RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540963.1

CHFR-218, Transcript of checkpoint with forkhead and ring finger domains, humanhuman

TSL 2

Gene CHFR, Length 875 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFR-218ENST00000540963 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa47.69■■■■■ 5.22
CHFR-218ENST00000540963 MAPKBP1O60336 1514 aa47.47■■■■■ 5.19
CHFR-218ENST00000540963 ABCC10Q5T3U5 1492 aa47.46■■■■■ 5.19
CHFR-218ENST00000540963 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP47.46■■■■■ 5.19
CHFR-218ENST00000540963 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa47.43■■■■■ 5.18
CHFR-218ENST00000540963 CUL7Q14999 1698 aa47.39■■■■■ 5.18
CHFR-218ENST00000540963 IGF1RP08069 1367 aa47.37■■■■■ 5.17
CHFR-218ENST00000540963 ADCY10Q96PN6 1610 aa47.37■■■■■ 5.17
CHFR-218ENST00000540963 KIF27Q86VH2 1401 aa47.36■■■■■ 5.17
CHFR-218ENST00000540963 FAM69CQ0P6D2 419 aa47.35■■■■■ 5.17
CHFR-218ENST00000540963 DIP2BQ9P265 1576 aa47.31■■■■■ 5.16
CHFR-218ENST00000540963 PTPRGP23470 1445 aa47.05■■■■■ 5.12
CHFR-218ENST00000540963 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa47.04■■■■■ 5.12
CHFR-218ENST00000540963 KDM6BO15054 1643 aa47.01■■■■■ 5.12
CHFR-218ENST00000540963 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa46.98■■■■■ 5.11
CHFR-218ENST00000540963 TSPOAP1O95153 1857 aa46.94■■■■■ 5.1
CHFR-218ENST00000540963 TNIKQ9UKE5 1360 aa46.94■■■■■ 5.1
CHFR-218ENST00000540963 ABCC2Q92887 1545 aa46.89■■■■■ 5.1
CHFR-218ENST00000540963 IQGAP2Q13576 1575 aa46.88■■■■■ 5.1
CHFR-218ENST00000540963 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa46.8■■■■■ 5.08
CHFR-218ENST00000540963 PLB1Q6P1J6 1458 aa46.78■■■■■ 5.08
CHFR-218ENST00000540963 GLI2P10070 1586 aa46.75■■■■■ 5.07
CHFR-218ENST00000540963 ASXL2Q76L83 1435 aa46.73■■■■■ 5.07
CHFR-218ENST00000540963 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP46.71■■■■■ 5.07
CHFR-218ENST00000540963 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa46.7■■■■■ 5.07
CHFR-218ENST00000540963 UACAQ9BZF9 1416 aa46.68■■■■■ 5.06
CHFR-218ENST00000540963 DISP1Q96F81 1524 aa46.67■■■■■ 5.06
CHFR-218ENST00000540963 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP46.62■■■■■ 5.05
CHFR-218ENST00000540963 UGGT2Q9NYU1 1516 aa46.6■■■■■ 5.05
CHFR-218ENST00000540963 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa46.59■■■■■ 5.05
CHFR-218ENST00000540963 KDM5BQ9UGL1 1544 aa46.56■■■■■ 5.04
CHFR-218ENST00000540963 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP46.47■■■■■ 5.03
CHFR-218ENST00000540963 KIAA0556O60303 1618 aa46.46■■■■■ 5.03
CHFR-218ENST00000540963 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa46.45■■■■■ 5.03
CHFR-218ENST00000540963 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP46.41■■■■■ 5.02
CHFR-218ENST00000540963 TEX14Q8IWB6 1497 aa46.38■■■■■ 5.01
CHFR-218ENST00000540963 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP46.29■■■■■ 5
CHFR-218ENST00000540963 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa46.27■■■■■ 5
CHFR-218ENST00000540963 ADGRL1O94910 1474 aa46.24■■■■■ 4.99
CHFR-218ENST00000540963 WDR7Q9Y4E6 1490 aa46.23■■■■■ 4.99
CHFR-218ENST00000540963 GOLGA3Q08378 1498 aa46.19■■■■■ 4.99
CHFR-218ENST00000540963 ABCA8O94911 1581 aa46.08■■■■■ 4.97
CHFR-218ENST00000540963 CFAP43Q8NDM7 1665 aa46.05■■■■■ 4.96
CHFR-218ENST00000540963 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa46.04■■■■■ 4.96
CHFR-218ENST00000540963 PRXQ9BXM0 1461 aa46■■■■■ 4.95
CHFR-218ENST00000540963 CD109Q6YHK3 1445 aa45.98■■■■■ 4.95
CHFR-218ENST00000540963 KCNH8Q96L42 1107 aa45.85■■■■■ 4.93
CHFR-218ENST00000540963 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP45.81■■■■■ 4.92
CHFR-218ENST00000540963 HECW2Q9P2P5 1572 aa45.76■■■■■ 4.92
