RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461426.1

SIGMAR1-204, Transcript of sigma non-opioid intracellular receptor 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SIGMAR1, Length 939 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIGMAR1-204ENST00000461426 ARAP1Q96P48 1450 aa44.56■■■■■ 4.72
SIGMAR1-204ENST00000461426 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa44.55■■■■■ 4.72
SIGMAR1-204ENST00000461426 SHROOM2Q13796 1616 aa44.51■■■■■ 4.72
SIGMAR1-204ENST00000461426 CSRNP3Q8WYN3 585 aa44.48■■■■■ 4.71
SIGMAR1-204ENST00000461426 EEA1Q15075 1411 aa44.47■■■■■ 4.71
SIGMAR1-204ENST00000461426 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP44.42■■■■■ 4.7
SIGMAR1-204ENST00000461426 PRXQ9BXM0 1461 aa44.41■■■■■ 4.7
SIGMAR1-204ENST00000461426 ERCC6L2Q5T890 1561 aa44.36■■■■■ 4.69
SIGMAR1-204ENST00000461426 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP44.27■■■■■ 4.68
SIGMAR1-204ENST00000461426 IQGAP2Q13576 1575 aa44.22■■■■■ 4.67
SIGMAR1-204ENST00000461426 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa44.1■■■■■ 4.65
SIGMAR1-204ENST00000461426 UGGT2Q9NYU1 1516 aa44.02■■■■■ 4.64
SIGMAR1-204ENST00000461426 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa43.97■■■■■ 4.63
SIGMAR1-204ENST00000461426 TNIKQ9UKE5 1360 aa43.95■■■■■ 4.63
SIGMAR1-204ENST00000461426 PTPRGP23470 1445 aa43.94■■■■■ 4.62
SIGMAR1-204ENST00000461426 DISP1Q96F81 1524 aa43.93■■■■■ 4.62
SIGMAR1-204ENST00000461426 KIF21BO75037 1637 aa43.88■■■■■ 4.62
SIGMAR1-204ENST00000461426 GOLGA3Q08378 1498 aa43.83■■■■■ 4.61
SIGMAR1-204ENST00000461426 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP43.82■■■■■ 4.61
SIGMAR1-204ENST00000461426 KIAA0556O60303 1618 aa43.76■■■■■ 4.6
SIGMAR1-204ENST00000461426 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP43.74■■■■■ 4.59
SIGMAR1-204ENST00000461426 TRHP20396 242 aaPredicted RBP43.73■■■■■ 4.59
SIGMAR1-204ENST00000461426 UBTFP17480 764 aaKnown RBP43.69■■■■■ 4.58
SIGMAR1-204ENST00000461426 EHMT2Q96KQ7 1210 aa43.64■■■■■ 4.58
SIGMAR1-204ENST00000461426 ADCY10Q96PN6 1610 aa43.63■■■■■ 4.58
SIGMAR1-204ENST00000461426 UACAQ9BZF9 1416 aa43.62■■■■■ 4.57
SIGMAR1-204ENST00000461426 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa43.57■■■■■ 4.56
SIGMAR1-204ENST00000461426 P3H3Q8IVL6 736 aa43.56■■■■■ 4.56
SIGMAR1-204ENST00000461426 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP43.54■■■■■ 4.56
SIGMAR1-204ENST00000461426 SAMD9Q5K651 1589 aa43.48■■■■■ 4.55
SIGMAR1-204ENST00000461426 ABCC2Q92887 1545 aa43.48■■■■■ 4.55
SIGMAR1-204ENST00000461426 MAPKBP1O60336 1514 aa43.42■■■■■ 4.54
SIGMAR1-204ENST00000461426 PLB1Q6P1J6 1458 aa43.39■■■■■ 4.54
SIGMAR1-204ENST00000461426 EFCAB5A4FU69 1503 aa43.35■■■■■ 4.53
SIGMAR1-204ENST00000461426 KDM5BQ9UGL1 1544 aa43.33■■■■■ 4.53
SIGMAR1-204ENST00000461426 ABCA8O94911 1581 aa43.33■■■■■ 4.53
SIGMAR1-204ENST00000461426 FHOD3Q2V2M9 1422 aa43.28■■■■■ 4.52
SIGMAR1-204ENST00000461426 ABCC10Q5T3U5 1492 aa43.25■■■■■ 4.51
SIGMAR1-204ENST00000461426 FAM69CQ0P6D2 419 aa43.24■■■■■ 4.51
SIGMAR1-204ENST00000461426 ASXL2Q76L83 1435 aa43.22■■■■■ 4.51
SIGMAR1-204ENST00000461426 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP43.15■■■■■ 4.5
SIGMAR1-204ENST00000461426 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa43.14■■■■■ 4.5
SIGMAR1-204ENST00000461426 KIF13AQ9H1H9 1805 aa43.08■■■■■ 4.49
SIGMAR1-204ENST00000461426 DIP2BQ9P265 1576 aa43.08■■■■■ 4.49
SIGMAR1-204ENST00000461426 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa43.07■■■■■ 4.48
SIGMAR1-204ENST00000461426 ATP10BO94823 1461 aa43.05■■■■■ 4.48
SIGMAR1-204ENST00000461426 ARID3CA6NKF2 412 aa43.03■■■■■ 4.48
SIGMAR1-204ENST00000461426 FMN1Q68DA7 1419 aa43.02■■■■■ 4.48
SIGMAR1-204ENST00000461426 WDR7Q9Y4E6 1490 aa42.98■■■■■ 4.47
SIGMAR1-204ENST00000461426 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP42.97■■■■■ 4.47
