RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483926.5

SYTL1-204, Transcript of synaptotagmin like 1, humanhuman

TSL 2

Gene SYTL1, Length 2,525 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL1-204ENST00000483926 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.91
SYTL1-204ENST00000483926 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.95■■□□□ 1.9
SYTL1-204ENST00000483926 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.91■■□□□ 1.9
SYTL1-204ENST00000483926 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.9■■□□□ 1.9
SYTL1-204ENST00000483926 MIER1Q8N108 512 aa26.87■■□□□ 1.89
SYTL1-204ENST00000483926 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.86■■□□□ 1.89
SYTL1-204ENST00000483926 CUL7Q14999 1698 aa26.83■■□□□ 1.89
SYTL1-204ENST00000483926 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
SYTL1-204ENST00000483926 CFAP43Q8NDM7 1665 aa26.82■■□□□ 1.88
SYTL1-204ENST00000483926 ITGAEP38570 1179 aa26.81■■□□□ 1.88
SYTL1-204ENST00000483926 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
SYTL1-204ENST00000483926 EFCAB5A4FU69 1503 aa26.79■■□□□ 1.88
SYTL1-204ENST00000483926 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.79■■□□□ 1.88
SYTL1-204ENST00000483926 P3H3Q8IVL6 736 aa26.78■■□□□ 1.88
SYTL1-204ENST00000483926 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa26.76■■□□□ 1.87
SYTL1-204ENST00000483926 FHOD3Q2V2M9 1422 aa26.76■■□□□ 1.87
SYTL1-204ENST00000483926 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
SYTL1-204ENST00000483926 WDR97A6NE52 1622 aa26.74■■□□□ 1.87
SYTL1-204ENST00000483926 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa26.74■■□□□ 1.87
SYTL1-204ENST00000483926 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.73■■□□□ 1.87
SYTL1-204ENST00000483926 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.71■■□□□ 1.876e-7■■■■□ 25.4
SYTL1-204ENST00000483926 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.71■■□□□ 1.87
SYTL1-204ENST00000483926 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.7■■□□□ 1.86
SYTL1-204ENST00000483926 SETD5Q9C0A6 1442 aa26.69■■□□□ 1.86
SYTL1-204ENST00000483926 MAPKBP1O60336 1514 aa26.66■■□□□ 1.86
SYTL1-204ENST00000483926 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.66■■□□□ 1.86
SYTL1-204ENST00000483926 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
SYTL1-204ENST00000483926 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.65■■□□□ 1.86
SYTL1-204ENST00000483926 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
SYTL1-204ENST00000483926 FMN1Q68DA7 1419 aa26.62■■□□□ 1.85
SYTL1-204ENST00000483926 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
SYTL1-204ENST00000483926 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.59■■□□□ 1.85
SYTL1-204ENST00000483926 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP26.57■■□□□ 1.84
SYTL1-204ENST00000483926 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.57■■□□□ 1.84
SYTL1-204ENST00000483926 SAMD9Q5K651 1589 aa26.54■■□□□ 1.84
SYTL1-204ENST00000483926 FGD6Q6ZV73 1430 aa26.46■■□□□ 1.83
SYTL1-204ENST00000483926 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
SYTL1-204ENST00000483926 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.43■■□□□ 1.82
SYTL1-204ENST00000483926 GRIN2BQ13224 1484 aa26.42■■□□□ 1.82
SYTL1-204ENST00000483926 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa26.41■■□□□ 1.82
SYTL1-204ENST00000483926 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
SYTL1-204ENST00000483926 SIN3AQ96ST3 1273 aa26.38■■□□□ 1.81
SYTL1-204ENST00000483926 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa26.37■■□□□ 1.81
SYTL1-204ENST00000483926 ERCC6Q03468 1493 aa26.35■■□□□ 1.81
SYTL1-204ENST00000483926 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.35■■□□□ 1.81
