RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483778.5

ATG4B-221, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 3

Gene ATG4B, Length 1,103 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-221ENST00000483778 KIF27Q86VH2 1401 aa31.48■■■□□ 2.63
ATG4B-221ENST00000483778 CUL7Q14999 1698 aa31.38■■■□□ 2.61
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ATG4B-221ENST00000483778 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa31.3■■■□□ 2.6
ATG4B-221ENST00000483778 KIF13AQ9H1H9 1805 aa31.29■■■□□ 2.6
ATG4B-221ENST00000483778 ADCY10Q96PN6 1610 aa31.21■■■□□ 2.59
ATG4B-221ENST00000483778 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP31.11■■■□□ 2.57
ATG4B-221ENST00000483778 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP31.11■■■□□ 2.57
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ATG4B-221ENST00000483778 PTPRGP23470 1445 aa31.06■■■□□ 2.56
ATG4B-221ENST00000483778 IQGAP2Q13576 1575 aa31.05■■■□□ 2.56
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ATG4B-221ENST00000483778 DIP2BQ9P265 1576 aa31■■■□□ 2.55
ATG4B-221ENST00000483778 TNIKQ9UKE5 1360 aa30.98■■■□□ 2.55
ATG4B-221ENST00000483778 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa30.98■■■□□ 2.55
ATG4B-221ENST00000483778 DISP1Q96F81 1524 aa30.96■■■□□ 2.55
ATG4B-221ENST00000483778 TSPOAP1O95153 1857 aa30.92■■■□□ 2.54
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ATG4B-221ENST00000483778 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa30.8■■■□□ 2.52
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ATG4B-221ENST00000483778 KIAA0556O60303 1618 aa30.78■■■□□ 2.52
ATG4B-221ENST00000483778 ASXL2Q76L83 1435 aa30.78■■■□□ 2.52
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ATG4B-221ENST00000483778 KDM6BO15054 1643 aa30.68■■■□□ 2.5
ATG4B-221ENST00000483778 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP30.67■■■□□ 2.5
ATG4B-221ENST00000483778 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP30.66■■■□□ 2.5
ATG4B-221ENST00000483778 GLI2P10070 1586 aa30.64■■■□□ 2.5
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ATG4B-221ENST00000483778 GOLGA3Q08378 1498 aa30.55■■■□□ 2.48
ATG4B-221ENST00000483778 ABCA8O94911 1581 aa30.53■■■□□ 2.48
ATG4B-221ENST00000483778 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa30.52■■■□□ 2.48
ATG4B-221ENST00000483778 P3H3Q8IVL6 736 aa30.52■■■□□ 2.48
ATG4B-221ENST00000483778 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP30.48■■■□□ 2.47
ATG4B-221ENST00000483778 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa30.46■■■□□ 2.47
ATG4B-221ENST00000483778 WDR7Q9Y4E6 1490 aa30.44■■■□□ 2.46
ATG4B-221ENST00000483778 KCNH8Q96L42 1107 aa30.41■■■□□ 2.46
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ATG4B-221ENST00000483778 ARID3CA6NKF2 412 aa30.39■■■□□ 2.46
ATG4B-221ENST00000483778 SAMD9Q5K651 1589 aa30.33■■■□□ 2.45
ATG4B-221ENST00000483778 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP30.32■■■□□ 2.44
ATG4B-221ENST00000483778 ATP10BO94823 1461 aa30.31■■■□□ 2.44
ATG4B-221ENST00000483778 TEX14Q8IWB6 1497 aa30.31■■■□□ 2.44
ATG4B-221ENST00000483778 EEA1Q15075 1411 aa30.29■■■□□ 2.44
ATG4B-221ENST00000483778 CD109Q6YHK3 1445 aa30.28■■■□□ 2.44
ATG4B-221ENST00000483778 CFAP43Q8NDM7 1665 aa30.27■■■□□ 2.44
ATG4B-221ENST00000483778 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa30.22■■■□□ 2.43
ATG4B-221ENST00000483778 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa30.2■■■□□ 2.43
ATG4B-221ENST00000483778 FHOD3Q2V2M9 1422 aa30.17■■■□□ 2.42
ATG4B-221ENST00000483778 ADGRL1O94910 1474 aa30.14■■■□□ 2.42
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ATG4B-221ENST00000483778 EHMT2Q96KQ7 1210 aa30.14■■■□□ 2.42
ATG4B-221ENST00000483778 KIF21BO75037 1637 aa30.14■■■□□ 2.41
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ATG4B-221ENST00000483778 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP30.08■■■□□ 2.41
ATG4B-221ENST00000483778 ABCA9Q8IUA7 1624 aa30.07■■■□□ 2.4
ATG4B-221ENST00000483778 ARAP3Q8WWN8 1544 aa30■■■□□ 2.39
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ATG4B-221ENST00000483778 RAPGEF3O95398 923 aa29.93■■■□□ 2.38
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ATG4B-221ENST00000483778 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP29.86■■■□□ 2.37
ATG4B-221ENST00000483778 PHLDB1Q86UU1 1377 aa29.86■■■□□ 2.37
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ATG4B-221ENST00000483778 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP29.83■■■□□ 2.37
ATG4B-221ENST00000483778 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa29.83■■■□□ 2.37
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ATG4B-221ENST00000483778 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP29.79■■■□□ 2.36
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ATG4B-221ENST00000483778 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa29.57■■■□□ 2.32
ATG4B-221ENST00000483778 PTPRMP28827 1452 aa29.56■■■□□ 2.32
ATG4B-221ENST00000483778 MYO5CQ9NQX4 1742 aa29.55■■■□□ 2.32
ATG4B-221ENST00000483778 SCAPERQ9BY12 1400 aa29.54■■■□□ 2.32
ATG4B-221ENST00000483778 YEATS2Q9ULM3 1422 aa29.54■■■□□ 2.32
ATG4B-221ENST00000483778 MADDQ8WXG6 1647 aa29.53■■■□□ 2.32
ATG4B-221ENST00000483778 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP29.53■■■□□ 2.32
ATG4B-221ENST00000483778 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa29.52■■■□□ 2.32
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