RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475693.1

ATG4B-217, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 2,237 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-217ENST00000475693 GRIN2AQ12879 1464 aa28.82■■■□□ 2.2
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ATG4B-217ENST00000475693 CEP170Q5SW79 1584 aa28.69■■■□□ 2.18
ATG4B-217ENST00000475693 CHD1O14646 1710 aa28.68■■■□□ 2.18
ATG4B-217ENST00000475693 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa28.67■■■□□ 2.18
ATG4B-217ENST00000475693 ARAP1Q96P48 1450 aa28.63■■■□□ 2.17
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ATG4B-217ENST00000475693 SAMD9Q5K651 1589 aa28.42■■■□□ 2.14
ATG4B-217ENST00000475693 UGGT2Q9NYU1 1516 aa28.41■■■□□ 2.14
ATG4B-217ENST00000475693 DISP1Q96F81 1524 aa28.41■■■□□ 2.14
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ATG4B-217ENST00000475693 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
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ATG4B-217ENST00000475693 ERCC6L2Q5T890 1561 aa28.28■■■□□ 2.12
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ATG4B-217ENST00000475693 SHROOM2Q13796 1616 aa28.2■■■□□ 2.1
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ATG4B-217ENST00000475693 TIAM1Q13009 1591 aa28■■■□□ 2.07
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ATG4B-217ENST00000475693 ASXL2Q76L83 1435 aa27.44■■□□□ 1.98
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ATG4B-217ENST00000475693 PTPN23Q9H3S7 1636 aa27.34■■□□□ 1.97
ATG4B-217ENST00000475693 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa27.31■■□□□ 1.96
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ATG4B-217ENST00000475693 PTPRKQ15262 1439 aa27.28■■□□□ 1.96
ATG4B-217ENST00000475693 CHIC2Q9UKJ5 165 aa27.27■■□□□ 1.96
ATG4B-217ENST00000475693 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa27.26■■□□□ 1.95
ATG4B-217ENST00000475693 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
ATG4B-217ENST00000475693 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa27.23■■□□□ 1.95
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