CHFR-218ENST00000540963 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP45.73■■■■■ 4.91
CHFR-218ENST00000540963 ARAP3Q8WWN8 1544 aa45.7■■■■■ 4.91
CHFR-218ENST00000540963 ATP10BO94823 1461 aa45.67■■■■■ 4.9
CHFR-218ENST00000540963 PHLDB1Q86UU1 1377 aa45.62■■■■■ 4.89
CHFR-218ENST00000540963 ABCA9Q8IUA7 1624 aa45.59■■■■■ 4.89
CHFR-218ENST00000540963 KIF21BO75037 1637 aa45.57■■■■■ 4.89
CHFR-218ENST00000540963 SAMD9Q5K651 1589 aa45.57■■■■■ 4.89
CHFR-218ENST00000540963 P3H3Q8IVL6 736 aa45.52■■■■■ 4.88
CHFR-218ENST00000540963 CSRNP3Q8WYN3 585 aa45.48■■■■■ 4.87
CHFR-218ENST00000540963 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa45.48■■■■■ 4.87
CHFR-218ENST00000540963 ARID3CA6NKF2 412 aa45.47■■■■■ 4.87
CHFR-218ENST00000540963 NEO1Q92859 1461 aa45.42■■■■■ 4.86
CHFR-218ENST00000540963 ADAMTSL3P82987 1691 aa45.31■■■■■ 4.84
CHFR-218ENST00000540963 EEA1Q15075 1411 aa45.3■■■■■ 4.84
CHFR-218ENST00000540963 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP45.29■■■■■ 4.84
CHFR-218ENST00000540963 RAPGEF3O95398 923 aa45.26■■■■■ 4.84
CHFR-218ENST00000540963 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP45.25■■■■■ 4.83
CHFR-218ENST00000540963 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP45.25■■■■■ 4.83
CHFR-218ENST00000540963 PTPRMP28827 1452 aa45.23■■■■■ 4.83
CHFR-218ENST00000540963 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa45.2■■■■■ 4.83
CHFR-218ENST00000540963 BCORL1Q5H9F3 1711 aa45.16■■■■■ 4.82
CHFR-218ENST00000540963 FHOD3Q2V2M9 1422 aa45.13■■■■■ 4.82
CHFR-218ENST00000540963 PLEKHD1A6NEE1 506 aa45.11■■■■■ 4.81
CHFR-218ENST00000540963 CFAP74Q9C0B2 1584 aa45.07■■■■■ 4.8
CHFR-218ENST00000540963 EFCAB5A4FU69 1503 aa45.06■■■■■ 4.8
CHFR-218ENST00000540963 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP45.04■■■■■ 4.8
CHFR-218ENST00000540963 RICTORQ6R327 1708 aa45.04■■■■■ 4.8
CHFR-218ENST00000540963 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa45.04■■■■■ 4.8
CHFR-218ENST00000540963 MADDQ8WXG6 1647 aa45.02■■■■■ 4.8
CHFR-218ENST00000540963 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP45.01■■■■■ 4.8
CHFR-218ENST00000540963 AKNAQ7Z591 1439 aa45■■■■■ 4.79
CHFR-218ENST00000540963 FANCAO15360 1455 aa44.98■■■■■ 4.79
CHFR-218ENST00000540963 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP44.98■■■■■ 4.79
CHFR-218ENST00000540963 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP44.97■■■■■ 4.79
CHFR-218ENST00000540963 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP44.92■■■■■ 4.78
CHFR-218ENST00000540963 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa44.91■■■■■ 4.78
CHFR-218ENST00000540963 FBXO41Q8TF61 875 aa44.91■■■■■ 4.78
CHFR-218ENST00000540963 TTC37Q6PGP7 1564 aa44.87■■■■■ 4.77
CHFR-218ENST00000540963 LMTK3Q96Q04 1460 aa44.85■■■■■ 4.77
CHFR-218ENST00000540963 MAGI2Q86UL8 1455 aa44.84■■■■■ 4.77
CHFR-218ENST00000540963 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP44.83■■■■■ 4.77
CHFR-218ENST00000540963 POGZQ7Z3K3 1410 aa44.83■■■■■ 4.77
CHFR-218ENST00000540963 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa44.78■■■■■ 4.76
CHFR-218ENST00000540963 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP44.74■■■■■ 4.75
CHFR-218ENST00000540963 PLCH2O75038 1416 aa44.72■■■■■ 4.75
CHFR-218ENST00000540963 YEATS2Q9ULM3 1422 aa44.69■■■■■ 4.75
CHFR-218ENST00000540963 HECW1Q76N89 1606 aa44.68■■■■■ 4.74
CHFR-218ENST00000540963 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa44.66■■■■■ 4.74
CHFR-218ENST00000540963 FMN1Q68DA7 1419 aa44.65■■■■■ 4.74
CHFR-218ENST00000540963 SCAPERQ9BY12 1400 aa44.64■■■■■ 4.74
CHFR-218ENST00000540963 MYO5CQ9NQX4 1742 aa44.58■■■■■ 4.73
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