RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473095.1

CHCHD2-202, Transcript of coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CHCHD2, Length 694 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD2-202ENST00000473095 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.94■■□□□ 1.42
CHCHD2-202ENST00000473095 ABCC10Q5T3U5 1492 aa23.85■■□□□ 1.41
CHCHD2-202ENST00000473095 MAPKBP1O60336 1514 aa23.84■■□□□ 1.41
CHCHD2-202ENST00000473095 ADCY10Q96PN6 1610 aa23.81■■□□□ 1.4
CHCHD2-202ENST00000473095 FAM69CQ0P6D2 419 aa23.79■■□□□ 1.4
CHCHD2-202ENST00000473095 DIP2BQ9P265 1576 aa23.78■■□□□ 1.4
CHCHD2-202ENST00000473095 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP23.78■■□□□ 1.4
CHCHD2-202ENST00000473095 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.78■■□□□ 1.4
CHCHD2-202ENST00000473095 IGF1RP08069 1367 aa23.76■■□□□ 1.39
CHCHD2-202ENST00000473095 CUL7Q14999 1698 aa23.74■■□□□ 1.39
CHCHD2-202ENST00000473095 KIF27Q86VH2 1401 aa23.7■■□□□ 1.38
CHCHD2-202ENST00000473095 KDM6BO15054 1643 aa23.63■■□□□ 1.37
CHCHD2-202ENST00000473095 TSPOAP1O95153 1857 aa23.62■■□□□ 1.37
CHCHD2-202ENST00000473095 PTPRGP23470 1445 aa23.59■■□□□ 1.37
CHCHD2-202ENST00000473095 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.56■■□□□ 1.36
CHCHD2-202ENST00000473095 ABCC2Q92887 1545 aa23.54■■□□□ 1.36
CHCHD2-202ENST00000473095 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.53■■□□□ 1.36
CHCHD2-202ENST00000473095 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa23.53■■□□□ 1.36
CHCHD2-202ENST00000473095 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa23.53■■□□□ 1.36
CHCHD2-202ENST00000473095 IQGAP2Q13576 1575 aa23.5■■□□□ 1.35
CHCHD2-202ENST00000473095 GLI2P10070 1586 aa23.48■■□□□ 1.35
CHCHD2-202ENST00000473095 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa23.47■■□□□ 1.35
CHCHD2-202ENST00000473095 PLB1Q6P1J6 1458 aa23.47■■□□□ 1.35
CHCHD2-202ENST00000473095 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
CHCHD2-202ENST00000473095 ASXL2Q76L83 1435 aa23.46■■□□□ 1.35
CHCHD2-202ENST00000473095 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
CHCHD2-202ENST00000473095 DISP1Q96F81 1524 aa23.43■■□□□ 1.34
CHCHD2-202ENST00000473095 UACAQ9BZF9 1416 aa23.41■■□□□ 1.34
CHCHD2-202ENST00000473095 UGGT2Q9NYU1 1516 aa23.37■■□□□ 1.33
CHCHD2-202ENST00000473095 KDM5BQ9UGL1 1544 aa23.36■■□□□ 1.33
CHCHD2-202ENST00000473095 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
CHCHD2-202ENST00000473095 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa23.33■■□□□ 1.33
CHCHD2-202ENST00000473095 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.32■■□□□ 1.32
CHCHD2-202ENST00000473095 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
CHCHD2-202ENST00000473095 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
CHCHD2-202ENST00000473095 KIAA0556O60303 1618 aa23.3■■□□□ 1.32
CHCHD2-202ENST00000473095 ADGRL1O94910 1474 aa23.26■■□□□ 1.31
CHCHD2-202ENST00000473095 TEX14Q8IWB6 1497 aa23.25■■□□□ 1.31
CHCHD2-202ENST00000473095 WDR7Q9Y4E6 1490 aa23.19■■□□□ 1.3
CHCHD2-202ENST00000473095 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.19■■□□□ 1.3
CHCHD2-202ENST00000473095 GOLGA3Q08378 1498 aa23.12■■□□□ 1.29
CHCHD2-202ENST00000473095 ABCA8O94911 1581 aa23.12■■□□□ 1.29
CHCHD2-202ENST00000473095 CFAP43Q8NDM7 1665 aa23.11■■□□□ 1.29
CHCHD2-202ENST00000473095 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa23.1■■□□□ 1.29
CHCHD2-202ENST00000473095 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
CHCHD2-202ENST00000473095 CD109Q6YHK3 1445 aa23.07■■□□□ 1.28
CHCHD2-202ENST00000473095 HECW2Q9P2P5 1572 aa23.05■■□□□ 1.28
CHCHD2-202ENST00000473095 PRXQ9BXM0 1461 aa23.04■■□□□ 1.28
CHCHD2-202ENST00000473095 KCNH8Q96L42 1107 aa23■■□□□ 1.27
CHCHD2-202ENST00000473095 ARAP3Q8WWN8 1544 aa22.93■■□□□ 1.26
