RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000457264.5

MRPL55-222, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L55, human

TSL 3

Gene MRPL55, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL55-222	ENST00000457264	IGF1R	P08069	1367 aa		29.34	■■■□□ 2.29
MRPL55-222	ENST00000457264	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		29.32	■■■□□ 2.28
MRPL55-222	ENST00000457264	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		29.32	■■■□□ 2.28
MRPL55-222	ENST00000457264	KIF27	Q86VH2	1401 aa		29.31	■■■□□ 2.28
MRPL55-222	ENST00000457264	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		29.28	■■■□□ 2.28
MRPL55-222	ENST00000457264	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		29.23	■■■□□ 2.27
MRPL55-222	ENST00000457264	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		29.18	■■■□□ 2.26
MRPL55-222	ENST00000457264	MAPKBP1	O60336	1514 aa		29.17	■■■□□ 2.26
MRPL55-222	ENST00000457264	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		29.15	■■■□□ 2.26
MRPL55-222	ENST00000457264	CUL7	Q14999	1698 aa		29.14	■■■□□ 2.26
MRPL55-222	ENST00000457264	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		29.12	■■■□□ 2.25
MRPL55-222	ENST00000457264	PTPRG	P23470	1445 aa		29.11	■■■□□ 2.25
MRPL55-222	ENST00000457264	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	29.1	■■■□□ 2.25
MRPL55-222	ENST00000457264	DIP2B	Q9P265	1576 aa		29.05	■■■□□ 2.24
MRPL55-222	ENST00000457264	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		29.04	■■■□□ 2.24
MRPL55-222	ENST00000457264	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		29.01	■■■□□ 2.24
MRPL55-222	ENST00000457264	ABCC2	Q92887	1545 aa		28.91	■■■□□ 2.22
MRPL55-222	ENST00000457264	IQGAP2	Q13576	1575 aa		28.89	■■■□□ 2.22
MRPL55-222	ENST00000457264	KDM6B	O15054	1643 aa		28.88	■■■□□ 2.21
MRPL55-222	ENST00000457264	ASXL2	Q76L83	1435 aa		28.85	■■■□□ 2.21
MRPL55-222	ENST00000457264	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		28.85	■■■□□ 2.21
MRPL55-222	ENST00000457264	UACA	Q9BZF9	1416 aa		28.84	■■■□□ 2.21
MRPL55-222	ENST00000457264	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		28.83	■■■□□ 2.21
MRPL55-222	ENST00000457264	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		28.82	■■■□□ 2.2
MRPL55-222	ENST00000457264	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		28.81	■■■□□ 2.2
MRPL55-222	ENST00000457264	DISP1	Q96F81	1524 aa		28.8	■■■□□ 2.2
MRPL55-222	ENST00000457264	TSPOAP1	O95153	1857 aa		28.8	■■■□□ 2.2
MRPL55-222	ENST00000457264	GLI2	P10070	1586 aa		28.72	■■■□□ 2.19
MRPL55-222	ENST00000457264	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		28.72	■■■□□ 2.19
MRPL55-222	ENST00000457264	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		28.69	■■■□□ 2.18
MRPL55-222	ENST00000457264	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	28.65	■■■□□ 2.18
MRPL55-222	ENST00000457264	KIAA0556	O60303	1618 aa		28.61	■■■□□ 2.17
MRPL55-222	ENST00000457264	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		28.57	■■■□□ 2.16
MRPL55-222	ENST00000457264	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	28.57	■■■□□ 2.16
MRPL55-222	ENST00000457264	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	28.54	■■■□□ 2.16
MRPL55-222	ENST00000457264	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	28.54	■■■□□ 2.16
MRPL55-222	ENST00000457264	GOLGA3	Q08378	1498 aa		28.53	■■■□□ 2.16
MRPL55-222	ENST00000457264	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		28.52	■■■□□ 2.16
MRPL55-222	ENST00000457264	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		28.51	■■■□□ 2.15
MRPL55-222	ENST00000457264	KCNH8	Q96L42	1107 aa		28.49	■■■□□ 2.15
MRPL55-222	ENST00000457264	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	28.48	■■■□□ 2.15
MRPL55-222	ENST00000457264	ADGRL1	O94910	1474 aa		28.46	■■■□□ 2.15
MRPL55-222	ENST00000457264	PRX	Q9BXM0	1461 aa		28.44	■■■□□ 2.14
MRPL55-222	ENST00000457264	CD109	Q6YHK3	1445 aa		28.42	■■■□□ 2.14
MRPL55-222	ENST00000457264	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		28.39	■■■□□ 2.14
MRPL55-222	ENST00000457264	ABCA8	O94911	1581 aa		28.37	■■■□□ 2.13
MRPL55-222	ENST00000457264	P3H3	Q8IVL6	736 aa		28.36	■■■□□ 2.13
MRPL55-222	ENST00000457264	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		28.34	■■■□□ 2.13
MRPL55-222	ENST00000457264	ARID3C	A6NKF2	412 aa		28.32	■■■□□ 2.12
MRPL55-222	ENST00000457264	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		28.28	■■■□□ 2.12
MRPL55-222	ENST00000457264	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		28.25	■■■□□ 2.11
