RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511663.5

SH3BP2-220, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 966 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-220ENST00000511663 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP33.37■■■□□ 2.93
SH3BP2-220ENST00000511663 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa33.35■■■□□ 2.93
SH3BP2-220ENST00000511663 CUL7Q14999 1698 aa33.32■■■□□ 2.92
SH3BP2-220ENST00000511663 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa33.32■■■□□ 2.92
SH3BP2-220ENST00000511663 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa33.27■■■□□ 2.92
SH3BP2-220ENST00000511663 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP33.17■■■□□ 2.9
SH3BP2-220ENST00000511663 FAM69CQ0P6D2 419 aa33.13■■■□□ 2.89
SH3BP2-220ENST00000511663 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP33.08■■■□□ 2.89
SH3BP2-220ENST00000511663 PTPRGP23470 1445 aa33.07■■■□□ 2.88
SH3BP2-220ENST00000511663 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa33.07■■■□□ 2.88
SH3BP2-220ENST00000511663 KIF13AQ9H1H9 1805 aa33.05■■■□□ 2.88
SH3BP2-220ENST00000511663 ABCC10Q5T3U5 1492 aa33.03■■■□□ 2.88
SH3BP2-220ENST00000511663 ADCY10Q96PN6 1610 aa33.02■■■□□ 2.88
SH3BP2-220ENST00000511663 MAPKBP1O60336 1514 aa33.02■■■□□ 2.88
SH3BP2-220ENST00000511663 TNIKQ9UKE5 1360 aa32.99■■■□□ 2.87
SH3BP2-220ENST00000511663 IQGAP2Q13576 1575 aa32.96■■■□□ 2.87
SH3BP2-220ENST00000511663 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa32.93■■■□□ 2.86
SH3BP2-220ENST00000511663 DIP2BQ9P265 1576 aa32.87■■■□□ 2.85
SH3BP2-220ENST00000511663 ABCC2Q92887 1545 aa32.8■■■□□ 2.84
SH3BP2-220ENST00000511663 UACAQ9BZF9 1416 aa32.77■■■□□ 2.84
SH3BP2-220ENST00000511663 DISP1Q96F81 1524 aa32.77■■■□□ 2.84
SH3BP2-220ENST00000511663 UGGT2Q9NYU1 1516 aa32.74■■■□□ 2.83
SH3BP2-220ENST00000511663 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa32.74■■■□□ 2.83
SH3BP2-220ENST00000511663 PLB1Q6P1J6 1458 aa32.72■■■□□ 2.83
SH3BP2-220ENST00000511663 ASXL2Q76L83 1435 aa32.7■■■□□ 2.83
SH3BP2-220ENST00000511663 TSPOAP1O95153 1857 aa32.69■■■□□ 2.82
SH3BP2-220ENST00000511663 KDM6BO15054 1643 aa32.65■■■□□ 2.82
SH3BP2-220ENST00000511663 KIAA0556O60303 1618 aa32.62■■■□□ 2.81
SH3BP2-220ENST00000511663 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP32.6■■■□□ 2.81
SH3BP2-220ENST00000511663 GOLGA3Q08378 1498 aa32.59■■■□□ 2.81
SH3BP2-220ENST00000511663 KDM5BQ9UGL1 1544 aa32.57■■■□□ 2.8
SH3BP2-220ENST00000511663 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa32.56■■■□□ 2.8
SH3BP2-220ENST00000511663 GLI2P10070 1586 aa32.56■■■□□ 2.8
SH3BP2-220ENST00000511663 PRXQ9BXM0 1461 aa32.54■■■□□ 2.8
SH3BP2-220ENST00000511663 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP32.48■■■□□ 2.79
SH3BP2-220ENST00000511663 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP32.47■■■□□ 2.79
SH3BP2-220ENST00000511663 CSRNP3Q8WYN3 585 aa32.46■■■□□ 2.79
SH3BP2-220ENST00000511663 TEX14Q8IWB6 1497 aa32.39■■■□□ 2.78
SH3BP2-220ENST00000511663 WDR7Q9Y4E6 1490 aa32.38■■■□□ 2.77
SH3BP2-220ENST00000511663 KCNH8Q96L42 1107 aa32.37■■■□□ 2.77
SH3BP2-220ENST00000511663 P3H3Q8IVL6 736 aa32.36■■■□□ 2.77
SH3BP2-220ENST00000511663 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP32.36■■■□□ 2.77
SH3BP2-220ENST00000511663 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa32.34■■■□□ 2.77
SH3BP2-220ENST00000511663 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa32.34■■■□□ 2.77
SH3BP2-220ENST00000511663 ABCA8O94911 1581 aa32.32■■■□□ 2.77
SH3BP2-220ENST00000511663 EEA1Q15075 1411 aa32.26■■■□□ 2.76
SH3BP2-220ENST00000511663 CD109Q6YHK3 1445 aa32.25■■■□□ 2.75
SH3BP2-220ENST00000511663 ARID3CA6NKF2 412 aa32.23■■■□□ 2.75
SH3BP2-220ENST00000511663 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP32.23■■■□□ 2.75
