RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459159.1

SNORD54-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 54, humanhuman

BASIC

Gene SNORD54, Length 67 nt, Biotype snoRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD54-201ENST00000459159 KRTAP5-8O75690 187 aa0.18□□□□□ -2.38
SNORD54-201ENST00000459159 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP0.18□□□□□ -2.38
SNORD54-201ENST00000459159 NOTCH3Q9UM47 2321 aa0.18□□□□□ -2.38
SNORD54-201ENST00000459159 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa0.18□□□□□ -2.38
SNORD54-201ENST00000459159 BSNQ9UPA5 3926 aa0.17□□□□□ -2.38
SNORD54-201ENST00000459159 JMJD1CQ15652 2540 aa0.17□□□□□ -2.38
SNORD54-201ENST00000459159 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP0.17□□□□□ -2.38
SNORD54-201ENST00000459159 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP0.17□□□□□ -2.38
SNORD54-201ENST00000459159 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP0.16□□□□□ -2.38
SNORD54-201ENST00000459159 HERC1Q15751 4861 aa0.16□□□□□ -2.38
SNORD54-201ENST00000459159 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa0.16□□□□□ -2.38
SNORD54-201ENST00000459159 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa0.15□□□□□ -2.39
SNORD54-201ENST00000459159 ZNF462Q96JM2 2506 aa0.14□□□□□ -2.39
SNORD54-201ENST00000459159 USH2AO75445 5202 aa0.13□□□□□ -2.39
SNORD54-201ENST00000459159 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa0.13□□□□□ -2.39
SNORD54-201ENST00000459159 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP0.13□□□□□ -2.39
SNORD54-201ENST00000459159 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa0.13□□□□□ -2.39
SNORD54-201ENST00000459159 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa0.13□□□□□ -2.39
SNORD54-201ENST00000459159 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP0.12□□□□□ -2.39
SNORD54-201ENST00000459159 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP0.12□□□□□ -2.39
SNORD54-201ENST00000459159 HIVEP2P31629 2446 aa0.12□□□□□ -2.39
SNORD54-201ENST00000459159 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP0.12□□□□□ -2.39
SNORD54-201ENST00000459159 POLQO75417 2590 aa0.11□□□□□ -2.39
SNORD54-201ENST00000459159 PHGR1C9JFL3 82 aa0.1□□□□□ -2.39
SNORD54-201ENST00000459159 KRT10P13645 584 aa0.1□□□□□ -2.39
SNORD54-201ENST00000459159 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa0.1□□□□□ -2.39
SNORD54-201ENST00000459159 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD54-201ENST00000459159 ACANP16112 2415 aa0.08□□□□□ -2.4
SNORD54-201ENST00000459159 MUC6Q6W4X9 2439 aa0.08□□□□□ -2.4
SNORD54-201ENST00000459159 FAT3Q8TDW7 4589 aa0.08□□□□□ -2.4
SNORD54-201ENST00000459159 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa0.08□□□□□ -2.4
SNORD54-201ENST00000459159 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP0.08□□□□□ -2.4
SNORD54-201ENST00000459159 HECTD1Q9ULT8 2610 aa0.07□□□□□ -2.4
SNORD54-201ENST00000459159 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa0.07□□□□□ -2.4
SNORD54-201ENST00000459159 MAST4O15021 2626 aa0.07□□□□□ -2.4
SNORD54-201ENST00000459159 FASNP49327 2511 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
SNORD54-201ENST00000459159 COL6A5A8TX70 2615 aa0.06□□□□□ -2.4
SNORD54-201ENST00000459159 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa0.05□□□□□ -2.4
SNORD54-201ENST00000459159 COL12A1Q99715 3063 aa0.05□□□□□ -2.4
SNORD54-201ENST00000459159 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP0.04□□□□□ -2.4
SNORD54-201ENST00000459159 TENM3Q9P273 2699 aa0.04□□□□□ -2.4
SNORD54-201ENST00000459159 ABCA12Q86UK0 2595 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD54-201ENST00000459159 FBN2P35556 2912 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD54-201ENST00000459159 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP0.03□□□□□ -2.4
SNORD54-201ENST00000459159 CHD6Q8TD26 2715 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD54-201ENST00000459159 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa0.03□□□□□ -2.41
SNORD54-201ENST00000459159 TRANK1O15050 2925 aa0.02□□□□□ -2.41
