RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472019.5

DNAJB2-210, Transcript of DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member B2, humanhuman

TSL 3

Gene DNAJB2, Length 1,419 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB2-210ENST00000472019 CLIP1P30622 1438 aa41.36■■■■■ 4.21
DNAJB2-210ENST00000472019 FBLN2P98095 1184 aa41.31■■■■■ 4.2
DNAJB2-210ENST00000472019 IQGAP2Q13576 1575 aa41.31■■■■■ 4.2
DNAJB2-210ENST00000472019 CEP170Q5SW79 1584 aa41.3■■■■■ 4.2
DNAJB2-210ENST00000472019 NUP160Q12769 1436 aa41.28■■■■■ 4.2
DNAJB2-210ENST00000472019 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa41.26■■■■■ 4.2
DNAJB2-210ENST00000472019 EFCAB5A4FU69 1503 aa41.22■■■■■ 4.19
DNAJB2-210ENST00000472019 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa41.12■■■■■ 4.17
DNAJB2-210ENST00000472019 SAMD9Q5K651 1589 aa41.12■■■■■ 4.17
DNAJB2-210ENST00000472019 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP41.11■■■■■ 4.17
DNAJB2-210ENST00000472019 UGGT2Q9NYU1 1516 aa41.1■■■■■ 4.17
DNAJB2-210ENST00000472019 ARAP1Q96P48 1450 aa41.02■■■■■ 4.16
DNAJB2-210ENST00000472019 VPS8Q8N3P4 1428 aa40.94■■■■■ 4.14
DNAJB2-210ENST00000472019 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.93■■■■■ 4.14
DNAJB2-210ENST00000472019 SHROOM2Q13796 1616 aa40.9■■■■■ 4.14
DNAJB2-210ENST00000472019 KIAA0556O60303 1618 aa40.89■■■■■ 4.14
DNAJB2-210ENST00000472019 FHOD3Q2V2M9 1422 aa40.83■■■■■ 4.13
DNAJB2-210ENST00000472019 DISP1Q96F81 1524 aa40.82■■■■■ 4.13
DNAJB2-210ENST00000472019 JPH4Q96JJ6 628 aa40.82■■■■■ 4.12
DNAJB2-210ENST00000472019 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa40.8■■■■■ 4.12
DNAJB2-210ENST00000472019 FMN1Q68DA7 1419 aa40.76■■■■■ 4.12
DNAJB2-210ENST00000472019 P3H3Q8IVL6 736 aa40.75■■■■■ 4.11
DNAJB2-210ENST00000472019 OSCARQ8IYS5 282 aa40.67■■■■■ 4.1
DNAJB2-210ENST00000472019 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP40.66■■■■■ 4.1
DNAJB2-210ENST00000472019 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP40.63■■■■■ 4.1
DNAJB2-210ENST00000472019 FYCO1Q9BQS8 1478 aa40.6■■■■■ 4.09
DNAJB2-210ENST00000472019 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa40.57■■■■■ 4.09
DNAJB2-210ENST00000472019 APLP2Q06481 763 aa40.49■■■■■ 4.07
DNAJB2-210ENST00000472019 HECW1Q76N89 1606 aa40.49■■■■■ 4.07
DNAJB2-210ENST00000472019 MAP3K1Q13233 1512 aa40.46■■■■■ 4.07
DNAJB2-210ENST00000472019 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa40.45■■■■■ 4.07
DNAJB2-210ENST00000472019 CFAP43Q8NDM7 1665 aa40.45■■■■■ 4.07
DNAJB2-210ENST00000472019 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.45■■■■■ 4.07
DNAJB2-210ENST00000472019 TIAM1Q13009 1591 aa40.38■■■■■ 4.05
DNAJB2-210ENST00000472019 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa40.37■■■■■ 4.05
DNAJB2-210ENST00000472019 PTPRGP23470 1445 aa40.36■■■■■ 4.05
DNAJB2-210ENST00000472019 ABCA8O94911 1581 aa40.33■■■■■ 4.05
DNAJB2-210ENST00000472019 CCDC18Q5T9S5 1454 aa40.33■■■■■ 4.05
DNAJB2-210ENST00000472019 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP40.28■■■■■ 4.04
DNAJB2-210ENST00000472019 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP40.28■■■■■ 4.04
DNAJB2-210ENST00000472019 PLB1Q6P1J6 1458 aa40.25■■■■■ 4.03
DNAJB2-210ENST00000472019 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP40.21■■■■■ 4.03
DNAJB2-210ENST00000472019 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP40.2■■■■■ 4.03
DNAJB2-210ENST00000472019 UACAQ9BZF9 1416 aa40.16■■■■■ 4.02
DNAJB2-210ENST00000472019 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa40.12■■■■■ 4.01
DNAJB2-210ENST00000472019 ABCC2Q92887 1545 aa40.12■■■■■ 4.01
DNAJB2-210ENST00000472019 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP40.09■■■■■ 4.01
DNAJB2-210ENST00000472019 ARHGEF11O15085 1522 aa40.09■■■■■ 4.01
DNAJB2-210ENST00000472019 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP40.08■■■■■ 4.01
DNAJB2-210ENST00000472019 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa40.07■■■■■ 4.01
