RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487547.1

USP34-216, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, humanhuman

TSL 3

Gene USP34, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34-216ENST00000487547 GSE1Q14687 1217 aa17.04■□□□□ 0.32
USP34-216ENST00000487547 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP17.03■□□□□ 0.32
USP34-216ENST00000487547 DCAF8Q5TAQ9 597 aa16.99■□□□□ 0.31
USP34-216ENST00000487547 RASEFQ8IZ41 740 aa16.99■□□□□ 0.31
USP34-216ENST00000487547 PHF12Q96QT6 1004 aa16.97■□□□□ 0.31
USP34-216ENST00000487547 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
USP34-216ENST00000487547 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
USP34-216ENST00000487547 TRIM41Q8WV44 630 aa16.92■□□□□ 0.3
USP34-216ENST00000487547 CCDC61Q9Y6R9 512 aa16.9■□□□□ 0.3
USP34-216ENST00000487547 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
USP34-216ENST00000487547 POTEIP0CG38 1075 aa16.83■□□□□ 0.28
USP34-216ENST00000487547 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP16.81■□□□□ 0.28
USP34-216ENST00000487547 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP16.79■□□□□ 0.28
USP34-216ENST00000487547 PKD2Q13563 968 aa16.79■□□□□ 0.28
USP34-216ENST00000487547 MS4A3Q96HJ5 214 aa16.77■□□□□ 0.28
USP34-216ENST00000487547 KIF12Q96FN5 646 aa16.76■□□□□ 0.27
USP34-216ENST00000487547 DCBLD2Q96PD2 775 aa16.76■□□□□ 0.27
USP34-216ENST00000487547 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
USP34-216ENST00000487547 PYGBP11216 843 aa16.7■□□□□ 0.26
USP34-216ENST00000487547 SGIP1Q9BQI5 828 aa16.68■□□□□ 0.26
USP34-216ENST00000487547 MAP3K13O43283 966 aa16.67■□□□□ 0.26
USP34-216ENST00000487547 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
USP34-216ENST00000487547 TAOK2Q9UL54 1235 aa16.6■□□□□ 0.25
USP34-216ENST00000487547 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa16.58■□□□□ 0.24
USP34-216ENST00000487547 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
USP34-216ENST00000487547 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
USP34-216ENST00000487547 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
USP34-216ENST00000487547 TRPC6Q9Y210 931 aa16.54■□□□□ 0.24
USP34-216ENST00000487547 RGL2O15211 777 aa16.51■□□□□ 0.23
USP34-216ENST00000487547 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
USP34-216ENST00000487547 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
USP34-216ENST00000487547 TIE1P35590 1138 aa16.48■□□□□ 0.23
USP34-216ENST00000487547 IFNL1Q8IU54 200 aa16.48■□□□□ 0.23
USP34-216ENST00000487547 LHX8Q68G74 356 aa16.47■□□□□ 0.23
USP34-216ENST00000487547 VGFO15240 615 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
USP34-216ENST00000487547 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
USP34-216ENST00000487547 PCDHB8Q9UN66 801 aa16.45■□□□□ 0.22
USP34-216ENST00000487547 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
USP34-216ENST00000487547 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
USP34-216ENST00000487547 DCAF8L2P0C7V8 631 aa16.41■□□□□ 0.22
USP34-216ENST00000487547 TTLL13PA6NNM8 815 aa16.4■□□□□ 0.22
USP34-216ENST00000487547 SLC39A7Q92504 469 aa16.38■□□□□ 0.21
USP34-216ENST00000487547 METRNQ9UJH8 293 aa16.36■□□□□ 0.21
USP34-216ENST00000487547 C7P10643 843 aa16.35■□□□□ 0.21
USP34-216ENST00000487547 PSEN1P49768 467 aa16.35■□□□□ 0.21
USP34-216ENST00000487547 TMEM106CQ9BVX2 250 aa16.3■□□□□ 0.2
USP34-216ENST00000487547 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
USP34-216ENST00000487547 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
USP34-216ENST00000487547 POTEB2H3BUK9 544 aa16.28■□□□□ 0.2