SYTL1-204ENST00000483926 NCOA2Q15596 1464 aa26.33■■□□□ 1.81
SYTL1-204ENST00000483926 MYOM3Q5VTT5 1437 aa26.3■■□□□ 1.8
SYTL1-204ENST00000483926 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa26.3■■□□□ 1.8
SYTL1-204ENST00000483926 PBRM1Q86U86 1689 aa26.29■■□□□ 1.8
SYTL1-204ENST00000483926 HFM1A2PYH4 1435 aa26.29■■□□□ 1.8
SYTL1-204ENST00000483926 PTPRKQ15262 1439 aa26.29■■□□□ 1.8
SYTL1-204ENST00000483926 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
SYTL1-204ENST00000483926 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.26■■□□□ 1.79
SYTL1-204ENST00000483926 PTPN23Q9H3S7 1636 aa26.23■■□□□ 1.79
SYTL1-204ENST00000483926 ARHGEF11O15085 1522 aa26.23■■□□□ 1.79
SYTL1-204ENST00000483926 UGGT2Q9NYU1 1516 aa26.23■■□□□ 1.79
SYTL1-204ENST00000483926 ADAMTS12P58397 1594 aa26.22■■□□□ 1.79
SYTL1-204ENST00000483926 UACAQ9BZF9 1416 aa26.21■■□□□ 1.79
SYTL1-204ENST00000483926 WDR62O43379 1518 aa26.21■■□□□ 1.79
SYTL1-204ENST00000483926 IQGAP2Q13576 1575 aa26.21■■□□□ 1.79
SYTL1-204ENST00000483926 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa26.21■■□□□ 1.79
SYTL1-204ENST00000483926 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
SYTL1-204ENST00000483926 NAIPQ13075 1403 aa26.19■■□□□ 1.78
SYTL1-204ENST00000483926 HECW1Q76N89 1606 aa26.18■■□□□ 1.78
SYTL1-204ENST00000483926 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.77
SYTL1-204ENST00000483926 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
SYTL1-204ENST00000483926 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
SYTL1-204ENST00000483926 TONSLQ96HA7 1378 aa26.09■■□□□ 1.77
SYTL1-204ENST00000483926 ANP32EQ9BTT0 268 aa26.09■■□□□ 1.77
SYTL1-204ENST00000483926 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
SYTL1-204ENST00000483926 IFT140Q96RY7 1462 aa26.07■■□□□ 1.76
SYTL1-204ENST00000483926 BCL11AQ9H165 835 aa26.06■■□□□ 1.76
SYTL1-204ENST00000483926 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
SYTL1-204ENST00000483926 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
SYTL1-204ENST00000483926 KCNH8Q96L42 1107 aa26.03■■□□□ 1.76
SYTL1-204ENST00000483926 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa26.02■■□□□ 1.76
SYTL1-204ENST00000483926 MIA2Q96PC5 1412 aa26.01■■□□□ 1.76
SYTL1-204ENST00000483926 GCC2Q8IWJ2 1684 aa26■■□□□ 1.75
SYTL1-204ENST00000483926 AKNAQ7Z591 1439 aa26■■□□□ 1.75
SYTL1-204ENST00000483926 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
SYTL1-204ENST00000483926 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa25.98■■□□□ 1.75
SYTL1-204ENST00000483926 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.98■■□□□ 1.75
SYTL1-204ENST00000483926 CHIC2Q9UKJ5 165 aa25.96■■□□□ 1.75
SYTL1-204ENST00000483926 KIAA0556O60303 1618 aa25.94■■□□□ 1.74
SYTL1-204ENST00000483926 DISP1Q96F81 1524 aa25.94■■□□□ 1.74
SYTL1-204ENST00000483926 KDM5BQ9UGL1 1544 aa25.94■■□□□ 1.74
SYTL1-204ENST00000483926 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
SYTL1-204ENST00000483926 ARID3CA6NKF2 412 aa25.9■■□□□ 1.74
SYTL1-204ENST00000483926 GRIN2AQ12879 1464 aa25.89■■□□□ 1.73
SYTL1-204ENST00000483926 KDM6BO15054 1643 aa25.89■■□□□ 1.73
SYTL1-204ENST00000483926 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
SYTL1-204ENST00000483926 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
SYTL1-204ENST00000483926 CCER2I3L3R5 266 aa25.85■■□□□ 1.73
SYTL1-204ENST00000483926 TRIM52Q96A61 297 aa25.84■■□□□ 1.73
SYTL1-204ENST00000483926 ANP32CO43423 234 aa25.83■■□□□ 1.73
SYTL1-204ENST00000483926 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25.83■■□□□ 1.73
SYTL1-204ENST00000483926 ROCK1Q13464 1354 aa25.8■■□□□ 1.72
SYTL1-204ENST00000483926 DAPK1P53355 1430 aa25.8■■□□□ 1.72
SYTL1-204ENST00000483926 MPHOSPH9Q99550 1183 aa25.8■■□□□ 1.72
SYTL1-204ENST00000483926 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23 ms