RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498678.5

HOXB3-212, Transcript of homeobox B3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 2,196 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-212ENST00000498678 ADAMTS12P58397 1594 aa40.73■■■■■ 4.11
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HOXB3-212ENST00000498678 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.49■■■■■ 4.07
HOXB3-212ENST00000498678 EFCAB5A4FU69 1503 aa40.45■■■■■ 4.07
HOXB3-212ENST00000498678 APLP2Q06481 763 aa40.41■■■■■ 4.06
HOXB3-212ENST00000498678 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP40.38■■■■■ 4.06
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HOXB3-212ENST00000498678 GRIN2AQ12879 1464 aa40.38■■■■■ 4.05
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HOXB3-212ENST00000498678 IQGAP2Q13576 1575 aa40.29■■■■■ 4.04
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HOXB3-212ENST00000498678 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP39.18■■■■□ 3.86
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HOXB3-212ENST00000498678 PTPN23Q9H3S7 1636 aa38.97■■■■□ 3.83
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HOXB3-212ENST00000498678 SETD5Q9C0A6 1442 aa38.81■■■■□ 3.8
HOXB3-212ENST00000498678 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa38.78■■■■□ 3.8
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HOXB3-212ENST00000498678 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa38.58■■■■□ 3.77
HOXB3-212ENST00000498678 CLSPNQ9HAW4 1339 aa38.56■■■■□ 3.76
HOXB3-212ENST00000498678 DAPK1P53355 1430 aa38.55■■■■□ 3.76
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HOXB3-212ENST00000498678 NAIPQ13075 1403 aa38.54■■■■□ 3.76
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