RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520911.5

RNF130-204, Transcript of ring finger protein 130, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RNF130, Length 1,790 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF130-204ENST00000520911 OSCARQ8IYS5 282 aa45.86■■■■■ 4.93
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RNF130-204ENST00000520911 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa45.73■■■■■ 4.91
RNF130-204ENST00000520911 TNIKQ9UKE5 1360 aa45.69■■■■■ 4.9
RNF130-204ENST00000520911 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP45.68■■■■■ 4.9
RNF130-204ENST00000520911 CLASP1Q7Z460 1538 aa45.67■■■■■ 4.9
RNF130-204ENST00000520911 IQGAP2Q13576 1575 aa45.64■■■■■ 4.9
RNF130-204ENST00000520911 JPH4Q96JJ6 628 aa45.56■■■■■ 4.88
RNF130-204ENST00000520911 SHROOM2Q13796 1616 aa45.41■■■■■ 4.86
RNF130-204ENST00000520911 UGGT2Q9NYU1 1516 aa45.4■■■■■ 4.86
RNF130-204ENST00000520911 CEP162Q5TB80 1403 aa45.37■■■■■ 4.85
RNF130-204ENST00000520911 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP45.36■■■■■ 4.85
RNF130-204ENST00000520911 P3H3Q8IVL6 736 aa45.33■■■■■ 4.85
RNF130-204ENST00000520911 CLIP1P30622 1438 aa45.31■■■■■ 4.84
RNF130-204ENST00000520911 DISP1Q96F81 1524 aa45.3■■■■■ 4.84
RNF130-204ENST00000520911 ERCC6L2Q5T890 1561 aa45.3■■■■■ 4.84
RNF130-204ENST00000520911 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa45.25■■■■■ 4.83
RNF130-204ENST00000520911 SAMD9Q5K651 1589 aa45.22■■■■■ 4.83
RNF130-204ENST00000520911 KIAA0556O60303 1618 aa45.19■■■■■ 4.83
RNF130-204ENST00000520911 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa45.19■■■■■ 4.83
RNF130-204ENST00000520911 EFCAB5A4FU69 1503 aa45.17■■■■■ 4.82
RNF130-204ENST00000520911 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP45.15■■■■■ 4.82
RNF130-204ENST00000520911 FHOD3Q2V2M9 1422 aa45.14■■■■■ 4.82
RNF130-204ENST00000520911 ARHGEF11O15085 1522 aa45.1■■■■■ 4.81
RNF130-204ENST00000520911 ARAP1Q96P48 1450 aa45.07■■■■■ 4.81
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RNF130-204ENST00000520911 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa44.99■■■■■ 4.79
RNF130-204ENST00000520911 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa44.99■■■■■ 4.79
RNF130-204ENST00000520911 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.95■■■■■ 4.79
RNF130-204ENST00000520911 PTPRGP23470 1445 aa44.94■■■■■ 4.78
RNF130-204ENST00000520911 FMN1Q68DA7 1419 aa44.78■■■■■ 4.76
RNF130-204ENST00000520911 CYB5RLQ6IPT4 315 aa44.76■■■■■ 4.76
RNF130-204ENST00000520911 PLB1Q6P1J6 1458 aa44.76■■■■■ 4.76
RNF130-204ENST00000520911 VPS8Q8N3P4 1428 aa44.71■■■■■ 4.75
RNF130-204ENST00000520911 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP44.66■■■■■ 4.74
RNF130-204ENST00000520911 UACAQ9BZF9 1416 aa44.65■■■■■ 4.74
RNF130-204ENST00000520911 ABCA8O94911 1581 aa44.64■■■■■ 4.74
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RNF130-204ENST00000520911 ARID3CA6NKF2 412 aa44.59■■■■■ 4.73
RNF130-204ENST00000520911 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa44.58■■■■■ 4.73
RNF130-204ENST00000520911 ABCC2Q92887 1545 aa44.51■■■■■ 4.72
RNF130-204ENST00000520911 ADCY10Q96PN6 1610 aa44.51■■■■■ 4.72
RNF130-204ENST00000520911 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP44.5■■■■■ 4.71
RNF130-204ENST00000520911 FYCO1Q9BQS8 1478 aa44.49■■■■■ 4.71
RNF130-204ENST00000520911 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa44.46■■■■■ 4.71
RNF130-204ENST00000520911 HECW1Q76N89 1606 aa44.44■■■■■ 4.7
RNF130-204ENST00000520911 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa44.39■■■■■ 4.7
RNF130-204ENST00000520911 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP44.36■■■■■ 4.69
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RNF130-204ENST00000520911 ATP10BO94823 1461 aa44.34■■■■■ 4.69
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RNF130-204ENST00000520911 KDM5BQ9UGL1 1544 aa44.29■■■■■ 4.68
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RNF130-204ENST00000520911 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP44.24■■■■■ 4.67
RNF130-204ENST00000520911 CCDC18Q5T9S5 1454 aa44.23■■■■■ 4.67
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RNF130-204ENST00000520911 TIAM1Q13009 1591 aa44.16■■■■■ 4.66
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RNF130-204ENST00000520911 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP44.04■■■■■ 4.64
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RNF130-204ENST00000520911 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa43.98■■■■■ 4.63
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RNF130-204ENST00000520911 MAPKBP1O60336 1514 aa43.93■■■■■ 4.62
RNF130-204ENST00000520911 WDR7Q9Y4E6 1490 aa43.92■■■■■ 4.62
RNF130-204ENST00000520911 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP43.92■■■■■ 4.62
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RNF130-204ENST00000520911 GLI2P10070 1586 aa43.51■■■■■ 4.56
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RNF130-204ENST00000520911 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa43.4■■■■■ 4.54
RNF130-204ENST00000520911 MYO5CQ9NQX4 1742 aa43.39■■■■■ 4.54
RNF130-204ENST00000520911 PLCH2O75038 1416 aa43.38■■■■■ 4.53
RNF130-204ENST00000520911 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP43.36■■■■■ 4.53
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RNF130-204ENST00000520911 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP43.31■■■■■ 4.52
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