RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503687.2

RABGEF1-211, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 4,139 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-211ENST00000503687 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP17.88■□□□□ 0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP17.87■□□□□ 0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa17.87■□□□□ 0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 MYT1Q01538 1121 aa17.87■□□□□ 0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 MYT1LQ9UL68 1186 aa17.86■□□□□ 0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 KCNH8Q96L42 1107 aa17.85■□□□□ 0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 FAM9BQ8IZU0 186 aa17.83■□□□□ 0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa17.79■□□□□ 0.44
RABGEF1-211ENST00000503687 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
RABGEF1-211ENST00000503687 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
RABGEF1-211ENST00000503687 CLSPNQ9HAW4 1339 aa17.78■□□□□ 0.44
RABGEF1-211ENST00000503687 FANCD2Q9BXW9 1451 aa17.78■□□□□ 0.44
RABGEF1-211ENST00000503687 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.44
RABGEF1-211ENST00000503687 NESP48681 1621 aa17.77■□□□□ 0.43
RABGEF1-211ENST00000503687 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa17.75■□□□□ 0.43
RABGEF1-211ENST00000503687 IGF1RP08069 1367 aa17.73■□□□□ 0.43
RABGEF1-211ENST00000503687 FGD5Q6ZNL6 1462 aa17.72■□□□□ 0.43
RABGEF1-211ENST00000503687 CFTRP13569 1480 aa17.72■□□□□ 0.43
RABGEF1-211ENST00000503687 FOXD1Q16676 465 aa17.7■□□□□ 0.42
RABGEF1-211ENST00000503687 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP17.69■□□□□ 0.42
RABGEF1-211ENST00000503687 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa17.69■□□□□ 0.42
RABGEF1-211ENST00000503687 CUX1P39880 1505 aa17.69■□□□□ 0.42
RABGEF1-211ENST00000503687 KIF21BO75037 1637 aa17.68■□□□□ 0.42
RABGEF1-211ENST00000503687 SETD5Q9C0A6 1442 aa17.68■□□□□ 0.42
RABGEF1-211ENST00000503687 FHOD3Q2V2M9 1422 aa17.68■□□□□ 0.42
RABGEF1-211ENST00000503687 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP17.67■□□□□ 0.42
RABGEF1-211ENST00000503687 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa17.67■□□□□ 0.42
RABGEF1-211ENST00000503687 PDS5BQ9NTI5 1447 aa17.66■□□□□ 0.42
RABGEF1-211ENST00000503687 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP17.66■□□□□ 0.42
RABGEF1-211ENST00000503687 MRS2Q9HD23 443 aa17.65■□□□□ 0.42
RABGEF1-211ENST00000503687 PEG3Q9GZU2 1588 aa17.65■□□□□ 0.42
RABGEF1-211ENST00000503687 ERCC6Q03468 1493 aa17.64■□□□□ 0.42
RABGEF1-211ENST00000503687 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP17.63■□□□□ 0.412e-7■■■■■ 50.1
RABGEF1-211ENST00000503687 HMGXB3Q12766 1538 aa17.62■□□□□ 0.41
RABGEF1-211ENST00000503687 ARAP1Q96P48 1450 aa17.62■□□□□ 0.41
RABGEF1-211ENST00000503687 FHAD1B1AJZ9 1412 aa17.61■□□□□ 0.41
RABGEF1-211ENST00000503687 TOP2BQ02880 1626 aa17.61■□□□□ 0.41
RABGEF1-211ENST00000503687 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP17.58■□□□□ 0.4
RABGEF1-211ENST00000503687 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP17.57■□□□□ 0.41e-6■■■□□ 16.6
RABGEF1-211ENST00000503687 PRXQ9BXM0 1461 aa17.54■□□□□ 0.4
RABGEF1-211ENST00000503687 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa17.52■□□□□ 0.4
RABGEF1-211ENST00000503687 PHLDB1Q86UU1 1377 aa17.51■□□□□ 0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP17.49■□□□□ 0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP17.49■□□□□ 0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 RGL3Q3MIN7 710 aa17.49■□□□□ 0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 TMC1Q8TDI8 760 aa17.47■□□□□ 0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP17.47■□□□□ 0.392e-7■■■□□ 15.2
RABGEF1-211ENST00000503687 TSPY4P0CV99 314 aa17.46■□□□□ 0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 TSPY10P0CW01 314 aa17.46■□□□□ 0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP17.44■□□□□ 0.38