CHCHD2-202ENST00000473095 KIF21BO75037 1637 aa22.92■■□□□ 1.26
CHCHD2-202ENST00000473095 ATP10BO94823 1461 aa22.91■■□□□ 1.26
CHCHD2-202ENST00000473095 ABCA9Q8IUA7 1624 aa22.88■■□□□ 1.25
CHCHD2-202ENST00000473095 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
CHCHD2-202ENST00000473095 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.85■■□□□ 1.25
CHCHD2-202ENST00000473095 SAMD9Q5K651 1589 aa22.84■■□□□ 1.25
CHCHD2-202ENST00000473095 P3H3Q8IVL6 736 aa22.83■■□□□ 1.25
CHCHD2-202ENST00000473095 ARID3CA6NKF2 412 aa22.82■■□□□ 1.24
CHCHD2-202ENST00000473095 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.79■■□□□ 1.24
CHCHD2-202ENST00000473095 ADAMTSL3P82987 1691 aa22.79■■□□□ 1.24
CHCHD2-202ENST00000473095 NEO1Q92859 1461 aa22.78■■□□□ 1.24
CHCHD2-202ENST00000473095 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.74■■□□□ 1.23
CHCHD2-202ENST00000473095 PTPRMP28827 1452 aa22.73■■□□□ 1.23
CHCHD2-202ENST00000473095 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa22.73■■□□□ 1.23
CHCHD2-202ENST00000473095 RAPGEF3O95398 923 aa22.73■■□□□ 1.23
CHCHD2-202ENST00000473095 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
CHCHD2-202ENST00000473095 BCORL1Q5H9F3 1711 aa22.7■■□□□ 1.22
CHCHD2-202ENST00000473095 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
CHCHD2-202ENST00000473095 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
CHCHD2-202ENST00000473095 MADDQ8WXG6 1647 aa22.64■■□□□ 1.22
CHCHD2-202ENST00000473095 RICTORQ6R327 1708 aa22.62■■□□□ 1.21
CHCHD2-202ENST00000473095 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.62■■□□□ 1.21
CHCHD2-202ENST00000473095 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa22.62■■□□□ 1.21
CHCHD2-202ENST00000473095 EEA1Q15075 1411 aa22.61■■□□□ 1.21
CHCHD2-202ENST00000473095 FBXO41Q8TF61 875 aa22.61■■□□□ 1.21
CHCHD2-202ENST00000473095 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
CHCHD2-202ENST00000473095 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
CHCHD2-202ENST00000473095 CFAP74Q9C0B2 1584 aa22.59■■□□□ 1.21
CHCHD2-202ENST00000473095 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
CHCHD2-202ENST00000473095 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.58■■□□□ 1.21
CHCHD2-202ENST00000473095 AKNAQ7Z591 1439 aa22.57■■□□□ 1.2
CHCHD2-202ENST00000473095 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.57■■□□□ 1.24e-16■□□□□ 10.9
CHCHD2-202ENST00000473095 FANCAO15360 1455 aa22.56■■□□□ 1.2
CHCHD2-202ENST00000473095 LMTK3Q96Q04 1460 aa22.56■■□□□ 1.2
CHCHD2-202ENST00000473095 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
CHCHD2-202ENST00000473095 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.54■■□□□ 1.2
CHCHD2-202ENST00000473095 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa22.54■■□□□ 1.2
CHCHD2-202ENST00000473095 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
CHCHD2-202ENST00000473095 TTC37Q6PGP7 1564 aa22.52■■□□□ 1.2
CHCHD2-202ENST00000473095 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa22.48■■□□□ 1.19
CHCHD2-202ENST00000473095 MAGI2Q86UL8 1455 aa22.47■■□□□ 1.19
CHCHD2-202ENST00000473095 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa22.47■■□□□ 1.19
CHCHD2-202ENST00000473095 POGZQ7Z3K3 1410 aa22.46■■□□□ 1.19
CHCHD2-202ENST00000473095 YEATS2Q9ULM3 1422 aa22.46■■□□□ 1.19
CHCHD2-202ENST00000473095 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
CHCHD2-202ENST00000473095 HECW1Q76N89 1606 aa22.44■■□□□ 1.18
CHCHD2-202ENST00000473095 PLCH2O75038 1416 aa22.41■■□□□ 1.18
CHCHD2-202ENST00000473095 SCAPERQ9BY12 1400 aa22.39■■□□□ 1.17
CHCHD2-202ENST00000473095 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa22.38■■□□□ 1.17
CHCHD2-202ENST00000473095 HSPA2P54652 639 aa22.38■■□□□ 1.17
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