SIGMAR1-204ENST00000461426 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP42.94■■■■■ 4.46
SIGMAR1-204ENST00000461426 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP42.93■■■■■ 4.46
SIGMAR1-204ENST00000461426 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP42.93■■■■■ 4.46
SIGMAR1-204ENST00000461426 CLIP1P30622 1438 aa42.93■■■■■ 4.46
SIGMAR1-204ENST00000461426 GLI2P10070 1586 aa42.93■■■■■ 4.46
SIGMAR1-204ENST00000461426 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa42.89■■■■■ 4.46
SIGMAR1-204ENST00000461426 KCNH8Q96L42 1107 aa42.88■■■■■ 4.45
SIGMAR1-204ENST00000461426 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP42.82■■■■■ 4.45
SIGMAR1-204ENST00000461426 PLEKHD1A6NEE1 506 aa42.78■■■■■ 4.44
SIGMAR1-204ENST00000461426 CEP162Q5TB80 1403 aa42.71■■■■■ 4.43
SIGMAR1-204ENST00000461426 HECW1Q76N89 1606 aa42.69■■■■■ 4.42
SIGMAR1-204ENST00000461426 TSPOAP1O95153 1857 aa42.68■■■■■ 4.42
SIGMAR1-204ENST00000461426 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa42.67■■■■■ 4.42
SIGMAR1-204ENST00000461426 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa42.67■■■■■ 4.42
SIGMAR1-204ENST00000461426 CD109Q6YHK3 1445 aa42.63■■■■■ 4.42
SIGMAR1-204ENST00000461426 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP42.63■■■■■ 4.41
SIGMAR1-204ENST00000461426 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP42.61■■■■■ 4.41
SIGMAR1-204ENST00000461426 TEX14Q8IWB6 1497 aa42.57■■■■■ 4.41
SIGMAR1-204ENST00000461426 CFAP43Q8NDM7 1665 aa42.55■■■■■ 4.4
SIGMAR1-204ENST00000461426 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP42.54■■■■■ 4.4
SIGMAR1-204ENST00000461426 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa42.53■■■■■ 4.4
SIGMAR1-204ENST00000461426 FYCO1Q9BQS8 1478 aa42.52■■■■■ 4.4
SIGMAR1-204ENST00000461426 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP42.51■■■■■ 4.4
SIGMAR1-204ENST00000461426 CCDC18Q5T9S5 1454 aa42.48■■■■■ 4.39
SIGMAR1-204ENST00000461426 ABCA9Q8IUA7 1624 aa42.47■■■■■ 4.39
SIGMAR1-204ENST00000461426 KDM6BO15054 1643 aa42.41■■■■■ 4.38
SIGMAR1-204ENST00000461426 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP42.37■■■■■ 4.37
SIGMAR1-204ENST00000461426 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa42.36■■■■■ 4.37
SIGMAR1-204ENST00000461426 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP42.32■■■■■ 4.37
SIGMAR1-204ENST00000461426 PHLDB1Q86UU1 1377 aa42.31■■■■■ 4.36
SIGMAR1-204ENST00000461426 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP42.28■■■■■ 4.36
SIGMAR1-204ENST00000461426 NEO1Q92859 1461 aa42.22■■■■■ 4.35
SIGMAR1-204ENST00000461426 VPS8Q8N3P4 1428 aa42.21■■■■■ 4.35
SIGMAR1-204ENST00000461426 TTC37Q6PGP7 1564 aa42.2■■■■■ 4.35
SIGMAR1-204ENST00000461426 KIF14Q15058 1648 aa42.19■■■■■ 4.34
SIGMAR1-204ENST00000461426 ARAP3Q8WWN8 1544 aa42.17■■■■■ 4.34
SIGMAR1-204ENST00000461426 PLCH2O75038 1416 aa42.17■■■■■ 4.34
SIGMAR1-204ENST00000461426 FANCAO15360 1455 aa42.11■■■■■ 4.33
SIGMAR1-204ENST00000461426 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa42.08■■■■■ 4.33
SIGMAR1-204ENST00000461426 MTUS2Q5JR59 1369 aa42.08■■■■■ 4.33
SIGMAR1-204ENST00000461426 AKNAQ7Z591 1439 aa42.07■■■■■ 4.33
SIGMAR1-204ENST00000461426 CFAP74Q9C0B2 1584 aa42.01■■■■■ 4.32
SIGMAR1-204ENST00000461426 RAPGEF3O95398 923 aa41.99■■■■■ 4.31
SIGMAR1-204ENST00000461426 MYO5CQ9NQX4 1742 aa41.98■■■■■ 4.31
SIGMAR1-204ENST00000461426 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP41.93■■■■■ 4.3
SIGMAR1-204ENST00000461426 ARHGAP5Q13017 1502 aa41.91■■■■■ 4.3
SIGMAR1-204ENST00000461426 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa41.9■■■■■ 4.3
SIGMAR1-204ENST00000461426 TIAM1Q13009 1591 aa41.89■■■■■ 4.3
SIGMAR1-204ENST00000461426 MAP3K1Q13233 1512 aa41.88■■■■■ 4.29
SIGMAR1-204ENST00000461426 ADGRL1O94910 1474 aa41.87■■■■■ 4.29
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