RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442708.5

USP39-205, Transcript of ubiquitin specific peptidase 39, humanhuman

TSL 4

Gene USP39, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP39-205ENST00000442708 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.75■■□□□ 1.87
USP39-205ENST00000442708 ARHGEF11O15085 1522 aa26.74■■□□□ 1.87
USP39-205ENST00000442708 SHROOM2Q13796 1616 aa26.71■■□□□ 1.87
USP39-205ENST00000442708 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa26.69■■□□□ 1.86
USP39-205ENST00000442708 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.65■■□□□ 1.86
USP39-205ENST00000442708 JPH4Q96JJ6 628 aa26.61■■□□□ 1.85
USP39-205ENST00000442708 KIF21BO75037 1637 aa26.61■■□□□ 1.85
USP39-205ENST00000442708 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa26.6■■□□□ 1.85
USP39-205ENST00000442708 IQGAP2Q13576 1575 aa26.58■■□□□ 1.85
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USP39-205ENST00000442708 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
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USP39-205ENST00000442708 UGGT2Q9NYU1 1516 aa26.45■■□□□ 1.83
USP39-205ENST00000442708 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.45■■□□□ 1.82
USP39-205ENST00000442708 GOLGA3Q08378 1498 aa26.43■■□□□ 1.82
USP39-205ENST00000442708 DISP1Q96F81 1524 aa26.42■■□□□ 1.82
USP39-205ENST00000442708 KIAA0556O60303 1618 aa26.35■■□□□ 1.81
USP39-205ENST00000442708 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa26.34■■□□□ 1.81
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USP39-205ENST00000442708 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
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USP39-205ENST00000442708 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
USP39-205ENST00000442708 P3H3Q8IVL6 736 aa26.2■■□□□ 1.78
USP39-205ENST00000442708 ADCY10Q96PN6 1610 aa26.18■■□□□ 1.78
USP39-205ENST00000442708 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa26.14■■□□□ 1.78
USP39-205ENST00000442708 EFCAB5A4FU69 1503 aa26.13■■□□□ 1.77
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USP39-205ENST00000442708 TRHP20396 242 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
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USP39-205ENST00000442708 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa26.05■■□□□ 1.76
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USP39-205ENST00000442708 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25.96■■□□□ 1.75
USP39-205ENST00000442708 KDM5BQ9UGL1 1544 aa25.94■■□□□ 1.74
USP39-205ENST00000442708 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
USP39-205ENST00000442708 CEP162Q5TB80 1403 aa25.93■■□□□ 1.74
USP39-205ENST00000442708 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP25.91■■□□□ 1.74
USP39-205ENST00000442708 MAPKBP1O60336 1514 aa25.9■■□□□ 1.74
USP39-205ENST00000442708 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
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USP39-205ENST00000442708 ATP10BO94823 1461 aa25.84■■□□□ 1.73
USP39-205ENST00000442708 ASXL2Q76L83 1435 aa25.82■■□□□ 1.72
USP39-205ENST00000442708 KIF13AQ9H1H9 1805 aa25.8■■□□□ 1.72
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USP39-205ENST00000442708 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.77■■□□□ 1.72
USP39-205ENST00000442708 HECW1Q76N89 1606 aa25.75■■□□□ 1.71
USP39-205ENST00000442708 DIP2BQ9P265 1576 aa25.75■■□□□ 1.71
USP39-205ENST00000442708 ABCC10Q5T3U5 1492 aa25.75■■□□□ 1.71
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USP39-205ENST00000442708 FAM69CQ0P6D2 419 aa25.67■■□□□ 1.7
USP39-205ENST00000442708 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP25.66■■□□□ 1.7
USP39-205ENST00000442708 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
USP39-205ENST00000442708 GLI2P10070 1586 aa25.63■■□□□ 1.69
USP39-205ENST00000442708 KCNH8Q96L42 1107 aa25.6■■□□□ 1.69
USP39-205ENST00000442708 VPS8Q8N3P4 1428 aa25.59■■□□□ 1.69
USP39-205ENST00000442708 TSPOAP1O95153 1857 aa25.57■■□□□ 1.68
USP39-205ENST00000442708 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa25.56■■□□□ 1.68
USP39-205ENST00000442708 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.56■■□□□ 1.68
USP39-205ENST00000442708 PLEKHD1A6NEE1 506 aa25.55■■□□□ 1.68
USP39-205ENST00000442708 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
USP39-205ENST00000442708 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.53■■□□□ 1.68
USP39-205ENST00000442708 ABCA9Q8IUA7 1624 aa25.5■■□□□ 1.67
USP39-205ENST00000442708 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.49■■□□□ 1.67
USP39-205ENST00000442708 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
USP39-205ENST00000442708 KIF14Q15058 1648 aa25.46■■□□□ 1.67
USP39-205ENST00000442708 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
USP39-205ENST00000442708 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP25.45■■□□□ 1.66
USP39-205ENST00000442708 TTC37Q6PGP7 1564 aa25.44■■□□□ 1.66
USP39-205ENST00000442708 CD109Q6YHK3 1445 aa25.44■■□□□ 1.66
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USP39-205ENST00000442708 MAP3K1Q13233 1512 aa25.33■■□□□ 1.65
USP39-205ENST00000442708 TEX14Q8IWB6 1497 aa25.33■■□□□ 1.65
USP39-205ENST00000442708 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.32■■□□□ 1.64
USP39-205ENST00000442708 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.31■■□□□ 1.64
USP39-205ENST00000442708 MYO5CQ9NQX4 1742 aa25.3■■□□□ 1.64
USP39-205ENST00000442708 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
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USP39-205ENST00000442708 PLCH2O75038 1416 aa25.26■■□□□ 1.63
USP39-205ENST00000442708 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
USP39-205ENST00000442708 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa25.26■■□□□ 1.63
USP39-205ENST00000442708 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa25.26■■□□□ 1.63
USP39-205ENST00000442708 KDM6BO15054 1643 aa25.25■■□□□ 1.63
USP39-205ENST00000442708 PREX2Q70Z35 1606 aa25.23■■□□□ 1.63
USP39-205ENST00000442708 FANCAO15360 1455 aa25.21■■□□□ 1.63
USP39-205ENST00000442708 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
USP39-205ENST00000442708 ARAP3Q8WWN8 1544 aa25.21■■□□□ 1.63
USP39-205ENST00000442708 NEO1Q92859 1461 aa25.21■■□□□ 1.63
USP39-205ENST00000442708 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
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