DNAJB2-210ENST00000472019 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa40.04■■■■■ 4
DNAJB2-210ENST00000472019 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP40.02■■■■■ 4
DNAJB2-210ENST00000472019 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.99■■■■□ 3.99
DNAJB2-210ENST00000472019 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.99■■■■□ 3.99
DNAJB2-210ENST00000472019 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.99■■■■□ 3.99
DNAJB2-210ENST00000472019 MTUS2Q5JR59 1369 aa39.97■■■■□ 3.99
DNAJB2-210ENST00000472019 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP39.94■■■■□ 3.98
DNAJB2-210ENST00000472019 ATP10BO94823 1461 aa39.94■■■■□ 3.98
DNAJB2-210ENST00000472019 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP39.93■■■■□ 3.98
DNAJB2-210ENST00000472019 ADCY10Q96PN6 1610 aa39.92■■■■□ 3.98
DNAJB2-210ENST00000472019 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa39.9■■■■□ 3.98
DNAJB2-210ENST00000472019 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP39.88■■■■□ 3.97
DNAJB2-210ENST00000472019 ARID3CA6NKF2 412 aa39.87■■■■□ 3.97
DNAJB2-210ENST00000472019 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP39.87■■■■□ 3.97
DNAJB2-210ENST00000472019 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP39.87■■■■□ 3.97
DNAJB2-210ENST00000472019 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP39.87■■■■□ 3.97
DNAJB2-210ENST00000472019 KDM5BQ9UGL1 1544 aa39.86■■■■□ 3.97
DNAJB2-210ENST00000472019 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP39.8■■■■□ 3.96
DNAJB2-210ENST00000472019 NCOA2Q15596 1464 aa39.74■■■■□ 3.95
DNAJB2-210ENST00000472019 PLEKHD1A6NEE1 506 aa39.72■■■■□ 3.95
DNAJB2-210ENST00000472019 KIF14Q15058 1648 aa39.7■■■■□ 3.95
DNAJB2-210ENST00000472019 PHLDB1Q86UU1 1377 aa39.62■■■■□ 3.93
DNAJB2-210ENST00000472019 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP39.61■■■■□ 3.93
DNAJB2-210ENST00000472019 ITSN2Q9NZM3 1697 aa39.6■■■■□ 3.93
DNAJB2-210ENST00000472019 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP39.57■■■■□ 3.93
DNAJB2-210ENST00000472019 MYOM3Q5VTT5 1437 aa39.56■■■■□ 3.92
DNAJB2-210ENST00000472019 PCGF6Q9BYE7 350 aa39.54■■■■□ 3.92
DNAJB2-210ENST00000472019 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.53■■■■□ 3.92
DNAJB2-210ENST00000472019 CCNB3Q8WWL7 1395 aa39.49■■■■□ 3.91
DNAJB2-210ENST00000472019 WDR7Q9Y4E6 1490 aa39.49■■■■□ 3.91
DNAJB2-210ENST00000472019 FGD6Q6ZV73 1430 aa39.48■■■■□ 3.91
DNAJB2-210ENST00000472019 ABCC10Q5T3U5 1492 aa39.48■■■■□ 3.91
DNAJB2-210ENST00000472019 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa39.47■■■■□ 3.91
DNAJB2-210ENST00000472019 MIA2Q96PC5 1412 aa39.44■■■■□ 3.9
DNAJB2-210ENST00000472019 ASXL2Q76L83 1435 aa39.43■■■■□ 3.9
DNAJB2-210ENST00000472019 PTPN23Q9H3S7 1636 aa39.41■■■■□ 3.9
DNAJB2-210ENST00000472019 MYO5CQ9NQX4 1742 aa39.4■■■■□ 3.9
DNAJB2-210ENST00000472019 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP39.4■■■■□ 3.9
DNAJB2-210ENST00000472019 MAPKBP1O60336 1514 aa39.4■■■■□ 3.9
DNAJB2-210ENST00000472019 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP39.39■■■■□ 3.9
DNAJB2-210ENST00000472019 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.38■■■■□ 3.89
DNAJB2-210ENST00000472019 TTC37Q6PGP7 1564 aa39.37■■■■□ 3.89
DNAJB2-210ENST00000472019 PREX2Q70Z35 1606 aa39.37■■■■□ 3.89
DNAJB2-210ENST00000472019 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP39.36■■■■□ 3.89
DNAJB2-210ENST00000472019 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP39.33■■■■□ 3.89
DNAJB2-210ENST00000472019 ABCA9Q8IUA7 1624 aa39.31■■■■□ 3.88
DNAJB2-210ENST00000472019 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa39.3■■■■□ 3.88
DNAJB2-210ENST00000472019 KCNH8Q96L42 1107 aa39.28■■■■□ 3.88
DNAJB2-210ENST00000472019 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP39.23■■■■□ 3.87
DNAJB2-210ENST00000472019 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP39.21■■■■□ 3.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.2 ms