 4.4
MACROD1-208ENST00000545464 DISP1Q96F81 1524 aa42.49■■■■■ 4.39
MACROD1-208ENST00000545464 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa42.49■■■■■ 4.39
MACROD1-208ENST00000545464 GLI2P10070 1586 aa42.43■■■■■ 4.38
MACROD1-208ENST00000545464 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa42.42■■■■■ 4.38
MACROD1-208ENST00000545464 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP42.37■■■■■ 4.37
MACROD1-208ENST00000545464 UGGT2Q9NYU1 1516 aa42.33■■■■■ 4.37
MACROD1-208ENST00000545464 KDM5BQ9UGL1 1544 aa42.31■■■■■ 4.36
MACROD1-208ENST00000545464 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP42.3■■■■■ 4.36
MACROD1-208ENST00000545464 KIAA0556O60303 1618 aa42.25■■■■■ 4.35
MACROD1-208ENST00000545464 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP42.24■■■■■ 4.35
MACROD1-208ENST00000545464 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP42.22■■■■■ 4.35
MACROD1-208ENST00000545464 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa42.19■■■■■ 4.34
MACROD1-208ENST00000545464 ADGRL1O94910 1474 aa42.17■■■■■ 4.34
MACROD1-208ENST00000545464 TEX14Q8IWB6 1497 aa42.17■■■■■ 4.34
MACROD1-208ENST00000545464 WDR7Q9Y4E6 1490 aa42.09■■■■■ 4.33
MACROD1-208ENST00000545464 KCNH8Q96L42 1107 aa42.05■■■■■ 4.32
MACROD1-208ENST00000545464 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa42.02■■■■■ 4.32
MACROD1-208ENST00000545464 GOLGA3Q08378 1498 aa42.01■■■■■ 4.32
MACROD1-208ENST00000545464 CD109Q6YHK3 1445 aa41.94■■■■■ 4.3
MACROD1-208ENST00000545464 ABCA8O94911 1581 aa41.88■■■■■ 4.3
MACROD1-208ENST00000545464 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP41.87■■■■■ 4.29
MACROD1-208ENST00000545464 ARID3CA6NKF2 412 aa41.85■■■■■ 4.29
MACROD1-208ENST00000545464 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa41.82■■■■■ 4.29
MACROD1-208ENST00000545464 PRXQ9BXM0 1461 aa41.82■■■■■ 4.29
MACROD1-208ENST00000545464 P3H3Q8IVL6 736 aa41.81■■■■■ 4.28
MACROD1-208ENST00000545464 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.8■■■■■ 4.28
MACROD1-208ENST00000545464 CFAP43Q8NDM7 1665 aa41.8■■■■■ 4.28
MACROD1-208ENST00000545464 HECW2Q9P2P5 1572 aa41.71■■■■■ 4.27
MACROD1-208ENST00000545464 ATP10BO94823 1461 aa41.6■■■■■ 4.25
MACROD1-208ENST00000545464 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP41.54■■■■■ 4.24
MACROD1-208ENST00000545464 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP41.54■■■■■ 4.24
MACROD1-208ENST00000545464 KIF21BO75037 1637 aa41.54■■■■■ 4.24
MACROD1-208ENST00000545464 ARAP3Q8WWN8 1544 aa41.51■■■■■ 4.24
MACROD1-208ENST00000545464 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.51■■■■■ 4.24
MACROD1-208ENST00000545464 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP41.49■■■■■ 4.23
MACROD1-208ENST00000545464 RAPGEF3O95398 923 aa41.42■■■■■ 4.22
MACROD1-208ENST00000545464 ABCA9Q8IUA7 1624 aa41.4■■■■■ 4.22
MACROD1-208ENST00000545464 PHLDB1Q86UU1 1377 aa41.38■■■■■ 4.22
MACROD1-208ENST00000545464 SAMD9Q5K651 1589 aa41.38■■■■■ 4.22
MACROD1-208ENST00000545464 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa41.38■■■■■ 4.21
MACROD1-208ENST00000545464 NEO1Q92859 1461 aa41.28■■■■■ 4.2
MACROD1-208ENST00000545464 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP41.27■■■■■ 4.2
MACROD1-208ENST00000545464 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP41.24■■■■■ 4.19
MACROD1-208ENST00000545464 FHOD3Q2V2M9 1422 aa41.24■■■■■ 4.19
MACROD1-208ENST00000545464 PTPRMP28827 1452 aa41.21■■■■■ 4.19
MACROD1-208ENST00000545464 PLEKHD1A6NEE1 506 aa41.19■■■■■ 4.18
MACROD1-208ENST00000545464 ADAMTSL3P82987 1691 aa41.17■■■■■ 4.18
MACROD1-208ENST00000545464 EEA1Q15075 1411 aa41.13■■■■■ 4.17
MACROD1-208ENST00000545464 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa41.12■■■■■ 4.17
MACROD1-208ENST00000545464 BCORL1Q5H9F3 1711 aa41.05■■■■■ 4.16
MACROD1-208ENST00000545464 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP41.04■■■■■ 4.16
MACROD1-208ENST00000545464 AKNAQ7Z591 1439 aa41.02■■■■■ 4.16
MACROD1-208ENST00000545464 MADDQ8WXG6 1647 aa41.02■■■■■ 4.16
MACROD1-208ENST00000545464 FANCAO15360 1455 aa41■■■■■ 4.15
MACROD1-208ENST00000545464 PLPPR3Q6T4P5 718 aa40.96■■■■■ 4.15
MACROD1-208ENST00000545464 FBXO41Q8TF61 875 aa40.96■■■■■ 4.15
MACROD1-208ENST00000545464 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP40.95■■■■■ 4.158e-8■■■□□ 19.1
MACROD1-208ENST00000545464 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa40.94■■■■■ 4.14
MACROD1-208ENST00000545464 EHMT2Q96KQ7 1210 aa40.93■■■■■ 4.14
MACROD1-208ENST00000545464 RICTORQ6R327 1708 aa40.91■■■■■ 4.14
MACROD1-208ENST00000545464 EFCAB5A4FU69 1503 aa40.91■■■■■ 4.14
MACROD1-208ENST00000545464 CFAP74Q9C0B2 1584 aa40.91■■■■■ 4.14
MACROD1-208ENST00000545464 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP40.89■■■■■ 4.14
MACROD1-208ENST00000545464 TTC37Q6PGP7 1564 aa40.88■■■■■ 4.13
MACROD1-208ENST00000545464 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP40.88■■■■■ 4.13
MACROD1-208ENST00000545464 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP40.88■■■■■ 4.13
MACROD1-208ENST00000545464 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP40.84■■■■■ 4.13
MACROD1-208ENST00000545464 LMTK3Q96Q04 1460 aa40.83■■■■■ 4.13
MACROD1-208ENST00000545464 POGZQ7Z3K3 1410 aa40.83■■■■■ 4.13
MACROD1-208ENST00000545464 MLECQ14165 292 aa40.8■■■■■ 4.12
MACROD1-208ENST00000545464 YEATS2Q9ULM3 1422 aa40.8■■■■■ 4.12
MACROD1-208ENST00000545464 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa40.79■■■■■ 4.12
MACROD1-208ENST00000545464 UBTFP17480 764 aaKnown RBP40.79■■■■■ 4.12
MACROD1-208ENST00000545464 HSPA2P54652 639 aa40.77■■■■■ 4.12
MACROD1-208ENST00000545464 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa40.76■■■■■ 4.12
MACROD1-208ENST00000545464 SCAPERQ9BY12 1400 aa40.74■■■■■ 4.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 126.1 ms