RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511907.1

CTBP1-211, Transcript of C-terminal binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTBP1, Length 900 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP1-211ENST00000511907 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP33.36■■■□□ 2.93
CTBP1-211ENST00000511907 JPH4Q96JJ6 628 aa33.35■■■□□ 2.93
CTBP1-211ENST00000511907 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa33.28■■■□□ 2.92
CTBP1-211ENST00000511907 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa33.25■■■□□ 2.91
CTBP1-211ENST00000511907 IQGAP2Q13576 1575 aa33.04■■■□□ 2.88
CTBP1-211ENST00000511907 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa33.04■■■□□ 2.88
CTBP1-211ENST00000511907 ADCY10Q96PN6 1610 aa32.99■■■□□ 2.87
CTBP1-211ENST00000511907 KIF13AQ9H1H9 1805 aa32.93■■■□□ 2.86
CTBP1-211ENST00000511907 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa32.92■■■□□ 2.86
CTBP1-211ENST00000511907 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP32.9■■■□□ 2.86
CTBP1-211ENST00000511907 PTPRGP23470 1445 aa32.87■■■□□ 2.85
CTBP1-211ENST00000511907 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP32.87■■■□□ 2.85
CTBP1-211ENST00000511907 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa32.85■■■□□ 2.85
CTBP1-211ENST00000511907 TNIKQ9UKE5 1360 aa32.84■■■□□ 2.85
CTBP1-211ENST00000511907 DISP1Q96F81 1524 aa32.83■■■□□ 2.85
CTBP1-211ENST00000511907 MAPKBP1O60336 1514 aa32.82■■■□□ 2.85
CTBP1-211ENST00000511907 UGGT2Q9NYU1 1516 aa32.81■■■□□ 2.84
CTBP1-211ENST00000511907 PRXQ9BXM0 1461 aa32.77■■■□□ 2.84
CTBP1-211ENST00000511907 KIAA0556O60303 1618 aa32.75■■■□□ 2.83
CTBP1-211ENST00000511907 ABCC10Q5T3U5 1492 aa32.74■■■□□ 2.83
CTBP1-211ENST00000511907 DIP2BQ9P265 1576 aa32.72■■■□□ 2.83
CTBP1-211ENST00000511907 FAM69CQ0P6D2 419 aa32.7■■■□□ 2.83
CTBP1-211ENST00000511907 ABCC2Q92887 1545 aa32.67■■■□□ 2.82
CTBP1-211ENST00000511907 UACAQ9BZF9 1416 aa32.65■■■□□ 2.82
CTBP1-211ENST00000511907 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa32.63■■■□□ 2.81
CTBP1-211ENST00000511907 CSRNP3Q8WYN3 585 aa32.6■■■□□ 2.81
CTBP1-211ENST00000511907 GOLGA3Q08378 1498 aa32.57■■■□□ 2.8
CTBP1-211ENST00000511907 TSPOAP1O95153 1857 aa32.57■■■□□ 2.8
CTBP1-211ENST00000511907 ASXL2Q76L83 1435 aa32.53■■■□□ 2.8
CTBP1-211ENST00000511907 EEA1Q15075 1411 aa32.52■■■□□ 2.8
CTBP1-211ENST00000511907 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP32.51■■■□□ 2.8
CTBP1-211ENST00000511907 KDM5BQ9UGL1 1544 aa32.49■■■□□ 2.79
CTBP1-211ENST00000511907 PLB1Q6P1J6 1458 aa32.48■■■□□ 2.79
CTBP1-211ENST00000511907 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP32.47■■■□□ 2.79
CTBP1-211ENST00000511907 ABCA8O94911 1581 aa32.41■■■□□ 2.78
CTBP1-211ENST00000511907 GLI2P10070 1586 aa32.39■■■□□ 2.78
CTBP1-211ENST00000511907 P3H3Q8IVL6 736 aa32.36■■■□□ 2.77
CTBP1-211ENST00000511907 KDM6BO15054 1643 aa32.36■■■□□ 2.77
CTBP1-211ENST00000511907 SAMD9Q5K651 1589 aa32.34■■■□□ 2.77
CTBP1-211ENST00000511907 CHIC1Q5VXU3 224 aa32.34■■■□□ 2.77
CTBP1-211ENST00000511907 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP32.34■■■□□ 2.77
CTBP1-211ENST00000511907 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP32.34■■■□□ 2.77
CTBP1-211ENST00000511907 KIF21BO75037 1637 aa32.31■■■□□ 2.76
CTBP1-211ENST00000511907 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa32.27■■■□□ 2.76
CTBP1-211ENST00000511907 WDR7Q9Y4E6 1490 aa32.27■■■□□ 2.76
CTBP1-211ENST00000511907 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP32.26■■■□□ 2.75
CTBP1-211ENST00000511907 ARID3CA6NKF2 412 aa32.18■■■□□ 2.74
CTBP1-211ENST00000511907 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP32.17■■■□□ 2.74
CTBP1-211ENST00000511907 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa32.16■■■□□ 2.74
CTBP1-211ENST00000511907 EHMT2Q96KQ7 1210 aa32.16■■■□□ 2.74
