RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459697.1

RABGGTB-203, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 1,177 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-203ENST00000459697 PLCD3Q8N3E9 789 aa11.92□□□□□ -0.5
RABGGTB-203ENST00000459697 FKBP8Q14318 412 aa11.91□□□□□ -0.5
RABGGTB-203ENST00000459697 CCDC61Q9Y6R9 512 aa11.91□□□□□ -0.5
RABGGTB-203ENST00000459697 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
RABGGTB-203ENST00000459697 RASEFQ8IZ41 740 aa11.86□□□□□ -0.51
RABGGTB-203ENST00000459697 TRIM41Q8WV44 630 aa11.86□□□□□ -0.51
RABGGTB-203ENST00000459697 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
RABGGTB-203ENST00000459697 KIF12Q96FN5 646 aa11.85□□□□□ -0.51
RABGGTB-203ENST00000459697 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
RABGGTB-203ENST00000459697 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
RABGGTB-203ENST00000459697 POTEB2H3BUK9 544 aa11.82□□□□□ -0.52
RABGGTB-203ENST00000459697 SLC39A7Q92504 469 aa11.8□□□□□ -0.52
RABGGTB-203ENST00000459697 METRNQ9UJH8 293 aa11.8□□□□□ -0.52
RABGGTB-203ENST00000459697 MAP3K13O43283 966 aa11.79□□□□□ -0.52
RABGGTB-203ENST00000459697 C7P10643 843 aa11.79□□□□□ -0.52
RABGGTB-203ENST00000459697 OTUD5Q96G74 571 aa11.79□□□□□ -0.52
RABGGTB-203ENST00000459697 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
RABGGTB-203ENST00000459697 NUBP1P53384 320 aa11.74□□□□□ -0.53
RABGGTB-203ENST00000459697 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
RABGGTB-203ENST00000459697 TRPC6Q9Y210 931 aa11.72□□□□□ -0.53
RABGGTB-203ENST00000459697 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa11.71□□□□□ -0.53
RABGGTB-203ENST00000459697 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa11.71□□□□□ -0.53
RABGGTB-203ENST00000459697 TIE1P35590 1138 aa11.7□□□□□ -0.54
RABGGTB-203ENST00000459697 FBXO3Q9UK99 471 aa11.7□□□□□ -0.54
RABGGTB-203ENST00000459697 CECR2Q9BXF3 1484 aa11.7□□□□□ -0.54
RABGGTB-203ENST00000459697 FAM212AQ96EL1 285 aa11.69□□□□□ -0.54
RABGGTB-203ENST00000459697 SGIP1Q9BQI5 828 aa11.68□□□□□ -0.54
RABGGTB-203ENST00000459697 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa11.68□□□□□ -0.54
RABGGTB-203ENST00000459697 MAMSTRQ6ZN01 415 aa11.65□□□□□ -0.54
RABGGTB-203ENST00000459697 TTLL13PA6NNM8 815 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGGTB-203ENST00000459697 POTEJP0CG39 1038 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGGTB-203ENST00000459697 DCAF8Q5TAQ9 597 aa11.61□□□□□ -0.55
RABGGTB-203ENST00000459697 IFNL1Q8IU54 200 aa11.6□□□□□ -0.55
RABGGTB-203ENST00000459697 SEC24BO95487 1268 aa11.59□□□□□ -0.55
RABGGTB-203ENST00000459697 SCUBE2Q9NQ36 999 aa11.59□□□□□ -0.55
RABGGTB-203ENST00000459697 POTEFA5A3E0 1075 aa11.58□□□□□ -0.56
RABGGTB-203ENST00000459697 TRIM35Q9UPQ4 493 aa11.58□□□□□ -0.56
RABGGTB-203ENST00000459697 KLHL34Q8N239 644 aa11.55□□□□□ -0.56
RABGGTB-203ENST00000459697 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa11.55□□□□□ -0.56
RABGGTB-203ENST00000459697 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
RABGGTB-203ENST00000459697 PYGBP11216 843 aa11.53□□□□□ -0.56
RABGGTB-203ENST00000459697 VASPP50552 380 aaPredicted RBP11.53□□□□□ -0.56
RABGGTB-203ENST00000459697 IER5LQ5T953 404 aa11.53□□□□□ -0.56
RABGGTB-203ENST00000459697 TMEM106CQ9BVX2 250 aa11.53□□□□□ -0.56
RABGGTB-203ENST00000459697 POTEMA6NI47 508 aa11.5□□□□□ -0.57
RABGGTB-203ENST00000459697 CUX2O14529 1486 aa11.49□□□□□ -0.57
RABGGTB-203ENST00000459697 POTEGQ6S5H5 508 aa11.47□□□□□ -0.57
RABGGTB-203ENST00000459697 PLSCR2Q9NRY7 297 aa11.47□□□□□ -0.57
RABGGTB-203ENST00000459697 UNC13AQ9UPW8 1703 aa11.46□□□□□ -0.58
RABGGTB-203ENST00000459697 GSE1Q14687 1217 aa11.45□□□□□ -0.58
