RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484647.1

TIMM17A-204, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 17A, humanhuman

TSL 2

Gene TIMM17A, Length 661 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM17A-204ENST00000484647 JPH4Q96JJ6 628 aa23.8■■□□□ 1.4
TIMM17A-204ENST00000484647 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.79■■□□□ 1.4
TIMM17A-204ENST00000484647 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.66■■□□□ 1.38
TIMM17A-204ENST00000484647 IGF1RP08069 1367 aa23.65■■□□□ 1.38
TIMM17A-204ENST00000484647 KIF13AQ9H1H9 1805 aa23.64■■□□□ 1.38
TIMM17A-204ENST00000484647 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP23.6■■□□□ 1.37
TIMM17A-204ENST00000484647 KIF27Q86VH2 1401 aa23.59■■□□□ 1.37
TIMM17A-204ENST00000484647 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.58■■□□□ 1.36
TIMM17A-204ENST00000484647 FAM69CQ0P6D2 419 aa23.55■■□□□ 1.36
TIMM17A-204ENST00000484647 CUL7Q14999 1698 aa23.54■■□□□ 1.36
TIMM17A-204ENST00000484647 ABCC10Q5T3U5 1492 aa23.52■■□□□ 1.36
TIMM17A-204ENST00000484647 ADCY10Q96PN6 1610 aa23.5■■□□□ 1.35
TIMM17A-204ENST00000484647 MAPKBP1O60336 1514 aa23.49■■□□□ 1.35
TIMM17A-204ENST00000484647 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.47■■□□□ 1.35
TIMM17A-204ENST00000484647 DIP2BQ9P265 1576 aa23.43■■□□□ 1.34
TIMM17A-204ENST00000484647 PTPRGP23470 1445 aa23.41■■□□□ 1.34
TIMM17A-204ENST00000484647 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.34
TIMM17A-204ENST00000484647 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa23.35■■□□□ 1.33
TIMM17A-204ENST00000484647 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.34■■□□□ 1.33
TIMM17A-204ENST00000484647 TSPOAP1O95153 1857 aa23.33■■□□□ 1.33
TIMM17A-204ENST00000484647 IQGAP2Q13576 1575 aa23.31■■□□□ 1.32
TIMM17A-204ENST00000484647 ABCC2Q92887 1545 aa23.27■■□□□ 1.32
TIMM17A-204ENST00000484647 KDM6BO15054 1643 aa23.26■■□□□ 1.31
TIMM17A-204ENST00000484647 DISP1Q96F81 1524 aa23.23■■□□□ 1.31
TIMM17A-204ENST00000484647 PLPPR3Q6T4P5 718 aa23.22■■□□□ 1.31
TIMM17A-204ENST00000484647 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.22■■□□□ 1.31
TIMM17A-204ENST00000484647 ASXL2Q76L83 1435 aa23.21■■□□□ 1.31
TIMM17A-204ENST00000484647 UACAQ9BZF9 1416 aa23.21■■□□□ 1.31
TIMM17A-204ENST00000484647 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa23.21■■□□□ 1.31
TIMM17A-204ENST00000484647 PLB1Q6P1J6 1458 aa23.2■■□□□ 1.3
TIMM17A-204ENST00000484647 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa23.16■■□□□ 1.3
TIMM17A-204ENST00000484647 UGGT2Q9NYU1 1516 aa23.16■■□□□ 1.3
TIMM17A-204ENST00000484647 GLI2P10070 1586 aa23.15■■□□□ 1.3
TIMM17A-204ENST00000484647 KDM5BQ9UGL1 1544 aa23.12■■□□□ 1.29
TIMM17A-204ENST00000484647 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
TIMM17A-204ENST00000484647 KIAA0556O60303 1618 aa23.09■■□□□ 1.29
TIMM17A-204ENST00000484647 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
TIMM17A-204ENST00000484647 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
TIMM17A-204ENST00000484647 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa23.02■■□□□ 1.28
TIMM17A-204ENST00000484647 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.02■■□□□ 1.28
TIMM17A-204ENST00000484647 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
TIMM17A-204ENST00000484647 FOXD1Q16676 465 aa22.98■■□□□ 1.27
TIMM17A-204ENST00000484647 GOLGA3Q08378 1498 aa22.97■■□□□ 1.27
TIMM17A-204ENST00000484647 TEX14Q8IWB6 1497 aa22.97■■□□□ 1.27
TIMM17A-204ENST00000484647 WDR7Q9Y4E6 1490 aa22.95■■□□□ 1.26
TIMM17A-204ENST00000484647 PRXQ9BXM0 1461 aa22.94■■□□□ 1.26
TIMM17A-204ENST00000484647 KCNH8Q96L42 1107 aa22.91■■□□□ 1.26
TIMM17A-204ENST00000484647 ABCA8O94911 1581 aa22.9■■□□□ 1.26
TIMM17A-204ENST00000484647 ADGRL1O94910 1474 aa22.88■■□□□ 1.25
TIMM17A-204ENST00000484647 CD109Q6YHK3 1445 aa22.86■■□□□ 1.25
