RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460297.1

NME4-209, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

TSL 5

Gene NME4, Length 1,652 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-209ENST00000460297 CEP162Q5TB80 1403 aa39■■■■□ 3.83
NME4-209ENST00000460297 CEP170Q5SW79 1584 aa38.93■■■■□ 3.82
NME4-209ENST00000460297 NUP160Q12769 1436 aa38.9■■■■□ 3.82
NME4-209ENST00000460297 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP38.87■■■■□ 3.81
NME4-209ENST00000460297 CLIP1P30622 1438 aa38.85■■■■□ 3.81
NME4-209ENST00000460297 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa38.83■■■■□ 3.81
NME4-209ENST00000460297 IQGAP2Q13576 1575 aa38.82■■■■□ 3.81
NME4-209ENST00000460297 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa38.7■■■■□ 3.79
NME4-209ENST00000460297 UGGT2Q9NYU1 1516 aa38.63■■■■□ 3.77
NME4-209ENST00000460297 EFCAB5A4FU69 1503 aa38.62■■■■□ 3.77
NME4-209ENST00000460297 SAMD9Q5K651 1589 aa38.61■■■■□ 3.77
NME4-209ENST00000460297 ARAP1Q96P48 1450 aa38.58■■■■□ 3.77
NME4-209ENST00000460297 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.57■■■■□ 3.77
NME4-209ENST00000460297 JPH4Q96JJ6 628 aa38.53■■■■□ 3.76
NME4-209ENST00000460297 P3H3Q8IVL6 736 aa38.51■■■■□ 3.76
NME4-209ENST00000460297 DISP1Q96F81 1524 aa38.48■■■■□ 3.75
NME4-209ENST00000460297 SHROOM2Q13796 1616 aa38.47■■■■□ 3.75
NME4-209ENST00000460297 FHOD3Q2V2M9 1422 aa38.47■■■■□ 3.75
NME4-209ENST00000460297 OSCARQ8IYS5 282 aa38.46■■■■□ 3.75
NME4-209ENST00000460297 KIAA0556O60303 1618 aa38.44■■■■□ 3.74
NME4-209ENST00000460297 VPS8Q8N3P4 1428 aa38.41■■■■□ 3.74
NME4-209ENST00000460297 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP38.35■■■■□ 3.73
NME4-209ENST00000460297 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa38.33■■■■□ 3.73
NME4-209ENST00000460297 ERCC6L2Q5T890 1561 aa38.25■■■■□ 3.71
NME4-209ENST00000460297 FMN1Q68DA7 1419 aa38.24■■■■□ 3.71
NME4-209ENST00000460297 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP38.17■■■■□ 3.7
NME4-209ENST00000460297 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP38.13■■■■□ 3.69
NME4-209ENST00000460297 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa38.11■■■■□ 3.69
NME4-209ENST00000460297 FYCO1Q9BQS8 1478 aa38.08■■■■□ 3.69
NME4-209ENST00000460297 PTPRGP23470 1445 aa38.03■■■■□ 3.68
NME4-209ENST00000460297 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa37.98■■■■□ 3.67
NME4-209ENST00000460297 PLB1Q6P1J6 1458 aa37.98■■■■□ 3.67
NME4-209ENST00000460297 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP37.98■■■■□ 3.67
NME4-209ENST00000460297 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa37.97■■■■□ 3.67
NME4-209ENST00000460297 HECW1Q76N89 1606 aa37.94■■■■□ 3.66
NME4-209ENST00000460297 ABCA8O94911 1581 aa37.93■■■■□ 3.66
NME4-209ENST00000460297 APLP2Q06481 763 aa37.92■■■■□ 3.66
NME4-209ENST00000460297 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP37.88■■■■□ 3.66
NME4-209ENST00000460297 TIAM1Q13009 1591 aa37.88■■■■□ 3.65
NME4-209ENST00000460297 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP37.87■■■■□ 3.65
NME4-209ENST00000460297 MAP3K1Q13233 1512 aa37.87■■■■□ 3.65
NME4-209ENST00000460297 ARHGEF11O15085 1522 aa37.87■■■■□ 3.65
NME4-209ENST00000460297 CFAP43Q8NDM7 1665 aa37.86■■■■□ 3.65
NME4-209ENST00000460297 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP37.82■■■■□ 3.65
NME4-209ENST00000460297 UACAQ9BZF9 1416 aa37.81■■■■□ 3.64
NME4-209ENST00000460297 CCDC18Q5T9S5 1454 aa37.79■■■■□ 3.64
NME4-209ENST00000460297 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP37.77■■■■□ 3.64
NME4-209ENST00000460297 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP37.76■■■■□ 3.64
NME4-209ENST00000460297 ARID3CA6NKF2 412 aa37.76■■■■□ 3.63
NME4-209ENST00000460297 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.75■■■■□ 3.63
