RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522702.5

FAM49B-222, Transcript of family with sequence similarity 49 member B, human

TSL 4

Gene FAM49B, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM49B-222	ENST00000522702	ASTL	Q6HA08	431 aa	Predicted RBP	11.46	□□□□□ -0.57
FAM49B-222	ENST00000522702	ATMIN	O43313	823 aa	Predicted RBP	11.45	□□□□□ -0.58
FAM49B-222	ENST00000522702	FKBP8	Q14318	412 aa		11.45	□□□□□ -0.58
FAM49B-222	ENST00000522702	KIF12	Q96FN5	646 aa		11.45	□□□□□ -0.58
FAM49B-222	ENST00000522702	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	11.44	□□□□□ -0.58
FAM49B-222	ENST00000522702	C7	P10643	843 aa		11.43	□□□□□ -0.58
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC39A7	Q92504	469 aa		11.43	□□□□□ -0.58
FAM49B-222	ENST00000522702	RASEF	Q8IZ41	740 aa		11.42	□□□□□ -0.58
FAM49B-222	ENST00000522702	POTEB2	H3BUK9	544 aa		11.41	□□□□□ -0.58
FAM49B-222	ENST00000522702	OTUD5	Q96G74	571 aa		11.41	□□□□□ -0.58
FAM49B-222	ENST00000522702	METRN	Q9UJH8	293 aa		11.41	□□□□□ -0.58
FAM49B-222	ENST00000522702	MAP3K13	O43283	966 aa		11.38	□□□□□ -0.59
FAM49B-222	ENST00000522702	ATN1	P54259	1190 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
FAM49B-222	ENST00000522702	BMP2K	Q9NSY1	1161 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
FAM49B-222	ENST00000522702	TIE1	P35590	1138 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FAM49B-222	ENST00000522702	NUBP1	P53384	320 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FAM49B-222	ENST00000522702	MAMSTR	Q6ZN01	415 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FAM49B-222	ENST00000522702	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FAM49B-222	ENST00000522702	FBXO3	Q9UK99	471 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FAM49B-222	ENST00000522702	FAM212A	Q96EL1	285 aa		11.29	□□□□□ -0.6
FAM49B-222	ENST00000522702	TRPC6	Q9Y210	931 aa		11.29	□□□□□ -0.6
FAM49B-222	ENST00000522702	PCDHB13	Q9Y5F0	798 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FAM49B-222	ENST00000522702	TTLL13P	A6NNM8	815 aa		11.23	□□□□□ -0.61
FAM49B-222	ENST00000522702	SEC24B	O95487	1268 aa		11.23	□□□□□ -0.61
FAM49B-222	ENST00000522702	POTEJ	P0CG39	1038 aa		11.23	□□□□□ -0.61
FAM49B-222	ENST00000522702	SCUBE2	Q9NQ36	999 aa		11.23	□□□□□ -0.61
FAM49B-222	ENST00000522702	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		11.22	□□□□□ -0.61
FAM49B-222	ENST00000522702	IFNL1	Q8IU54	200 aa		11.19	□□□□□ -0.62
FAM49B-222	ENST00000522702	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		11.18	□□□□□ -0.62
FAM49B-222	ENST00000522702	POTEF	A5A3E0	1075 aa		11.16	□□□□□ -0.62
FAM49B-222	ENST00000522702	IER5L	Q5T953	404 aa		11.16	□□□□□ -0.62
FAM49B-222	ENST00000522702	KLHL34	Q8N239	644 aa		11.16	□□□□□ -0.62
FAM49B-222	ENST00000522702	TMEM106C	Q9BVX2	250 aa		11.15	□□□□□ -0.62
FAM49B-222	ENST00000522702	POTEM	A6NI47	508 aa		11.14	□□□□□ -0.63
FAM49B-222	ENST00000522702	PLSCR2	Q9NRY7	297 aa		11.14	□□□□□ -0.63
FAM49B-222	ENST00000522702	COLQ	Q9Y215	455 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
FAM49B-222	ENST00000522702	PYGB	P11216	843 aa		11.12	□□□□□ -0.63
FAM49B-222	ENST00000522702	POTEG	Q6S5H5	508 aa		11.11	□□□□□ -0.63
FAM49B-222	ENST00000522702	FAM163A	Q96GL9	167 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
FAM49B-222	ENST00000522702	VASP	P50552	380 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
FAM49B-222	ENST00000522702	GSE1	Q14687	1217 aa		11.07	□□□□□ -0.64
FAM49B-222	ENST00000522702	PLCG2	P16885	1265 aa		11.06	□□□□□ -0.64
FAM49B-222	ENST00000522702	PCDHB8	Q9UN66	801 aa		11.04	□□□□□ -0.64
FAM49B-222	ENST00000522702	PCDH10	Q9P2E7	1040 aa		11.03	□□□□□ -0.64
FAM49B-222	ENST00000522702	OCEL1	Q9H607	264 aa		11	□□□□□ -0.65
FAM49B-222	ENST00000522702	IRX5	P78411	483 aa	Predicted RBP	10.98	□□□□□ -0.65
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF467	Q7Z7K2	595 aa	Predicted RBP	10.98	□□□□□ -0.65
FAM49B-222	ENST00000522702	SLAIN1	Q8ND83	568 aa		10.97	□□□□□ -0.65
FAM49B-222	ENST00000522702	CHRM1	P11229	460 aa	Predicted RBP	10.96	□□□□□ -0.65