RABGEF1-211ENST00000503687 GAPVD1Q14C86 1478 aa17.43■□□□□ 0.38
RABGEF1-211ENST00000503687 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa17.42■□□□□ 0.38
RABGEF1-211ENST00000503687 TOPBP1Q92547 1522 aa17.42■□□□□ 0.38
RABGEF1-211ENST00000503687 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP17.41■□□□□ 0.38
RABGEF1-211ENST00000503687 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa17.41■□□□□ 0.38
RABGEF1-211ENST00000503687 PLEKHD1A6NEE1 506 aa17.41■□□□□ 0.38
RABGEF1-211ENST00000503687 L3MBTL2Q969R5 705 aa17.4■□□□□ 0.38
RABGEF1-211ENST00000503687 MPHOSPH9Q99550 1183 aa17.4■□□□□ 0.38
RABGEF1-211ENST00000503687 FMN1Q68DA7 1419 aa17.38■□□□□ 0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 ERICH3Q5RHP9 1530 aa17.38■□□□□ 0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa17.37■□□□□ 0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 CCDC136Q96JN2 1154 aa17.37■□□□□ 0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 CCER2I3L3R5 266 aa17.35■□□□□ 0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP17.35■□□□□ 0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP17.33■□□□□ 0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa17.33■□□□□ 0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 CARD11Q9BXL7 1154 aa17.33■□□□□ 0.36
RABGEF1-211ENST00000503687 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP17.31■□□□□ 0.36
RABGEF1-211ENST00000503687 PKD2Q13563 968 aa17.3■□□□□ 0.36
RABGEF1-211ENST00000503687 JPH4Q96JJ6 628 aa17.3■□□□□ 0.36
RABGEF1-211ENST00000503687 NBR1Q14596 966 aa17.29■□□□□ 0.36
RABGEF1-211ENST00000503687 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP17.29■□□□□ 0.36
RABGEF1-211ENST00000503687 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP17.29■□□□□ 0.36
RABGEF1-211ENST00000503687 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa17.28■□□□□ 0.36
RABGEF1-211ENST00000503687 CHGAP10645 457 aaKnown RBP17.28■□□□□ 0.36
RABGEF1-211ENST00000503687 DCAF11Q8TEB1 546 aa17.28■□□□□ 0.36
RABGEF1-211ENST00000503687 ANP32EQ9BTT0 268 aa17.28■□□□□ 0.36
RABGEF1-211ENST00000503687 DNMBPQ6XZF7 1577 aa17.24■□□□□ 0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 CCDC18Q5T9S5 1454 aa17.24■□□□□ 0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP17.23■□□□□ 0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 FGD6Q6ZV73 1430 aa17.22■□□□□ 0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP17.22■□□□□ 0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa17.19■□□□□ 0.34
RABGEF1-211ENST00000503687 BCL11AQ9H165 835 aa17.19■□□□□ 0.34
RABGEF1-211ENST00000503687 PPP4R2Q9NY27 417 aa17.19■□□□□ 0.34
RABGEF1-211ENST00000503687 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP17.18■□□□□ 0.34
RABGEF1-211ENST00000503687 WDR97A6NE52 1622 aa17.17■□□□□ 0.34
RABGEF1-211ENST00000503687 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP17.16■□□□□ 0.344e-6■■■□□ 18.8
RABGEF1-211ENST00000503687 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa17.14■□□□□ 0.33
RABGEF1-211ENST00000503687 WASHC2AQ641Q2 1341 aa17.13■□□□□ 0.33
RABGEF1-211ENST00000503687 NUP155O75694 1391 aa17.13■□□□□ 0.33
RABGEF1-211ENST00000503687 CCDC184Q52MB2 194 aa17.13■□□□□ 0.33
RABGEF1-211ENST00000503687 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP17.13■□□□□ 0.33
RABGEF1-211ENST00000503687 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa17.13■□□□□ 0.33
RABGEF1-211ENST00000503687 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP17.12■□□□□ 0.33
RABGEF1-211ENST00000503687 CANXP27824 592 aaKnown RBP17.12■□□□□ 0.33
RABGEF1-211ENST00000503687 TIAM1Q13009 1591 aa17.12■□□□□ 0.33
RABGEF1-211ENST00000503687 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa17.11■□□□□ 0.33
RABGEF1-211ENST00000503687 NCOA2Q15596 1464 aa17.1■□□□□ 0.33
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