RABGGTB-203ENST00000459697 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
RABGGTB-203ENST00000459697 PCDHB8Q9UN66 801 aa11.44□□□□□ -0.58
RABGGTB-203ENST00000459697 PLCG2P16885 1265 aa11.43□□□□□ -0.58
RABGGTB-203ENST00000459697 BICRAQ9NZM4 1560 aa11.41□□□□□ -0.58
RABGGTB-203ENST00000459697 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
RABGGTB-203ENST00000459697 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
RABGGTB-203ENST00000459697 OCEL1Q9H607 264 aa11.35□□□□□ -0.59
RABGGTB-203ENST00000459697 NACADO15069 1562 aa11.34□□□□□ -0.59
RABGGTB-203ENST00000459697 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
RABGGTB-203ENST00000459697 SLAIN1Q8ND83 568 aa11.34□□□□□ -0.59
RABGGTB-203ENST00000459697 PCDH10Q9P2E7 1040 aa11.33□□□□□ -0.6
RABGGTB-203ENST00000459697 SPOCK2Q92563 424 aa11.32□□□□□ -0.6
RABGGTB-203ENST00000459697 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
RABGGTB-203ENST00000459697 GOLGA2Q08379 1002 aa11.3□□□□□ -0.6
RABGGTB-203ENST00000459697 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
RABGGTB-203ENST00000459697 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
RABGGTB-203ENST00000459697 PSEN1P49768 467 aa11.26□□□□□ -0.61
RABGGTB-203ENST00000459697 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
RABGGTB-203ENST00000459697 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
RABGGTB-203ENST00000459697 ERCC6Q03468 1493 aa11.22□□□□□ -0.61
RABGGTB-203ENST00000459697 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
RABGGTB-203ENST00000459697 DCAF8L2P0C7V8 631 aa11.2□□□□□ -0.62
RABGGTB-203ENST00000459697 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
RABGGTB-203ENST00000459697 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
RABGGTB-203ENST00000459697 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP11.19□□□□□ -0.622e-21■□□□□ 9.4
RABGGTB-203ENST00000459697 ST18O60284 1047 aa11.18□□□□□ -0.62
RABGGTB-203ENST00000459697 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
RABGGTB-203ENST00000459697 SNPHO15079 494 aa11.15□□□□□ -0.62
RABGGTB-203ENST00000459697 C3orf67Q6ZVT6 689 aa11.15□□□□□ -0.62
RABGGTB-203ENST00000459697 CDAN1Q8IWY9 1227 aa11.13□□□□□ -0.63
RABGGTB-203ENST00000459697 CABP2Q9NPB3 220 aa11.13□□□□□ -0.63
RABGGTB-203ENST00000459697 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
RABGGTB-203ENST00000459697 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa11.07□□□□□ -0.64
RABGGTB-203ENST00000459697 DPY19L2Q6NUT2 758 aa11.06□□□□□ -0.64
RABGGTB-203ENST00000459697 G3V3G9 751 aa11.05□□□□□ -0.64
RABGGTB-203ENST00000459697 BOLA1Q9Y3E2 137 aa11.02□□□□□ -0.65
RABGGTB-203ENST00000459697 MARVELD3Q96A59 401 aa11.01□□□□□ -0.65
RABGGTB-203ENST00000459697 EFCAB3Q8N7B9 438 aa10.99□□□□□ -0.65
RABGGTB-203ENST00000459697 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
RABGGTB-203ENST00000459697 EMP3P54852 163 aa10.93□□□□□ -0.66
RABGGTB-203ENST00000459697 VGFO15240 615 aaPredicted RBP10.91□□□□□ -0.66
RABGGTB-203ENST00000459697 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP10.91□□□□□ -0.66
RABGGTB-203ENST00000459697 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP10.9□□□□□ -0.66
RABGGTB-203ENST00000459697 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP10.9□□□□□ -0.66
RABGGTB-203ENST00000459697 SOX12O15370 315 aa10.89□□□□□ -0.67
RABGGTB-203ENST00000459697 FAM205CA6NFA0 338 aa10.87□□□□□ -0.67
RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF710Q8N1W2 664 aa10.86□□□□□ -0.67
RABGGTB-203ENST00000459697 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP10.85□□□□□ -0.67
RABGGTB-203ENST00000459697 SPNS2Q8IVW8 549 aa10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.1 ms