RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502935.5

XPNPEP1-218, Transcript of X-prolyl aminopeptidase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene XPNPEP1, Length 2,539 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPNPEP1-218ENST00000502935 TIAM1Q13009 1591 aa22.38■■□□□ 1.17
XPNPEP1-218ENST00000502935 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
XPNPEP1-218ENST00000502935 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
XPNPEP1-218ENST00000502935 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
XPNPEP1-218ENST00000502935 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.35■■□□□ 1.171e-7■■■■■ 32.3
XPNPEP1-218ENST00000502935 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.34■■□□□ 1.17
XPNPEP1-218ENST00000502935 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.33■■□□□ 1.17
XPNPEP1-218ENST00000502935 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.31■■□□□ 1.16
XPNPEP1-218ENST00000502935 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.29■■□□□ 1.16
XPNPEP1-218ENST00000502935 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.29■■□□□ 1.16
XPNPEP1-218ENST00000502935 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.27■■□□□ 1.15
XPNPEP1-218ENST00000502935 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
XPNPEP1-218ENST00000502935 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
XPNPEP1-218ENST00000502935 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
XPNPEP1-218ENST00000502935 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.23■■□□□ 1.15
XPNPEP1-218ENST00000502935 MAP3K1Q13233 1512 aa22.23■■□□□ 1.15
XPNPEP1-218ENST00000502935 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
XPNPEP1-218ENST00000502935 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.2■■□□□ 1.15
XPNPEP1-218ENST00000502935 PBRM1Q86U86 1689 aa22.2■■□□□ 1.14
XPNPEP1-218ENST00000502935 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.2■■□□□ 1.14
XPNPEP1-218ENST00000502935 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.17■■□□□ 1.14
XPNPEP1-218ENST00000502935 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
XPNPEP1-218ENST00000502935 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.16■■□□□ 1.14
XPNPEP1-218ENST00000502935 SAMD9Q5K651 1589 aa22.14■■□□□ 1.14
XPNPEP1-218ENST00000502935 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.13■■□□□ 1.13
XPNPEP1-218ENST00000502935 FMN1Q68DA7 1419 aa22.12■■□□□ 1.13
XPNPEP1-218ENST00000502935 ARID3CA6NKF2 412 aa22.12■■□□□ 1.13
XPNPEP1-218ENST00000502935 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.11■■□□□ 1.13
XPNPEP1-218ENST00000502935 ERCC6Q03468 1493 aa22.09■■□□□ 1.13
XPNPEP1-218ENST00000502935 ADAMTS12P58397 1594 aa22.09■■□□□ 1.13
XPNPEP1-218ENST00000502935 WDR62O43379 1518 aa22.08■■□□□ 1.13
XPNPEP1-218ENST00000502935 GRIN2BQ13224 1484 aa22.08■■□□□ 1.12
XPNPEP1-218ENST00000502935 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.05■■□□□ 1.12
XPNPEP1-218ENST00000502935 IFT140Q96RY7 1462 aa22.05■■□□□ 1.12
XPNPEP1-218ENST00000502935 IQGAP2Q13576 1575 aa22.01■■□□□ 1.11
XPNPEP1-218ENST00000502935 SETD5Q9C0A6 1442 aa21.99■■□□□ 1.11
XPNPEP1-218ENST00000502935 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
XPNPEP1-218ENST00000502935 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa21.97■■□□□ 1.11
XPNPEP1-218ENST00000502935 CLSPNQ9HAW4 1339 aa21.96■■□□□ 1.11
XPNPEP1-218ENST00000502935 FBLN2P98095 1184 aa21.96■■□□□ 1.11
XPNPEP1-218ENST00000502935 FGD6Q6ZV73 1430 aa21.95■■□□□ 1.1
XPNPEP1-218ENST00000502935 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
XPNPEP1-218ENST00000502935 MAPKBP1O60336 1514 aa21.94■■□□□ 1.1
XPNPEP1-218ENST00000502935 NCOA2Q15596 1464 aa21.93■■□□□ 1.1
XPNPEP1-218ENST00000502935 PTPRKQ15262 1439 aa21.92■■□□□ 1.1
XPNPEP1-218ENST00000502935 SIN3AQ96ST3 1273 aa21.92■■□□□ 1.1
XPNPEP1-218ENST00000502935 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