MRPL55-222	ENST00000457264	ATP10B	O94823	1461 aa		28.22	■■■□□ 2.11
MRPL55-222	ENST00000457264	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	28.18	■■■□□ 2.1
MRPL55-222	ENST00000457264	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	28.18	■■■□□ 2.1
MRPL55-222	ENST00000457264	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	28.18	■■■□□ 2.1
MRPL55-222	ENST00000457264	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		28.13	■■■□□ 2.09
MRPL55-222	ENST00000457264	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		28.13	■■■□□ 2.09
MRPL55-222	ENST00000457264	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	28.12	■■■□□ 2.09
MRPL55-222	ENST00000457264	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		28.09	■■■□□ 2.09
MRPL55-222	ENST00000457264	RAPGEF3	O95398	923 aa		28.06	■■■□□ 2.08
MRPL55-222	ENST00000457264	SAMD9	Q5K651	1589 aa		28.05	■■■□□ 2.08
MRPL55-222	ENST00000457264	EEA1	Q15075	1411 aa		28.04	■■■□□ 2.08
MRPL55-222	ENST00000457264	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		28.03	■■■□□ 2.08
MRPL55-222	ENST00000457264	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		28.02	■■■□□ 2.08
MRPL55-222	ENST00000457264	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		28	■■■□□ 2.07
MRPL55-222	ENST00000457264	NEO1	Q92859	1461 aa		28	■■■□□ 2.07
MRPL55-222	ENST00000457264	KIF21B	O75037	1637 aa		27.99	■■■□□ 2.07
MRPL55-222	ENST00000457264	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	27.97	■■■□□ 2.07
MRPL55-222	ENST00000457264	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		27.97	■■■□□ 2.07
MRPL55-222	ENST00000457264	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	27.93	■■■□□ 2.06
MRPL55-222	ENST00000457264	PTPRM	P28827	1452 aa		27.86	■■■□□ 2.05
MRPL55-222	ENST00000457264	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	27.83	■■■□□ 2.04
MRPL55-222	ENST00000457264	AKNA	Q7Z591	1439 aa		27.82	■■■□□ 2.04
MRPL55-222	ENST00000457264	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		27.79	■■■□□ 2.04
MRPL55-222	ENST00000457264	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		27.79	■■■□□ 2.04
MRPL55-222	ENST00000457264	FANCA	O15360	1455 aa		27.79	■■■□□ 2.04
MRPL55-222	ENST00000457264	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		27.78	■■■□□ 2.04
MRPL55-222	ENST00000457264	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	27.75	■■■□□ 2.03
MRPL55-222	ENST00000457264	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	27.74	■■■□□ 2.03
MRPL55-222	ENST00000457264	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		27.74	■■■□□ 2.03
MRPL55-222	ENST00000457264	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	27.74	■■■□□ 2.03
MRPL55-222	ENST00000457264	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		27.7	■■■□□ 2.03
MRPL55-222	ENST00000457264	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		27.68	■■■□□ 2.02
MRPL55-222	ENST00000457264	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		27.68	■■■□□ 2.02
MRPL55-222	ENST00000457264	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		27.68	■■■□□ 2.02
MRPL55-222	ENST00000457264	MADD	Q8WXG6	1647 aa		27.67	■■■□□ 2.02
MRPL55-222	ENST00000457264	FBXO41	Q8TF61	875 aa		27.66	■■■□□ 2.02
MRPL55-222	ENST00000457264	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	27.66	■■■□□ 2.02
MRPL55-222	ENST00000457264	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	27.66	■■■□□ 2.02
MRPL55-222	ENST00000457264	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		27.65	■■■□□ 2.02
MRPL55-222	ENST00000457264	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		27.64	■■■□□ 2.02
MRPL55-222	ENST00000457264	PLCH2	O75038	1416 aa		27.64	■■■□□ 2.02
MRPL55-222	ENST00000457264	FMN1	Q68DA7	1419 aa		27.63	■■■□□ 2.01
MRPL55-222	ENST00000457264	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		27.63	■■■□□ 2.01
MRPL55-222	ENST00000457264	RICTOR	Q6R327	1708 aa		27.63	■■■□□ 2.01
MRPL55-222	ENST00000457264	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		27.62	■■■□□ 2.01
MRPL55-222	ENST00000457264	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		27.62	■■■□□ 2.01
MRPL55-222	ENST00000457264	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		27.62	■■■□□ 2.01
MRPL55-222	ENST00000457264	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		27.61	■■■□□ 2.01
MRPL55-222	ENST00000457264	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	27.6	■■■□□ 2.01

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.4 ms