SNORD54-201ENST00000459159 PDZD2O15018 2839 aa0.02□□□□□ -2.41
SNORD54-201ENST00000459159 MUC16Q8WXI7 14507 aa0.02□□□□□ -2.41
SNORD54-201ENST00000459159 UBXN11Q5T124 520 aa0.01□□□□□ -2.41
SNORD54-201ENST00000459159 PIEZO1Q92508 2521 aa0.01□□□□□ -2.41
SNORD54-201ENST00000459159 TENM4Q6N022 2769 aa0□□□□□ -2.41
SNORD54-201ENST00000459159 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa0□□□□□ -2.41
SNORD54-201ENST00000459159 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP0□□□□□ -2.41
SNORD54-201ENST00000459159 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP-0□□□□□ -2.41
SNORD54-201ENST00000459159 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP-0.01□□□□□ -2.41
SNORD54-201ENST00000459159 COL26A1Q96A83 441 aa-0.01□□□□□ -2.41
SNORD54-201ENST00000459159 AKAP13Q12802 2813 aa-0.01□□□□□ -2.41
SNORD54-201ENST00000459159 BDP1A6H8Y1 2624 aa-0.02□□□□□ -2.41
SNORD54-201ENST00000459159 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa-0.02□□□□□ -2.41
SNORD54-201ENST00000459159 LCE1FQ5T754 118 aa-0.02□□□□□ -2.41
SNORD54-201ENST00000459159 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP-0.02□□□□□ -2.41
SNORD54-201ENST00000459159 LRCH2Q5VUJ6 765 aa-0.02□□□□□ -2.41
SNORD54-201ENST00000459159 ATRXP46100 2492 aa-0.02□□□□□ -2.41
SNORD54-201ENST00000459159 FRAS1Q86XX4 4008 aa-0.02□□□□□ -2.41
SNORD54-201ENST00000459159 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP-0.02□□□□□ -2.41
SNORD54-201ENST00000459159 ABCA2Q9BZC7 2435 aa-0.03□□□□□ -2.41
SNORD54-201ENST00000459159 ZNF292O60281 2723 aa-0.03□□□□□ -2.41
SNORD54-201ENST00000459159 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa-0.03□□□□□ -2.41
SNORD54-201ENST00000459159 TENM2Q9NT68 2774 aa-0.03□□□□□ -2.41
SNORD54-201ENST00000459159 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
SNORD54-201ENST00000459159 BIRC6Q9NR09 4857 aa-0.04□□□□□ -2.42
SNORD54-201ENST00000459159 OTOGQ6ZRI0 2925 aa-0.04□□□□□ -2.42
SNORD54-201ENST00000459159 FBXL17Q9UF56 701 aa-0.04□□□□□ -2.42
SNORD54-201ENST00000459159 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
SNORD54-201ENST00000459159 ACACBO00763 2458 aa-0.05□□□□□ -2.42
SNORD54-201ENST00000459159 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
SNORD54-201ENST00000459159 MPNDQ8N594 471 aa-0.05□□□□□ -2.42
SNORD54-201ENST00000459159 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
SNORD54-201ENST00000459159 CAAP1Q9H8G2 361 aa-0.05□□□□□ -2.42
SNORD54-201ENST00000459159 HERC2O95714 4834 aa-0.06□□□□□ -2.42
SNORD54-201ENST00000459159 COL7A1Q02388 2944 aa-0.06□□□□□ -2.42
SNORD54-201ENST00000459159 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa-0.06□□□□□ -2.42
SNORD54-201ENST00000459159 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP-0.06□□□□□ -2.42
SNORD54-201ENST00000459159 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa-0.06□□□□□ -2.42
SNORD54-201ENST00000459159 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
SNORD54-201ENST00000459159 TGP01266 2768 aa-0.07□□□□□ -2.42
SNORD54-201ENST00000459159 LORP23490 312 aaPredicted RBP-0.07□□□□□ -2.42
SNORD54-201ENST00000459159 LRRK2Q5S007 2527 aa-0.07□□□□□ -2.42
SNORD54-201ENST00000459159 MGAM2Q2M2H8 2515 aa-0.08□□□□□ -2.42
SNORD54-201ENST00000459159 ATRQ13535 2644 aa-0.08□□□□□ -2.42
SNORD54-201ENST00000459159 TRPM4Q8TD43 1214 aa-0.08□□□□□ -2.42
SNORD54-201ENST00000459159 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa-0.08□□□□□ -2.42
SNORD54-201ENST00000459159 TENM1Q9UKZ4 2725 aa-0.08□□□□□ -2.42
SNORD54-201ENST00000459159 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
SNORD54-201ENST00000459159 LCE1CQ5T751 118 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD54-201ENST00000459159 LCE1EQ5T753 118 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD54-201ENST00000459159 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
SNORD54-201ENST00000459159 CCDC168Q8NDH2 2452 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD54-201ENST00000459159 MYO18BQ8IUG5 2567 aa-0.09□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.7 ms