XPNPEP1-218ENST00000502935 MIER1Q8N108 512 aa21.89■■□□□ 1.09
XPNPEP1-218ENST00000502935 NEUROD1Q13562 356 aa21.88■■□□□ 1.09
XPNPEP1-218ENST00000502935 GRIN2AQ12879 1464 aa21.88■■□□□ 1.09
XPNPEP1-218ENST00000502935 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
XPNPEP1-218ENST00000502935 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
XPNPEP1-218ENST00000502935 DISP1Q96F81 1524 aa21.85■■□□□ 1.09
XPNPEP1-218ENST00000502935 MYOM3Q5VTT5 1437 aa21.84■■□□□ 1.09
XPNPEP1-218ENST00000502935 UGGT2Q9NYU1 1516 aa21.84■■□□□ 1.09
XPNPEP1-218ENST00000502935 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa21.83■■□□□ 1.09
XPNPEP1-218ENST00000502935 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
XPNPEP1-218ENST00000502935 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
XPNPEP1-218ENST00000502935 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa21.82■■□□□ 1.08
XPNPEP1-218ENST00000502935 CHIC2Q9UKJ5 165 aa21.81■■□□□ 1.08
XPNPEP1-218ENST00000502935 HECW1Q76N89 1606 aa21.81■■□□□ 1.08
XPNPEP1-218ENST00000502935 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP21.8■■□□□ 1.08
XPNPEP1-218ENST00000502935 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
XPNPEP1-218ENST00000502935 KIAA0556O60303 1618 aa21.79■■□□□ 1.08
XPNPEP1-218ENST00000502935 CEP170Q5SW79 1584 aa21.78■■□□□ 1.08
XPNPEP1-218ENST00000502935 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.78■■□□□ 1.08
XPNPEP1-218ENST00000502935 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa21.76■■□□□ 1.07
XPNPEP1-218ENST00000502935 PTPN23Q9H3S7 1636 aa21.76■■□□□ 1.07
XPNPEP1-218ENST00000502935 ARHGEF11O15085 1522 aa21.75■■□□□ 1.07
XPNPEP1-218ENST00000502935 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
XPNPEP1-218ENST00000502935 SYNJ2O15056 1496 aa21.73■■□□□ 1.07
XPNPEP1-218ENST00000502935 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
XPNPEP1-218ENST00000502935 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
XPNPEP1-218ENST00000502935 NAIPQ13075 1403 aa21.7■■□□□ 1.07
XPNPEP1-218ENST00000502935 PLB1Q6P1J6 1458 aa21.69■■□□□ 1.06
XPNPEP1-218ENST00000502935 JPH4Q96JJ6 628 aa21.69■■□□□ 1.06
XPNPEP1-218ENST00000502935 HFM1A2PYH4 1435 aa21.69■■□□□ 1.06
XPNPEP1-218ENST00000502935 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
XPNPEP1-218ENST00000502935 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa21.66■■□□□ 1.06
XPNPEP1-218ENST00000502935 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.06
XPNPEP1-218ENST00000502935 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
XPNPEP1-218ENST00000502935 KDM6BO15054 1643 aa21.62■■□□□ 1.05
XPNPEP1-218ENST00000502935 NUP160Q12769 1436 aa21.61■■□□□ 1.05
XPNPEP1-218ENST00000502935 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
XPNPEP1-218ENST00000502935 UACAQ9BZF9 1416 aa21.58■■□□□ 1.05
XPNPEP1-218ENST00000502935 TRIM52Q96A61 297 aa21.57■■□□□ 1.04
XPNPEP1-218ENST00000502935 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
XPNPEP1-218ENST00000502935 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
XPNPEP1-218ENST00000502935 FOXD1Q16676 465 aa21.54■■□□□ 1.04
XPNPEP1-218ENST00000502935 MIA2Q96PC5 1412 aa21.54■■□□□ 1.04
XPNPEP1-218ENST00000502935 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
XPNPEP1-218ENST00000502935 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa21.52■■□□□ 1.04
XPNPEP1-218ENST00000502935 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.03
XPNPEP1-218ENST00000502935 KIF14Q15058 1648 aa21.51■■□□□ 1.03
XPNPEP1-218ENST00000502935 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa21.51■■□□□ 1.03
XPNPEP1-218ENST00000502935 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
XPNPEP1-218ENST00000502935 ABCC5O15440 1437 aa21.48■■□□□ 1.03
XPNPEP1-218ENST00000502935 DAPK1P53355 1430 aa21.48■■□□□ 1.03
XPNPEP1-218ENST00000502935 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
XPNPEP1-218ENST00000502935 TONSLQ96HA7 1378 aa21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.9 ms