RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466662.1

PNCK-223, Transcript of pregnancy up-regulated nonubiquitous CaM kinase, human

TSL 3

Gene PNCK, Length 464 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PNCK-223	ENST00000466662	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		30.61	■■■□□ 2.49
PNCK-223	ENST00000466662	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	30.55	■■■□□ 2.48
PNCK-223	ENST00000466662	JPH4	Q96JJ6	628 aa		30.54	■■■□□ 2.48
PNCK-223	ENST00000466662	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		30.53	■■■□□ 2.48
PNCK-223	ENST00000466662	IQGAP2	Q13576	1575 aa		30.46	■■■□□ 2.47
PNCK-223	ENST00000466662	PRX	Q9BXM0	1461 aa		30.41	■■■□□ 2.46
PNCK-223	ENST00000466662	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		30.39	■■■□□ 2.46
PNCK-223	ENST00000466662	EEA1	Q15075	1411 aa		30.33	■■■□□ 2.45
PNCK-223	ENST00000466662	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		30.29	■■■□□ 2.44
PNCK-223	ENST00000466662	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		30.26	■■■□□ 2.43
PNCK-223	ENST00000466662	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		30.24	■■■□□ 2.43
PNCK-223	ENST00000466662	DISP1	Q96F81	1524 aa		30.23	■■■□□ 2.43
PNCK-223	ENST00000466662	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		30.22	■■■□□ 2.43
PNCK-223	ENST00000466662	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		30.22	■■■□□ 2.43
PNCK-223	ENST00000466662	KIAA0556	O60303	1618 aa		30.19	■■■□□ 2.42
PNCK-223	ENST00000466662	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		30.17	■■■□□ 2.42
PNCK-223	ENST00000466662	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	30.14	■■■□□ 2.42
PNCK-223	ENST00000466662	PTPRG	P23470	1445 aa		30.13	■■■□□ 2.41
PNCK-223	ENST00000466662	KIF21B	O75037	1637 aa		30.11	■■■□□ 2.41
PNCK-223	ENST00000466662	GOLGA3	Q08378	1498 aa		30.06	■■■□□ 2.4
PNCK-223	ENST00000466662	MAPKBP1	O60336	1514 aa		30.06	■■■□□ 2.4
PNCK-223	ENST00000466662	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		30.02	■■■□□ 2.4
PNCK-223	ENST00000466662	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	30.02	■■■□□ 2.4
PNCK-223	ENST00000466662	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		30	■■■□□ 2.39
PNCK-223	ENST00000466662	ABCC2	Q92887	1545 aa		29.98	■■■□□ 2.39
PNCK-223	ENST00000466662	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	29.96	■■■□□ 2.39
PNCK-223	ENST00000466662	UACA	Q9BZF9	1416 aa		29.96	■■■□□ 2.39
PNCK-223	ENST00000466662	SAMD9	Q5K651	1589 aa		29.95	■■■□□ 2.39
PNCK-223	ENST00000466662	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	29.95	■■■□□ 2.39
PNCK-223	ENST00000466662	DIP2B	Q9P265	1576 aa		29.9	■■■□□ 2.38
PNCK-223	ENST00000466662	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		29.89	■■■□□ 2.38
PNCK-223	ENST00000466662	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		29.86	■■■□□ 2.37
PNCK-223	ENST00000466662	ABCA8	O94911	1581 aa		29.86	■■■□□ 2.37
PNCK-223	ENST00000466662	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		29.84	■■■□□ 2.37
PNCK-223	ENST00000466662	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	29.84	■■■□□ 2.37
PNCK-223	ENST00000466662	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		29.76	■■■□□ 2.36
PNCK-223	ENST00000466662	ASXL2	Q76L83	1435 aa		29.76	■■■□□ 2.35
PNCK-223	ENST00000466662	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		29.71	■■■□□ 2.35
PNCK-223	ENST00000466662	P3H3	Q8IVL6	736 aa		29.7	■■■□□ 2.35
PNCK-223	ENST00000466662	GLI2	P10070	1586 aa		29.69	■■■□□ 2.34
PNCK-223	ENST00000466662	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		29.67	■■■□□ 2.34
PNCK-223	ENST00000466662	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		29.65	■■■□□ 2.34
PNCK-223	ENST00000466662	TSPOAP1	O95153	1857 aa		29.64	■■■□□ 2.34
PNCK-223	ENST00000466662	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	29.63	■■■□□ 2.33
PNCK-223	ENST00000466662	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		29.61	■■■□□ 2.33
PNCK-223	ENST00000466662	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	29.61	■■■□□ 2.33
PNCK-223	ENST00000466662	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	29.61	■■■□□ 2.33
PNCK-223	ENST00000466662	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		29.6	■■■□□ 2.33
PNCK-223	ENST00000466662	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	29.57	■■■□□ 2.32
