RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502686.6

CTCFL-211, Transcript of CCCTC-binding factor like, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTCFL, Length 2,023 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTCFL-211ENST00000502686 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa21.02■□□□□ 0.95
CTCFL-211ENST00000502686 CHD1O14646 1710 aa20.98■□□□□ 0.95
CTCFL-211ENST00000502686 CLIP1P30622 1438 aa20.98■□□□□ 0.95
CTCFL-211ENST00000502686 CEP170Q5SW79 1584 aa20.96■□□□□ 0.95
CTCFL-211ENST00000502686 NUP160Q12769 1436 aa20.94■□□□□ 0.94
CTCFL-211ENST00000502686 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa20.91■□□□□ 0.94
CTCFL-211ENST00000502686 IQGAP2Q13576 1575 aa20.91■□□□□ 0.94
CTCFL-211ENST00000502686 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa20.87■□□□□ 0.93
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CTCFL-211ENST00000502686 KIAA0556O60303 1618 aa20.71■□□□□ 0.91
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CTCFL-211ENST00000502686 ABCA8O94911 1581 aa20.43■□□□□ 0.86
CTCFL-211ENST00000502686 TIAM1Q13009 1591 aa20.43■□□□□ 0.86
CTCFL-211ENST00000502686 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa20.43■□□□□ 0.86
CTCFL-211ENST00000502686 MAP3K1Q13233 1512 aa20.42■□□□□ 0.86
CTCFL-211ENST00000502686 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
CTCFL-211ENST00000502686 CFAP43Q8NDM7 1665 aa20.41■□□□□ 0.86
CTCFL-211ENST00000502686 ARID3CA6NKF2 412 aa20.4■□□□□ 0.86
CTCFL-211ENST00000502686 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
CTCFL-211ENST00000502686 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.86
CTCFL-211ENST00000502686 UACAQ9BZF9 1416 aa20.38■□□□□ 0.85
CTCFL-211ENST00000502686 CCDC18Q5T9S5 1454 aa20.38■□□□□ 0.85
CTCFL-211ENST00000502686 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
CTCFL-211ENST00000502686 ARHGEF11O15085 1522 aa20.36■□□□□ 0.85
CTCFL-211ENST00000502686 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa20.34■□□□□ 0.85
CTCFL-211ENST00000502686 ABCC2Q92887 1545 aa20.32■□□□□ 0.84
CTCFL-211ENST00000502686 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
CTCFL-211ENST00000502686 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
CTCFL-211ENST00000502686 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa20.29■□□□□ 0.84
CTCFL-211ENST00000502686 ATP10BO94823 1461 aa20.29■□□□□ 0.84
CTCFL-211ENST00000502686 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa20.29■□□□□ 0.84
CTCFL-211ENST00000502686 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa20.29■□□□□ 0.84
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CTCFL-211ENST00000502686 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa20.28■□□□□ 0.84
CTCFL-211ENST00000502686 MTUS2Q5JR59 1369 aa20.28■□□□□ 0.84
CTCFL-211ENST00000502686 ADCY10Q96PN6 1610 aa20.25■□□□□ 0.83
CTCFL-211ENST00000502686 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa20.25■□□□□ 0.83
CTCFL-211ENST00000502686 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
CTCFL-211ENST00000502686 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.83
CTCFL-211ENST00000502686 KDM5BQ9UGL1 1544 aa20.2■□□□□ 0.82
CTCFL-211ENST00000502686 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
CTCFL-211ENST00000502686 CYB5RLQ6IPT4 315 aa20.18■□□□□ 0.82
CTCFL-211ENST00000502686 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
CTCFL-211ENST00000502686 PLEKHD1A6NEE1 506 aa20.17■□□□□ 0.82
CTCFL-211ENST00000502686 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
CTCFL-211ENST00000502686 NCOA2Q15596 1464 aa20.16■□□□□ 0.82
CTCFL-211ENST00000502686 PHLDB1Q86UU1 1377 aa20.15■□□□□ 0.82
CTCFL-211ENST00000502686 PCGF6Q9BYE7 350 aa20.12■□□□□ 0.81
CTCFL-211ENST00000502686 KIF14Q15058 1648 aa20.1■□□□□ 0.81
CTCFL-211ENST00000502686 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP20.09■□□□□ 0.81
CTCFL-211ENST00000502686 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
CTCFL-211ENST00000502686 MYOM3Q5VTT5 1437 aa20.05■□□□□ 0.8
CTCFL-211ENST00000502686 WDR7Q9Y4E6 1490 aa20.03■□□□□ 0.8
CTCFL-211ENST00000502686 ASXL2Q76L83 1435 aa20.03■□□□□ 0.8
CTCFL-211ENST00000502686 CCNB3Q8WWL7 1395 aa20.03■□□□□ 0.8
CTCFL-211ENST00000502686 KCNH8Q96L42 1107 aa20.03■□□□□ 0.8
CTCFL-211ENST00000502686 ABCC10Q5T3U5 1492 aa20.02■□□□□ 0.8
CTCFL-211ENST00000502686 FGD6Q6ZV73 1430 aa20.02■□□□□ 0.79
CTCFL-211ENST00000502686 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP19.98■□□□□ 0.793e-12■■■■■ 30.2
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CTCFL-211ENST00000502686 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa19.97■□□□□ 0.79
CTCFL-211ENST00000502686 TTC37Q6PGP7 1564 aa19.97■□□□□ 0.79
CTCFL-211ENST00000502686 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
CTCFL-211ENST00000502686 MIA2Q96PC5 1412 aa19.95■□□□□ 0.78
CTCFL-211ENST00000502686 ITSN2Q9NZM3 1697 aa19.95■□□□□ 0.78
CTCFL-211ENST00000502686 MAPKBP1O60336 1514 aa19.95■□□□□ 0.78
CTCFL-211ENST00000502686 PTPN23Q9H3S7 1636 aa19.94■□□□□ 0.78
CTCFL-211ENST00000502686 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa19.94■□□□□ 0.78
CTCFL-211ENST00000502686 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP19.92■□□□□ 0.78
CTCFL-211ENST00000502686 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP19.91■□□□□ 0.78
CTCFL-211ENST00000502686 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP19.91■□□□□ 0.78
CTCFL-211ENST00000502686 PREX2Q70Z35 1606 aa19.89■□□□□ 0.78
CTCFL-211ENST00000502686 ITGAEP38570 1179 aa19.88■□□□□ 0.77
CTCFL-211ENST00000502686 MYO5CQ9NQX4 1742 aa19.88■□□□□ 0.77
CTCFL-211ENST00000502686 ABCA9Q8IUA7 1624 aa19.88■□□□□ 0.77
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