RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529677.1

PACS1-208, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene PACS1, Length 679 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-208ENST00000529677 FAM69CQ0P6D2 419 aa29.01■■■□□ 2.23
PACS1-208ENST00000529677 KDM6BO15054 1643 aa29■■■□□ 2.23
PACS1-208ENST00000529677 ADCY10Q96PN6 1610 aa28.97■■■□□ 2.23
PACS1-208ENST00000529677 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.94■■■□□ 2.22
PACS1-208ENST00000529677 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.94■■■□□ 2.22
PACS1-208ENST00000529677 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.93■■■□□ 2.22
PACS1-208ENST00000529677 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.92■■■□□ 2.22
PACS1-208ENST00000529677 JPH4Q96JJ6 628 aa28.89■■■□□ 2.22
PACS1-208ENST00000529677 TOP2BQ02880 1626 aa28.87■■■□□ 2.21
PACS1-208ENST00000529677 TSPOAP1O95153 1857 aa28.87■■■□□ 2.21
PACS1-208ENST00000529677 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP28.72■■■□□ 2.19
PACS1-208ENST00000529677 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
PACS1-208ENST00000529677 ADGRL1O94910 1474 aa28.69■■■□□ 2.18
PACS1-208ENST00000529677 HECW2Q9P2P5 1572 aa28.64■■■□□ 2.18
PACS1-208ENST00000529677 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP28.57■■■□□ 2.16
PACS1-208ENST00000529677 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa28.55■■■□□ 2.16
PACS1-208ENST00000529677 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.54■■■□□ 2.16
PACS1-208ENST00000529677 GLI2P10070 1586 aa28.53■■■□□ 2.16
PACS1-208ENST00000529677 ABCC2Q92887 1545 aa28.46■■■□□ 2.15
PACS1-208ENST00000529677 ASXL2Q76L83 1435 aa28.45■■■□□ 2.15
PACS1-208ENST00000529677 CUL7Q14999 1698 aa28.42■■■□□ 2.14
PACS1-208ENST00000529677 PTPRGP23470 1445 aa28.41■■■□□ 2.14
PACS1-208ENST00000529677 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa28.39■■■□□ 2.13
PACS1-208ENST00000529677 PLB1Q6P1J6 1458 aa28.38■■■□□ 2.13
PACS1-208ENST00000529677 IGF1RP08069 1367 aa28.36■■■□□ 2.13
PACS1-208ENST00000529677 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa28.32■■■□□ 2.12
PACS1-208ENST00000529677 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
PACS1-208ENST00000529677 TNIKQ9UKE5 1360 aa28.29■■■□□ 2.12
PACS1-208ENST00000529677 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
PACS1-208ENST00000529677 KDM5BQ9UGL1 1544 aa28.23■■■□□ 2.11
PACS1-208ENST00000529677 UACAQ9BZF9 1416 aa28.2■■■□□ 2.11
PACS1-208ENST00000529677 DISP1Q96F81 1524 aa28.19■■■□□ 2.1
PACS1-208ENST00000529677 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
PACS1-208ENST00000529677 TEX14Q8IWB6 1497 aa28.19■■■□□ 2.1
PACS1-208ENST00000529677 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa28.18■■■□□ 2.1
PACS1-208ENST00000529677 IQGAP2Q13576 1575 aa28.17■■■□□ 2.1
PACS1-208ENST00000529677 KIF27Q86VH2 1401 aa28.16■■■□□ 2.1
PACS1-208ENST00000529677 FBXO41Q8TF61 875 aa28.15■■■□□ 2.1
PACS1-208ENST00000529677 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa28.08■■■□□ 2.09
PACS1-208ENST00000529677 EEA1Q15075 1411 aa28.07■■■□□ 2.08
PACS1-208ENST00000529677 KIF21BO75037 1637 aa28.07■■■□□ 2.08
PACS1-208ENST00000529677 WDR7Q9Y4E6 1490 aa28.02■■■□□ 2.08
PACS1-208ENST00000529677 UGGT2Q9NYU1 1516 aa27.99■■■□□ 2.07
PACS1-208ENST00000529677 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa27.98■■■□□ 2.07
PACS1-208ENST00000529677 KIAA0556O60303 1618 aa27.98■■■□□ 2.07
PACS1-208ENST00000529677 CFAP43Q8NDM7 1665 aa27.96■■■□□ 2.07
PACS1-208ENST00000529677 ADAMTSL3P82987 1691 aa27.91■■■□□ 2.06
PACS1-208ENST00000529677 CD109Q6YHK3 1445 aa27.9■■■□□ 2.06
PACS1-208ENST00000529677 PTPRMP28827 1452 aa27.87■■■□□ 2.05
PACS1-208ENST00000529677 CSRNP3Q8WYN3 585 aa27.83■■■□□ 2.05
