RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526137.1

SIPA1-202, Transcript of signal-induced proliferation-associated 1, humanhuman

TSL 3

Gene SIPA1, Length 379 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIPA1-202ENST00000526137 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa45.59■■■■■ 4.89
SIPA1-202ENST00000526137 KIF27Q86VH2 1401 aa45.52■■■■■ 4.88
SIPA1-202ENST00000526137 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP45.52■■■■■ 4.88
SIPA1-202ENST00000526137 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa45.48■■■■■ 4.87
SIPA1-202ENST00000526137 FAM69CQ0P6D2 419 aa45.46■■■■■ 4.87
SIPA1-202ENST00000526137 ABCC10Q5T3U5 1492 aa45.38■■■■■ 4.86
SIPA1-202ENST00000526137 KIF13AQ9H1H9 1805 aa45.37■■■■■ 4.85
SIPA1-202ENST00000526137 MAPKBP1O60336 1514 aa45.3■■■■■ 4.84
SIPA1-202ENST00000526137 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa45.29■■■■■ 4.84
SIPA1-202ENST00000526137 ADCY10Q96PN6 1610 aa45.27■■■■■ 4.84
SIPA1-202ENST00000526137 CUL7Q14999 1698 aa45.27■■■■■ 4.84
SIPA1-202ENST00000526137 PTPRGP23470 1445 aa45.18■■■■■ 4.82
SIPA1-202ENST00000526137 DIP2BQ9P265 1576 aa45.14■■■■■ 4.82
SIPA1-202ENST00000526137 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP45.11■■■■■ 4.81
SIPA1-202ENST00000526137 TNIKQ9UKE5 1360 aa45.05■■■■■ 4.8
SIPA1-202ENST00000526137 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa45.04■■■■■ 4.8
SIPA1-202ENST00000526137 ABCC2Q92887 1545 aa44.9■■■■■ 4.78
SIPA1-202ENST00000526137 IQGAP2Q13576 1575 aa44.89■■■■■ 4.78
SIPA1-202ENST00000526137 ASXL2Q76L83 1435 aa44.81■■■■■ 4.76
SIPA1-202ENST00000526137 DISP1Q96F81 1524 aa44.8■■■■■ 4.76
SIPA1-202ENST00000526137 KDM6BO15054 1643 aa44.8■■■■■ 4.76
SIPA1-202ENST00000526137 UACAQ9BZF9 1416 aa44.79■■■■■ 4.76
SIPA1-202ENST00000526137 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa44.78■■■■■ 4.76
SIPA1-202ENST00000526137 PLB1Q6P1J6 1458 aa44.77■■■■■ 4.76
SIPA1-202ENST00000526137 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa44.77■■■■■ 4.76
SIPA1-202ENST00000526137 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa44.74■■■■■ 4.75
SIPA1-202ENST00000526137 TSPOAP1O95153 1857 aa44.72■■■■■ 4.75
SIPA1-202ENST00000526137 UGGT2Q9NYU1 1516 aa44.66■■■■■ 4.74
SIPA1-202ENST00000526137 GLI2P10070 1586 aa44.62■■■■■ 4.73
SIPA1-202ENST00000526137 KDM5BQ9UGL1 1544 aa44.59■■■■■ 4.73
SIPA1-202ENST00000526137 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP44.51■■■■■ 4.72
SIPA1-202ENST00000526137 KIAA0556O60303 1618 aa44.47■■■■■ 4.71
SIPA1-202ENST00000526137 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP44.45■■■■■ 4.71
SIPA1-202ENST00000526137 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP44.42■■■■■ 4.7
SIPA1-202ENST00000526137 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP44.35■■■■■ 4.69
SIPA1-202ENST00000526137 TEX14Q8IWB6 1497 aa44.29■■■■■ 4.68
SIPA1-202ENST00000526137 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa44.29■■■■■ 4.68
SIPA1-202ENST00000526137 WDR7Q9Y4E6 1490 aa44.28■■■■■ 4.68
SIPA1-202ENST00000526137 GOLGA3Q08378 1498 aa44.27■■■■■ 4.68
SIPA1-202ENST00000526137 PRXQ9BXM0 1461 aa44.27■■■■■ 4.68
SIPA1-202ENST00000526137 KCNH8Q96L42 1107 aa44.19■■■■■ 4.66
SIPA1-202ENST00000526137 ADGRL1O94910 1474 aa44.16■■■■■ 4.66
SIPA1-202ENST00000526137 ABCA8O94911 1581 aa44.14■■■■■ 4.66
SIPA1-202ENST00000526137 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa44.14■■■■■ 4.66
SIPA1-202ENST00000526137 CD109Q6YHK3 1445 aa44.11■■■■■ 4.65
SIPA1-202ENST00000526137 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa44.04■■■■■ 4.64
SIPA1-202ENST00000526137 P3H3Q8IVL6 736 aa44.03■■■■■ 4.64
SIPA1-202ENST00000526137 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP43.98■■■■■ 4.63
SIPA1-202ENST00000526137 ARID3CA6NKF2 412 aa43.96■■■■■ 4.63