USP34-216ENST00000487547 TRIM35Q9UPQ4 493 aa16.28■□□□□ 0.2
USP34-216ENST00000487547 STK25O00506 426 aa16.26■□□□□ 0.19
USP34-216ENST00000487547 CHGAP10645 457 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
USP34-216ENST00000487547 HS6ST3Q8IZP7 471 aa16.25■□□□□ 0.19
USP34-216ENST00000487547 POTEFA5A3E0 1075 aa16.21■□□□□ 0.19
USP34-216ENST00000487547 IER5LQ5T953 404 aa16.21■□□□□ 0.19
USP34-216ENST00000487547 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.19
USP34-216ENST00000487547 STK24Q9Y6E0 443 aa16.21■□□□□ 0.19
USP34-216ENST00000487547 GOLGA2Q08379 1002 aa16.19■□□□□ 0.18
USP34-216ENST00000487547 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa16.14■□□□□ 0.17
USP34-216ENST00000487547 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
USP34-216ENST00000487547 POTEJP0CG39 1038 aa16.13■□□□□ 0.17
USP34-216ENST00000487547 OTUD5Q96G74 571 aa16.12■□□□□ 0.17
USP34-216ENST00000487547 CABP2Q9NPB3 220 aa16.12■□□□□ 0.17
USP34-216ENST00000487547 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
USP34-216ENST00000487547 SEC24BO95487 1268 aa16.1■□□□□ 0.17
USP34-216ENST00000487547 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
USP34-216ENST00000487547 SOX12O15370 315 aa16.06■□□□□ 0.16
USP34-216ENST00000487547 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
USP34-216ENST00000487547 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
USP34-216ENST00000487547 EFCAB3Q8N7B9 438 aa16.03■□□□□ 0.16
USP34-216ENST00000487547 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
USP34-216ENST00000487547 PLCG2P16885 1265 aa16.01■□□□□ 0.15
USP34-216ENST00000487547 MAMSTRQ6ZN01 415 aa16.01■□□□□ 0.15
USP34-216ENST00000487547 OCEL1Q9H607 264 aa15.98■□□□□ 0.15
USP34-216ENST00000487547 NLRP6P59044 892 aa15.96■□□□□ 0.15
USP34-216ENST00000487547 SCUBE2Q9NQ36 999 aa15.94■□□□□ 0.14
USP34-216ENST00000487547 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP15.94■□□□□ 0.141e-11■■■□□ 18.8
USP34-216ENST00000487547 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
USP34-216ENST00000487547 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
USP34-216ENST00000487547 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
USP34-216ENST00000487547 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa15.89■□□□□ 0.13
USP34-216ENST00000487547 MFRPQ9BY79 579 aa15.89■□□□□ 0.13
USP34-216ENST00000487547 PHF8Q9UPP1 1060 aa15.87■□□□□ 0.13
USP34-216ENST00000487547 FBXO22Q8NEZ5 403 aa15.84■□□□□ 0.13
USP34-216ENST00000487547 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
USP34-216ENST00000487547 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP15.81■□□□□ 0.12
USP34-216ENST00000487547 CFAP44Q96MT7 982 aa15.78■□□□□ 0.12
USP34-216ENST00000487547 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.12
USP34-216ENST00000487547 PLCB2Q00722 1185 aa15.75■□□□□ 0.11
USP34-216ENST00000487547 MS4A4AQ96JQ5 239 aa15.75■□□□□ 0.11
USP34-216ENST00000487547 G3V3G9 751 aa15.73■□□□□ 0.11
USP34-216ENST00000487547 DPY19L2Q6NUT2 758 aa15.72■□□□□ 0.11
USP34-216ENST00000487547 SLAIN1Q8ND83 568 aa15.69■□□□□ 0.1
USP34-216ENST00000487547 BOLA1Q9Y3E2 137 aa15.67■□□□□ 0.1
USP34-216ENST00000487547 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
USP34-216ENST00000487547 PPP1R37O75864 691 aa15.64■□□□□ 0.09
USP34-216ENST00000487547 C3orf67Q6ZVT6 689 aa15.63■□□□□ 0.09
USP34-216ENST00000487547 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
USP34-216ENST00000487547 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
USP34-216ENST00000487547 MICALL2Q8IY33 904 aa15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.6 ms