PNCK-223	ENST00000466662	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		29.57	■■■□□ 2.32
PNCK-223	ENST00000466662	ATP10B	O94823	1461 aa		29.55	■■■□□ 2.32
PNCK-223	ENST00000466662	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	29.53	■■■□□ 2.32
PNCK-223	ENST00000466662	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		29.53	■■■□□ 2.32
PNCK-223	ENST00000466662	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		29.47	■■■□□ 2.31
PNCK-223	ENST00000466662	KDM6B	O15054	1643 aa		29.45	■■■□□ 2.3
PNCK-223	ENST00000466662	ARID3C	A6NKF2	412 aa		29.42	■■■□□ 2.3
PNCK-223	ENST00000466662	FMN1	Q68DA7	1419 aa		29.42	■■■□□ 2.3
PNCK-223	ENST00000466662	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		29.37	■■■□□ 2.29
PNCK-223	ENST00000466662	HECW1	Q76N89	1606 aa		29.37	■■■□□ 2.29
PNCK-223	ENST00000466662	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		29.35	■■■□□ 2.29
PNCK-223	ENST00000466662	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		29.33	■■■□□ 2.29
PNCK-223	ENST00000466662	CD109	Q6YHK3	1445 aa		29.31	■■■□□ 2.28
PNCK-223	ENST00000466662	KCNH8	Q96L42	1107 aa		29.31	■■■□□ 2.28
PNCK-223	ENST00000466662	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	29.3	■■■□□ 2.28
PNCK-223	ENST00000466662	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	29.27	■■■□□ 2.28
PNCK-223	ENST00000466662	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	29.27	■■■□□ 2.28
PNCK-223	ENST00000466662	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		29.27	■■■□□ 2.28
PNCK-223	ENST00000466662	CLIP1	P30622	1438 aa		29.26	■■■□□ 2.27
PNCK-223	ENST00000466662	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	29.25	■■■□□ 2.27
PNCK-223	ENST00000466662	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	29.2	■■■□□ 2.26
PNCK-223	ENST00000466662	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		29.18	■■■□□ 2.26
PNCK-223	ENST00000466662	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		29.17	■■■□□ 2.26
PNCK-223	ENST00000466662	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	29.15	■■■□□ 2.26
PNCK-223	ENST00000466662	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		29.14	■■■□□ 2.26
PNCK-223	ENST00000466662	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		29.13	■■■□□ 2.25
PNCK-223	ENST00000466662	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	29.11	■■■□□ 2.25
PNCK-223	ENST00000466662	CEP162	Q5TB80	1403 aa		29.11	■■■□□ 2.25
PNCK-223	ENST00000466662	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		29.1	■■■□□ 2.25
PNCK-223	ENST00000466662	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		29.08	■■■□□ 2.25
PNCK-223	ENST00000466662	NEO1	Q92859	1461 aa		29.07	■■■□□ 2.24
PNCK-223	ENST00000466662	KIF14	Q15058	1648 aa		29.05	■■■□□ 2.24
PNCK-223	ENST00000466662	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		29.05	■■■□□ 2.24
PNCK-223	ENST00000466662	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	29.04	■■■□□ 2.24
PNCK-223	ENST00000466662	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		29.04	■■■□□ 2.24
PNCK-223	ENST00000466662	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	29.03	■■■□□ 2.24
PNCK-223	ENST00000466662	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		29.02	■■■□□ 2.24
PNCK-223	ENST00000466662	FANCA	O15360	1455 aa		28.97	■■■□□ 2.23
PNCK-223	ENST00000466662	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		28.95	■■■□□ 2.22
PNCK-223	ENST00000466662	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		28.94	■■■□□ 2.22
PNCK-223	ENST00000466662	PLCH2	O75038	1416 aa		28.92	■■■□□ 2.22
PNCK-223	ENST00000466662	RICTOR	Q6R327	1708 aa		28.91	■■■□□ 2.22
PNCK-223	ENST00000466662	AKNA	Q7Z591	1439 aa		28.89	■■■□□ 2.22
PNCK-223	ENST00000466662	PREX2	Q70Z35	1606 aa		28.86	■■■□□ 2.21
PNCK-223	ENST00000466662	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		28.85	■■■□□ 2.21
PNCK-223	ENST00000466662	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	28.83	■■■□□ 2.21
PNCK-223	ENST00000466662	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PNCK-223	ENST00000466662	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		28.8	■■■□□ 2.2
PNCK-223	ENST00000466662	ADGRL1	O94910	1474 aa		28.8	■■■□□ 2.2
PNCK-223	ENST00000466662	RAPGEF3	O95398	923 aa		28.8	■■■□□ 2.2
PNCK-223	ENST00000466662	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		28.79	■■■□□ 2.2

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