PACS1-208ENST00000529677 PRXQ9BXM0 1461 aa27.81■■■□□ 2.04
PACS1-208ENST00000529677 ABCA8O94911 1581 aa27.81■■■□□ 2.04
PACS1-208ENST00000529677 ARAP3Q8WWN8 1544 aa27.8■■■□□ 2.04
PACS1-208ENST00000529677 LMTK3Q96Q04 1460 aa27.77■■■□□ 2.04
PACS1-208ENST00000529677 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP27.77■■■□□ 2.04
PACS1-208ENST00000529677 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.75■■■□□ 2.03
PACS1-208ENST00000529677 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa27.73■■■□□ 2.03
PACS1-208ENST00000529677 KCNH8Q96L42 1107 aa27.73■■■□□ 2.03
PACS1-208ENST00000529677 MADDQ8WXG6 1647 aa27.72■■■□□ 2.03
PACS1-208ENST00000529677 BCORL1Q5H9F3 1711 aa27.72■■■□□ 2.03
PACS1-208ENST00000529677 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa27.66■■■□□ 2.02
PACS1-208ENST00000529677 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa27.65■■■□□ 2.02
PACS1-208ENST00000529677 ABCA9Q8IUA7 1624 aa27.61■■■□□ 2.01
PACS1-208ENST00000529677 GOLGA3Q08378 1498 aa27.58■■■□□ 2.01
PACS1-208ENST00000529677 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
PACS1-208ENST00000529677 RAPGEF3O95398 923 aa27.56■■■□□ 2
PACS1-208ENST00000529677 ILDR2Q71H61 639 aa27.55■■■□□ 2
PACS1-208ENST00000529677 ATP10BO94823 1461 aa27.52■■■□□ 2
PACS1-208ENST00000529677 HSPA2P54652 639 aa27.5■■□□□ 1.99
PACS1-208ENST00000529677 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa27.49■■□□□ 1.99
PACS1-208ENST00000529677 PHLDB1Q86UU1 1377 aa27.48■■□□□ 1.99
PACS1-208ENST00000529677 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa27.47■■□□□ 1.99
PACS1-208ENST00000529677 NEO1Q92859 1461 aa27.47■■□□□ 1.99
PACS1-208ENST00000529677 ARID3CA6NKF2 412 aa27.45■■□□□ 1.98
PACS1-208ENST00000529677 CERKQ8TCT0 537 aa27.44■■□□□ 1.98
PACS1-208ENST00000529677 RICTORQ6R327 1708 aa27.41■■□□□ 1.98
PACS1-208ENST00000529677 SOCS7O14512 581 aa27.39■■□□□ 1.98
PACS1-208ENST00000529677 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
PACS1-208ENST00000529677 DISP3Q9P2K9 1392 aa27.35■■□□□ 1.97
PACS1-208ENST00000529677 UBTFP17480 764 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
PACS1-208ENST00000529677 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa27.28■■□□□ 1.96
PACS1-208ENST00000529677 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa27.27■■□□□ 1.96
PACS1-208ENST00000529677 TTC37Q6PGP7 1564 aa27.26■■□□□ 1.96
PACS1-208ENST00000529677 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa27.26■■□□□ 1.96
PACS1-208ENST00000529677 FHOD3Q2V2M9 1422 aa27.26■■□□□ 1.95
PACS1-208ENST00000529677 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.25■■□□□ 1.95
PACS1-208ENST00000529677 SAMD9Q5K651 1589 aa27.25■■□□□ 1.95
PACS1-208ENST00000529677 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP27.25■■□□□ 1.95
PACS1-208ENST00000529677 YEATS2Q9ULM3 1422 aa27.24■■□□□ 1.95
PACS1-208ENST00000529677 PLPPR3Q6T4P5 718 aa27.24■■□□□ 1.95
PACS1-208ENST00000529677 P3H3Q8IVL6 736 aa27.24■■□□□ 1.95
PACS1-208ENST00000529677 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa27.24■■□□□ 1.95
PACS1-208ENST00000529677 STRCQ7RTU9 1775 aa27.22■■□□□ 1.95
PACS1-208ENST00000529677 FANCAO15360 1455 aa27.22■■□□□ 1.95
PACS1-208ENST00000529677 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa27.22■■□□□ 1.95
PACS1-208ENST00000529677 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
PACS1-208ENST00000529677 AKNAQ7Z591 1439 aa27.19■■□□□ 1.94
PACS1-208ENST00000529677 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa27.19■■□□□ 1.94
PACS1-208ENST00000529677 PREX1Q8TCU6 1659 aa27.17■■□□□ 1.94
PACS1-208ENST00000529677 EFCAB5A4FU69 1503 aa27.16■■□□□ 1.94
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