FAM49B-222	ENST00000522702	GOLGA2	Q08379	1002 aa		10.94	□□□□□ -0.66
FAM49B-222	ENST00000522702	LCE2D	Q5TA82	110 aa	Predicted RBP	10.94	□□□□□ -0.66
FAM49B-222	ENST00000522702	SPOCK2	Q92563	424 aa		10.92	□□□□□ -0.66
FAM49B-222	ENST00000522702	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	10.91	□□□□□ -0.66
FAM49B-222	ENST00000522702	CIZ1	Q9ULV3	898 aa	Predicted RBP	10.89	□□□□□ -0.67
FAM49B-222	ENST00000522702	PSEN1	P49768	467 aa		10.88	□□□□□ -0.67
FAM49B-222	ENST00000522702	IFNLR1	Q8IU57	520 aa	Predicted RBP	10.88	□□□□□ -0.67
FAM49B-222	ENST00000522702	EIF2AK3	Q9NZJ5	1116 aa	Known RBP	10.87	□□□□□ -0.67
FAM49B-222	ENST00000522702	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	10.84	□□□□□ -0.67
FAM49B-222	ENST00000522702	SNPH	O15079	494 aa		10.83	□□□□□ -0.68
FAM49B-222	ENST00000522702	ST18	O60284	1047 aa		10.82	□□□□□ -0.68
FAM49B-222	ENST00000522702	PDAP1	Q13442	181 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
FAM49B-222	ENST00000522702	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	10.82	□□□□□ -0.68
FAM49B-222	ENST00000522702	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		10.79	□□□□□ -0.68
FAM49B-222	ENST00000522702	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		10.79	□□□□□ -0.68
FAM49B-222	ENST00000522702	PDCD7	Q8N8D1	485 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
FAM49B-222	ENST00000522702	TMEM121B	Q9BXQ6	578 aa	Predicted RBP	10.74	□□□□□ -0.69
FAM49B-222	ENST00000522702	TRIM41	Q8WV44	630 aa		10.73	□□□□□ -0.69
FAM49B-222	ENST00000522702	CABP2	Q9NPB3	220 aa		10.73	□□□□□ -0.69
FAM49B-222	ENST00000522702		G3V3G9	751 aa		10.72	□□□□□ -0.69
FAM49B-222	ENST00000522702	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	10.68	□□□□□ -0.7
FAM49B-222	ENST00000522702	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		10.67	□□□□□ -0.7
FAM49B-222	ENST00000522702	BOLA1	Q9Y3E2	137 aa		10.65	□□□□□ -0.7
FAM49B-222	ENST00000522702	MARVELD3	Q96A59	401 aa		10.64	□□□□□ -0.71
FAM49B-222	ENST00000522702	EMP3	P54852	163 aa		10.59	□□□□□ -0.71
FAM49B-222	ENST00000522702	EFCAB3	Q8N7B9	438 aa		10.59	□□□□□ -0.71
FAM49B-222	ENST00000522702	RIOK3	O14730	519 aa	Known RBP	10.57	□□□□□ -0.72
FAM49B-222	ENST00000522702	SOX12	O15370	315 aa		10.53	□□□□□ -0.72
FAM49B-222	ENST00000522702	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	10.52	□□□□□ -0.73
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF710	Q8N1W2	664 aa		10.52	□□□□□ -0.73
FAM49B-222	ENST00000522702	FAM205C	A6NFA0	338 aa		10.51	□□□□□ -0.73
FAM49B-222	ENST00000522702	SPNS2	Q8IVW8	549 aa		10.51	□□□□□ -0.73
FAM49B-222	ENST00000522702	ZFP91-CNTF	A0A0A6YYC7	529 aa	Predicted RBP	10.5	□□□□□ -0.73
FAM49B-222	ENST00000522702	ZFP91	Q96JP5	570 aa	Predicted RBP	10.5	□□□□□ -0.73
FAM49B-222	ENST00000522702	DOK7	Q18PE1	504 aa		10.49	□□□□□ -0.73
FAM49B-222	ENST00000522702	HS3ST6	Q96QI5	342 aa		10.49	□□□□□ -0.73
FAM49B-222	ENST00000522702	TAOK2	Q9UL54	1235 aa		10.49	□□□□□ -0.73
FAM49B-222	ENST00000522702	HOXB3	P14651	431 aa	Predicted RBP	10.47	□□□□□ -0.73
FAM49B-222	ENST00000522702	MMRN1	Q13201	1228 aa		10.47	□□□□□ -0.73
FAM49B-222	ENST00000522702	RNF25	Q96BH1	459 aa	Predicted RBP	10.47	□□□□□ -0.73
FAM49B-222	ENST00000522702	RIMBP2	O15034	1052 aa		10.45	□□□□□ -0.74
FAM49B-222	ENST00000522702	MICALL2	Q8IY33	904 aa		10.45	□□□□□ -0.74
FAM49B-222	ENST00000522702	POTEB3	A0JP26	581 aa		10.44	□□□□□ -0.74
FAM49B-222	ENST00000522702	POTEB	Q6S5H4	581 aa		10.44	□□□□□ -0.74
FAM49B-222	ENST00000522702	HOXB1	P14653	301 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
FAM49B-222	ENST00000522702	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		10.43	□□□□□ -0.74
FAM49B-222	ENST00000522702	ERBB3	P21860	1342 aa		10.41	□□□□□ -0.74
FAM49B-222	ENST00000522702	NLRP6	P59044	892 aa		10.4	□□□□□ -0.74
FAM49B-222	ENST00000522702	MS4A4A	Q96JQ5	239 aa		10.4	□□□□□ -0.74
FAM49B-222	ENST00000522702	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	10.39	□□□□□ -0.75
FAM49B-222	ENST00000522702	KRTAP3-3	Q9BYR6	98 aa		10.38	□□□□□ -0.75

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