TIMM17A-204ENST00000484647 P3H3Q8IVL6 736 aa22.83■■□□□ 1.25
TIMM17A-204ENST00000484647 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
TIMM17A-204ENST00000484647 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.83■■□□□ 1.24
TIMM17A-204ENST00000484647 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.82■■□□□ 1.24
TIMM17A-204ENST00000484647 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.79■■□□□ 1.24
TIMM17A-204ENST00000484647 ARID3CA6NKF2 412 aa22.78■■□□□ 1.24
TIMM17A-204ENST00000484647 ATP10BO94823 1461 aa22.75■■□□□ 1.23
TIMM17A-204ENST00000484647 SAMD9Q5K651 1589 aa22.67■■□□□ 1.22
TIMM17A-204ENST00000484647 ARAP3Q8WWN8 1544 aa22.66■■□□□ 1.22
TIMM17A-204ENST00000484647 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
TIMM17A-204ENST00000484647 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
TIMM17A-204ENST00000484647 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
TIMM17A-204ENST00000484647 ABCA9Q8IUA7 1624 aa22.63■■□□□ 1.21
TIMM17A-204ENST00000484647 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.63■■□□□ 1.21
TIMM17A-204ENST00000484647 HECW2Q9P2P5 1572 aa22.61■■□□□ 1.21
TIMM17A-204ENST00000484647 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.61■■□□□ 1.21
TIMM17A-204ENST00000484647 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
TIMM17A-204ENST00000484647 EEA1Q15075 1411 aa22.59■■□□□ 1.21
TIMM17A-204ENST00000484647 KIF21BO75037 1637 aa22.59■■□□□ 1.21
TIMM17A-204ENST00000484647 RAPGEF3O95398 923 aa22.57■■□□□ 1.2
TIMM17A-204ENST00000484647 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
TIMM17A-204ENST00000484647 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.54■■□□□ 1.2
TIMM17A-204ENST00000484647 NEO1Q92859 1461 aa22.53■■□□□ 1.2
TIMM17A-204ENST00000484647 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.51■■□□□ 1.19
TIMM17A-204ENST00000484647 ADAMTSL3P82987 1691 aa22.43■■□□□ 1.18
TIMM17A-204ENST00000484647 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa22.42■■□□□ 1.18
TIMM17A-204ENST00000484647 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.41■■□□□ 1.18
TIMM17A-204ENST00000484647 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
TIMM17A-204ENST00000484647 PTPRMP28827 1452 aa22.41■■□□□ 1.18
TIMM17A-204ENST00000484647 AKNAQ7Z591 1439 aa22.39■■□□□ 1.17
TIMM17A-204ENST00000484647 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.38■■□□□ 1.17
TIMM17A-204ENST00000484647 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
TIMM17A-204ENST00000484647 FANCAO15360 1455 aa22.37■■□□□ 1.17
TIMM17A-204ENST00000484647 BCORL1Q5H9F3 1711 aa22.37■■□□□ 1.17
TIMM17A-204ENST00000484647 RICTORQ6R327 1708 aa22.36■■□□□ 1.17
TIMM17A-204ENST00000484647 EHMT2Q96KQ7 1210 aa22.35■■□□□ 1.17
TIMM17A-204ENST00000484647 UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
TIMM17A-204ENST00000484647 TTC37Q6PGP7 1564 aa22.33■■□□□ 1.16
TIMM17A-204ENST00000484647 CFAP74Q9C0B2 1584 aa22.33■■□□□ 1.16
TIMM17A-204ENST00000484647 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
TIMM17A-204ENST00000484647 MADDQ8WXG6 1647 aa22.31■■□□□ 1.16
TIMM17A-204ENST00000484647 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
TIMM17A-204ENST00000484647 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa22.3■■□□□ 1.16
TIMM17A-204ENST00000484647 PLCH2O75038 1416 aa22.26■■□□□ 1.15
TIMM17A-204ENST00000484647 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa22.25■■□□□ 1.15
TIMM17A-204ENST00000484647 FMN1Q68DA7 1419 aa22.24■■□□□ 1.15
TIMM17A-204ENST00000484647 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
TIMM17A-204ENST00000484647 SCAPERQ9BY12 1400 aa22.23■■□□□ 1.15
TIMM17A-204ENST00000484647 YEATS2Q9ULM3 1422 aa22.23■■□□□ 1.15
TIMM17A-204ENST00000484647 MAGI2Q86UL8 1455 aa22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.2 ms