SH3BP2-220ENST00000511663 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP32.19■■■□□ 2.74
SH3BP2-220ENST00000511663 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP32.16■■■□□ 2.74
SH3BP2-220ENST00000511663 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP32.16■■■□□ 2.74
SH3BP2-220ENST00000511663 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa32.15■■■□□ 2.74
SH3BP2-220ENST00000511663 CFAP43Q8NDM7 1665 aa32.15■■■□□ 2.74
SH3BP2-220ENST00000511663 ATP10BO94823 1461 aa32.12■■■□□ 2.73
SH3BP2-220ENST00000511663 SAMD9Q5K651 1589 aa32.08■■■□□ 2.73
SH3BP2-220ENST00000511663 ADGRL1O94910 1474 aa32.06■■■□□ 2.72
SH3BP2-220ENST00000511663 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa32.01■■■□□ 2.72
SH3BP2-220ENST00000511663 FHOD3Q2V2M9 1422 aa31.95■■■□□ 2.71
SH3BP2-220ENST00000511663 PHLDB1Q86UU1 1377 aa31.94■■■□□ 2.7
SH3BP2-220ENST00000511663 PLEKHD1A6NEE1 506 aa31.94■■■□□ 2.7
SH3BP2-220ENST00000511663 UBTFP17480 764 aaKnown RBP31.91■■■□□ 2.7
SH3BP2-220ENST00000511663 ARAP3Q8WWN8 1544 aa31.9■■■□□ 2.7
SH3BP2-220ENST00000511663 KIF21BO75037 1637 aa31.89■■■□□ 2.7
SH3BP2-220ENST00000511663 ABCA9Q8IUA7 1624 aa31.89■■■□□ 2.7
SH3BP2-220ENST00000511663 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP31.88■■■□□ 2.69
SH3BP2-220ENST00000511663 EHMT2Q96KQ7 1210 aa31.87■■■□□ 2.69
SH3BP2-220ENST00000511663 EFCAB5A4FU69 1503 aa31.85■■■□□ 2.69
SH3BP2-220ENST00000511663 CHIC1Q5VXU3 224 aa31.83■■■□□ 2.69
SH3BP2-220ENST00000511663 NEO1Q92859 1461 aa31.8■■■□□ 2.68
SH3BP2-220ENST00000511663 RAPGEF3O95398 923 aa31.79■■■□□ 2.68
SH3BP2-220ENST00000511663 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP31.75■■■□□ 2.67
SH3BP2-220ENST00000511663 FMN1Q68DA7 1419 aa31.66■■■□□ 2.66
SH3BP2-220ENST00000511663 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP31.65■■■□□ 2.66
SH3BP2-220ENST00000511663 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP31.64■■■□□ 2.66
SH3BP2-220ENST00000511663 AKNAQ7Z591 1439 aa31.62■■■□□ 2.65
SH3BP2-220ENST00000511663 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP31.61■■■□□ 2.65
SH3BP2-220ENST00000511663 FANCAO15360 1455 aa31.6■■■□□ 2.65
SH3BP2-220ENST00000511663 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP31.59■■■□□ 2.65
SH3BP2-220ENST00000511663 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP31.58■■■□□ 2.65
SH3BP2-220ENST00000511663 HECW2Q9P2P5 1572 aa31.57■■■□□ 2.64
SH3BP2-220ENST00000511663 CFAP74Q9C0B2 1584 aa31.56■■■□□ 2.64
SH3BP2-220ENST00000511663 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa31.55■■■□□ 2.64
SH3BP2-220ENST00000511663 HECW1Q76N89 1606 aa31.52■■■□□ 2.64
SH3BP2-220ENST00000511663 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa31.51■■■□□ 2.63
SH3BP2-220ENST00000511663 TTC37Q6PGP7 1564 aa31.5■■■□□ 2.63
SH3BP2-220ENST00000511663 PLCH2O75038 1416 aa31.48■■■□□ 2.63
SH3BP2-220ENST00000511663 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa31.47■■■□□ 2.63
SH3BP2-220ENST00000511663 PTPRMP28827 1452 aa31.45■■■□□ 2.62
SH3BP2-220ENST00000511663 ADAMTSL3P82987 1691 aa31.44■■■□□ 2.62
SH3BP2-220ENST00000511663 RICTORQ6R327 1708 aa31.43■■■□□ 2.62
SH3BP2-220ENST00000511663 SCAPERQ9BY12 1400 aa31.41■■■□□ 2.62
SH3BP2-220ENST00000511663 BCORL1Q5H9F3 1711 aa31.4■■■□□ 2.62
SH3BP2-220ENST00000511663 CLIP1P30622 1438 aa31.4■■■□□ 2.62
SH3BP2-220ENST00000511663 POGZQ7Z3K3 1410 aa31.4■■■□□ 2.62
SH3BP2-220ENST00000511663 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa31.39■■■□□ 2.62
SH3BP2-220ENST00000511663 MAGI2Q86UL8 1455 aa31.38■■■□□ 2.61
SH3BP2-220ENST00000511663 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP31.36■■■□□ 2.61
SH3BP2-220ENST00000511663 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP31.36■■■□□ 2.61
SH3BP2-220ENST00000511663 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa31.35■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.7 ms