NME4-209ENST00000460297 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.75■■■■□ 3.63
NME4-209ENST00000460297 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.75■■■■□ 3.63
NME4-209ENST00000460297 ABCC2Q92887 1545 aa37.74■■■■□ 3.63
NME4-209ENST00000460297 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa37.7■■■■□ 3.63
NME4-209ENST00000460297 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa37.69■■■■□ 3.62
NME4-209ENST00000460297 ATP10BO94823 1461 aa37.65■■■■□ 3.62
NME4-209ENST00000460297 ADCY10Q96PN6 1610 aa37.64■■■■□ 3.62
NME4-209ENST00000460297 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa37.62■■■■□ 3.61
NME4-209ENST00000460297 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP37.57■■■■□ 3.61
NME4-209ENST00000460297 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP37.57■■■■□ 3.61
NME4-209ENST00000460297 MTUS2Q5JR59 1369 aa37.56■■■■□ 3.6
NME4-209ENST00000460297 KDM5BQ9UGL1 1544 aa37.54■■■■□ 3.6
NME4-209ENST00000460297 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa37.53■■■■□ 3.6
NME4-209ENST00000460297 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP37.51■■■■□ 3.6
NME4-209ENST00000460297 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP37.47■■■■□ 3.59
NME4-209ENST00000460297 CYB5RLQ6IPT4 315 aa37.47■■■■□ 3.59
NME4-209ENST00000460297 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP37.42■■■■□ 3.58
NME4-209ENST00000460297 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP37.41■■■■□ 3.58
NME4-209ENST00000460297 PLEKHD1A6NEE1 506 aa37.39■■■■□ 3.58
NME4-209ENST00000460297 NCOA2Q15596 1464 aa37.35■■■■□ 3.57
NME4-209ENST00000460297 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP37.32■■■■□ 3.57
NME4-209ENST00000460297 PHLDB1Q86UU1 1377 aa37.32■■■■□ 3.56
NME4-209ENST00000460297 KIF14Q15058 1648 aa37.3■■■■□ 3.56
NME4-209ENST00000460297 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP37.25■■■■□ 3.55
NME4-209ENST00000460297 ASXL2Q76L83 1435 aa37.19■■■■□ 3.54
NME4-209ENST00000460297 WDR7Q9Y4E6 1490 aa37.19■■■■□ 3.54
NME4-209ENST00000460297 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.18■■■■□ 3.54
NME4-209ENST00000460297 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP37.16■■■■□ 3.54
NME4-209ENST00000460297 ABCC10Q5T3U5 1492 aa37.16■■■■□ 3.54
NME4-209ENST00000460297 MYOM3Q5VTT5 1437 aa37.15■■■■□ 3.54
NME4-209ENST00000460297 KCNH8Q96L42 1107 aa37.12■■■■□ 3.53
NME4-209ENST00000460297 PCGF6Q9BYE7 350 aa37.12■■■■□ 3.53
NME4-209ENST00000460297 CCNB3Q8WWL7 1395 aa37.1■■■■□ 3.53
NME4-209ENST00000460297 FGD6Q6ZV73 1430 aa37.09■■■■□ 3.53
NME4-209ENST00000460297 MAPKBP1O60336 1514 aa37.09■■■■□ 3.53
NME4-209ENST00000460297 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP37.09■■■■□ 3.531e-6■■■□□ 18.6
NME4-209ENST00000460297 TTC37Q6PGP7 1564 aa37.07■■■■□ 3.52
NME4-209ENST00000460297 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa37.06■■■■□ 3.52
NME4-209ENST00000460297 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP37.05■■■■□ 3.52
NME4-209ENST00000460297 ITSN2Q9NZM3 1697 aa37.04■■■■□ 3.52
NME4-209ENST00000460297 MIA2Q96PC5 1412 aa37■■■■□ 3.51
NME4-209ENST00000460297 PTPN23Q9H3S7 1636 aa36.97■■■■□ 3.51
NME4-209ENST00000460297 ABCA9Q8IUA7 1624 aa36.95■■■■□ 3.51
NME4-209ENST00000460297 PREX2Q70Z35 1606 aa36.95■■■■□ 3.5
NME4-209ENST00000460297 MYO5CQ9NQX4 1742 aa36.94■■■■□ 3.5
NME4-209ENST00000460297 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa36.94■■■■□ 3.5
NME4-209ENST00000460297 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP36.92■■■■□ 3.5
NME4-209ENST00000460297 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP36.91■■■■□ 3.5
NME4-209ENST00000460297 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP36.9■■■■□ 3.5
NME4-209ENST00000460297 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP36.9■■■■□ 3.52e-10■■■■■ 37.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15 ms