CTBP1-211ENST00000511907 FHOD3Q2V2M9 1422 aa32.14■■■□□ 2.74
CTBP1-211ENST00000511907 KCNH8Q96L42 1107 aa32.13■■■□□ 2.73
CTBP1-211ENST00000511907 ATP10BO94823 1461 aa32.11■■■□□ 2.73
CTBP1-211ENST00000511907 TEX14Q8IWB6 1497 aa32.1■■■□□ 2.73
CTBP1-211ENST00000511907 CFAP43Q8NDM7 1665 aa32.1■■■□□ 2.73
CTBP1-211ENST00000511907 EFCAB5A4FU69 1503 aa32.06■■■□□ 2.72
CTBP1-211ENST00000511907 UBTFP17480 764 aaKnown RBP32.03■■■□□ 2.72
CTBP1-211ENST00000511907 CD109Q6YHK3 1445 aa32.02■■■□□ 2.72
CTBP1-211ENST00000511907 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP32.02■■■□□ 2.72
CTBP1-211ENST00000511907 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP32■■■□□ 2.71
CTBP1-211ENST00000511907 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa31.97■■■□□ 2.71
CTBP1-211ENST00000511907 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP31.97■■■□□ 2.71
CTBP1-211ENST00000511907 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP31.97■■■□□ 2.71
CTBP1-211ENST00000511907 ABCA9Q8IUA7 1624 aa31.9■■■□□ 2.7
CTBP1-211ENST00000511907 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa31.84■■■□□ 2.69
CTBP1-211ENST00000511907 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa31.8■■■□□ 2.68
CTBP1-211ENST00000511907 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP31.77■■■□□ 2.68
CTBP1-211ENST00000511907 PLEKHD1A6NEE1 506 aa31.76■■■□□ 2.67
CTBP1-211ENST00000511907 FMN1Q68DA7 1419 aa31.75■■■□□ 2.67
CTBP1-211ENST00000511907 HECW1Q76N89 1606 aa31.73■■■□□ 2.67
CTBP1-211ENST00000511907 ARAP3Q8WWN8 1544 aa31.71■■■□□ 2.67
CTBP1-211ENST00000511907 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP31.71■■■□□ 2.67
CTBP1-211ENST00000511907 ADGRL1O94910 1474 aa31.69■■■□□ 2.66
CTBP1-211ENST00000511907 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP31.66■■■□□ 2.66
CTBP1-211ENST00000511907 NEO1Q92859 1461 aa31.65■■■□□ 2.66
CTBP1-211ENST00000511907 TTC37Q6PGP7 1564 aa31.65■■■□□ 2.66
CTBP1-211ENST00000511907 PHLDB1Q86UU1 1377 aa31.63■■■□□ 2.65
CTBP1-211ENST00000511907 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa31.61■■■□□ 2.65
CTBP1-211ENST00000511907 RAPGEF3O95398 923 aa31.55■■■□□ 2.64
CTBP1-211ENST00000511907 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa31.55■■■□□ 2.64
CTBP1-211ENST00000511907 CFAP74Q9C0B2 1584 aa31.55■■■□□ 2.64
CTBP1-211ENST00000511907 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP31.54■■■□□ 2.64
CTBP1-211ENST00000511907 FANCAO15360 1455 aa31.52■■■□□ 2.64
CTBP1-211ENST00000511907 AKNAQ7Z591 1439 aa31.49■■■□□ 2.63
CTBP1-211ENST00000511907 KIF14Q15058 1648 aa31.49■■■□□ 2.63
CTBP1-211ENST00000511907 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP31.49■■■□□ 2.63
CTBP1-211ENST00000511907 RICTORQ6R327 1708 aa31.47■■■□□ 2.63
CTBP1-211ENST00000511907 MYO5CQ9NQX4 1742 aa31.46■■■□□ 2.63
CTBP1-211ENST00000511907 CLIP1P30622 1438 aa31.46■■■□□ 2.63
CTBP1-211ENST00000511907 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa31.45■■■□□ 2.63
CTBP1-211ENST00000511907 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP31.44■■■□□ 2.62
CTBP1-211ENST00000511907 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP31.43■■■□□ 2.62
CTBP1-211ENST00000511907 PLCH2O75038 1416 aa31.41■■■□□ 2.62
CTBP1-211ENST00000511907 CCDC18Q5T9S5 1454 aa31.4■■■□□ 2.62
CTBP1-211ENST00000511907 FYCO1Q9BQS8 1478 aa31.37■■■□□ 2.61
CTBP1-211ENST00000511907 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa31.34■■■□□ 2.61
CTBP1-211ENST00000511907 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa31.3■■■□□ 2.6
CTBP1-211ENST00000511907 SCAPERQ9BY12 1400 aa31.3■■■□□ 2.6
CTBP1-211ENST00000511907 ARHGAP5Q13017 1502 aa31.29■■■□□ 2.6
CTBP1-211ENST00000511907 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa31.28■■■□□ 2.6
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