SIPA1-202ENST00000526137 CSRNP3Q8WYN3 585 aa43.95■■■■■ 4.63
SIPA1-202ENST00000526137 ATP10BO94823 1461 aa43.89■■■■■ 4.62
SIPA1-202ENST00000526137 CFAP43Q8NDM7 1665 aa43.88■■■■■ 4.61
SIPA1-202ENST00000526137 ARAP3Q8WWN8 1544 aa43.7■■■■■ 4.59
SIPA1-202ENST00000526137 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP43.67■■■■■ 4.58
SIPA1-202ENST00000526137 SAMD9Q5K651 1589 aa43.66■■■■■ 4.58
SIPA1-202ENST00000526137 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP43.64■■■■■ 4.58
SIPA1-202ENST00000526137 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP43.64■■■■■ 4.58
SIPA1-202ENST00000526137 PHLDB1Q86UU1 1377 aa43.63■■■■■ 4.57
SIPA1-202ENST00000526137 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP43.62■■■■■ 4.57
SIPA1-202ENST00000526137 HECW2Q9P2P5 1572 aa43.59■■■■■ 4.57
SIPA1-202ENST00000526137 EEA1Q15075 1411 aa43.56■■■■■ 4.56
SIPA1-202ENST00000526137 RAPGEF3O95398 923 aa43.56■■■■■ 4.56
SIPA1-202ENST00000526137 ABCA9Q8IUA7 1624 aa43.55■■■■■ 4.56
SIPA1-202ENST00000526137 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa43.54■■■■■ 4.56
SIPA1-202ENST00000526137 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP43.51■■■■■ 4.56
SIPA1-202ENST00000526137 FHOD3Q2V2M9 1422 aa43.49■■■■■ 4.55
SIPA1-202ENST00000526137 NEO1Q92859 1461 aa43.46■■■■■ 4.55
SIPA1-202ENST00000526137 KIF21BO75037 1637 aa43.46■■■■■ 4.55
SIPA1-202ENST00000526137 PLEKHD1A6NEE1 506 aa43.41■■■■■ 4.54
SIPA1-202ENST00000526137 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP43.25■■■■■ 4.51
SIPA1-202ENST00000526137 PTPRMP28827 1452 aa43.25■■■■■ 4.51
SIPA1-202ENST00000526137 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa43.23■■■■■ 4.51
SIPA1-202ENST00000526137 ADAMTSL3P82987 1691 aa43.19■■■■■ 4.5
SIPA1-202ENST00000526137 AKNAQ7Z591 1439 aa43.19■■■■■ 4.5
SIPA1-202ENST00000526137 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP43.19■■■■■ 4.5
SIPA1-202ENST00000526137 EFCAB5A4FU69 1503 aa43.18■■■■■ 4.5
SIPA1-202ENST00000526137 FANCAO15360 1455 aa43.14■■■■■ 4.5
SIPA1-202ENST00000526137 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP43.12■■■■■ 4.49
SIPA1-202ENST00000526137 EHMT2Q96KQ7 1210 aa43.08■■■■■ 4.49
SIPA1-202ENST00000526137 UBTFP17480 764 aaKnown RBP43.06■■■■■ 4.48
SIPA1-202ENST00000526137 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP43.03■■■■■ 4.48
SIPA1-202ENST00000526137 BCORL1Q5H9F3 1711 aa43.03■■■■■ 4.48
SIPA1-202ENST00000526137 TTC37Q6PGP7 1564 aa43■■■■■ 4.47
SIPA1-202ENST00000526137 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa43■■■■■ 4.47
SIPA1-202ENST00000526137 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP42.99■■■■■ 4.47
SIPA1-202ENST00000526137 MADDQ8WXG6 1647 aa42.97■■■■■ 4.47
SIPA1-202ENST00000526137 RICTORQ6R327 1708 aa42.96■■■■■ 4.47
SIPA1-202ENST00000526137 PLCH2O75038 1416 aa42.94■■■■■ 4.46
SIPA1-202ENST00000526137 CFAP74Q9C0B2 1584 aa42.94■■■■■ 4.46
SIPA1-202ENST00000526137 YEATS2Q9ULM3 1422 aa42.93■■■■■ 4.46
SIPA1-202ENST00000526137 FMN1Q68DA7 1419 aa42.9■■■■■ 4.46
SIPA1-202ENST00000526137 SCAPERQ9BY12 1400 aa42.89■■■■■ 4.46
SIPA1-202ENST00000526137 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa42.89■■■■■ 4.46
SIPA1-202ENST00000526137 CHIC1Q5VXU3 224 aa42.88■■■■■ 4.45
SIPA1-202ENST00000526137 MAGI2Q86UL8 1455 aa42.87■■■■■ 4.45
SIPA1-202ENST00000526137 POGZQ7Z3K3 1410 aa42.87■■■■■ 4.45
SIPA1-202ENST00000526137 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa42.87■■■■■ 4.45
SIPA1-202ENST00000526137 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP42.85■■■■■ 4.45
SIPA1-202ENST00000526137 LMTK3Q96Q04 1460 aa42.85■■■■■ 4.45
SIPA1-202ENST00000526137 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP42.84■■■■■ 4.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.6 ms